Математическая модель прогноза скорости фиброза печени у больных с хроническим гепатитом С на основе комбинаций геномных маркеров

Aim of study. To evaluate clinical significance of different combinations of gene polymorphisms IL-1b, IL-6, IL-10, TNF, HFE, TGF-b, ATR1, NOS3894, CYBA, AGT, MTHFR, FII, FV, FVII, FXIII, ITGA2, ITGB3, FBG, PAI and their prognostic value for prediction of liver fibrosis progression rate in patients with chronic hepatitis C (CHC).Subjects and methods: 118 patients with CHC were divided into «fast» and «slow» (fibrosis rate progression ≥0,13 and 0,13 fibrosis units/yr; n =64 and n =54) fibrosis groups. Gene polymorphisms were determined. Statistical analysis was performed using Statistica 10.Results. A allele (p =0,012) and genotype AA (p =0,024) of AGT G-6T gene, as well as T allele (p =0,013) and MT+TT genotypes (p =0,005) of AGT 235 M/T gene were significantly more common in «fast fibrosers» than in «slow fibrosers». Patients with genotype TT of CYBA 242 C/T had a higher fibrosis progression rate than patients with CC+CT genotype (p =0,02). Our analysis showed a protective effect of TT genotype of ITGA2 807 C/T on fibrosis progression rate (p =0,03). There was a trend (p 0,15) to higher fibrosis progression rate in patients with mutant alleles and genotypes of TGFb +915 G/C, FXIII 103 G/T, PAI -675 5G/4G genes. Other gene polymorphisms were not associated with enhanced liver fibrosis. To build a mathematical model for prediction of liver fibrosis progression rate we performed coding with scores for genotypes and virus genotype. Total score correlated with the fibrosis progression rate (R =0,39, p =0,000).Conclusion: Determination of genetic profile of the patient and virus genotype allows to predict the course of CHC. Обоснование. В настоящее время большое внимание уделяется поиску генетических факторов, объясняющих течение хронического гепатита С (ХГС).Цель исследования: оценить прогностическую значимость носительства комбинаций аллельных вариантов генов IL 1b, IL 6, IL 10, TNF α, HFE, TGF b, ATR1, NOS3, CYBA, AGT, MTHFR, FII, FV, FVII, FXIII, ITGA2, ITGB3, FBG, PAI на прогрессирование фиброза печени при ХГС.Материалы и методы: 118 пациентов с ХГС разделены на группы с быстрым и медленным (скорость фиброза ≥0,13 и 0,13 ед. фиброза/год; n =64 и n =54, соответственно) фиброзом. Выполнено определение полиморфизма. Статистическую обработку результатов проводили с использованием пакетов программ Statistica 10.Результаты. У больных с быстрым фиброзом в сравнении с группой с медленным чаще встречались аллель А (р =0,012) и мутантный генотип АА (р =0,024) гена AGT G-6T, также в данной группе чаще выявляли аллель Т (р =0,013) и генотип МТ+ТТ гена AGT 235 M/T (р =0,005). Больные с генотипом ТТ гена CYBA 242 C/T имели более высокую скорость фиброза по сравнению с больными с генотипом СС+СТ (р =0,02). В ходе анализа выявлено протективное влияние гомозиготы ТТ гена ITGA2 807 C/T на темпы фиброза (р =0,03). Наблюдались тенденции к различию по встречаемости аллелей и генотипов полиморфных маркеров TGFb +915 G/С, FXIII 103 G/T, PAI -675 5G/4G между двумя группами. Для остальных генов достоверных отличий не обнаружено. В дальнейшем построена математическая модель, учитывающая протективное и профиброгенное влияние генов, в также влияние генотипа вируса. Выявлена корреляция между суммой баллов в этой модели и темпом прогрессирования фиброза в печени (R =0,39, p =0,000).Заключение: предложенная математическая модель может прогнозировать течение болезни

Magnetic and charge structures in itinerant-electron magnets: Coexistence of multiple SDW and CDW

A theory of Kondo lattices is applied to studying possible magnetic and charge structures of itinerant-electron antiferromagnets. Even helical spin structures can be stabilized when the nesting of the Fermi surface is not sharp and the superexchange interaction, which arises from the virtual exchange of pair excitations across the Mott-Hubbard gap, is mainly responsible for magnetic instability. Sinusoidal spin structures or spin density waves (SDW) are only stabilized when the nesting of the Fermi surface is sharp enough and a novel exchange interaction arising from that of pair excitations of quasi-particles is mainly responsible for magnetic instability. In particular, multiple SDW are stabilized when their incommensurate ordering wave-numbers $\pm{\bf Q}$ are multiple; magnetizations of different $\pm{\bf Q}$ components are orthogonal to each other in double and triple SDW when magnetic anisotropy is weak enough. Unless $\pm 2{\bf Q}$ are commensurate, charge density waves (CDW) with $\pm 2{\bf Q}$ coexist with SDW with $\pm{\bf Q}$. Because the quenching of magnetic moments by the Kondo effect depends on local numbers of electrons, the phase of CDW or electron densities is such that magnetic moments are large where the quenching is weak. It is proposed that the so called stipe order in cuprate-oxide high-temperature superconductors must be the coexisting state of double incommensurate SDW and CDW.Comment: 10 pages, no figure

Total Cross Section Measurements With π- , Σ- And Protons On Nuclei And Nucleons Around 600 Gev/c

Total cross sections for Σ- and π- on beryllium, carbon, polyethylene and copper as well as total cross sections for protons on beryllium and carbon have been measured in a broad momentum range around 600GeV/c . These measurements were performed with a transmission technique in the SELEX hyperon-beam experiment at Fermilab. We report on results obtained for hadron-nucleus cross sections and on results for σtot(Σ-N) and σtot(π-N) , which were deduced from nuclear cross sections. © 2000 Elsevier Science B.V.57901/02/15277312Langland, J.L., (1995) Ph.D. Thesis, , University of IowaKleinfelder, S.A., (1988) IEEE Trans. Nucl. Sci., 35 (1)Dersch, U., (1998) Ph.D. Thesis, HeidelbergBiagi, S.F., (1981) Nucl. Phys. B, 186, pp. 1-21Bellettini, G., (1966) Nucl. Phys., 79, pp. 609-624Schiz, A.M., (1980) Phys. Rev. D, 21, pp. 3010-3022Murthy, P.V.R., (1975) Nucl. Phys. B, 92, pp. 269-308Caso, C., (1998) Eur. Phys. J. C, 3. , http://pdg.lbl.gov/1998/contents_plots.html, and data on total cross sections from computer readable filesSchiz, A.M., (1979) Ph.D. Thesis, , Yale University(1973) Landolt Börnstein Tables, 7. , Springer editionEngler, J., (1970) Phys. Lett. B, 32, pp. 716-719Babaev, A., (1974) Phys. Lett. B, 51, pp. 501-504Glauber, R.J., (1959) Boulder Lectures, pp. 315-413Franco, V., (1972) Phys. Rev. C, 6, pp. 748-757Karmanov, V.A., Kondratyuk, L.A., (1973) JETP Lett., 18, pp. 266-268Burq, J.P., (1983) Nucl. Phys. B, 217, pp. 285-335Gross, D., (1978) Phys. Rev. Lett., 41, pp. 217-220Beznogikh, G.G., (1972) Phys. Lett. B, 39, pp. 411-413Vorobyov, A.A., (1972) Phys. Lett. B, 41, pp. 639-641Foley, K.J., (1967) Phys. Rev. Lett., 19, pp. 857-859Fajardo, L.A., (1981) Phys. Rev. D, 24, pp. 46-65Jenni, P., (1977) Nucl. Phys. B, 129, pp. 232-252Breedon, R.E., (1989) Phys. Rev. Lett. B, 216, pp. 459-465Amos, N., (1983) Phys. Rev. Lett. B, 128, pp. 343-348Amaldi, U., (1977) Phys. Rev. Lett. B, 66, pp. 390-394Amos, N., (1985) Nucl. Phys. B, 262, pp. 689-714Akopin, V.D., (1977) Sov. J. Nucl. Phys., 25, pp. 51-55Amirkhanov, I.V., (1973) Sov. J. Nucl. Phys., 17, pp. 636-637Foley, K.J., (1969) Phys. Rev., 181, pp. 1775-1793Apokin, V.D., (1976) Nucl. Phys. B, 106, pp. 413-429Burq, J.P., (1982) Phys. Lett. B, 109, pp. 124-127Dakhno, L.G., (1983) Sov. J. Nucl. Phys., 37, pp. 590-598Kazarinov, M., (1976) Sov. Phys. JETP, 43, pp. 598-606De Jager, C.W., (1974) At. Data Nucl. Data Tables, 14, pp. 479-508Donnachie, A., Landshoff, P.V., (1992) Phys. Lett. B, 296, pp. 227-232Lipkin, H., (1975) Phys. Rev. D, 11, pp. 1827-1831Barnett, R.M., (1996) Phys. Rev. D, 54, pp. 191-192Carroll, A.S., (1979) Phys. Lett. B, 80, pp. 423-427Badier, J., (1972) Phys. Lett. B, 41, pp. 387-39

Total Cross Section Measurements with pi-, Sigma- and Protons on Nuclei and Nucleons around 600 GeV/c

Total cross sections for Sigma- and pi- on beryllium, carbon, polyethylene and copper as well as total cross sections for protons on beryllium and carbon have been measured in a broad momentum range around 600GeV/c. These measurements were performed with a transmission technique adapted to the SELEX hyperon-beam experiment at Fermilab. We report on results obtained for hadron-nucleus cross sections and on results for sigma_tot(Sigma- N) and sigma_tot(pi- N), which were deduced from nuclear cross sections.Comment: 42 pages, submitted to Nucl.Phys.

Прогнозирование скорости развития фиброза печени у больных хроническим гепатитом С на основе комбинации генетических и средовых факторов

Rationale: Search for predictors of aggressive course of chronic hepatitis C virus (HCV) infection in individual patients, including genetic studies, is considered  to be a major urgent  goal. High rates of fibrosis progression  in chronic HCV infection is associated with several gene polymorphisms  coding for the components of renin-angiotensin system and involved in the formation of endothelial dysfunction and oxidative stress.Aim: To develop a predictive  model  to  assess  the  probability  of rapid fibrosis progression  in patients  with chronic HCV infection based on the combination of the known genetic markers, clinical and demographic parameters.Materials and methods:  One hundred  and  nine  patients  with  chronic  HCV  infection (79 women  and 30 men) of known duration and liver fibrosis were categorized  into the groups with “rapid fibrosis” (n = 54, the rate of fibrosis progression ≥ 0.13 fibrosis units / year) and with “slow fibrosis”  (n = 55, the  rate  of progression 0.13  fibrosis units / year). Polymorphisms  of the studied genes were assessed by molecular genetic assays. Multivariate analysis of the influence of combination of genetic  variants, as well as of the interaction of genetic, clinical and demographic factors on the rate of fibrosis progression  in the patients with chronic HCV infection was performed by logistic  regression   method. Results:  The  rapid rate of fibrosis progression  was significantly associated with patient's  age at the time of infection (Wald statistics  14.955;  p = 0.00011), male gender (Wald statistics  6.787;  p = 0.00918),  (-6)АА genotype  of the  AGT  gene  carriage  (Wald statistics 6.512;  p = 0.01072), 242ТТ-genotype  of the  CYBA gene   (Wald  statistics   4.347;   p = 0.03708),   and 235МТ genotype of the AGT gene  (Wald statistics 4.306; p = 0.03799). The model to predict the probability of rapid fibrosis progression  in individuals with chronic HCV infection included the above mentioned factors; its use was demonstrated with two clinical cases.Conclusion: The analysis of the AGT  gene  (M235T and  G-6A loci) and  the  СYBA gene  (C242T  locus) polymorphisms  are  relevant to  identify patients  at  risk of rapid  liver fibrosis progression. In this case, 242ТТ genotype of the CYBA gene  and  (-6)AA and  235MT genotypes of the AGT gene  are considered  unfavorable. To refine the prognosis, it is necessary to take into account  demographic parameters (gender  and age at the moment of infection contraction), because male gender and older age of getting the infection would increase the probability of rapidly progressive of hepatitis C.Актуальность. Поиск у конкретного  больного предикторов агрессивного течения хронического гепатита С (ХГС), в том числе с помощью генетических исследований, представляется актуальной задачей. Быстрый темп прогрессирования  фиброза  при ХГС ассоциируется  с полиморфизмом ряда генов, кодирующих компоненты     ренин-ангиотензиновой     системы и вовлеченных  в формирование эндотелиальной   дисфункции  и  окислительного   стресса.Цель – разработка  прогностической модели оценки вероятности быстрого прогрессирования  фиброза  у больных  ХГС  на  основании комбинации   изученных  генетических   маркеров  и клинико-демографических   параметров.Материал  и  методы.  Сто девять  пациентов с  хронической   HCV-инфекцией   (79  женщин и 30 мужчин) с известной  длительностью  инфекции и стадией фиброза печени были разделены на группы с «быстрым фиброзом» (n = 54, скорость прогрессирования фиброза  ≥ 0,13 ед. фиброза / год)   и   с   «медленным   фиброзом» (n = 55,  скорость  прогрессирования  0,13  ед. фиброза / год).    Определение   полиморфизма исследуемых  генов  проводилось  молекулярно-генетическими методами. Многофакторный анализ комплексного влияния генетических вариантов, а  также  совместного  воздействия генетических и клинико-демографических  факторов на скорость развития фиброза у больных ХГС проводили методом логистической регрессии. Результаты.  Статистически значимо с быстрым темпом прогрессирования фиброза коррелировали возраст больных на момент инфицирования     (статистика   Вальда = 14,955; p = 0,00011),       мужской       пол       (статистика Вальда = 6,787; p = 0,00918), носительство  (-6)АА генотипа  гена  AGT (статистика Вальда = 6,512; p = 0,01072),  242ТТ-генотипа  гена  CYBA  (статистика  Вальда = 4,347;  p = 0,03708)  и  235МТ  генотипа   гена   AGT (статистика  Вальда = 4,306; p = 0,03799). Построена модель, предсказывающая вероятность  быстрого  прогрессирования фиброза  у больного  ХГС  на основании  вышеприведенных  факторов, продемонстрировано ее применение  на двух клинических примерах.Заключение. Для выявления больных с риском «быстрого» развития  фиброза  печени  целесообразно  проведение анализа полиморфизма гена  AGT (локусы M235T и G-6A) и гена  СYBA (локус C242T). Неблагоприятными  в этом случае являются генотипы 242ТТ гена CYBA, (-6)AA и 235MT гена AGT. Для уточнения прогноза  необходимо учитывать демографические показатели (пол и возраст  на момент инфицирования) – мужской пол и более  старший возраст инфицирования  увеличивают вероятность  быстропрогрессирующего течения ХГС

Связь полиморфизма генов ренин-ангиотензиновой системы и эндотелиальной дисфункции с формированием и тяжестью портальной гипертензии у больных хроническим гепатитом С

Background: At present, much attention is paid to genetic factors explaining the clinical course of chronic hepatitis C. Aim: To evaluate an association of the gene polymorphisms involved in the formation of endothelial dysfunction (NOS3 894G/T, CYBA 242C/T, MTHFR 677C/T) and encoding components of the renin-angiotensin system (ATR1 1166A/C, AGT (-6)G/T and 235M/T) with development and severity of portal hypertension syndrome in patients with chronic hepatitis C. Materials and methods: 162 patients with chronic hepatitis C and HCV-related cirrhosis (114 women and 48 men) were divided into the following groups: no portal hypertension (n = 98), "compensated" (n = 19) and "decompensated" (n = 45) portal hypertension. The gene polymorphisms were assessed by molecular genetic methods. Results: TT genotype of CYBA was more common in patients with portal hypertension than in those without (odds ratio (OR) for TT = 3.59, p = 0.031). This difference becomes larger when comparing the decompensated portal hypertension group with the no portal hypertension group (OR TT = 5.46, p = 0.009). Other gene polymorphisms were not associated with development or decompensation of portal hypertension. Multivariate analysis of the impact of genetic, clinical and demographic factors showed that portal hypertension was associated primarily with patients age at the time of the study (Wald's х2 = 14.99) and with their body mass index (Wald's х2 = 4.35). After exclusion of these population-wide risk factors from the model, the development of portal hypertension correlated with the carriage of 235TT genotype of CYBA (Wald's х2 = 6.07, OR = 4.29) and (-6)AA genotype AGT (Wald's х2 = 4.73, OR = 4.13), as well as with the lack of protective 235TT genotype AGT (Wald's х2 = 4.06, OR = 0.33). The combined effects of the studied gene polymorphisms on decompensation of the portal hypertension in patients with chronic HCV infection were similar. Conclusion: The development and increase in severity of portal hypertension syndrome in patients with chronic hepatitis C is directly correlated with the carriage of AA genotype of AGT (-6)G/A and TT genotype CYBA 242C/T and the absence of TT genotype AGT 235M/T.Актуальность. Сегодня большое внимание уделяется поиску генетических факторов, определяющих  течение  хронического  гепатита С. Цель – оценить  связь полиморфизма  генов, вовлеченных  в развитие  эндотелиальной дисфункции (NOS3 894G/T, CYBA 242C/T, MTHFR 677C/T) и кодирующих компоненты ренин-ангиотензиновой   системы   (ATR1 1166A/C,  AGT (-6)G/A и 235M/T), с формированием и нарастанием тяжести синдрома портальной гипертензии  у больных  хроническим  гепатитом  С. Материал и методы.  Сто шестьдесят два больных хроническим гепатитом С и циррозом печени С (114 женщин и 48 мужчин) были разделены на группы: без признаков  портальной гипертензии  (n = 98), с синдромом  портальной гипертензии в компенсированной (n = 19) и декомпенсированной (n = 45) фазе. Определение полиморфизма исследуемых генов проводилось молекулярно-генетическими методами. Результаты.  У  пациентов  с симптомами  портальной  гипертензии   достоверно   чаще,  чем в группе без  портальной  гипертензии,  встречалось носительство генотипа TT гена CYBA (отношение  шансов  (ОШ) TT = 3,59,  р = 0,031). При сравнении  групп пациентов  с декомпенсированной  портальной гипертензией  и без портальной   гипертензии   различия   нарастали (ОШ TT = 5,46, р = 0,009). Для остальных генов  достоверных   различий   не  обнаружено. Многофакторный анализ совместного влияния генетических и клинико-демографических факторов  выявил: портальная  гипертензия  ассоциируется прежде  всего с возрастом  больных на  момент  обследования  (статистика Вальда χ² = 14,99) и с их индексом массы тела (статистика Вальда χ² = 4,35). После исключения из модели этих общепопуляционных  факторов  риска развитие портальной гипертензии коррелировало с носительством 235ТТ генотипа гена CYBA (статистика Вальда χ² = 6,07, ОШ = 4,29) и (-6)АА генотипа гена AGT (статистика Вальда χ² = 4,73, ОШ = 4,13) и отсутствием протективного 235ТТ генотипа гена AGT (статистика Вальда χ² = 4,06, ОШ = 0,33). Аналогичным было сочетанное влияние комбинации исследованных генетических вариантов  на декомпенсацию  портальной  гипертензии.  Заключение.  Развитие  и нарастание  тяжести синдрома  портальной  гипертензии у больных хроническим гепатитом С прямо коррелирует с носительством  (-6)АА генотипа гена AGT и 242TТ генотипа гена CYBA и с отсутствием 235ТТ генотипа гена AGT