Landscape of Transcription in Human Cells

Eukaryotic cells make many types of primary and processed RNAs that are found either in specific subcellular compartments or throughout the cells. A complete catalogue of these RNAs is not yet available and their characteristic subcellular localizations are also poorly understood. Because RNA represents the direct output of the genetic information encoded by genomes and a significant proportion of a cell’s regulatory capabilities are focused on its synthesis, processing, transport, modification and translation, the generation of such a catalogue is crucial for understanding genome function. Here we report evidence that three-quarters of the human genome is capable of being transcribed, as well as observations about the range and levels of expression, localization, processing fates, regulatory regions and modifications of almost all currently annotated and thousands of previously unannotated RNAs. These observations, taken together, prompt a redefinition of the concept of a gene

An Integrated Encyclopedia of DNA Elements in the Human Genome

The human genome encodes the blueprint of life, but the function of the vast majority of its nearly three billion bases is unknown. The Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project has systematically mapped regions of transcription, transcription factor association, chromatin structure and histone modification. These data enabled us to assign biochemical functions for 80% of the genome, in particular outside of the well-studied protein-coding regions. Many discovered candidate regulatory elements are physically associated with one another and with expressed genes, providing new insights into the mechanisms of gene regulation. The newly identified elements also show a statistical correspondence to sequence variants linked to human disease, and can thereby guide interpretation of this variation. Overall, the project provides new insights into the organization and regulation of our genes and genome, and is an expansive resource of functional annotations for biomedical research

ANALISIS ALIH KODE DAN CAMPUR KODE DALAM PESAN GRUP WHATSAPP MAHASISWA SEMESTER VIII PENDIDIKAN BAHASA DAN SASTRA INDONESIA UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH KUPANG

Penelitian ini bertujuan untuk memaparkan jenis-jenis dan faktor penyebab terjadinya alih kode dancampur kode dalam pesan grup whatsapp mahasiswa Program Studi Pendidikan Bahasa dan SastraIndonesia Universitas Muhammadiyah Kupang. Penelitian ini merupakan jenis penelitian kualitatifdengan menggunakan metode deskriptif . Data dalam penelitian ini berupa data tulisan yaknibahasa yang digunakan dalam pesan grup whatsapp mahasiswa dan data pendukung berupatangkapan layar Handphone (screen shoot). Teknik analisis data dengan teknik analisis deskriptif.Analsisis data dengan cara mentranskipkan, memilih, mengumpulkan, menandai, mengidentifikasi,mengklasifikasikan, menganalisis, membahas dan meyimpulkan hasil penelitian. Hasil penelitianmenunjukan jenis alih kode yang terdapat dalam pesan grup whatsapp mahasiswa PBSI adalah alihkode intern dan alih kode ekstern. Alih kode intern berlangsung dari bahasa Melayu Kupang kebahasa Indonesia. Alih kode ekstern terjadi dari bahasa Indonesia ke bahasa Inggris. Sedangkanjenis campur kode yang terjadi adalah campur kode ke dalam, campur kode keluar dan campur kodecampuran. Campur kode ke dalam berlangsung dari bahasa Adonara ke bahasa Indonesia. Campurkode ke luar berlangsung dari bahasa Indonesia ke bahasa Inggris. Campur kode campuranberlangsung dari bahasa Indonesia, bahasa Melayu Kupang dan bahasa Inggris. Faktor penyebabterjadinya alih kode adalah penutur, mitra tutur, hadirnya penutur ketiga, perubahan situasi formalke informal atau sebaliknya, dan berubahnya topik pembicaraan. Sedangkan faktor yangmenyebabkan terjadinya campur kode adalah keterbatasan penggunaan kode, penggunaan istilahyang lebih populer dan sekedar untuk bergengsi

Teacher and Student Interpersonal Communication through a Moodle-Based Learning Management System Application in Improving Student Learning Achievement in SMA Negeri Kota Depok

This study aims to determine the Interpersonal Communication of Teachers and Students through the Moodle-based Learning Management System Application in Improving Student Learning Achievement at Depok State High School. The theory used is the theory of SOR and symbolic interactional theory. The results of this study indicate that learning is done through the application of Moodle-based LMS can facilitate interpersonal communication between teachers and students in giving and receiving learning materials that teachers convey, but because learning is done online, it can be said to be still less effective than face-to-face teaching and learning activities in schools. Teacher equality in giving understanding to students can be shown through the material that teachers provide through the media contained in the Moodle-based LMS application students can more easily understand the learning materials provided so as to help students to still be able to improve learning achievement in school

Efektifitas Strategi Brain Game terhadap Minat Belajar Siswa Kelas VII SMP Guppi Samata Kabupaten Gowa Tahun Ajaran 2015-2016

Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa : (1) Penerapan strategi Brain Game pada siswa kelas VII SMP Guppi Samata Kab.Gowa, berdasarkan analisis lembar obsevasi kegiatan guru dan lembar penilaian diri siswa adalah berada pada kategori sangat tinggi, karena siswa memahami materi dan guru melaksanakan semua langkah-langkah strategi pembelajaran Brain Game; (2) Gambaran minat belajar siswa setelah diajar dengan strategi Brain Game pada siswa kelas VII SMP Guppi Samata Kab.Gowa menunjukkan bahwa strategi Brain Game yang digunakan dalam penelitian ini dapat membangkitkan minat belajar siswa untuk belajar berdasarkan analisis angket minat belajar berada pada kategori tinggi, karena siswa memiliki rasa senang, perhatian, tertarik dan aktif dalam strategi pembelajaran Brain Game; (3) Strategi Brain Game terbilang efektif dalam meningkatkan minat belajar siswa kelas VII SMP Guppi Samata Kab.Gowa. Karena siswa memiliki minat setelah mengikuti proses belajar mengajar dengan menggunakan strategi Brain Game. Implikasi penelitian adalah karena strategi Brain Game dengan rangkaian Teka Teki Silang dapat digunakan dalam mencapai minat belajar yang tinggi, maka diharapkan kepada peneliti/guru selanjutnya untuk meneliti lebih lanjut dengan jenis brain game yang lain, yang sesuai dengan materi yang akan diajarkan

Long Noncoding RNAs are Rarely Translated in Two Human Cell Lines

Data from the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project show over 9640 human genome loci classified as long noncoding RNAs (lncRNAs), yet only ~100 have been deeply characterized to determine their role in the cell. To measure the protein-coding output from these RNAs, we jointly analyzed two recent data sets produced in the ENCODE project: tandem mass spectrometry (MS/MS) data mapping expressed peptides to their encoding genomic loci, and RNA-seq data generated by ENCODE in long polyA+ and polyA– fractions in the cell lines K562 and GM12878. We used the machinelearning algorithm RuleFit3 to regress the peptide data against RNA expression data. The most important covariate for predicting translation was, surprisingly, the Cytosol polyA– fraction in both cell lines. LncRNAs are ~13-fold less likely to produce detectable peptides than similar mRNAs, indicating that ~92% of GENCODE v7 lncRNAs are not translated in these two ENCODE cell lines. Intersecting 9640 lncRNA loci with 79,333 peptides yielded 85 unique peptides matching 69 lncRNAs. Most cases were due to a coding transcript misannotated as lncRNA. Two exceptions were an unprocessed pseudogene and a bona fide lncRNA gene, both with open reading frames (ORFs) compromised by upstream stop codons. All potentially translatable lncRNA ORFs had only a single peptide match, indicating low protein abundance and/or false-positive peptide matches. We conclude that with very few exceptions, ribosomes are able to distinguish coding from noncoding transcripts and, hence, that ectopic translation and cryptic mRNAs are rare in the human lncRNAome

Evaluasi Kinerja Saluran Drainase Kawasan Kampus Universitas Jenderal Soedirman Purbalingga (Studi Kasus: Fakultas Teknik)

Salah satu infrastruktur yang sangat berpengaruh dan berperan penting dalam kehidupan serta pembangunan adalah infrastruktur drainase yang berfungsi untuk mengalirkan limpasan air yang berada dipermukaan tanah. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui kinerja saluran drainase eksisting serta debit banjir rencana di kawasan Fakultas Teknik Unsoed. Data yang digunakan dalam penelitian ini berupa data primer dan data sekunder, data primer adalah data yang didapatkan langsung dilapangan sedangkan data sekunder meliputi peta, luas wilayah dan data curah hujan. Metode untuk menghitung beban pengaliran menggunakan Metode Rasional, sedangkan untuk menghitung kapasitas pengaliran saluran yang ada menggunakan rumus Qc = v × A. Rasio diperoleh dengan cara membandingkan beban pengaliran dan kapasitas pengaliran. Hasil penelitian di kawasan Fakultas Teknik Unsoed adalah kapasitas saluran drainase mampu menampung debit limpasan yang terjadi

ANALISIS PERBANDINGAN KINERJA KEUANGAN PERUSAHAAN INDUSTRI BARANG DAN KONSUMSI SUB SEKTOR ROKOK YANG TERDAFTAR DI BURSA EFEK INDONESIA (BEI) (Studi Kasus pada PT. Bentoel Internasional Investama Tbk dan PT. Wismilak Inti Makmur Tbk Periode 2016-2020)

The success of a company in running its business can be seen from the company's financial performance which can be seen from the reports that describe the company's finances from a certain period. The good and bad condition of the company can be seen from the analysis of the company's financial statements. In this case, ratio analysis can be used to provide an overview of the financial performance of the financial performance regarding the sustainable development of the company the company does business. This study aims to find out how the performance comparison of financial ratios at the company PT. Bentoel Internasional Investama Tbk and PT. Wismilak Inti Makmur Tbk. The data analysis method used in this study is a quantitative descriptive analysis method using financial ratios. The results of this study indicate that in terms of the Liquidity Ratio Proxy Current Ratio and the Solvency Ratio Proxy Debt to Asset Ratio there is a significant difference and in terms of the ratio of the Total Assets Turnover Proxy Activity and the Profitability Ratio of the Return on Equity Proxy there is no significant difference.Keywords: financial performance; Liquidity Ratio Proxy Current Ratio; Solvency Ratio Proxy Debt to Asset Ratio; Proxy Activity Total Assets Turnover; Profitability Ratio Proxy Return on Equity

INDEKS ISOLASI SEXUAL ANTARA LALAT BUAH (DROSOPHILAMELANOGASTER (MEIGEN)) DARI MOYA, PULAU TERNATE DAN GURABUNGA, PULAU TIDORE

Barreir geografis berupa laut/selat antara Pulau Ternate dan Tidore mengisolasi pertemuan populasi Drosophilamelanogaster masing-masing, sehingga perkawinan antara keduanya sangat kecil dan berpeluang terjadinya isolasi seksual yang memungkinkan mengalami allopatrik spesiasi.  Penelitian ini bertujuan melihat indeks isolasi lalat buah Drosophila melanogaster antara kedua populasi tersebut. Metode penelitian dilakukan dengan desain perkawinan dalam empat kelompok perlakukan berdasarkan jenis kelamin dan asal populasi. Lalat jantan virgin disatukan dengan betina virgin dari asal yang sama dan dari asal yang berbeda secara berkebalikan sebanyak 5x perlakukan dengan 10x pengulangan masing-masing kelompok. Indeks isolasi dihitung berdasarkan persen selisih perkawinan lalat sesama pulau dengan pulau yang berbeda dibandingkan dengan total perkawinan.Indeks isolasi yang didapatkan yakni 0,1. Ini artinya tidak ada isolasi seksual antara lalat dari Pulau Ternate dengan TidoreKata kunci : Drosophilamelanogaster, isolasi seksual, Ternate, Tidor