Species-Specific Codon Context Rules Unveil Non-Neutrality Effects of Synonymous Mutations

Codon pair usage (codon context) is a species specific gene primary structure feature whose evolutionary and functional roles are poorly understood. The data available show that codon-context has direct impact on both translation accuracy and efficiency, but one does not yet understand how it affects these two translation variables or whether context biases shape gene evolution.Here we study codon-context biases using a set of 72 orthologous highly conserved genes from bacteria, archaea, fungi and high eukaryotes to identify 7 distinct groups of codon context rules. We show that synonymous mutations, i.e., neutral mutations that occur in synonymous codons of codon-pairs, are selected to maintain context biases and that non-synonymous mutations, i.e., non-neutral mutations that alter protein amino acid sequences, are also under selective pressure to preserve codon-context biases.Since in vivo studies provide evidence for a role of codon context on decoding fidelity in E. coli and for decoding efficiency in mammalian cells, our data support the hypothesis that, like codon usage, codon context modulates the evolution of gene primary structure and fine tunes the structure of open reading frames for high genome translational fidelity and efficiency in the 3 domains of life

The potential role of polyelectrolyte complex nanoparticles based on cashew gum, tripolyphosphate and chitosan for the loading of insulin

Polyelectrolytic complexation has stood out due to its application in the development of drug delivery systems using biopolymers as raw materials. The formation of complexes between cashew gum and chitosan can be intermediated by cross-links, mediated by the action of the sodium tripolyphosphate crosslinking agent. These polymers have been used in the nanotechnological development of formulations to protect peptide drugs, such as insulin, allowing their oral administration. In this work, we describe the development of polyelectrolytic complexes from cashew gum and chitosan as biopolymers for oral administration of insulin. The obtained complexes showed a mean particle size of 234 nm and polydispersity index of 0.2. The complexes were 234 nm in size, PDI 0.2, zeta potential 4.5 mV and 22% trapping. The obtained complexes demonstrated considerable and promising characteristics for use as oral insulin delivery systems.e Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco (FACEPE), Banco do Nordeste (grant FUNDECI/2016.0015), Portuguese Science and Technology Foundation (FCT/MCT) and from European Funds (PRODER/COMPETE) through the project UIDB/04469/2020 (strategic fund), co-financed by FEDER, under the Partnership Agreement PT2020info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Hysterothylacium larvae (Nematoda, Anisakidae) in the freshwater mussel Diplodon suavidicus (Lea, 1856) (Mollusca, Unioniformes, Hyriidae) in Aripuanã River, Amazon, Brazil

Larvae of Hysterothylacium use various invertebrates as intermediate hosts. Definite hosts include fish, birds, reptiles or marine mammals. This study describes the occurrence of Hysterothylacium (Nematoda, Anisakidae) larvae parasitizing the pericardic cavity of Diplodon suavidicus (Unioniformes, Hyriidae) specimens collected in the Amazon basin, Brazil. This is the first record of this nematode parasitizing freshwater bivalves in South America. The high prevalence, medium intensity and medium abundance suggest that D. suavidicus acts as intermediate host for Hysterothylacium species in that environment. © 2010 Elsevier Inc

O Lúdico como motivador no desenvolvimento da aprendizagem das séries inicias

O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de verificar a importância do lúdico como ferramenta pedagógica motivadora da aprendizagem em escolas públicas de Ensino Fundamental do Distrito Federal. Para alcançar estes objetivos, utilizou-se como metodologia pesquisa qualitativa, pois houve a preocupação com a leitura da qualidade dos dados que se buscava e não a ênfase numérica dos resultados. A pesquisa bibliográfica permitiu a abordagem de conceitos relacionados ao histórico do lúdico, sua relação com o desenvolvimento infantil, sua importância no processo de aprendizagem e como o educador faz uso da ludicidade em sala de aula. Os resultados foram obtidos por meio de revisão bibliográfica e observações dos alunos durante o recreio e as atividades lúdicas dirigidas durante a Semana do Trânsito. Foram observadas: uma turma de ensino especial do Centro de Ensino Especial da Samambaia, uma turma de 1° Série da Escola Classe 401 do Recanto das Emas, uma turma de 2ª série e outra de Educação Infantil da Escola Classe 407, além das características físicas e pedagógicas de cada escola, procurando levantar seus pontos convergentes e divergentes, bem como a forma como o lúdico tem sido utilizado no desenvolvimento do aprendizado destes alunos. Os resultados demonstraram que a atividade lúdica, no contexto pedagógico, pode contribuir para que o aluno tenha uma aprendizagem significativa, possibilitando-lhe um maior desenvolvimento global e capacitando a relacionar o aprendizado obtido na escola com o cotidiano por ele vivenciado, independente das dificuldades apresentadas pela escola ou mesmo do aluno. Por fim, o estudo possibilitou concluir que cabe ao educador conhecer os benefícios do lúdico para poder explorar as brincadeiras e jogos como forma de desenvolvimento do processo ensino-aprendizagem, proporcionando aos seus alunos atividades prazerosas que lhe permitiram construir um conhecimento mais amplo

Índice de sustentabilidade agroambiental para o perímetro irrigado Ayres de Souza.

Uma análise integrada do atual uso dos recursos naturais do Perímetro Irrigado de Ayres de Souza, localizado no Vale do Acaraú, Ceará, foi realizada através do desenvolvimento de um índice de sustentabilidade agroecológica. Os dados dessa pesquisa foram oriundos de questionários aplicados a 33 produtores agrícolas beneficiados pelo projeto de irrigação. Os indicadores de sustentabilidade foram estimados pelo emprego de análise fatorial, método da análise fatorial/análise de componentes principais. O índice de sustentabilidade estimado a partir dos indicadores selecionados registrou uma situação de sustentabilidade fragilizada ou de insustentabilidade reversível. As unidades produtivas apresentaram um porcentual de 60,6% com alguma sustentabilidade; e os demais 39,4% estão em condições de insustentabilidade. Os resultados também mostraram que os fatores dominantes do índice de sustentabilidade foram: nível da atividade agrícola praticada, agricultura familiar, condições atuais do sistema água-solo e infraestrutura,fontes alternativas de renda e experiência em tratos culturais

Characterization, evaluation and conservation of the Moxotó goat breed in Pernambuco, Brazil

This work aimed to characterize and evaluate the state of conservation of the goat breed in Pernambuco State, in the Northeast region of Brazil. The methodology used is based on phenotypic aspects, populational census and interviews with farmers so as to characterize the production system of these animals in this region. The means and standard deviations for morphometric measures included: body length (BL), hip height (HH), chest perimeter (CP) and adult body weight (AW) of females of the breed. These were respectively 77.30 ± 9.88 cm; 60.43 ± 7.31 cm; 63.13 ± 7.02 cm and 30.13 ± 8.43 kg. Of all animals studied, approximately 76% are Without Breed Pattern Defined (WBPD), a product of crossbreeding with native animals, especially Moxotó and Nambi with exotic breeds such as Bhuj, Saanen, Boer and Anglo-Nubian, with a predominance of the latter. Only 12% are native breeds, with a predominance of Moxotó. Some older farmers confirm that the numbers of animals of this breed are decreasing progressively in the last few years. This is confirmed where at present 76% of the herd in the region are of mixed breed, due to crossbreeding with exotic breeds

INIBIÇÃO DA INFECÇÃO in vitro DE MACRÓFAGOS POR Leishmania amazonensis POR EXTRATO E FRAÇÕES DE Chenopodium ambrosioides L.

A utilização de espécies vegetais, como Chenopodium ambrosioides L., para o tratamento da leishmaniose na terapêutica tradicional tem despertado interesse na busca de novos compostos mais eficazes e menos tóxicos. Nosso grupo demonstrou as atividades imunoestimuladora e anti-Leishmania in vivo do extrato bruto hidroalcoólico (EBH) de C. ambrosioides e efeito anti-promastigota in vitro do EBH e das suas frações. Neste trabalho, avaliou-se a atividade anti-Leishmania do EBH e suas frações acetato de etila (FAc) e clorofórmica (FCHCl3) em macrófagos infectados in vitro por Leishmania amazonensis. Foram realizados dois modelos: “proflático” e “terapêutico”. No primeiro, macrófagos peritoneais de camundongos Swiss  foram tratados com EBH, FAc ou FCHCl3 nas concentrações de 62,5µg/mL, 125µg/mL e 250µg/mL e, após 4 horas, infectados com formas promastigotas do parasito na razão de 1:10 por 24 horas. No segundo, os macrófagos foram infectados com promastigotas (1:10) e, após 4 horas, tratados com EBH, FAc ou FCHCl3 por 24 horas. Foram então realizados a quantifcação das amastigotas fagocitadas e o cálculo das taxas de infecção. No modelo “proflático”, apenas os macrófagos expostos ao EBH nas maiores concentrações apresentaram  taxas de  infecção  inferiores ao controle negativo. Entretanto, no modelo “terapêutico”, as  três concentrações de EBH e também da FAc reduziram a infecção de macrófagos em relação ao controle negativo, sendo a maior concentração do EBH mais efetiva inclusive que o controle positivo.  Em conclusão, o EBH de folhas de C. ambrosioides e a sua FAc possuem efeito terapêutico anti-Leishmania na infecção in vitro de macrófagos.Descritores: Leishmaniose; Leishmania amazonensis; Chenopodium ambrosioides.AbstractInhibit  of  in  vitro  macrophage  infection  by  Leishmania  amazonensis  by  extract  and  fractions  from Chenopodium ambrosioides L. The use of plant species such as Chenopodium ambrosioides L. for the treatment of leishmaniasis in traditional medicine has aroused interest in fnding new, more effective and less toxic compounds. Our group demonstrated the immunostimulatory and in vivo anti-Leishmania activities of the crude hydroalcoholic extract (HCE) from C. ambrosioides L. and the in vitro anti-promastigote effect of the HCE and its fractions. In this study, we evaluated the anti-Leishmania activity of the HCE and its fractions ethyl acetate (FAc) and chloroform (FCHCl3) in macrophages infected in vitro with Leishmania amazonensis. Two models, “prophylactic” and “therapeutic”, were performed. In the frst, Swiss mice peritoneal macrophages were treated with CHE, FAc or FCHCl3 in concentrations of 62,5μg/mL, 125μg/mL and 250μg/mL and, after 4 hours, infected with promastigote forms in the ratio of 1:10 for 24 hours. In the second model, the macrophages were infected with promastigotes (1:10)  and,  after 4 hours,  treated with HCE, FAc or FCHCl3 for 24 hours. Quantifcation of phagocytosed amastigotes and calculation  of  infection  rates were  then  perfomed.  In  the  “prophylactic” model,  only macrophages  exposed  to  the  highest concentrations of HCE presented  infection  rates  lower  than  the negative  control. However,  in  the  “therapeutic” model,  the three concentrations of both the HCE and FAc reduced the infection of macrophages compared to the negative control, with the highest concentration of HCE being even more effective than the positive control. In conclusion, the HCE from leaves of Chenopodium ambrosioides and its FAc have an anti-Leishmania therapeutic effect on the in vitro macrophages infection.Descriptors: Leishmaniasis. Leishmania amazonensis. Chenopodium ambrosioides