Methylation Data Analysis Associated with Alzheimer’s Disease

Curs 2014-2015Alzheimer disease (AD) is associated with distinctive changes in DNA methylation patterns. DNA methylation is a chemical modification that is involved in gene silencing. These modifications give rise to heritable changes in gene expression without altering the DNA sequence. In a first study, researchers observed differential methylated regions (DMRs) in a specific DNA in postmortem brains from AD patients. Due to this fact we decided to focus on two target genes from AD in order to compare differences in methylation between different experimental situations. In this project, we have developed a pipeline for finding DMR between different experimental conditions based on methylation data generated with the 454 GS FLX system from Roche, and DNA bisulfite-treated samples.Director/a: Malu Calle, co-director: Marta Barrachina Castill

Obtención de estándares de sustentabilidad para mejorar la eficiencia energética y la confortabilidad de las viviendas patrimoniales del Centro Histórico de Cuenca

El presente estudio tiene como objetivo general analizar los estándares de eficiencia energética y calidad del ambiente interior de las viviendas patrimoniales del Centro Histórico de Cuenca, por lo que se consideran los siguientes factores: consumo de energía, temperatura, calidad del aire interior, iluminación natural y confort acústico. La metodología empleada es mixta, no experimental y de diseño longitudinal que involucra variables cuantitativas y cualitativas para la evaluación de las mediciones ambientales, eléctricas, así como las percepciones de confort de los ocupantes de las viviendas. En una primera etapa se realiza una encuesta a los habitantes de 280 viviendas de Cuenca, para determinar los hábitos de consumo energético y las condiciones del ambiente interior, en una segunda fase se ejecuta un monitoreo de las variables eléctricas y ambientales en tres viviendas de características patrimoniales, mediante el uso de sensores de medición, simulaciones y encuestas de percepción. Posteriormente se analiza y evalúa los resultados obtenidos, finalmente se desarrolla una comparación de estos datos con los estándares de eficiencia energética y calidad del ambiente interior según las normas nacionales e internacionales.The present study focus in the analysis of the energy efficiency and indoor quality environment of the heritage houses inside of the city center of Cuenca, considering elements such as energy, temperature, indoor quality air, nature lightning and acoustic comfort. The method use for the study is a mixed investigation not experimental with linear design that involves variables quantitative and qualitative for the assessment of the environment and electric measuring and the comfort perception of the occupants of the housings. In the first stage it will be necessary to make a survey to 280 houses to establish the energetic habits and the conditions of indoor environment. The second stage will take the monitor of the energetic and environment variables of three houses with heritage characteristics using measuring sensors, simulations and perception survey. Afterwards it will be analyzed and evaluated the obtain results and make a comparison of the energy efficacy standards and indoor quality environment through the national and international norms according with the type of housing.Magíster en ConstruccionesCuenc

The Historic Archive of the Centre for Agrarian Studies of Extremadura: a guardian of the countryside’s heritage

El Centro de Estudios Agrarios (CEA) es una unidad cuyo objetivo es servir al usuario un completo panorama del devenir del campo extremeño (objetos, documentos, publicaciones…) desde mediados del siglo XIX hasta finales del pasado siglo y, además, contar con trabajos que revisan aquella época en su Biblioteca Central. Además, el CEA añade la capacidad de editar alguno de esos trabajos desde la propia Consejería de Agricultura, Desarrollo Rural, Población y Territorio a través de su unidad de Imprenta y Publicaciones. En esta experiencia trasladamos al lector una breve descripción de los contenidos de su Archivo Histórico.The CEA (Centro de Estudios Agrarios/ Centre for Agrarian Studies) aims at providing the user with a complete overview of the development and transformations undergone by the countryside of Extremadura from the mid-19th century to the end of the last century using a diversity of objects, documents and publications. It also aims to have and disseminate works that review that period in its Central Library. Furthermore, the CEA has the capacity to edit and publish some of these specialized publications through the Printing and Publications unit of the Regional Ministry of Agriculture, Rural Development, Population and Territory. In this experience, we provide the reader with a brief description of the contents of its Historical Archive

Campaña de marketing digital orientada al posicionamiento de la marca Ambar Sweet

Esta investigación tiene como objetivo general diseñar una campaña de marketing digital orientada al posicionamiento de la marca Ambar Sweet. La metodología se basó en la investigación no experimental con un enfoque mixto, a través de la investigación cualitativa y cuantitativa, empleando como técnica de investigación a la encuesta y la entrevista. La investigación evidenció que el mercado meta si usa las redes sociales para buscar bienes y servicios, siendo el Facebook y el Instagram los medios digitales de mayor aceptación, por lo que como parte de la campaña digital que se diseñó para la Marca Ambar Sweet se consideró como medios principales de comunicación las redes sociales antes mencionada para posicionar la marca de una forma efectiva, así también se recomienda un seguimiento continuo a través de un community manager que le permita recopilar información importante que sea transmitida a la gerencia de la marca pudiendo considerar cualquier cambio en el uso de las herramientas para el buen funcionamiento de las estrategiasThe general objective of this research is to design a digital marketing campaign aimed at positioning the Ambar Sweet brand. The methodology was based on non-experimental research with a mixed approach, through qualitative and quantitative research, using the survey and interview as a research technique. The research shows that the target market does use social networks to search for goods and services, with Facebook and Instagram being the most widely accepted digital media, so as part of the digital campaign that was designed for the Ambar Sweet Brand, it was considered As a means of communication, the aforementioned social networks to position the brand in an effective way, as well as continuous monitoring through a community manager is recommended that allows you to collect important information that is transmitted to the management of the brand, being able to consider any change in the use of tools for the proper functioning of the strategie

Selective DNA-Binding by Designed Bisbenzamidine-Homeodomain Chimeras

We report the construction of conjugates between three variants of the helix 3 region of a Q50K engrailed homeodomain and bisbenzamidine minor-groove DNA binders. The hybrid featuring the sequence of the native protein failed to bind to DNA; however, modifications that increased the α-helical folding propensity of the peptide allowed specific DNA binding by a bipartite (major/minor groove) interactionMinisterio de Economía y Competitividad. Grant Numbers: SAF2010-20822-C02, CTQ2012-31341 Consolider Ingenio. Grant Number: 2010 CSD2007-00006 Xunta de Galicia. Grant Number: GRC2013/14 European Regional Development Fund European Research Council. Grant Number: Na 340055 Ministerio de Ciencia e Innovación Fundación Gil DávilaS

ArduImu: Unidad de medición inercial basada en arduino

[Resumen] El objetivo principal de este proyecto de fin de grado es realizar el diseño hardware y software, además de su posterior implementación de una unidad de medición inercial en arduino. Para cumplir ese objetivo principal establecimos algunos objetivos secundarios: • Crear el software para el control de la placa de arduino. • Interacción con un Imu a través de arduino. • Registro de datos en una tarjeta sd en arduino. • Crear una aplicación de escritorio para poder interactuar con arduino desde el pc. • La posibilidad de ver en tiempo real los movimientos del imu desde el pc. • Sincronización de un RTC con la hora del ordenador al que la placa arduino este conectada. • Visualización en el pc de los datos guardados en la tarjeta SD. • Establecer un modo sueño para que el sistema arduino consuma menos energía. Para poder cumplir estos objetivos necesitamos algunos componentes hardware: • Arduino MkrZero. • Una unidad de medición inercial. • Un RTC. • Un pulsador. • Tarjeta micro sd. A mayores de los objetivos anteriores hemos alcanzado otros según íbamos avanzando en el desarrollo del proyecto, como evitar que la interfaz de usuario se congelase al recibir datos desde arduino por el puerto serie y mostrarlos en la pantalla. Poder guardar datos en la sd para poder cargarlos en el arranque de la placa de arduino. El realizar este proyecto me ha permitido adquirir una serie de conocimientos que antes no tenía o aumentar los conocimientos ya existentes. Algunos de ellos fueron: conseguir como el hardware y el software se unan para trabajar juntos a la perfección y en total sincronía, como a un sistema hardware se le pueden añadir más elementos para poder crear un sistema más complejo. A parte de aprender a conectar hardware y software, he conocido otras formas de crear interfaces de usuario en java basadas en xml. Al tener que actualizar esa interfaz de usuario con datos que provenientes del puerto serie he tenido que usar threads para evitar que se congelara dicha interfaz. El desarrollo del proyecto se realizó con una metodología basada en scrum con sprints o iteraciones. Cada sprint constaba de diversas fases: análisis, diseño, implementación y pruebas. Algunas fases podían estar divididas en subfases, por ejemplo, diseño comprendía tres categorías: diseño hardware, diseño software y diseño de la interfaz de usuario. Destacar que este proyecto se realizó para poder observar los movimientos de un objeto que realiza en una superficie, aunque puede tener otros usos. Ya que actualmente las unidades de medición inerciales las encontramos en cualquier sitio, incluso en nuestros móviles, drones, etc. Para finalizar este resumen, decir que este proyecto solo araña una parte de lo que se puede hacer con una placa de arduino, porque a pesar de haberlo finalizado, aún se pueden realizar muchas mejoras, una de ellas sería conectar la placa a internet, para poder obtener los datos de manera remota sin tener que acercarnos al lugar donde este y poder guardar los datos en un servidor u otro dispositivo remoto, ya que la memoria de la tarjeta sd es más limitada.[Abstract] The main objective of this end-of-grade project is to carry out the hardware and software design, as well as the subsequent implementation of an arduino based inertial measurement unit. In order to achieve this main objective, we established some secondary objectives: • Create the software for the control of the arduino board • Interaction with an Imu through arduino. • Data logging on an sd card in arduino. • Create a desktop application to be able to interact with arduino from the pc • The possibility to see in real time the movements of the imu from the pc. • Synchronization of a RTC with the time of the computer to which arduino is connected. • Visualization in the pc of the data saved in SD. • Establish a sleep mode so that the arduino system consumes less energy. In order to meet these objectives we need some hardware components: • Arduino MkrZero • A inertial measuring unit. • A RTC. • A pushbutton. • Micro sd card. In addition to the above objectives, we achieved others as we progressed in the development of the project, such as preventing the user interface from freezing when receiving data from arduino through the serial port and displaying it on the screen. To be able to save data in the sd to be able to load them in the start of the arduino board. This project has allowed me to acquire a series of knowledge that I did not have before or increase the existing knowledge. Some of them were: to get as the hardware and the software unite to work together to the perfection and in total synchrony, as to a hardware system more elements can be added to him to be able to create a more complex system. Apart from learning to connect hardware and software, I have known other ways to create user interfaces in java based on xml.Having to update that user interface with data from the serial port, I had to use threads to avoid freezing that interface. The development of the project was done with a scrum-based methodology with sprints or iterations. Each sprint consisted of several phases: analysis, design, implementation and testing. This phases could be divided into subphases, for example, design comprised two categories: hardware design and software design. To end this summary, say that this project only scratches a part of what can be done with an arduino board, because despite having finished, many improvements can still be made, one of them would be to connect the board to the Internet and be able to obtain data remotely without having to go near the place where it is and be able to save the data on a server or other remote device because the memory of the sd card is more limited.Traballo fin de grao (UDC.FIC). Enxeñaría informática. Curso 2018/201

Enfoque didáctico para la conceptualización de la parábola como lugar geométrico integrando Cabri Géomètre II Plus

La enseñanza de la parábola suele restringirse al enfoque de la geometría analítica. El presente estudio consistió en una propuesta didáctica que acercó a los estudiantes a la comprensión del significado de parábola como lugar geométrico mediante el diseño e implementación de una estrategia didáctica basada en el uso e integración del ambiente de geometría dinámica Cabri Géomètre II Plus. En su diseño, puesta en práctica y sistematización, se consideraron las fases de una micro-ingeniería didáctica: análisis preliminares, planeación del estudio, diseño de actividades y análisis de resultados. El estudio retrató el clima intelectual percibido en clases y permitió constatar que el progreso en el desempeño matemático de los estudiantes se hace factible por la mediación del Cabri a partir de diseños planificados

Nickel-promoted recognition of long DNA sites by designed peptide derivatives

NOTICE: This is the peer reviewed version of the following article: Jessica Rodríguez, Jesús Mosquera, M. Eugenio Vázquez*, José L. Mascareñas* (2016), Nickel-promoted Recognition of long DNA sites by designed Peptide Derivatives. ChemEurJ., 22 (38), 13474-13477 [doi:10.1002/chem.201602783]. This article may be used for non-commercial purposes in accordance with Wiley Terms and Conditions for selfarchivingWe describe the synthesis of designed peptidic modules that self-assemble in specific DNA sequences of 12 base pairs in the presence of NiII salts. The modules consist of modified fragments of transcription factors that have been appropriately engineered to include metal-chelating His and bipyridine ligandsWe are thankful for the support given by the Spanish grants SAF2013-41943-R, CTQ2015-70698-R, and CTQ2013-49317-EXP, the Xunta de Galicia GRC2013-041, the ERDF, and the European Research Council (Advanced Grant No. 340055). Support of COST Action CM1105, COST CM1306 and the orfeo-cinqa network are also kindly acknowledged. J.R. thanks the Xunta de Galicia for a PhD fellowshipS

Reversible supramolecular assembly at specific DNA sites: Ni-promoted, bivalent DNA binding with designed peptide and bipyridylbisbenzamidine components

At specific DNA sites, nickel(II) salts promote the assembly of designed components, namely a bis(histidine)-modified peptide that is derived from a bZIP transcription factor and a bis(benzamidine) unit that is equipped with a bipyridine. This programmed supramolecular system with emergent properties reproduces some key characteristics of naturally occurring DNA-binding proteins, such as bivalence, selectivity, responsiveness to external agents, and reversibility.We are thankful for support from Spanish grants (SAF2010-20822-C02 and CTQ2012-31341), Consolider Ingenio 2010 (CSD2007-00006), the Xunta de Galicia (GRC2013-041, INCITE09 209084PR, and PGIDIT08CSA-047209PR), the ERDF, and the European Research Council (Advanced Grant 340055). J.M. and M.I.S. thank the Spanish MCINN for their Ph.D. fellowships.S