Improving Yasso15 soil carbon model estimates with ensemble adjustment Kalman filter state data assimilation

Model-calculated forecasts of soil organic carbon (SOC) are important for approximating global terrestrial carbon pools and assessing their change. However, the lack of detailed observations limits the reliability and applicability of these SOC projections. Here, we studied whether state data assimilation (SDA) can be used to continuously update the modeled state with available total carbon measurements in order to improve future SOC estimations. We chose six fallow test sites with measurement time series spanning 30 to 80 years for this initial test. In all cases, SDA improved future projections but to varying degrees. Furthermore, already including the first few measurements impacted the state enough to reduce the error in decades-long projections by at least 1 tCha(-1). Our results show the benefits of implementing SDA methods for forecasting SOC as well as highlight implementation aspects that need consideration and further research.Peer reviewe

Dose monitoring in pediatric and young adult head and cervical spine CT studies at two emergency duty departments

PurposeAs the number of pediatric computed tomography (CT) imaging is increasing, there is a need for real-time radiation dose monitoring and evaluation of the imaging protocols. The aim of this study was to present the imaging data, patient doses, and observations of pediatric and young adult trauma—and routine head CT and cervical spine CT collected by a dose monitoring software.MethodsPatient age, study date, imaging parameters, and patient dose as volume CT dose index (CTDIvol) and dose length product (DLP) were collected from two emergency departments’ CT scanners for 2-year period. The patients were divided into four age groups (0–5, 6–10, 11–15, and 16–20 years) for statistical analysis and effective dose determination. The 75th percentile doses were evaluated to be used as local diagnostic reference levels (DRLs).ResultsSix hundred fifteen trauma head, 318 routine head, and 592 trauma cervical spine CT studies were assessed. All mean CTDIvol values were statistically lower in hospital B (40.3 ± 12.3, 30.03 ± 11.1, and 6.9 ± 3.1 mGy, respectively) than in hospital A (53.0 ± 12.9, 43.2 ± 8.7, and 18.3 ± 7.3 mGy, respectively). Statistically significant differences were observed on scanning length between hospitals and between CTDIvol values when protocol was updated. The 75th percentiles of trauma cervical spine in hospital B can be used as local DRL. Non-optimized protocols were also revealed in hospital A.ConclusionDose monitoring software offers a valuable tool for evaluating the imaging practices and finding non-optimized protocols.</div

National MEDigi project: systematic implementation of digitalization to undergraduate medical and dental education in Finland

MEDigi is a nationwide Finnish project that aims to develop and implement digital teaching, learning and assessment solutions and to provide possibilities for national harmonization of undergraduate medical and dental education in Finland. The MEDigi project will investigate the options and feasibility of a common national digital online platform and produce digital content and solutions for medical education. Furthermore, tools and support system for digital pedagogy training will be created to ensure that the teaching staff will achieve and retain appropriate digipedagogical skills. The project aims also to increase the competence related to the digital tools used in clinical practice (eHealth, digital health) of physicians and dentists. Furthermore, academic research will be carried out on various aspects of the project. All the universities in Finland that offer the Licentiate Degree in Medicine and Dentist programmes are involved: Universities of Eastern Finland, Helsinki, Oulu, Tampere and Turku. The project is coordinated by the University of Oulu. The project is carried out in close collaboration with the Finnish Medical Society Duodecim and the Finnish Dental Society Apollonia. The project lifespan is until the end of May 2021. MEDigi project is financed by the Finnish Ministry of Culture and Education and its total budget is over 4 million euros.</p

Lääketieteen opiskelijoiden työelämälähtöinen näkemys perusopetuksen kehityskohteista : entistäkin parempia kesäkandeja

Vertaisarvioitu. English summary. Teema : kesänumero : tutkimus ja opetusLääketieteen perusopetuksen tärkeä tavoite on antaa opiskelijalle hyvät käytännön valmiudet toimia lääkärin tehtävissä. Suurin osa ylimpien vuosikurssien opiskelijoista työskentelee kesäaikana lääkärinä. Pyysimme kesätöissä olleita kahden ylimmän vuosikurssin opiskelijoita arvioimaan työelämävalmiuksiaan ja antamaan ehdotuksia perusopetuksen kehittämiseksi. Onnistumisia oli koettu ammattihenkilöstön välisen yhteistyön, potilas-lääkärivuorovaikutuksen ja potilaan haastattelemisen osa-alueilla. Heikoimmin oli onnistuttu toimenpiteissä, diagnoosin löytämisessä ja potilaan tutkimisessa. Perusopetusta toivottiin tapauslähtöisemmäksi ja enemmän perusterveydenhuollossa tarvittavaa osaamista painottavaksi. Ohjaavaa yksilöllistä palautetta ja toimenpideopetusta haluttiin lisää. Toivelistalla oli myös lausuntojen laatimisen opetusta, lääkehoidon erityiskysymysten huomiointia, moniammatillisen yhteistyön harjoittelua ja lääkäriksi kasvamisen tukemista.Peer reviewe

Sähköisten terveyspalveluiden opetus lääketieteessä

Vertaisarvioitu.Digitalisaation myötä terveydenhuollon toiminnot muuttuvat nopeasti, ja sähköiset työkalut sekä palvelut ovat jo arkipäivää. Vaikutukset näkyvät koulutustarpeena, koska terveydenhuollon ammattilaisten digiosaaminen tulee turvata. Lääkärien peruskoulutuksen tulisi sisältää etälääketiedettä ja sähköisen terveydenhuollon palveluja (e-health) koskevaa opetusta. Kansallisessa MEDigi-hankkeessa määriteltiin suomalaisen e-health-opetuksen aihealueet ja tehtiin niille ydinainesanalyysi. Työryhmän työn perusteella määräytyi kaksitoista e-health-opetukseen soveltuvaa aihealuetta lääketieteen ja hammaslääketieteen peruskoulutuksessa. Niiden sisältämien opetusaiheiden keskeisyys määriteltiin kolmiportaisesti. Tuloksia sovellettiin pilottina Oulun yliopistossa lääketieteen viidennen vuosikurssin opiskelijoille toteutettuun teemapäivään, jonka opetussisältö muokattiin vastaamaan ydinainesanalyysin tuloksia. Opetus toteutettiin koronapandemian takia kokonaan etäopetuksena. Jatkossa tavoitteena on kansallisesti integroida ydinainesanalyysiin perustuva e-health-opetus suomalaiseen lääkärikoulutukseen

Sähköisten terveyspalveluiden opetus lääketieteessä

Vertaisarvioitu.Digitalisaation myötä terveydenhuollon toiminnot muuttuvat nopeasti, ja sähköiset työkalut sekä palvelut ovat jo arkipäivää. Vaikutukset näkyvät koulutustarpeena, koska terveydenhuollon ammattilaisten digiosaaminen tulee turvata. Lääkärien peruskoulutuksen tulisi sisältää etälääketiedettä ja sähköisen terveydenhuollon palveluja (e-health) koskevaa opetusta. Kansallisessa MEDigi-hankkeessa määriteltiin suomalaisen e-health-opetuksen aihealueet ja tehtiin niille ydinainesanalyysi. Työryhmän työn perusteella määräytyi kaksitoista e-health-opetukseen soveltuvaa aihealuetta lääketieteen ja hammaslääketieteen peruskoulutuksessa. Niiden sisältämien opetusaiheiden keskeisyys määriteltiin kolmiportaisesti. Tuloksia sovellettiin pilottina Oulun yliopistossa lääketieteen viidennen vuosikurssin opiskelijoille toteutettuun teemapäivään, jonka opetussisältö muokattiin vastaamaan ydinainesanalyysin tuloksia. Opetus toteutettiin koronapandemian takia kokonaan etäopetuksena. Jatkossa tavoitteena on kansallisesti integroida ydinainesanalyysiin perustuva e-health-opetus suomalaiseen lääkärikoulutukseen

Sähköisten terveyspalveluiden opetus lääketieteessä

publishedVersio

Protein phosphatase 2A (PP2A) inhibitor CIP2A indicates resistance to radiotherapy in rectal cancer

Preoperative (chemo)radiotherapy, (C)RT, is an essential part of the treatment of rectal cancer patients, but tumor response to this therapy among patients is variable. Thus far, there are no clinical biomarkers that could be used to predict response to (C)RT or to stratify patients into different preoperative treatment groups according to their prognosis. Overexpression of cancerous inhibitor of protein phosphatase 2A (CIP2A) has been demonstrated in several cancers and is frequently associated with reduced survival. Recently, high CIP2A expression has also been indicated to contribute to radioresistance in head and neck squamous cell carcinoma, but few studies have examined the connection between CIP2A and radiation response regarding other malignancies. We have evaluated CIP2A protein expression levels in relation to tumor regression after preoperative (C)RT and survival of rectal adenocarcinoma patients. The effects of CIP2A knockdown by siRNA on cell survival were further investigated in colorectal cancer cells exposed to radiation. Patients with low-CIP2A-expressing tumors had more frequently moderate or excellent response to long-course (C)RT than patients with high-CIP2A-expressing tumors. They also had higher 36-month disease-specific survival (DSS) rate in categorical analysis. In the multivariate analysis, low CIP2A expression level remained as an independent predictive factor for increased DSS. Suppression of CIP2A transcription by siRNA was found to sensitize colorectal cancer cells to irradiation and decrease their survival in vitro. In conclusion, these results suggest that by contributing to radiosensitivity of cancer cells, low CIP2A protein expression level associates with a favorable response to long-course (C)RT in rectal cancer patients.</p