Trends and biases in the scientific literature on Brazilian watersheds

Brazilian watersheds have a high species and natural resources biodiversity. To know the features of scientific production on these regions is important to adjust study focus and to determine publication biases. This study aims at characterizing the scientific literature about Brazilian watersheds on scientometric grounds. For this purpose, we performed a search of articles in the ISI Web of Science database of the Institute for Scientific Information (ISI). The search returned 2,945 articles: 1,613 on the Amazon basin, 584 on the La Plata basin, 262 on the São Francisco basin, 190 on the Tocantins basin, 117 on the Southeast Coastal basin, 70 on the Eastern Northeast Coastal basin, 48 on the Parnaíba basin, 45 on the South Coastal basin, 14 on the North Coastal basin and two on the Western Northeast Coastal basin. The highest number of articles, journal diversity and impact factor was for the Amazon basin. Generally, the increase of the number of articles on the coastal basins over the years is lower. A keyword analysis shows that the study of most basins deals with similar subjects. However, researches on the Amazon and La Plata basins follow lines that are very different both from each other and from the other basins. In view of such results, incentives for new studies must focus on coastal basins. It is also recommended to submit works to good quality journals

Effects of funding on the collaboration and citation in environmental papers and the relationship with nation’s science and technology budgets

Dados de entrada (input), saída (output), impacto e processos são indicadores centrais da produção em Ciência, Tecnologia e Inovação. O input está associado aos investimentos realizados em ciência e tecnologia, podendo variar entre diferentes países e áreas científicas. Assim, o input pode influenciar outros indicadores de impacto. Aqui, avaliamos seu o efeito (número de financiamentos) sobre o processo de colaboração e o número de citações (output) da pesquisa ecológica. Além disso, detalhamos o efeito do número de financiamentos sobre a colaboração e o número de citações por país (baseado na nacionalidade dos autores). Verificamos que a maioria dos artigos publicados tinha algum grau de suporte financeiro, e que a produção de artigos com financiamento aumentou ao longo dos anos. O número de financiamentos teve efeito positivo na colaboração e nas citações, porém observamos que: nos países com maior investimento em ciência e tecnologia, o número de financiamentos impacta positivamente e diretamente a colaboração (número de autores); e nos países com menor investimento em ciência e tecnologia, o número de financiamentos impacta positivamente e diretamente as citações. Nossos resultados demonstram que os indicadores de impacto avaliados têm estrutura integrada e os efeitos em um nível podem afetar outros níveis. Entretanto, o impacto do número de fomentos nos indicadores informétricos pode variar entre os países, portanto esse resultado é importante para o desenvolvimento de políticas nacionais e para futuros estudos informétricos.Input, output, impact, and processes are central indicators of the science, technology, and innovation production. The input is usually associated to investments made in science and technology, and it varies among different countries and scientific fields. Thus, the input can influence other impact indicators. Here, we evaluated the effect of the input data (i.e., number of funding) on process (i.e., collaboration) and output (i.e., number of citation) indicators of ecological research. Moreover, we detailed the effect of the number of funding on the collaboration and number of citations by each country (based on the nationality of authors). We found that most of published papers had some degrees of financial support, and that the production of papers with funding increased over the years. Funding had a positive effect on the collaboration and citation of papers; however, we observed that: in countries with higher investments in Science and Technology, the number of funding impacts positively and directly on the number of authors (collaboration) and in countries with low levels of investments in Science and Technology, the number of funding impacts positively and directly on the number of citations. Our models presented a low predictive power, but similar to other informetric studies. Our results indicated that impact indicators evaluated have an integrated structure, and the effects at one level can affect other levels. Nonetheless, the impact of the number of funding on informetric data can vary among countries; therefore, these results are important to the development of national policies and future informetric studies

Um “retrato” das características limnológicas das lagoas de uma planície de inundação tropical : influência relativa do clima e do uso da terra

Aim This study aimed to investigate the relative influence of climate (temperature and precipitation) and land use on limnological features of 30 floodplain lakes in the Araguaia River, in Central Brazil, an important river that drains in the Brazilian Cerrado. Methods The lakes were sampled in one same period, at a large spatial scale (900 km along the river) covering climate and landscape variability. For decomposing the relative importance of land use and climate, we used the RDA and partitioning variance techniques. Results The lakes presented limnological gradient along the floodplain; in general, the lakes presented low transparency, nutrients concentrations ​​(total nitrogen and total phosphorus) and oxygen saturation. The water pH was considered weakly acidic. Considering land use in Araguaia river basin, lakes in downstream presented more remnant vegetation and lakes in upstream presented more livestock and agriculture soil use. The climate conditions were the most important in explaining the variation in limnological characteristics of the lakes, while the individual analysis of limnological variables showed that land use was important to explain to the pH and transparency of the water. Conclusions Finally, this study showed the importance of investigating regional climatic attributes and land use information to explain the limnological characterization of floodplain lakes. Thus, it highlights the importance of the possible impacts of global climate change on limnological conditions.Objetivo O objetivo desse estudo foi investigar a influência relativa do clima (temperatura e precipitação) e do uso da terra nas características limnológicas de 30 lagoas da planície de inundação do Rio Araguaia, no Brasil Central, um importante rio que drena no Cerrado brasileiro. Métodos As lagoas foram amostradas em um mesmo período, em uma grande extensão espacial (900 km ao longo do rio) cobrindo uma variabilidade climática e de paisagem. Para decompor o efeito relativo do clima e do uso do solo foi utilizada uma RDA seguida da partição da variância. Resultados As lagoas apresentaram um gradiente limnológico ao longo da planície de inundação. Em geral, as lagoas possuem baixa transparência, concentração de nutrientes (nitrogênio total e fósforo total) e saturação de oxigênio. O pH da água pode ser considerado fracamente ácido. Considerando o uso do solo na bacia do Rio Araguaia, as lagoas a jusante da planície apresentaram maior percentual de vegetação remanescente, ao passo que lagoas a montante da planície apresentaram maior uso do solo em pastagem em agricultura. As características climáticas foram o principal fator para explicar a variação das características limnológicas das lagoas estudadas, enquanto que análises individuais das variáveis limnológicas evidenciaram que o uso do solo foi importante para explicar a variação no pH e transparência da água. Conclusões O presente estudo evidenciou a importância de investigar os atributos climáticos regionais e o uso do solo para explicar as características limnológicas de lagoas na planície de inundação. Portanto, destacamos a importância de possíveis impactos das mudanças climáticas globais sobre as características limnológicas

Tendências e lacunas da literatura científica sobre o bioma Cerrado: uma análise cienciométrica

The Cerrado (Brazilian savanna) is the second largest Brazilian biome and is considered a biodiversity hotspot, for presenting high endemism and being under intense threat. This study aimed at highlighting publication trends on the Cerrado, detecting possible gaps and indicating future directions for scientific studies on this biome. We searched for articles between 1991 and 2012 in the journal database of the Institute for Scientific Information (ISI). We observed a significant increase in the number of articles throughout the years of the evaluated period (r=0.89; P<0.001), demonstrating an increasing interest of the scientific community in the Cerrado. Largely addressed issues were related to biodiversity (64.75%), followed by abiotic environment (13.38%) and agricultural crops (11.21%). In addition, 10.65% addressed both biodiversity and abiotic environment jointly. The most studied taxonomic group was plants (42%), followed by fungi (18%) and insects (12%). Fishes presented a lower number of studies (0.6%). The main gaps concern the few studies dealing with abiotic aspects and freshwater organisms, such as fishes, and also a low increment in the number of articles on invertebrates, except insects. Based on these gaps, we suggest that future studies must be especially directed towards aquatic environments and their biodiversity.Keywords: biodiversity, hotspot, scientometrics.O Cerrado (Savana brasileira) é o segundo maior bioma brasileiro, sendo considerado um hotspot de biodiversidade, pois apresenta elevado endemismo e está sob intensa ameaça. O objetivo deste trabalho foi destacar as tendências das publicações sobre o Cerrado, detectar possíveis lacunas e indicar direções futuras para trabalhos científicos nesse bioma. Foi realizada uma busca de artigos utilizando-se a base de periódicos do Institute for Scientific Information (ISI), entre os anos de 1991 a 2012. Foi observado um aumento significativo de artigos ao longo dos anos (r=0,89; P<0,001), demonstrando aumento de interesse da comunidade científica sobre o Cerrado. Grande parte dos trabalhos aborda assuntos relacionados à biodiversidade (64,75%), seguida do meio abiótico (13,38%) e de culturas agrícolas (11,21%). Além disso, 10,65% desses trabalhos abordam os temas biodiversidade e meio abiótico conjuntamente. O grupo taxonômico mais estudado foi o das plantas (42%), seguido de fungos (18%) e insetos (12%). Os peixes apresentaram um menor número de estudos (0,6%). As principais lacunas detectadas estiveram relacionadas a aspectos abióticos e organismos límnicos, como, por exemplo, peixes, bem como um baixo incremento no número de artigos enfocando invertebrados, excetuando-se os insetos. Assim, sugere-se que futuros estudos sejam direcionados principalmente aos ecossistemas aquáticos e sua biodiversidade.Palavras-chave: biodiversidade, cienciometria, hotspot

Urban Occupation Increases Water Toxicity of an Important River in Central Brazil

Meia Ponte River supplies water for two million people in Goiás State, Brazil. Despite its importance, the Meia Ponte River faces serious environmental problems such as the disposal of domestic and industrial effluents, what could impact the aquatic biota and the health of people who consumes its water. In this sense, here we aimed to evaluate the environmental quality and toxicity of surface water along the course of this river. Physicochemical analyses of water at Goiânia urban perimeter were higher than the limits of Brazil environmental regulations for fresh water. In relation to the diversity of species, phytoplankton classes associated to polluted environments were detected closer to urban perimeter. Allium cepa bioassay suggested that this river may contain substances with mitogenic activity. This result is in accordance with genotoxic analysis, because it was observed a significant increase in chromosomal aberrations. This data reveal the genotoxic potential of Meia Ponte River water. This genotoxicity represents a risk for aquatic biota and humans, once the genotoxic agents in water samples might cause the loss of DNA integrity, inducing damages and DNA breaks. In this context, the water utilization from Meia Ponte River without any treatment should be avoided and public policies need to be formulated and implemented to depollute this important river for Goiás State.O rio Meia Ponte fornece água para dois milhões de pessoas no estado de Goiás, Brasil. Apesar de sua importância, o rio Meia Ponte enfrenta sérios problemas ambientais, como o lançamento de efluentes domésticos e industriais, o que pode impactar a biota aquática e a saúde das pessoas que consomem sua água. Nesse sentido, neste trabalho tivemos como objetivo avaliar a qualidade e a toxicidade das águas superficiais ao longo deste rio. As análises físico-químicas da água no perímetro urbano de Goiânia apresentaram alguns parâmetros fora dos limites das regulamentações ambientais do Brasil. Em relação à diversidade de espécies, foram detectadas classes de fitoplâncton associadas a ambientes poluídos. O ensaio com Allium cepa sugere que este rio pode conter substâncias com atividade mitogênica. Este resultado está de acordo com a análise genotóxica, pois se observou um aumento significativo nas aberrações cromossômicas. Estes dados revelam o potencial genotóxico da água do rio Meia Ponte. Esta genotoxicidade representa um risco para a biota aquática e os seres humanos, uma vez que os agentes genotóxicos em amostras de água podem causar a perda de integridade do DNA, induzindo danos e rupturas de DNA. Nesse contexto, a utilização da água do Rio Meia Ponte, sem qualquer tratamento, deve ser evitada, e políticas públicas precisam ser formuladas e implementadas para despoluir este importante rio para o estado de Goiás

Simplificação do monitoramento ambiental de comunidades planctônicas utilizando diferentes abordagens ecológicas

Objetivo Este estudo pretende responder: (i) as comunidades de fitoplâncton podem ser utilizadas como substitutos de comunidades zooplanctônicas? (ii) podemos utilizar abordagens ecológicas como grupos funcionais (FG) ou classificação morfofuncional (MBFG) como substitutos para espécies de fitoplâncton?; (iii) podemos usar grupos substitutos (cladóceros, copépodes, rotíferos ou amebas testáceas) como substitutos para espécies zooplanctônicas?; (iv) a ordenação das variáveis ambientais é concordante com o padrão de ordenação de espécies de fitoplâncton e zooplâncton?; e (v) para ambas as comunidades, o padrão espacial de ordenação é mantido utilizando dados de densidade ou presença/ausência de indivíduos ou resoluções taxonômicas menores? Métodos O estudo foi conduzido em 25 corpos d'água que fornecem irrigação por pivô central no Distrito Federal - Brasil (Bacia do Rio Preto), em outubro de 2012. Nós avaliamos algumas variáveis físicas e químicas, além de amostras de fitoplâncton e zooplâncton. Para avaliar a correlação entre grupos biológicos, resoluções numéricas e maiores resoluções taxonômicas, realizamos algumas análises de Mantel e Procrustes. Resultados Avaliando o uso de grupos substitutos, as comparações entre fitoplâncton e zooplâncton, as classificações de FG e MBFG e quase todas as comparações entre grupos de zooplâncton sugeriram padrões concordantes. No entanto, os valores de r obtidos foram baixos, todos abaixo de 0,70. As análises biológicas com fitoplâncton e zooplâncton podem ser realizadas utilizando dados de presença/ausência de indivíduos sem perda significativa de informação, exceto a classificação MBFG e os copépodes. Os dados também podem ser usados em nível de gênero ou família para copépodes e amebas testáceas e só dados em nível de gênero para cladóceros e rotíferos. Diferentes resultados foram encontrados quanto à resolução taxonômica do fitoplâncton, considerando que, embora significativo, o valor foi menor que 0,70. Conclusão Para fins de monitoramento ambiental, é importante amostrar tanto as comunidades de fitoplâncton como de zooplâncton, porque uma não é substituta da outra, da mesma forma que a densidade do fitoplâncton e suas abordagens funcional e morfofuncional. Por outro lado, para simplificar o monitoramento ambiental, é possível adotar dados de presença/ausência de espécies em vez de dados de abundância para as comunidades de zooplâncton e fitoplâncton, exceto para copépodes e para abordagem morfofuncional. Também é possível adotar nível de gênero para a comunidade zooplanctônica e nível de família para copépodes e amebas testadas.Aim This study aimed to answer: (i) can phytoplankton communities be used as surrogate of zooplankton communities?; (ii) can we use ecological approaches like functional groups (FG) or morphofunctional classification (MBFG) as surrogate for phytoplankton species?; (iii) can we use substitute groups (cladocera, copepod, rotifer or testate amoebae) as surrogate for zooplankton species?; (iv) are the environmental variables’ ordination standards concordant with the ordering patterns of phytoplankton and zooplankton species?; and (v) for both communities, is the spatial pattern of ordination maintained using density data or presence/absence of individuals or lower taxonomic resolutions? Methods The study was conducted in 25 water bodies that supply central-pivot irrigation in the Federal District - Brazil (Rio Preto Basin), in October 2012. We evaluated some physical and chemical variables as well as phytoplankton and zooplankton samples. To evaluate correlation among biological groups, numerical and higher taxonomic resolutions, we performed some Mantel and Procrustes analyses. Results Evaluating the use of substitute groups, comparisons between phytoplankton and zooplankton, FG and MBFG classifications and almost all the comparisons between zooplankton groups suggested concordant patterns. However, the values of r were low, all below 0.70. Biological analyses with phytoplankton and zooplankton can be performed using presence/absence of individuals without significant loss of information, except for MBFG classification and copepods. Data may also be used at genus or family level for copepods and testate amoebae and only data at genus level for cladocerans and rotifers. Different results were found concerning taxonomic resolution for phytoplankton considering that, while being significant, the r value was less than 0.70. Conclusions For environmental monitoring purposes, it is important to sample both phytoplankton and zooplankton communities because one is not surrogate of the other one, in the same way as phytoplankton density and their functional and morphofunctional approaches. On the other hand, to simplify the environmental monitoring, it is possible to adopt presence/absence species data instead of abundance data for both zooplankton and phytoplankton communities, except for copepods and morphofunctional approach. It is also possible to adopt genera level for zooplankton community and family level for copepods and testate amoebae

O Cálcio exógeno como biomarcador do uso de via metabólica alternativa por Biomphalaria spp (Mollusca, Planorbidae)

Caramujos do gênero Biomphalaria são hospedeiros do parasito Schsitosoma mansoni, bem como, bioindicadores de qualidade ambiental. Esses caramujos usam carboidratos como fonte primária de energia e aminoácidos na síntese de “novo” de glicose, pela gliconeogênese. A concentração do Ca2+ exógeno afeta o metabolismo energético dos caramujos. Este estudo avaliou o uso de uma via metabólica alternativa por Biomphalaria tenagophila e B. glabrata expostas a 20, 40, 60, 80 e 100 mg/L de CaCO3, por 30 dias, a partir das concentrações de proteína totais, ureia, ácido úrico e creatinina, obtidas utilizando espectrofotômetro. Para cada grupo, foram utilizados quinze caramujos, dos quais foram obtidos amostras compostas de hemolinfa. De maneira geral, houve aumento de proteínas totais e redução de ureia, em ambas as espécies, expostas às maiores concentrações de CaCO3, comparado ao controle. O ácido úrico também aumentou para as duas espécies nas maiores concentrações de CaCO3. Maiores valores de creatinina foram observados em B. tenagophila e B. glabrata expostas, respectivamente, a 20 e 40 mg CaCO3. O uso de proteínas como substrato energético foi observado principalmente na exposição a 20 mg de CaCO3, além de particularidades na regulação de mecanismos fisiológicos pelas espécies como hospedeiras de S. mansoni

Convalescent plasma for COVID-19 in hospitalised patients : an open-label, randomised clinical trial

Background: The effects of convalescent plasma (CP) therapy in hospitalised patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) remain uncertain. This study investigates the effect of CP on clinical improvement in these patients. Methods: This is an investigator-initiated, randomised, parallel arm, open-label, superiority clinical trial. Patients were randomly (1:1) assigned to two infusions of CP plus standard of care (SOC) or SOC alone. The primary outcome was the proportion of patients with clinical improvement 28 days after enrolment. Results: A total of 160 (80 in each arm) patients (66.3% critically ill, 33.7% severely ill) completed the trial. The median (interquartile range (IQR)) age was 60.5 (48–68) years; 58.1% were male and the median (IQR) time from symptom onset to randomisation was 10 (8–12) days. Neutralising antibody titres >1:80 were present in 133 (83.1%) patients at baseline. The proportion of patients with clinical improvement on day 28 was 61.3% in the CP+SOC group and 65.0% in the SOC group (difference −3.7%, 95% CI −18.8–11.3%). The results were similar in the severe and critically ill subgroups. There was no significant difference between CP+SOC and SOC groups in pre-specified secondary outcomes, including 28-day mortality, days alive and free of respiratory support and duration of invasive ventilatory support. Inflammatory and other laboratory marker values on days 3, 7 and 14 were similar between groups. Conclusions: CP+SOC did not result in a higher proportion of clinical improvement on day 28 in hospitalised patients with COVID-19 compared to SOC alone