Esimest tüüpi diabeedi kujunemises on viirusinfektsioonidel tähtis roll

Esimest tüüpi diabeet (T1D) on mitmeteguriline autoimmuunhaigus, mille kujunemises mängivad suure tõenäosusega rolli viirusinfektsioonid. Erilist tähelepanu on viimasel ajal pälvinud enteroviirusinfektsioonid, mille põdemine lapseeas on seotud pankrease saarekestevastaste autoantikehade tekkega. Enteroviiruste (EV) perekonda kuuluvad Coxsackie viirused võivad põhjustada immuunvastuse teket läbi molekulaarse mimikri või muutes Th1-rakkude vastust. Seda mehhanismi võimendab viirusinfektsioonide puhul aktiveeruv interferoonirada. Lisaks EV-le on uuritud ka teisi viiruseid. Tsütomegaloviiruse roll T1D tekkes on siiani kahtluse all, sest uuringute tulemused on vastakad. Parekhoviirus A puhul on näidatud kaitsvat efekti T1D tekkes ning parekhoviirus B on arvatavasti seotud autoantikehade tekkega, kuid samas on uuringute tulemused jäänud üksteisele vasturääkivaks. Rotaviirusinfektsioon enne 6. elukuud suurendab arvatavasti autoantikehade tekke tõenäosust. Punetisteviiruse infektsioon raseduse ajal võib põhjustada kaasasündinud punetiste sündroomi, mis suure tõenäosusega suurendab lapsel riski haigestuda T1D-sse. Siiski, vaatamata viiruste rollile haiguse vallandajana, ei ole vaktsineerimisega seni haigust ärahoidvat efekti saavutatud

Konopeptiidide klassifitseermine ja kindlakstegemine varjatud Markovi mudelite ja positsioonispetsiifiliste skoorimaatriksite abil

Väitekirja elektrooniline versioon ei sisalda publikatsioone.Konopeptiidid on soojades meredes elavate koonustigude (Conus sp.) mürgis leiduvad lühikesed valgud. Koonusteod on kiskjad ja toituvad ussikestest, teistest molluskitest või kaladest. Nad tulistavad saaki mürgiga täidetud harpuuniga, mürk muudab saaklooma liikumatuks ja tigu saab ta rahulikult tervelt alla neelata. Mürgi kiirelt uimastav ja halvav toime tuleb paljude erinevate konopeptiidide segust. Konopeptiidid sünteesitakse eellasvalkudena, millel on signaaljärjestus mürgitorusse transportimiseks ja propeptiid, mis aitab mürgipeptiidi õigesti pakkida ja mürgipeptiid. Konopeptiidid jagatakse sarnaste signaaljärjestuste alusel perekondadesse. Teadlased uurivad konopeptiide lootusega leida nende hulgast uusi ravimikandidaate. Konopeptiidid on väga spetsiifilised närvirakkudes leiduvate ioonkanalite modulaatorid ja omavad suurt potentsiaali valuvaigistite või lihastelõdvestajatena. Antud uurimistöö esimeseks eesmärgiks oli välja töötada meetod, mille abil saaks suurtest järjestuste hulkadest välja otsida ja klassifitseerida konopeptiidid. Klassifitseerimine on oluline, sest uuele valgule sarnaste valkude teadasaamine annab palju informatsiooni tema omaduste kohta. Meie valisime sarnasuse võrdlemiseks kahte tüüpi mudelid - profiil-HMM’id ja PSSM’id. Kuna signaalpeptiidid on ühe perekonna piires väga konserveerunud, siis on nende olemasolul järjestuste klassifitseerimine meie mudelitega 100% tundlik ja ka 100% spetsiifiline. pHMM’ide ja PSSM’ide kombineerimisega saavutasime 91% tundlikkuse ka mürgipeptiidide klassifitseerimisel. Töö teiseks eesmärgiks oli otsida konopeptiide koonusteo Conus consors’i genoomist ja mürgitoru transkriptoomist. Konopeptiidide otsimiseks järjestatud transkriptoomist ja genoomist kasutasime teiste meetodite hulgas ka pHMM’e. Me leidsime C. consors’i genoomist 214 konopeptiidi, millest 187 olid uued järjestused. Meil õnnestus teada saada 13-sse erinevasse perekonda kuuluva 15 konopeptiidi geenide ekson-intron struktuur. See on oluline, sest geenistruktuur võib mõjutada konopeptiidide mitmekesisuse teket.Conopeptides are small proteins found in the venom of cone snails (Conus sp.). Cone snails feed on worms, molluscs and fish. They paralyze their prey with venom and swallow it whole. The fast immobilization appears as a result of the mixture of conopeptides in the venom. Conopeptides are synthesized as prepropeptides with a signal sequence for transport into the venom duct, pro-peptide that facilitates proper folding and mature peptide. Conopeptides are grouped into superfamilies according to the signal sequences. Scientists are studying the conopeptides hoping to find new drug candidates. Conopeptides are specific modulators of ion channels in nerve and muscle cells and therefore can be potentially used as painkillers or muscle relaxants. Aim of this study was to develop a method for finding and classifying conopeptides from large amounts of sequences. Classification is important since finding the proteins similar to a newly discovered protein we get a lot of information about it. We used two types of models for classification and identification – profile hidden Markov Models (pHMMs) and position specific scoring matrices (PSSMs). With the signal peptide present the classification is 100% specific and sensitive. By combining the pHMMs and PSSMs we were able to obtain 91% sensitivity also for classification of mature peptides, which is better than with other methods. The second aim of this study was to find conopeptides from the genome and venom duct transcriptome of Conus consors. We used multiple methods, including the pHMMs, to locate the conopeptides. We discovered 214 conopeptides from the genome, 187 of which were novel. We also described the exon-intron structure for 15 conopeptide genes from 13 different superfamilies. Gene structure may influence the propagation of conopeptide diversity

Narkootikumide tarvitamisest põhjustatud üledooside levimus ja riskitegurid süstivate narkomaanide seas

http://www.ester.ee/record=b4415341~S58*es

Projektis "Tere, kevad!" osalenud Tartumaa lasteaedade laste looduskeskkonna märkamine ja väärtustamine õpetajate ja lastevanemate hinnangul

http://www.ester.ee/record=b4582665*es

Tava- ja väikeklassi 2. klassi õpilaste arvamused prosotsiaalse käitumise ja sellise käitumise motiivide kohta

https://www.ester.ee/record=b5453830*es

Äsja diagnoositud 1. tüüpi diabeeti põdevatel täiskasvanutel ja lastel on IgA-tüüpi enteroviirustevastaste antikehade hulk suurenenud

Eesti Arst 2023; 102(4):23

Atoopiline sensibiliseerumine täiskasvanud elanikkonna hulgas Tallinnas (FinEsS-uuringu tulemused)

Uuringus hinnati atoopilise sensibiliseerumise levimust Tallinna täiskasvanud elanike hulgas, tuginedes 15 inhaleeritava allergeeniekstraktiga teostatud nahatorketesti tulemusele. Lisaks hinnati seoseid atoopilise sensibiliseerumise ning astma, allergilise riniidi ja/või konjunktiviidi ning hingamisteede sümptomite vahel. Leiti, et atoopilise sensibiliseerumise levimus Tallinnas (34,5%) paigutub erinevate Lääne-Euroopa riikide elanikkonna seas leitud levimuste vahemikku, olles keskmisest pigem suurem. Eesti Arst 2004; 83 (7): 436–44

Abundances of Tetracycline, Sulphonamide and Beta-Lactam Antibiotic Resistance Genes in Conventional Wastewater Treatment Plants (WWTPs) with Different Waste Load

Peer reviewe