A Single Conserved Amino Acid Residue as a Critical Context-Specific Determinant of the Differential Ability of Mdm2 and MdmX RING Domains to Dimerize

Mdm2 and MdmX are related proteins serving in the form of the Mdm2 homodimer or Mdm2/MdmX heterodimer as an E3 ubiquitin ligase for the tumor suppressor p53. The dimerization is required for the E3 activity and is mediated by the conserved RING domains present in both proteins, but only the RING domain of Mdm2 can form homodimers efficiently. We performed a systematic mutational analysis of human Mdm2, exchanging parts of the RING with the corresponding MdmX sequence, to identify the molecular determinants of this difference. Mdm2 can also promote MdmX degradation, and we identified several mutations blocking it. They were located mainly at the Mdm2/E2 interface and did not disrupt the MdmX-Mdm2 interaction. Surprisingly, some mutations of the Mdm2/E2 interface inhibited MdmX degradation, which is mediated by the Mdm2/MdmX heterodimer, but did not affect p53 degradation, mediated by the Mdm2 homodimer. Only one mutant, replacing a conserved cysteine 449 with asparagine (C449N), disrupted the ability of Mdm2 to dimerize with MdmX. When we introduced the cysteine residue into the corresponding site in MdmX, the RING domain became capable of forming dimers with other MdmX molecules in vivo, suggesting that one conserved amino acid residue in the RINGs of Mdm2 and MdmX could serve as the determinant of the differential ability of these domains to form dimers and their E3 activity. In immunoprecipitations, however, the homodimerization of MdmX could be observed only when the asparagine residue was replaced with cysteine in both RINGs. This result suggested that heterocomplexes consisting of one mutated MdmX RING with cysteine and one wild-type MdmX RING with asparagine might be less stable, despite being readily detectable in the cell-based assay. Moreover, Mdm2 C449N blocked Mdm2-MdmX heterodimerization but did not disrupt the ability of Mdm2 homodimer to promote p53 degradation, suggesting that the effect of the conserved cysteine and asparagine residues on dimerization was context-specific. Collectively, our results indicate that the effects of individual exchanges of conserved residues between Mdm2 and MdmX RING domains might be context-specific, supporting the hypothesis that Mdm2 RING homodimers and Mdm2-MdmX heterodimers may not be entirely structurally equivalent, despite their apparent similarity

Network analysis for uncovering the relationship between host response and clinical factors to virus pathogen: Lessons from SARS-CoV-2

Analysing complex datasets while maintaining the interpretability and explainability of outcomes for clinicians and patients is challenging, not only in viral infections. These datasets often include a variety of heterogeneous clinical, demographic, laboratory, and personal data, and it is not a single factor but a combination of multiple factors that contribute to patient characterisation and host response. Therefore, multivariate approaches are needed to analyse these complex patient datasets, which are impossible to analyse with univariate comparisons (e.g., one immune cell subset versus one clinical factor). Using a SARS-CoV-2 infection as an example, we employed a patient similarity network (PSN) approach to assess the relationship between host immune factors and the clinical course of infection and performed visualisation and data interpretation. A PSN analysis of similar to 85 immunological (cellular and humoral) and similar to 70 clinical factors in 250 recruited patients with coronavirus disease (COVID-19) who were sampled four to eight weeks after a PCR-confirmed SARS-CoV-2 infection identified a minimal immune signature, as well as clinical and laboratory factors strongly associated with disease severity. Our study demonstrates the benefits of implementing multivariate network approaches to identify relevant factors and visualise their relationships in a SARS-CoV-2 infection, but the model is generally applicable to any complex dataset.Web of Science1411art. no. 242

Myomedin replicas of gp120 V3 loop glycan epitopes recognized by PGT121 and PGT126 antibodies as non-cognate antigens for stimulation of HIV-1 broadly neutralizing antibodies

IntroductionImprinting broadly neutralizing antibody (bNAb) paratopes by shape complementary protein mimotopes represents a potential alternative for developing vaccine immunogens. This approach, designated as a Non-Cognate Ligand Strategy (NCLS), has recently been used for the identification of protein variants mimicking CD4 binding region epitope or membrane proximal external region (MPER) epitope of HIV-1 envelope (Env) glycoprotein. However, the potential of small binding proteins to mimic viral glycan-containing epitopes has not yet been verified.MethodsIn this work, we employed a highly complex combinatorial Myomedin scaffold library to identify variants recognizing paratopes of super candidate bNAbs, PGT121 and PGT126, specific for HIV-1 V3 loop epitopes.ResultsIn the collection of Myomedins called MLD variants targeted to PGT121, three candidates competed with gp120 for binding to this bNAb in ELISA, thus suggesting an overlapping binding site and epitope-mimicking potential. Myomedins targeted to PGT126 designated MLB also provided variants that competed with gp120. Immunization of mice with MLB or MLD binders resulted in the production of anti-gp120 and -Env serum antibodies. Mouse hyper-immune sera elicited with MLB036, MLB041, MLB049, and MLD108 moderately neutralized 8-to-10 of 22 tested HIV-1-pseudotyped viruses of A, B, and C clades in vitro.DiscussionOur data demonstrate that Myomedin-derived variants can mimic particular V3 glycan epitopes of prominent anti-HIV-1 bNAbs, ascertain the potential of particular glycans controlling neutralizing sensitivity of individual HIV-1 pseudoviruses, and represent promising prophylactic candidates for HIV-1 vaccine development

Sportolás és szabadidő eltöltési szokások miskolci fiatalok körében

Dolgozatom célja, hogy megismerjem a mai fiatalok szabadidő eltöltési szokásait, szabadidős lehetőségeiket. Szabadidőnek tekintünk minden olyan elfoglaltságot, melyben az egyén önszántából vesz részt azért, hogy kipihenje magát, kapcsolatait ápolja, fejlessze saját képességeit. Ahogyan nő a szabadidő mennyisége, úgy változik a hozzá fűződő viszony is, meghatározó része lesz az életünknek. A munkával töltött idő, elfoglaltság és a szabadidős tevékenységek között kapcsolat alakul ki.MSc/MAegészségügyi tanármagyarlevelez

Deriválás oktatóprogram C# nyelven

Deriválás oktatóprogram C# nyelven írva. Konkrét feladatok feladatsémából történő létrehozása. A program a feladatot megoldja, ez kifejezésfák alakítását jelenti. A program megoldását összeveti a felhasználói bemenettel. A program tudatja a felhasználóval, hogy megoldása helyes, vagy helytelen. A bemenet hibás részeit piros színnel kiemeli, a könnyebb javíthatóság érdekében.BSc/BAMérnökinformatikus Bsc

Trigliceridek meghatározása HPLC-MS módszerrel

Szakdolgozatom során különböző olajokat vizsgáltam spektrometriai módszerekkel. HPLC-MS technika segítségével meghatároztam az olajok összetételét és szerkezetét a relatív intenzitáshoz viszonyítva.BSc/BAvegyészmérnökg

Modern active elements and their behavior in linear circuit blocks

Tématem této diplomové práce byly kmitočtové filtry a jejich realizace pomocí nových moderních aktivních prvků jako UVC, UCC, VFA, CFA a OTA. Hlavním bodem práce bylo navrhnout kmitočtové filtry s těmito aktivními prvky, kdy tvar přenosové funkce bude pro všechny struktury shodný a porovnat vlastnosti aktivních prvků. Navrhované kmitočtové filtry byly druhého řádu s jedním nebo dvěma aktivními prvky. V první části práce jsou probrány základní vlastnosti kmitočtových filtrů, jejich vlastnosti a rozdělení. Dále jsou popsány obecné vlastnosti aktivních filtrů a jejich základních prvků jako jsou operační zesilovače OTA, VFA a CFA a poslední době častěji používané napěťový a proudový konvejor. V druhé časti jsou pak navrženy kmitočtové filtry s těmito prky se shodnou přenosovou funkcí. Následně jsou provedeny simulace všech filtrů a získány frekvenční charakteristiky. Nakonec jsou tyto filtry experimentálně vyrobeny a provedeno praktické měření.The topic of this master’s thesis was a frequency filters and their realization using modern active elements like UVC, UCC, VFA, CFA and OTA. The base point of this thesis was designed frequency filters with these active elements, when the shape of the transfer function will be identical for all structures and compare the characteristics of active elements. The proposed frequency filters are second order with one or two active elements. In the first part of thesis are discussed basic properties of frequency filters, their properties and distribution. Next are described the general characteristics of active filters and their basic elements such as operational amplifier OTA, VFA and CFA, and recently more frequently used voltage and current conveyor. The second part is the frequency filters designed with these elements is the same transfer function. Subsequently, simulations are done all the filters and obtained the frequency response. Finally, these filters are experimentally made and made practical measurements.

A családtervezés jelentősége, védőnő szerepe

Szakdolgozatom témája a családtervezés jelentősége, védőnő szerepe. Szeretném bemutatni az optimális családtervezés fogalmát, tartalmi elemeit, valamint azokat a korszerű és hatékony ismereteket, módszereket, amelyeket magába foglal. A kutatásom során szerettem volna megismerni a gyermekvállalás előtt álló fiatalok családtervezésről, tudatos családalapításról szerzett ismereteit, valamint azt, hogy ismerik-e azt a lehetőséget, hogy a védőnő is segítséget tud nyújtani számukra.BSc/BAegészségügyi gondozás és prevenció – védőnőmagyarnappaliv

A kisgyermekes nők munkavállalási hajlandósága

Szakdolgozatom a kisgyermekes nők munkavállalásáról szól. Vállalnak-e munkát a kisgyermek 3 éves kora előtt, vagy sem. Interjúkat és kérdőívet is készítettem. A szakirodalmi áttekintés részei: kisgyermekes nők foglalkoztatási helyzete, dolgozó kisgyermekes anyák megítélése, családbarát munkahelyek, atipikus foglalkoztatás, apai szerepek változása, a bölcsődei helyzet, valamint a családtámogatási rendszer. A dolgozat második felében pedig a kutatásaimat elemeztem

Biogáz hasznosítás kommunális szennyvíztelepen

Kutatómunkám során arra kerestem a választ, hogy az értékes biogázt milyen hatásfokkal lehet felhasználni, ezáltal csökkenteni az energetikai költségeket, számszerűsítve azokat. A vizsgálatot a Budapesti Központi Szennyvíztisztító Telep Kft. telepén végzetem, az itt gyűjtött adatokkal dolgoztam a munkám során.A vizsgálataimhoz megfigyeltem az írott és internetes forrásokat, szakirodalmakat, a BKSZT Kft. 2011-es adatsorát használtam fel az eredményekben és számításokban. Végül lakóhelyem, a sátoraljaújhelyi szennyvíztisztító telepén végeztem számításokat arra vonatkozóan, hogy ha a telepen nem szűnik meg a biogáz hasznosítás egy évtizeddel ezelőtt, milyen mértékű megtakarítást jelentene ez a cégnek ma.BSc/BAkörnyezetgazdálkodási agrármérnök