Micobacterias no-tuberculosa en pacientes registrados en un programa de control de tuberculosis en el suroccidente de Colombia

Introduction: Pulmonary disease produced by nontuberculous mycobacteria and pulmonary tuberculosis can share clinical signs and symptoms. It is important to discern one from the other in order to provide the proper treatment and programmatic management. Objective: To describe the frequency of nontuberculous mycobacteria isolated from patients registered in the tuberculosis control program in Cali. Methods: We conducted a descriptive study to know what extent of the pulmonary tuberculosis load in Cali-Colombia corresponds to nontuberculous mycobacteria, in a four-year period, 2014-2017. Demographic (sex, age, health insurance), clinical (diagnosis dates, laboratory data, comorbidities) and programmatic data (tuberculosis treatment initiation and duration) was collected for statistical analysis. Results: Of 3,651 patients registered in the local tuberculosis program with an initial diagnosis of pulmonary tuberculosis, 2,904 had sputum culture and among them 1.5% (43/2904) had nontuberculous mycobacteria isolation rather than Mycobacterium tuberculosis. Most of the nontuberculous mycobacteria isolates were not identified at the species level; M. fortuitum and M. abscessus were the most common species identified. 86% of patients initiated unnecessary tuberculosis treatment. Conclusion: Nontuberculous mycobacteria isolation from pulmonary samples could be frequent in patients registered in the tuberculosis program in Cali, Colombia. The lack of clinical suspicion, the limited laboratory infrastructure, and the absence of a reporting system could be contributing factors to underestimate the importance of nontuberculous mycobacteria in this setting. We recommend that nontuberculous mycobacteria identification should be considered for public health intervention.Introducción: La enfermedad pulmonar producida por micobacterias no-tuberculosas y la tuberculosis pulmonar pueden compartir signos y síntomas. Es importante discernir entre estas dos enfermedades para poder proveer un tratamiento y manejo adecuado para cada una. Objetivo: Describir la frecuencia de micobacterias no-tuberculosas aisladas de pacientes registrados en el programa de control en la ciudad de Cali. Métodos: se realizó un estudio descriptivo para conocer la carga de micobacterias no-tuberculosos con respecto a la tuberculosis pulmonar en Cali, Colombia, en un periodo de cuatro años (2004-2017). Datos demográficos (sexo, edad, aseguramiento en salud), clínicos (diagnóstico, de laboratorio y comorbilidades) y datos del programa (iniciación y duración del tratamiento) fueron recolectaron para los análisis. Resultados: del registro de 3,651 pacientes en el programa de tuberculosis con un diagnostico inicial de tuberculosis pulmonar, a 2,904 se les realizó cultivo de esputo y entre estos, 1.5% (43/2,904) se les aisló micobacteria no-tuberculosa en lugar de Mycobacterium tuberculosis. La mayoría de las micobacterias no-tuberculosas no se identificaron asta el nivel de especie. M. fortuitum y M. abscessus fueron las mas frecuentemente identificadas. El 86% de estos pacientes iniciaron un tratamiento innecesario contra la tuberculosis. Conclusiones: Fueron identificadas Micobacterias no-tuberculosas aisladas de esputo en pacientes del programa de control. La falta de sospecha clínica, la infraestructura limitada de los laboratorios y la ausencia de un sistema de información podría contribuir a subestimar la importancia de micobacterias no tuberculosas. Nosotros recomendamos que la identificación de estas bacterias debe considerarse en una intervención de salud pública

Association between the histopathologic findings of a zero-time biopsy and the donor kidney function 24 hours and a year after nephrectomy

Background: The living-donor transplantation (LDT) is essential to provide patients with chronic kidney disease (CKD) a superior quality of life and improve their lifespan. Recent investigations prove that the living donors (LD) have a risk of developing CKD, without there being a way to anticipate it. The zero-time biopsies provide valuable information that may contribute to this objective since they report histopathologic findings of subclinical chronic damage. Methods: Retrospective, observational and analytical study. The information from the medical files and pathology department of LD attended at “Dr. Miguel Silva” general hospital from January 2006 to January 2018 was analyzed. The glomerular filtrate rate was obtained 24 hours and a year after nephrectomy and was estimated based on CDK-EPI. The comparison among groups was made through Mann-Whitney testing for continuous numeric. A value of p36 years, the dropping of the GFR >43%, the GFR and the creatinine levels after 24 hours of nephrectomy were associated with a reduction of the GFR the year after nephrectomy

Analysis of Sustainability of Three Pest Management Alternatives in Greenhouse Tomato in the Horticultural Belt of La Plata

El Manejo Convencional de plagas (MC) en tomate se basa en el uso de insecticidas, frecuentemente en forma indiscriminada, convirtiéndolo en poco sustentable económica, ecológica y socialmente. El Manejo Integrado de Plagas (MIP) aparece como alternativa y establece pautas como monitoreo de plagas, aplicación de niveles máximos de tolerancia (NMT) y el uso de insecticidas selectivos. El Manejo Orgánico (MO) incluye el control de plagas a través de preparados caseros (purines) y del aumento de diversidad vegetal que provee alimento y refugio para la fauna benéfica. Se comparó la sustentabilidad de estas tres alternativas de manejo sanitario en tomate bajo cubierta para sus dos principales plagas: 1) Tuta absoluta (Lepidoptera: Gelechiidae) y 2) Trialeurodes vaporariorum (Hemiptera: Aleyrodidae). El estudio se realizó en tres fincas durante dos campañas consecutivas. El mayor valor de sustentabilidad se encontró en el MO, seguido por el MIP, debido a que ambos presentaron un menor número de puntos críticos en las diferentes dimensiones (ecológica, económica, socio-cultural y técnica-productiva). El MC resultó ser no sustentable. El MIP sería el manejo más apropiado para el tomate bajo cubierta en el CHP porque: 1) actualmente se aplica en la región, 2) es más compatible con los principios agroecológicos, y 3) su implementación a mayor escala espacio-temporal conllevaría a un serie de beneficios (reducción de la contaminación ambiental, la mejora en las condiciones laborales, y la compatibilización con otras técnicas de control).Tomato pests in greenhouses are conventionally controlled by means of insecticides (referred herein as CM), which are frequently used indiscriminately, making the crop economically, ecologically and socially non-sustainable. Integrated Pest Management (IPM) provides alternative techniques different from the exclusive use of pesticides to cope with sanitary problems in crops. For the Horticultural Belt surrounding La Plata City (CHP), an Integrated Pest Control Management Protocol is being under implementation, and includes guidelines for producers (pest monitoring, use of maximum tolerance levels (MTL) and selective insecticides. Organic Management (OM) is also applied at a lesser extent in protected tomato in the region, and includes pest control through home-made preparations (“purines”), plant diversification that provides food and refuge for beneficial fauna (predators, parasitoids and pollinators), among others. In this contribution, the sustainability of three pest management alternatives in greenhouse tomato in the CHP, for: 1) Tuta absoluta (Lepidoptera: Gelechiidae) and 2) Trialeurodes vaporariorum (Hemiptera: Aleyrodidae) were analyzed. The study was carried out in three commercial farms in CHP during two consecutive production years. Sustainability analyses show that OM greenhouses, followed by IPM crops, had the higher sustainability values of the ecological, economical, social-cultural and technical-productive dimensions considered in this study, since both had the lesser number of critical points. CM crops were significantly non sustainable. To conclude, IPM is proposed as a proper pest management to carry out in greenhouse tomato in the CHP, because: 1) it is being applied in the region, 2) it is more compatible with agro-ecological principles, and 3) its implementation to larger space and temporal scales would imply a series of benefits (reduction of environmental contamination, improvement in rural work conditions, and its compatibility with another pest control techniques).Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Analysis of Sustainability of Three Pest Management Alternatives in Greenhouse Tomato in the Horticultural Belt of La Plata

El Manejo Convencional de plagas (MC) en tomate se basa en el uso de insecticidas, frecuentemente en forma indiscriminada, convirtiéndolo en poco sustentable económica, ecológica y socialmente. El Manejo Integrado de Plagas (MIP) aparece como alternativa y establece pautas como monitoreo de plagas, aplicación de niveles máximos de tolerancia (NMT) y el uso de insecticidas selectivos. El Manejo Orgánico (MO) incluye el control de plagas a través de preparados caseros (purines) y del aumento de diversidad vegetal que provee alimento y refugio para la fauna benéfica. Se comparó la sustentabilidad de estas tres alternativas de manejo sanitario en tomate bajo cubierta para sus dos principales plagas: 1) Tuta absoluta (Lepidoptera: Gelechiidae) y 2) Trialeurodes vaporariorum (Hemiptera: Aleyrodidae). El estudio se realizó en tres fincas durante dos campañas consecutivas. El mayor valor de sustentabilidad se encontró en el MO, seguido por el MIP, debido a que ambos presentaron un menor número de puntos críticos en las diferentes dimensiones (ecológica, económica, socio-cultural y técnica-productiva). El MC resultó ser no sustentable. El MIP sería el manejo más apropiado para el tomate bajo cubierta en el CHP porque: 1) actualmente se aplica en la región, 2) es más compatible con los principios agroecológicos, y 3) su implementación a mayor escala espacio-temporal conllevaría a un serie de beneficios (reducción de la contaminación ambiental, la mejora en las condiciones laborales, y la compatibilización con otras técnicas de control).Tomato pests in greenhouses are conventionally controlled by means of insecticides (referred herein as CM), which are frequently used indiscriminately, making the crop economically, ecologically and socially non-sustainable. Integrated Pest Management (IPM) provides alternative techniques different from the exclusive use of pesticides to cope with sanitary problems in crops. For the Horticultural Belt surrounding La Plata City (CHP), an Integrated Pest Control Management Protocol is being under implementation, and includes guidelines for producers (pest monitoring, use of maximum tolerance levels (MTL) and selective insecticides. Organic Management (OM) is also applied at a lesser extent in protected tomato in the region, and includes pest control through home-made preparations (“purines”), plant diversification that provides food and refuge for beneficial fauna (predators, parasitoids and pollinators), among others. In this contribution, the sustainability of three pest management alternatives in greenhouse tomato in the CHP, for: 1) Tuta absoluta (Lepidoptera: Gelechiidae) and 2) Trialeurodes vaporariorum (Hemiptera: Aleyrodidae) were analyzed. The study was carried out in three commercial farms in CHP during two consecutive production years. Sustainability analyses show that OM greenhouses, followed by IPM crops, had the higher sustainability values of the ecological, economical, social-cultural and technical-productive dimensions considered in this study, since both had the lesser number of critical points. CM crops were significantly non sustainable. To conclude, IPM is proposed as a proper pest management to carry out in greenhouse tomato in the CHP, because: 1) it is being applied in the region, 2) it is more compatible with agro-ecological principles, and 3) its implementation to larger space and temporal scales would imply a series of benefits (reduction of environmental contamination, improvement in rural work conditions, and its compatibility with another pest control techniques).Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

EL COMPLEJO ENTÉRICO NEONATAL EN ALPACAS ANDINAS.

Advances in research on the major causative agents of morbidity and mortality in newborn alpacas associated with enteric processes in southern Peru were reviewed. Microbiology and molecular analyses performed on intestinal samples from enterotoxemia fatalities confirmed the predominance of C. perfringens type A carrying only the gene coding for the major α exotoxin and identifiying for the first time the presence of the novel β2 toxin gene. In vitro studies have yielded three profiles for phospholipase activity (high, medium and low) with biological activity when high and medium strains were inoculated intraintestinally in mice and rabbits, but did not induce intestinal pathology in an alpaca cria. A detailed histopathological investigation has reveled that within necrotizing hemorrhagic enteritis Clostridium coexist with massive presence of Eimeria macusaniensis suggesting that primary parasite tissue destruction may well predispose overgrowth of clostridium and toxin production, triggering enteric fatalities. Additionally, studies on diarrheas intestinal swabs and/or intestinal contents identified Escherichia coli pathogenic strains (enteropathogenic and enterohemorrhagic). The immunofluorescent direct test and PCR revealed the presence of Giardia intestinalis coexisting with mostly enteropathogenic and enterohemorrhagic E. coli strains, as well as with a virus similar to bovine coronavirus. These microbes are potentially diarrheagenic pathogens and a possible infection source for Andean people.Se revisan avances de investigaciones sobre los principales agentes causales de morbilidad y mortalidad en alpacas neonatales asociadas a procesos entéricos en el sur peruano. Análisis microbiológicos confirman al Clostridium perfringens tipo A como el agente prevalente en fatalidades asociadas con enterotoxemia e identifican por primera vez la presencia del gen secundario β2. El análisis in vitro argumenta la existencia de cepas con tres perfiles en la actividad fosfolipídica (alta, mediana y baja), mostrando que las cepas de medianas y altas producciones fueron capaces de producir lesiones intestinales en conejos pero incapaces de producir similares lesiones en crías de alpacas. Estudios histopatológicos revelan la coexistencia de Clostridium y E. macusaniensis en lesiones de enteritis hemorrágica en muestras intestinales de crías muertas por enterotoxemia, sugiriendo a las infecciones coccidiales como posibles agentes desencadenantes de fatalidades conocidas como enterotoxemia. Por otro lado, estudios realizados en hisopados clínicos o contenidos intestinales han identificado molecularmente cepas de E. coli patogénicas (enteropatogénicas y enterohemorrágicas). Adicionalmente, en casos clínicos de diarreas neonatales, mediante inmunofluorescencia directa y PCR, se ha detectado Giardia intestinalis coexistiendo con cepas de E. coli enteropatogénicas, así como un coronavirus similar al virus bovino. Estos patógenos son potenciales causantes de procesos diarreicos en animales incluyendo a poblaciones humanas

Detección molecular del virus del distemper canino en casos clínicos de caninos domésticos no vacunados y evaluación de factores de riesgo

The canine distemper (CD) is a viral infection caused by a Morbillivirus of the family Paramyxoviridae. It can generate digestive, respiratory, and nervous symptomatology, depending on the infecting strain. This study was designed to detect the CD virus through the RT-PCR technique and perform the analysis of the data collected to have a current view of the behavior of this virus in Lima, Peru. Whole blood samples from 52 unvaccinated canines with clinical signs compatible with canine distemper were collected between June 2012 and January 2015. The nucleoprotein of 287 bp was successfully amplified in 32.7% (17/52) of the samples analyzed. In addition, it was found a greater detection of the virus, but not significative, in individuals that manifested systemic clinical signs (respiratory and digestive signs vs nervous) and within the age range of 1.5-4 months.El distemper canino (DC) es una infección vírica causada por un Morbilivirus de la familia Paramyxoviridae. Puede generar sintomatología digestiva, respiratoria y nerviosa, dependiendo de la cepa infectante. Este estudio estuvo destinado a detectar el virus del DC a través de la técnica de RT-PCR y analizar los datos recolectados para tener una visión actual del comportamiento de este virus en la zona de Lima, Perú. Se trabajó con muestras de sangre entera recolectadas entre junio de 2012 y enero de 2015 de 52 caninos no vacunados con signos clínicos compatibles con distemper canino. Se logró amplificar la nucleoproteína de 287 pb en el 32.7% (17/52) de las muestras analizadas, encontrando, además, una mayor detección del virus, aunque no significativa, en individuos que manifestaban signos clínicos sistémicos (signos respiratorios y digestivos vs nerviosos) y dentro del rango etario de 1.5-4 meses

Efecto de la administración oral de estreptomicina en la mortalidad de cuyes inoculados con una cepa virulenta de Salmonella Typhimurium

The present study aims to obtain data that facilitate the design of an animal model that replicates salmonellosis produced by the serovar Typhimurium under experimental conditions by a single dose of streptomycin 50 mg orally 24 hours prior to the challenge with three concentrations of a virulent strain of Salmonella Typhimurium. Female guinea pigs (n=58) were used, distributed in 6 treatment groups of 8 animals each (3 groups to which streptomycin was administered prior to the challenge and 3 groups that were only challenged) and 2 control groups of 5 animals each (1 group treated with streptomycin and unchallenged and another untreated and unchallenged). The doses of the inoculum were 107, 108, 109/ml of S. Thiphimurium per group, respectively, and the animals were monitored for 30 days. Collective stool samples per group were collected to determine the excretion time of S. Typhimurium by qPCR. A necropsy was performed on the animals that died, as well as those that survived at the end of the study, taking samples of intestine, liver and lung for histopathological analysis and of intestine, lung, spleen, liver and gallbladder for microbiological isolation. Challenged animals that previously received streptomycin had a higher mortality rate and frequency of macroscopic and microscopic lesions, lower feed consumption, lower final weight, as well as a greater amount and time of excretion of S. Typhimurium in the feces compared to the animals of the non-streptomycin treated group and challenged.El presente estudio busca obtener datos que faciliten el diseño de un modelo animal que replique la salmonelosis producida por el serovar Typhimurium en condiciones experimentales mediante el uso de una dosis única de estreptomicina de 50 mg por vía oral 24 horas previos al desafío con tres concentraciones de una cepa virulenta de Salmonella Typhimurium. Se utilizaron 58 cuyes hembras, distribuidas en 6 tratamientos de 8 animales cada uno (3 grupos a los cuales se les administró estreptomicina previo al desafío y 3 grupos que solo fueron desafiados) y 2 grupos de control de 5 animales cada uno (1 grupo tratado con estreptomicina y no desafiados y otro grupo no tratado ni desafiado). Las dosis del inóculo fueron de 107, 108, 109/ml de S. Thiphimurium por grupo, respectivamente, y se hizo el monitoreo de los animales por 30 días. Se recolectaron muestras de heces colectivas por grupo para determinar el tiempo de excreción de S. Typhimurium por qPCR. Se hizo la necropsia a los animales muertos durante esta fase, así como a los que sobrevivieron al final del estudio, tomándose muestras de intestino, hígado y pulmón para análisis histopatológico y de intestino, pulmón, bazo, hígado y vesícula biliar para aislamiento microbiológico. Se observó en los animales desafiados que recibieron previamente estreptomicina una mayor tasa de mortalidad y frecuencia de lesiones macroscópicas y microscópicas, menor consumo de alimento, menor peso final, así como una mayor cantidad y tiempo de excreción de S. Typhimurium por las heces en comparación a los animales del grupo no tratado con estreptomicina y desafiados

Genotypification, in vitro toxigenic evaluation, and antibiotic sensitivity of Escherichia coli strains isolated from diarrheic and fatal cases in neonatal alpacas

Se analizaron 27 hisopos diarreicos rectales y 24 contenidos patológicos del intestino de 51 alpacas de 1 a 7 semanas de edad para aislar y genotificar Escherichia coli, y caracterizar su sensibilidad antimicrobiana. Los aislamientos de E. coli fueron genotipificados por PCR múltiple para detectar genes de virulencia: stx1 y stx2 (shigatoxina 1 y 2), eae (intimina) y bfp (Bundle-Forming Pili), lt (toxina termolábil), sta y stb (toxina termoestable A y B), presentes en E. coli enterohemorrágica (EHEC), enteropatógena (EPEC) y enterotoxigénica (ETEC). Paralelamente, cepas positivas a stx1 o stx2 fueron analizadas en células Vero para detectar efectos verocitotóxicos. Posteriormente, todas las cepas aisladas fueron evaluadas para determinar su sensibilidad antimicrobiana a ocho antibióticos frecuentemente utilizados en ganaderías alpaqueras altoandinas. Los análisis microbiológicos y moleculares determinaron aislamientos de E. coli potencialmente patógenas en 19/27 (70.4%) de los hisopados clínicos y en 11/24 (45.8%) de los contenidos analizados. En crías padeciendo diarreas clínicas, se identificaron 18/19 (94.7%) cepas EPEC y la restante EHEC positiva al gen stx2 de baja actividad verocitotóxica (1:16). Once de las cepas EPEC contenían ambos genes eae y bfp y las siete restantes solamente el gen eae. De las crías muertas con antecedentes diarreicos, en 6/11 (54.5%) se aislaron cepas EPEC positivos al gen eae, mientras que las cinco restantes (45.5%) fueron EHEC. Tres de las 5 EHEC tenían el gen stx1 (dos con alta actividad verocitotóxica), la cuarta presentó el gen stx2 expresando alta actividad verocitotóxica, pero en el quinto aislado, positivo a ambos genes stx1 y stx2, no pudo evaluarse la actividad verocitotóxica. El 80% del total de E. coli (patogénicas y no patogénicas) aisladas en el estudio demostraron resistencia a la neomicina, y el 25% a la oxitetraciclina. Los resultados evidencian que las alpacas albergan cepas de E. coli potencialmente patógenas y probablemente causantes de patologías intestinales en crías de alpacas andinas.Clinical rectal diarrheic swabs (n=27) and pathological intestinal contents (n=24) from 51 alpacas between 1 to 7 weeks of age were used to isolate and genotype Escherichia coli, and to test for antimicrobial sensibility. All the E. coli isolates, confirmed by the API system, were genotyped by Multiplex PCR to determine the presence of virulence genes: stx1 and stx2 (shigatoxin 1 and 2), eae (intimin), bfp (Bundle-Forming Pili), lt (heat-labile toxin), sta and stb (heat-stable toxin A and B), in enterohemorrhagic (EHEC), enteropathogenic (EPEC) or enterotoxigenic (ETEC) E. coli strains. Positive stx1 and stx2 strains were tested on Vero cells for verocytotoxicity, and all isolates were tested for antimicrobial sensibility to the eight most frequent used antibiotics in Andean livestock. Microbiological and molecular analysis revealed the presence of pathogenic E. coli strains in 19/27 (70.4%) of the clinical diarrhea cases and 11/24 (45.8%) of the pathological intestinal content samples. In crias suffering from diarrhea, 94.7% (18/19) of the pathogenic isolates were EPEC strains while the remaining was stx2 EHEC with a low expression of verocytoxic activity (1:16). Eleven of the 18 EPEC were positive for both eae and bfp, while the remaining seven were eae positive only. Six of the 11 (54.5%) isolates from intestinal contents were EPEC eae positive only, while the remaining five (45.5%) were EHEC isolates. Three of the 5 EHEC isolates tested positive to stx1 with two expressing high verocytotoxicity, while the fourth tested positive for stx2 with similar high expression of verocytotoxicity, and the fifth was positive for both stx1 and stx2 genes but could not be evaluated the verocytotoxicity. Eighty percent of the pathogenic and non-pathogenic E. coli strains showed resistance to neomycin, and 25% to oxytetracycline. These results indicate that alpacas harbor potentially pathogenic E. coli strains that might cause clinical and fatal intestinal disorders in young animals

Análisis de Diversidad Genética de Cepas de Pasteurella multocida Aisladas de Alpacas con Signos de Neumonía

The purpose of this study was to characterize strains of Pasteurella multocida isolated from lungs of 1-2 months old alpacas with signs of pneumonia, collected in 2014. The BOX-PCR technique was used to demonstrate genetic diversity among strains. Twenty-four strains of P. multocida were isolated from 46 animals through biochemical identification tests. The BOX-PCR analysis showed two amplified band patterns, where 22 strains were grouped in one cluster and two strains in another cluster. The present study showed genetic homogeneity in most of the strains, evidencing a common source of infection that affected the animals.El propósito del estudio fue caracterizar cepas de Pasteurella multocida aisladas de pulmones de alpacas de 1 a 2 meses de edad con signos de neumonía, colectados en 2014. Se utilizó la técnica de BOX-PCR para demostrar la diversidad genética entre las cepas. Se aislaron 24 cepas de P. multocida de 46 animales mediante identificación bioquímica. El análisis por BOX-PCR demostró dos patrones de bandas amplificadas, donde 22 cepas fueron agrupadas en un clúster y dos cepas en otro clúster. El presente estudio demostró una homogeneidad genética en la mayoría de las cepas, evidenciando una fuente común de infección que afectó a los animales