Interconversion between active and inactive TATA-binding protein transcription complexes in the mouse genome

The TATA binding protein (TBP) plays a pivotal role in RNA polymerase II (Pol II) transcription through incorporation into the TFIID and B-TFIID complexes. The role of mammalian B-TFIID composed of TBP and B-TAF1 is poorly understood. Using a complementation system in genetically modified mouse cells where endogenous TBP can be conditionally inactivated and replaced by exogenous mutant TBP coupled to tandem affinity purification and mass spectrometry, we identify two TBP mutations, R188E and K243E, that disrupt the TBP–BTAF1 interaction and B-TFIID complex formation. Transcriptome and ChIP-seq analyses show that loss of B-TFIID does not generally alter gene expression or genomic distribution of TBP, but positively or negatively affects TBP and/or Pol II recruitment to a subset of promoters. We identify promoters where wild-type TBP assembles a partial inactive preinitiation complex comprising B-TFIID, TFIIB and Mediator complex, but lacking TFIID, TFIIE and Pol II. Exchange of B-TFIID in wild-type cells for TFIID in R188E and K243E mutant cells at these primed promoters completes preinitiation complex formation and recruits Pol II to activate their expression. We propose a novel regulatory mechanism involving formation of a partial preinitiation complex comprising B-TFIID that primes the promoter for productive preinitiation complex formation in mammalian cells

Formation continue et parcours professionnels : entre aspirations des salariés et contexte de l’entreprise

« Levier déterminant de la compétitivité des entreprises », « élément structurant de la sécurisation des parcours des personnes », instrument de « liberté de choisir son avenir professionnel », la formation continue est érigée en solution privilégiée pour le marché du travail. Les enjeux de la crise ouverte par la pandémie du Covid 19 pourraient bien aussi se décliner en termes de formation continue, notamment autour des besoins de reconversion. Pourtant, concilier les besoins des entreprises avec les aspirations professionnelles des personnes ne va pas de soi. Les travaux présentés dans cet ouvrage collectif, réalisés dans le cadre du premier groupe d’exploitation du Dispositif d’enquêtes couplées sur les formations et les itinéraires des salariés (Defis), éclairent, chacun à sa façon et sous des angles variés, les multiples enjeux de la formation continue. Ils questionnent la formation des salariés en lien avec leurs aspirations et les parcours professionnels. Ils tentent également de mieux comprendre la manière dont les différentes configurations productives et le contexte des entreprises peuvent influencer leurs pratiques de formation, de recrutement et autres modes d’acquisition des compétences. Conçu comme un lieu d’échanges et de dialogue pluridisciplinaire autour des données Defis, le groupe d’exploitation a réuni des chercheurs issus du Céreq, des universités ou laboratoires CNRS et autres organismes publics. Leurs appartenances disciplinaires sont variées (économie, sociologie, gestion, sciences de l’éducation) et les méthodologies mobilisées associent parfois une approche qualitative à l’analyse des données quantitatives

BMJ Med

OBJECTIVE: To evaluate the efficacy of covid-19 convalescent plasma to treat patients admitted to hospital for moderate covid-19 disease with or without underlying immunodeficiency (CORIPLASM trial). DESIGN: Open label, randomised clinical trial. SETTING: CORIMUNO-19 cohort (publicly supported platform of open label, randomised controlled trials of immune modulatory drugs in patients admitted to hospital with moderate or severe covid-19 disease) based on 19 university and general hospitals across France, from 16 April 2020 to 21 April 2021. PARTICIPANTS: 120 adults (n=60 in the covid-19 convalescent plasma group, n=60 in the usual care group) admitted to hospital with a positive SARS-CoV2 test result, duration of symptoms 40. MAIN OUTCOME MEASURES: Primary outcomes were proportion of patients with a WHO Clinical Progression Scale score of ≥6 on the 10 point scale on day 4 (higher values indicate a worse outcome), and survival without assisted ventilation or additional immunomodulatory treatment by day 14. Secondary outcomes were changes in WHO Clinical Progression Scale scores, overall survival, time to discharge, and time to end of dependence on oxygen supply. Predefined subgroups analyses included immunosuppression status, duration of symptoms before randomisation, and use of steroids. RESULTS: 120 patients were recruited and assigned to covid-19 convalescent plasma (n=60) or usual care (n=60), including 22 (covid-19 convalescent plasma) and 27 (usual care) patients who were immunocompromised. 13 (22%) patients who received convalescent plasma had a WHO Clinical Progression Scale score of ≥6 at day 4 versus eight (13%) patients who received usual care (adjusted odds ratio 1.88, 95% credible interval 0.71 to 5.24). By day 14, 19 (31.6%) patients in the convalescent plasma group and 20 (33.3%) patients in the usual care group needed ventilation, additional immunomodulatory treatment, or had died. For cumulative incidence of death, three (5%) patients in the convalescent plasma group and eight (13%) in the usual care group died by day 14 (adjusted hazard ratio 0.40, 95% confidence interval 0.10 to 1.53), and seven (12%) patients in the convalescent plasma group and 12 (20%) in the usual care group by day 28 (adjusted hazard ratio 0.51, 0.20 to 1.32). In a subgroup analysis performed in patients who were immunocompromised, transfusion of covid-19 convalescent plasma was associated with mortality (hazard ratio 0.39, 95% confidence interval 0.14 to 1.10). CONCLUSIONS: In this study, covid-19 convalescent plasma did not improve early outcomes in patients with moderate covid-19 disease. The efficacy of convalescent plasma in patients who are immunocompromised should be investigated further. TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov NCT04345991

COVID-19 symptoms at hospital admission vary with age and sex: results from the ISARIC prospective multinational observational study

Background: The ISARIC prospective multinational observational study is the largest cohort of hospitalized patients with COVID-19. We present relationships of age, sex, and nationality to presenting symptoms. Methods: International, prospective observational study of 60 109 hospitalized symptomatic patients with laboratory-confirmed COVID-19 recruited from 43 countries between 30 January and 3 August 2020. Logistic regression was performed to evaluate relationships of age and sex to published COVID-19 case definitions and the most commonly reported symptoms. Results: ‘Typical’ symptoms of fever (69%), cough (68%) and shortness of breath (66%) were the most commonly reported. 92% of patients experienced at least one of these. Prevalence of typical symptoms was greatest in 30- to 60-year-olds (respectively 80, 79, 69%; at least one 95%). They were reported less frequently in children (≤ 18 years: 69, 48, 23; 85%), older adults (≥ 70 years: 61, 62, 65; 90%), and women (66, 66, 64; 90%; vs. men 71, 70, 67; 93%, each P < 0.001). The most common atypical presentations under 60 years of age were nausea and vomiting and abdominal pain, and over 60 years was confusion. Regression models showed significant differences in symptoms with sex, age and country. Interpretation: This international collaboration has allowed us to report reliable symptom data from the largest cohort of patients admitted to hospital with COVID-19. Adults over 60 and children admitted to hospital with COVID-19 are less likely to present with typical symptoms. Nausea and vomiting are common atypical presentations under 30 years. Confusion is a frequent atypical presentation of COVID-19 in adults over 60 years. Women are less likely to experience typical symptoms than men

Télémètre laser par modulation de fréquence utilisant un mélangeur optoélectronique pour la mesure de distance sur cibles non coopératives

Un télémètre laser est étudié pour effectuer des mesures de distances sans contact sur des cibles non coopératives et sur une plage de 1 à 20m environ. Le dispositif est basé sur une technique de modulation de fréquence du signal optique émis appelée technique FMCW. Une amélioration de la mesure des plus courtes distances est obtenue grâce à l'introduction d'une ligne à retard. Une autre amélioration concernant la photodétection est apportée par l'utilisation d'un mélangeur optoélectronique. Ce mélangeur optoélectronique, basé sur une photodiode à avalanche, augmente le rapport signal sur bruit et réduit la dynamique du signal photoélectrique. Nous démontrons que le rendement de conversion maximal du mélange optoélectronique atteint la valeur 0,5. Pour des applications futures de scanner ou de caméra 3D, l'étude d'un mélangeur optoélectronique à grand champ de vision est réalisée. Pour finir, nous avons conçu un démonstrateur de télémètre laser basé sur les techniques développées.TOULOUSE-ENSEEIHT (315552331) / SudocSudocFranceF

Conception d'une chaîne de traitement analogique de signaux vidéo en technologie CMOS basse tension pour applications aux instruments d'observation de la Terre

Cette thèse traite de l'intégration de chaînes vidéo pour le traitement de signaux issus de capteur CCD, dans le cadre des instruments d'observation de la Terre. L'accent est mis sur le composant central de ces chaînes, le double-échantillonnur corrélé. La solution générale retenue est l'intégration des fonctions dans des circuits intégrés spécifiques (ASIC) analogiques dans des technologies CMOS sub-microniques basse-tension. Nous proposons une nouvelle architecture de double-échantillonneur corrélé à sensibilité réduite aux injections de charges, une comparaison de structures d'amplificateurs opérationnels à utiliser à l'intérieur de cette architecture ainsi qu'une discussion sur les amplificateurs symétriques et les buffers à grande précision. Ces travaux sont validés par la réalisation d'un ASIC analogique en technologie CMOS 0.35 [mu]m (0;3.3V) occupant 200*300 [mu]m sur la puce et consommant 12 mW.This thesis is about integration of CCD signals video processing chains for earth observation instruments. Its main focus is the central part of such chains, the correlated double-sampler stage. The overall approach that has been selected is the integration of the different functions into analog application-specific integrated circuits (ASIC) using low-voltage submicronic CMOS technologies. We propose a new correlated double sampler stage architecture with reduced sensibility to charge injections, comparison of several operationnal amplifiers architecture for use in this architecture and a discussion on symetric amplifiers and high-precision buffers. Results are validated through a demo ASIC made in CMOS 0.35 [mu]m technology (0;3.3V) with a size of 200*300 [mu]m and a 12 mW consumption.TOULOUSE-ENSEEIHT (315552331) / SudocSudocFranceF

Contribution à la conception de circuits intégrés analogiques en technologie CMOS basse tension pour application aux instruments d'observation de la Terre

Le présent mémoire de thèse s'inscrit dans la problématique d'intégration de chaînes vidéo spatiales CCD dédiées aux instruments d'observation de la Terre. La solution présentée à travers cette étude consiste à concevoir des circuits intégrés spécifiques (ASIC) analogiques avec des technologies CMOS sub-microniques basse-tension, principalement développées pour les circuits numériques complexes. A partir de l'étude des chaînes vidéo, une étude approfondie est consacrée au circuit E/B car cette fonction est limitante des performances des chaînes vidéo CCD. L'étude approfondie des architectures de circuits E/B combinée à des études de conception de circuits rail-to-rail nous permet de démontrer la faisabilité de la chaîne vidéo dans ces technologies : deux démonstrateurs sont ainsi réalisés en technologie CMOS 0.6{mu]m et BiCMOS 0.35[mu]m permettant d'envisager la réalisation d'une chaîne vidéo complète 20Mechs/s - 12bits.Thesis report describes interisting solution from integration issue of CCD signal processor dedicated to next Earth observatory instrumentation. This one uses specific analogue integrated circuits (ASICs) implemented on standard tehcnology. Challenge will so be to use technologies easily available that can be seen currently low-voltage CMOS technology, first developed to complex digital circuit integrations. From signal processor study, E/B circuit is studied cause its limiting impact on the whole CCD signal processor performances. Combined to conception studies of rail-to-rail circuits it allows to demonstrate the feasibility of the whole signal processor with these technologies : two demonstrators realized in technology CMOS 0.6{mu]m and 0.35[mu]m allow to expect the realization of a 20Msamples-s - 12bits CCD signal processor.TOULOUSE-ENSEEIHT (315552331) / SudocSudocFranceF

Transportabilité de fonctions analogiques en technologies CMOS submicroniques (application)

Dans le cadre de la transportabilité de circuits, nous étudions le transfert de circuits analogiques CMOS par une approche semi-analytique. Appliquée aux fonctions amplifications élémentaires, elle consiste à représenter graphiquement les caractéristiques de circuits normalisés afin d'en déduire un premier dimensionnement suivant les performances souhaitées. Cette approche est validée par l'étude de 2 amplificateurs opérationnels. L'écart relatif du produit gain bande passante obtenu avec celui de la simulation n'excède pas +- 20 %. Un circuit mixte pour des applications spatiales générant des retards programmables de l'ordre de la nanoseconde a été transporté dans 2 technologies. La validation expérimentale de ces 2 circuits intégrés montre les contributions importantes de la dispersion des éléments passifs et de leurs capacités parasites distribuées. Ces phénomènes sont minimisés en introduisant des commutateurs analogiques et en optimisant le dimensionnement des composants passifs.TOULOUSE-ENSEEIHT (315552331) / SudocSudocFranceF

Analog Circuit Modeling Method – Sample-and-Hold Model Development

International audienc

Télémètre laser FMCW comportant une ligne à retard et une détection non linéaire

National audienc