Pneumocystis jirovecii colonization among cystic fibrosis patients: A French prospective multicenter study

Pneumocystis carriage was detected in 12.5% of 104 cystic fibrosis (CF) patients during a prospective multicenter French study, with a prevalence of genotype 85C/248C and geographic variations. It was significantly associated with the absence of P. aeruginosa colonization and better FEV1 values. Results are discussed considering the natural history of CF

The Airway Microbiota in Cystic Fibrosis: A Complex Fungal and Bacterial Community—Implications for Therapeutic Management

International audienceBackground Given the polymicrobial nature of pulmonary infections in patients with cystic fibrosis (CF), it is essential to enhance our knowledge on the composition of the microbial community to improve patient management. In this study, we developed a pyrosequencing approach to extensively explore the diversity and dynamics of fungal and prokaryotic populations in CF lower airways. Methodology and Principal Findings Fungi and bacteria diversity in eight sputum samples collected from four adult CF patients was investigated using conventional microbiological culturing and high-throughput pyrosequencing approach targeting the ITS2 locus and the 16S rDNA gene. The unveiled microbial community structure was compared to the clinical profile of the CF patients. Pyrosequencing confirmed recently reported bacterial diversity and observed complex fungal communities, in which more than 60% of the species or genera were not detected by cultures. Strikingly, the diversity and species richness of fungal and bacterial communities was significantly lower in patients with decreased lung function and poor clinical status. Values of Chao1 richness estimator were statistically correlated with values of the Shwachman-Kulczycki score, body mass index, forced vital capacity, and forced expiratory volume in 1 s (p = 0.046, 0.047, 0.004, and 0.001, respectively for fungal Chao1 indices, and p = 0.010, 0.047, 0.002, and 0.0003, respectively for bacterial Chao1 values). Phylogenetic analysis showed high molecular diversities at the sub-species level for the main fungal and bacterial taxa identified in the present study. Anaerobes were isolated with Pseudomonas aeruginosa, which was more likely to be observed in association with Candida albicans than with Aspergillus fumigatus

Rapport IV. 5 : Le rôle d’une chute d’eau dans le bilan d’oxygène dissous d’une rivière : application au barrage de Pont à Mousson sur la Moselle

The main factors governing the dissolved oxygen balance are recalled ; the rate of oxygenation in a weir water fall is examined in the near and far field in relation with water quality and morphological characteristics of the river. Numerical examples are given for some dams of the Moselle and especially that of Pont-à-Mousson where investigations have been made during summer 1982.Après un rappel des principaux facteurs régissant le bilan d'oxygène dissous d'une rivière, on examine l'effet d'oxygénation d'une chute d'eau de barrage dans les champs proche et lointain, en fonction de la qualité des eaux et des caractéristiques morphologiques de la rivière. Des applications numériques sont données pour les barrages de la Moselle et plus particulièrement celui de Pont-à-Mousson qui ont fait l'objet d'études expérimentales au cours de l'été 1982.Gosse Ph., Salleron J. L. Rapport IV. 5 : Le rôle d’une chute d’eau dans le bilan d’oxygène dissous d’une rivière : application au barrage de Pont à Mousson sur la Moselle. In: L'impact des activités humaines sur les eaux continentales. Dix neuvièmes journées de l'hydraulique - Question I, II, III, IV, V et Compte rendu des séances. Tome 4, 1986

Assainissement des agglomérations : objectifs de protection des milieux par temps de pluie - éléments méthodologiques

Il est proposé de déterminer, à partir des objectifs de qualité du milieu naturel définis par la circulaire interministérielle du 17 mars 1978, des objectifs de qualité par temps de pluie suivant une démarche progressive, allant du temps sec à la prise en compte des événements paroxysmiques

Végétation fixée et phosphore en petit cours d'eau. Conséquences d'une réduction des apports de phosphore

Le cours d'eau du Vair, affluent de la Meuse, reçoit des effluents phosphorés dès l'amont, dans un contexte géologique complexe déterminant une forte minéralisation des eaux. D'autre part, son lit est fortement dégradé par un aménagement antérieur (curage, recalibrage). Un développement important d'algues filamenteuses et de potamot pectiné à l'amont influence notablement la qualité de l'eau. De plus, on constate dans ce cours d'eau des blooms à Diatomées s'étendant jusqu'en Meuse aval. Une réduction des apports de phosphore a été envisagée et mise en oeuvre. Un suivi de ces rejets et de leur impact sur la végétation a été mis en place en 1987 et 1988. Les résultats mettent en évidence une diminution importante des flux de phosphore. Toutefois, on ne remarque pas de modification immédiate des descripteurs de la végétation. En revanche, l'étude du profil longitudinal de la rivière rend compte d'une amélioration sensible de la qualité générale du cours d'eau de l'amont vers l'aval. Des actions permettant des réductions supplémentaires de ces apports et la restauration du lit sont engagées pour prolonger cette démarche qui restait encore insuffisante pour avoir un impact sur les proliférations végétales observées

Rapport III.4 Approches successives dans le contrôle de l’eutrophisation d’une rivière : le Doubs, la Moselle et la Meuse

The quantity of phytoplankton biomass of a river is used as a simple criterion to measure the eutrophication level. The various mechanisms governing phytoplankton growth are described and a computational routine is used to draw abaci which explain the various actual situations observed in French rivers ; this computational routine is also applied to help defining treatment programs or to forecast the alterations due to river harnessing. Examples are given for the Meuse, Moselle and Doubs rivers.La quantité de biomasse phytoplanctonique d'une rivière constitue un critère simple de mesure de son eutrophisation. Après avoir décrit les mécanismes régissant le développement du phytoplancton, un code de calcul est utilisé pour tracer des abaques qui expliquent la variété des situations réelles observées dans divers cours d'eau ; ce code de calcul est aussi exploité pour aider à définir les programmes d'assainissement ou bien prévoir les modifications induites par la création d'aménagements. Des exemples sont donnés pour la Meuse, la Moselle et le Doubs.Gosse Ph., Gras Raymond, Salleron J. L., Leglize L. Rapport III.4 Approches successives dans le contrôle de l’eutrophisation d’une rivière : le Doubs, la Moselle et la Meuse. In: L'impact des activités humaines sur les eaux continentales. Dix neuvièmes journées de l'hydraulique - Question I, II, III, IV, V et Compte rendu des séances. Tome 3, 1986

Dynamic MR defecography of the posterior compartment: Comparison with conventional X-ray defecography

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