Mendelian Randomization Analysis of the Relationship Between Native American Ancestry and Gallbladder Cancer Risk

Background A strong association between the proportion of Native American ancestry and the risk of gallbladder cancer (GBC) has been reported in observational studies. Chileans show the highest incidence of GBC worldwide, and the Mapuche are the largest Native American people in Chile. We set out to investigate the causal association between Native American Mapuche ancestry and GBC risk, and the possible mediating effects of gallstone disease and body mass index (BMI) on this association. Methods Markers of Mapuche ancestry were selected based on the informativeness for assignment measure and then used as instrumental variables in two-sample mendelian randomization (MR) analyses and complementary sensitivity analyses. Result We found evidence of a causal effect of Mapuche ancestry on GBC risk (inverse variance-weighted (IVW) risk increase of 0.8% for every 1% increase in Mapuche ancestry proportion, 95% CI 0.4% to 1.2%, p = 6.6×10-5). Mapuche ancestry was also causally linked to gallstone disease (IVW risk increase of 3.6% per 1% increase in Mapuche proportion, 95% CI 3.1% to 4.0%, p = 1.0×10-59), suggesting a mediating effect of gallstones in the relationship between Mapuche ancestry and GBC. In contrast, the proportion of Mapuche ancestry showed a negative causal effect on BMI (IVW estimate -0.006 kg/m2 per 1% increase in Mapuche proportion, 95% CI -0.009 to -0.003, p = 4.4×10-5). Conclusions The results presented here may have significant implications for GBC prevention and are important for future admixture mapping studies. Given that the association between Mapuche ancestry and GBC risk previously noted in observational studies appears to be causal, primary and secondary prevention strategies that take into account the individual proportion of Mapuche ancestry could be particularly efficient

Revista de Vertebrados de la Estación Biológica de Doñana

Página 298 con error de impresiónEstudio cariológico en dos especies de Serránidos del Mediterráneo (Peces: PerciformesRelaciones morfométricas de Atherina boyeri Risso (Pisces: Atherinidae) de la laguna de Zoñar (Córdoba, España)Contribución al conocimiento de la biometríay osteología de Barbus barbus bocagei, Steindachner, 1866 (Pisces: CyprinidaeLa actividad de la salamandra, Salamandra salamandra (L.), en Galicia.Estudios sobre el sapo corredor (Bufo calamita) en el Sur de España.1. BiometríaEstudios sobre el sapo corredor (Bufo calamita) en el Sur de España. II. AlimentaciónBiología de la reproducción de Rana iberica Boulenger 1879 en zonas simpátridas con Rana temporaria Linneo, 1758Nuevos datos sobre la distribución geográfica de Lacerta monticola cantabrica Mertens, 1929. (Sauria, lacertidae).Datos sobre Lacerta monticola Boulenger, 1905 (Saurio: lacertidae)en el oeste del Sistema Central.Nueva especie de Anolis (lacertilia, Iguanidae) para CubaEtograma cuantificado del cortejo en Falco naumannOntogénesis del comportamiento predador en Falco naumanniContaminación xenobiótica del Parque Nacional de Doñana. 1. Residuos de insecticidas organoclorados, bifenilos policlorados y mercurio en anseriformes y gruiformesReproducción del críalo (Clamator glandarius) en Sierra Morena CentraNidificación de Picus viridis en taludes de arcilla en Ramblas de Guadix (Granada)Comportamiento del calamón Porphyrio porphyrio (Linnaeus, 1758) en Doñana, Marismas del GuadalquiviBiología y ecología de la malvasía (Oxyura leucocephala) en Andalucía.On the differential diet of Carnivora in islands:a method for analysing it and a particular case.Notas sobre la distribución pasada y actual del meloncillo Herpestes ichneumon (L.) en la Península IbéricaEstructuración de las interacciones en una camada de lobos (Canís lupus)Nuevos datos sobre la distribución del Cottus gobio L. (pisces, cottidae) en EspañaSobre la alimentación de Callopistes maculatus (Reptilia,teiidaeObservación de Lacerta lepida depredando un nido de Alectoris rufaNueva cita del galápago leproso Mauremys leprosa (Scheigger, 1812) en los pirineosPrimera cita de Psammodromus hispanicus (Fitzinger) para GaliciaSobre la presencia de Gallotia (=Lacerta) atlantica (Peters y Doria, 1882) en Gran CanariaNota sobre las Lacerta monticola Boulenger, 1905 de las zonas del norte de GaliciaPrimeras notas herpetológicas de la provincia de Soria.Datos sobre selección de hábitat y ecología alimenticia del porrón pardo (Aythya nyroca)Probable nueva área de cría del pechiazul (Luscinia svecica cyanecula) en el sistema central. PerisPredación de Falco peregrinus y Falco subbuteo sobre quirópterosResultados de la producción de Oxyura leucocephala en el año 1981 en las lagunas de Zóñar y el rincónAnálisis de la dieta de Tyto alba en un medio árido antropógeno de los alrededores de Almería¿Son Eudocimus ruber y E. albus distintas especies?EL Estornino pinto (Sturnus vulgaris) en Canarias: nueva especie nidifiante en el archipiélagoDatos sobre la alimentación otoñal del cárabo (Strix aluco) en la sierra de CádizObservación primaveral de rapaces y otras aves en el páramo del estado de Mérida (Venezuela).Murciélago hematófago (Desmodus rotundus) parasitando a un chigüire (Hidrochoerus hydrochaeris)Observaciones sobre la reproducción del zacatuche o teporinho Romerolagus diazi (Mammalia: lagomorpha)Estudio electroforético de hemoglobinas y esterasas sanguíneas en Rhinolophus ferrumequinum (Chiroptera: rhinolophidae) y de hemoglobinas en Tadaria taeniotis (chiroptera: molossidae)Peer reviewe

International nosocomial infection control consortium (INICC) report, data summary of 36 countries, for 2004-2009

The results of a surveillance study conducted by the International Nosocomial Infection Control Consortium (INICC) from January 2004 through December 2009 in 422 intensive care units (ICUs) of 36 countries in Latin America, Asia, Africa, and Europe are reported. During the 6-year study period, using Centers for Disease Control and Prevention (CDC) National Healthcare Safety Network (NHSN; formerly the National Nosocomial Infection Surveillance system [NNIS]) definitions for device-associated health care-associated infections, we gathered prospective data from 313,008 patients hospitalized in the consortium's ICUs for an aggregate of 2,194,897 ICU bed-days. Despite the fact that the use of devices in the developing countries' ICUs was remarkably similar to that reported in US ICUs in the CDC's NHSN, rates of device-associated nosocomial infection were significantly higher in the ICUs of the INICC hospitals; the pooled rate of central line-associated bloodstream infection in the INICC ICUs of 6.8 per 1,000 central line-days was more than 3-fold higher than the 2.0 per 1,000 central line-days reported in comparable US ICUs. The overall rate of ventilator-associated pneumonia also was far higher (15.8 vs 3.3 per 1,000 ventilator-days), as was the rate of catheter-associated urinary tract infection (6.3 vs. 3.3 per 1,000 catheter-days). Notably, the frequencies of resistance of Pseudomonas aeruginosa isolates to imipenem (47.2% vs 23.0%), Klebsiella pneumoniae isolates to ceftazidime (76.3% vs 27.1%), Escherichia coli isolates to ceftazidime (66.7% vs 8.1%), Staphylococcus aureus isolates to methicillin (84.4% vs 56.8%), were also higher in the consortium's ICUs, and the crude unadjusted excess mortalities of device-related infections ranged from 7.3% (for catheter-associated urinary tract infection) to 15.2% (for ventilator-associated pneumonia). Copyright © 2012 by the Association for Professionals in Infection Control and Epidemiology, Inc. Published by Elsevier Inc. All rights reserved

Identification of Circulating lncRNAs Associated with Gallbladder Cancer Risk by Tissue-Based Preselection, Cis-eQTL Validation, and Analysis of Association with Genotype-Based Expression

Long noncoding RNAs (lncRNAs) play key roles in cell processes and are good candidates for cancer risk prediction. Few studies have investigated the association between individual genotypes and lncRNA expression. Here we integrate three separate datasets with information on lncRNA expression only, both lncRNA expression and genotype, and genotype information only to identify circulating lncRNAs associated with the risk of gallbladder cancer (GBC) using robust linear and logistic regression techniques. In the first dataset, we preselect lncRNAs based on expression changes along the sequence "gallstones → dysplasia → GBC". In the second dataset, we validate associations between genetic variants and serum expression levels of the preselected lncRNAs (cis-lncRNA-eQTLs) and build lncRNA expression prediction models. In the third dataset, we predict serum lncRNA expression based on individual genotypes and assess the association between genotype-based expression and GBC risk. AC084082.3 and LINC00662 showed increasing expression levels (p-value = 0.009), while C22orf34 expression decreased in the sequence from gallstones to GBC (p-value = 0.04). We identified and validated two cis-LINC00662-eQTLs (r2 = 0.26) and three cis-C22orf34-eQTLs (r2 = 0.24). Only LINC00662 showed a genotyped-based serum expression associated with GBC risk (OR = 1.25 per log2 expression unit, 95% CI 1.04-1.52, p-value = 0.02). Our results suggest that preselection of lncRNAs based on tissue samples and exploitation of cis-lncRNA-eQTLs may facilitate the identification of circulating noncoding RNAs linked to cancer risk

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 48 Número 5-12

A comparative study of the effect of soil boron on yield, yield attributes and nutrient uptake by susceptible and tolerant varieties of wheat. Por B. R. Chhipa and P. Lal.-- Suelos y vegetación de las Peñas de Aya (Navarra y Guipúzcoa. Por J. Peralta, J. Íñiguez y J. C. Bascones.-- Presencia de horizonte plácico en Ñadis (Placaquands) y Trumaos (Placudands) en el sur de Chile. Por W. Luzio, C. Barros, M. Aroncibia y S. Alcayaga.-- Retención de 0,0-Dimetil, S-(Z, Metilamino- 2, Oxoetil -Ditiofosfato (Dimetoato) por Vermiculitas homoionicas. l.-cinética del proceso. Por C. Valenzuela Calahorro, A. García Rodríguez y A. Bernalte García.-- Estudio edafogenético en suelo~ de Rañas. Distribución de hierro y aluminio. Por Mª P. García Rodr(guez, J. Forteza Bonnin, y L. F. Lorenzo Martín.-- Water retention equations and their relationship with particle size distribution and bulk density for undisturbed samples. Por A. Andriulo, N. Amiotti y C. Pecorari.-- Evolución regresiva de diversos parámetros edáficos en agroecosistemas (Cafetales, cañaverales) derivados del bosque mesófilo de montaña (México). Por N. García Calderón, F. Velasco y N. Aguilera.-- Micronutrients distribution in grown soils (Fe and Zn) prediction equations of contenta. Por A. Ruiz-Nieto, E. Barahona, S. Jaime, F. Huertas, A. Aguilar and J. Linares.-- Contenido de azufre total en muestras superficiales de suelos de la provincia de la Coruña. Por A. Merino García, C. Monterroso Martínez y E. García -Rodeja G.-- Aspectos termodinámicos de la adsorción de Clorprofan por suelos. Por G. Dios Cancela, J. A. Guillén Alfara y S. González García.-- Consideraciones acerca de las interralaciones entre suelos. Vegetación y paleoprocesos morfogenéticos en el Macizo de Ayllón y la Sierra de Alto Rey (Sector oriental del Sistema Central). Por J. J. Ibáñez Martín, F. Fernández González y A. García Alvarez.--Composición Geoquímica de unas ferricretas en el entorno de un monte isla de Ciudad Real. Por R. Jiménez Ballesta, A. M. Alvarez González, A. Gutiérrez Maroto y E. Redondo.--Relación entre algunas propiedades físico-químicas y las fracciones de fósforo en suelos naturales de Galicia (NW España). Por Mª C. Trasar Cepeda, F. Gil Sotres y F. Guitián Ojea.-- Respuesta del cultivo de tomate en enarenado y condiciones salinas a diferentes programas de fertilización fosfórica. Por M. J. Sarro, A. Saa, C. Cadahía y A. Masaguer.-- Distribución del fósforo en perfiles de suelos de Galicia (NW Spain). Por M. a C. Trasar Cepeda, F. Gil Sotres y F. Guitián Ojea.-- Influencia de la dilución en la desorción de cationes en Andosoles y suelos ándicos. Por C. D. Arbelo, J. E. García-Hernández y J. M. Hernández Moreno.-- Las marismas del Guadalquivir, reserva biogenética de plantas tolerantes a la salinidad. Por T. Marañón, L. V. García, J. M. Murillo y L. Clemente.-- Efectos del Abonado N/K sobre el contenido, interacciones y evolución del N, K, Ca y Mg en varias etapas del desarrollo de la patata. Por M. J. Lema Gesto y A. M. Cortizas.-- Estabilidad estructural de suelos afectados por sales: Revisión bibliográfica. Por E. Amezketa y R. Aragües.-- Descomposición de rastrojo de trigo, respiracion y biomasa microbiana bajo labranza convencional y siembra directa. Por O. J. Santanatoglia, R. Alvarez, P. E. Daniel, G. M. Brazzola y R. García.-- Factores formadores y características generales de los Luvisoles desarrollados sobre materiales calizos y su distribución en la provincia de Valencia. Por Mª D. Soriano Soto.-- Propiedades de intercambio iónico en tobas sálicas pumíticas del sur de la Isla de Tenerife. Por J. E. García Hernández, J. S. Notario del Pino y M. González Martín.-- Las reacciones lentas del fósforo en suelos gallegos: III. Experiencias de incubación: b) Comparación de las técnicas Bray II, Olsen y electroultrafiltración (EUF) para reflejar las variaciones con el tiempo en la extracción de fósforo. Por E. de Blas Varela, F. Gil Sotres y F. Guitián.-- Crecimiento y producción de genotipos procedentes de Haploides de Nicotiana tabacum L. seleccionados en cámara de bajo contenido en C02. Por E. Delgado y H. Medrano.-- Características foliares de genotipos de Nicotiana tabacum L. obtenidos a partir de Haploides seleccionados por supervivencia a bajas concentraciones de C02. Por E. Delgado y H. Medrano.-- Efecto de las poliaminas sobre la actividad fosfatasa ácida y ribonucleasa soluble en semillas de Garbanzo (Cicerarietinum L.). Por E. Merlo, T. Angosto y A. J. Matilla.-- Efectos de la 6-Bencil- aminopurina y el ácido Indol-3-Butfrico en cultivos in vitro de explantos de Hipocotilo-Epicotilo de Pinus canariensis Chr. Sm. ex DC. Por J. F. Pérez Francés, A. Bueno Marrero, V. M. García Díaz y R. Martín.-- Factores abióticos definitorios del área ocupada por Cytisus multiflorus (L 'Her) Sweet en España. Por E. V. Martínez Ropero, J. M. Gómez Gutiérrez y P. Galindo Villardon.-- Índice de satisfacción de los requerimientos hídricos de los cereales de invierno para una región marginal de secano. Por J. D. Paoloni.-- Effect of qualities of irrigation water and NPK fertilizars on grain and straw yield of wheat. Por R. Lal and P.Lal.-- Efecto de la concentración y tipo de agente solidificante del medio de cultivo en la vitrificación de brotes adventicios de Pinus canariensis. Por C. Martínez Pulido.-- Evolución de constituyentes químicos y de la emisión de etileno durante el desarrollo y maduración del albaricoque (Prunus armemízca, L. cv. Búlida). Por A. Amaros, M. Serrano, F. Riquelme y F. Romojaro.-- Cambio varietal en melocotoneros improductivos. Por J. Egea CaballeroPeer reviewe

A synthesis of radial growth patterns preceding tree mortality

Altres ajuts: this study generated from the COST Action STReESS (FP1106) financially supported by the EU Framework Programme for Research and Innovation HORIZON 2020. And the EU Project FEDER 0087 TRANSHABITAT and LIFE12 ENV/FI/000409Tree mortality is a key factor influencing forest functions and dynamics, but our understanding of the mechanisms leading to mortality and the associated changes in tree growth rates are still limited. We compiled a new pan-continental tree-ring width database from sites where both dead and living trees were sampled (2970 dead and 4224 living trees from 190 sites, including 36 species), and compared early and recent growth rates between trees that died and those that survived a given mortality event. We observed a decrease in radial growth before death in ca. 84% of the mortality events. The extent and duration of these reductions were highly variable (1-100 years in 96% of events) due to the complex interactions among study species and the source(s) of mortality. Strong and long-lasting declines were found for gymnosperms, shade- and drought-tolerant species, and trees that died from competition. Angiosperms and trees that died due to biotic attacks (especially bark-beetles) typically showed relatively small and short-term growth reductions. Our analysis did not highlight any universal trade-off between early growth and tree longevity within a species, although this result may also reflect high variability in sampling design among sites. The intersite and interspecific variability in growth patterns before mortality provides valuable information on the nature of the mortality process, which is consistent with our understanding of the physiological mechanisms leading to mortality. Abrupt changes in growth immediately before death can be associated with generalized hydraulic failure and/or bark-beetle attack, while long-term decrease in growth may be associated with a gradual decline in hydraulic performance coupled with depletion in carbon reserves. Our results imply that growth-based mortality algorithms may be a powerful tool for predicting gymnosperm mortality induced by chronic stress, but not necessarily so for angiosperms and in case of intense drought or bark-beetle outbreaks