X-kromosomin inaktivaation epigenetiikkaa

Tiivistelmä. Nisäkkäiden sukupuolen määräytyminen sukupuolikromosomien mukaisesti aiheuttaa geenituotteiden epätasapainoa. XX- ja XY-sukupuolikromosomien systeemi tuottaa eriarvoisen määrän proteiineja ja RNA:ita sukupuolien välillä, sillä nisäkäsnaarailla on kaksi X-kromosomia ja siten kaksinkertainen määrä sukupuolikromosomaalisia geenejä. Koiraiden yksi X-kromosomi sisältää suurimman osan geeneistä, kun taas sukupuolen määrittävän alueen sisältävä Y-kromosomi on geneettisesti köyhtynyt. Y-kromosomin morfologinen erilaistuminen X-kromosomista on ollut seurausta lokusten välisen rekombinaation estymisestä. Evolutiivinen valintapaine on kehittänyt erilaisia mekanismeja, annoskompensaatioita, geenituotteiden epätasapainon välttämiseksi. Annoskompensaatiomekanismit muuttavat sukupuolilinkittyneiden geenien ilmentymistä, jotta kumpikin sukupuoli ilmentäisi niitä tasapuolisesti. Mekanismeja ovat X-kromosomin kaksinkertainen ylisäätely, molempien hermafrodiittisten X-kromosomien alisäätely sekä X-kromosomin inaktivaatio. Tutkielmassa keskitytään X-kromosomin inaktivaatioon, jota ilmentyy nisäkkäillä. X-kromosomin inaktivaatio on molekyylitapahtumien sarja, jossa yksi naaraan X-kromosomeista inaktivoidaan satunnaisesti tai leimatusti. Inaktivaatio perustuu kromatiinirakenteiden epigeneettisiin modifikaatioihin sekä ei-koodaavien RNA:iden toimintaan. Satunnaisessa X-inaktivaatiossa kummallakin X-kromosomilla on yhtäläinen mahdollisuus hiljentyä. Pussieläinten ja kehittyvien hiirten alkioissa inaktivoituminen on leimattua ja hiljennettävä X-kromosomi on aina isältä peritty. Inaktivoitu X-kromosomi poikkeaa aktiivisesta homologistaan myöhäisemmällä replikaatioajankohdalla, Barr-kappaleella sekä histonien erilaisilla metylaatioilla ja asetylaatioilla. Poikkeuksena ovat X-inaktivaatiota väistävät geenit, jotka sijaitsevat hiljennetyssä X-kromosomissa, mutta ilmentyvät yhtäaikaisesti aktiivisen X-kromosomin geenien kanssa. Geenien hiljentymiseltä väistyminen on seurausta epänormaaleista epigeneettisistä muutoksista, kuten CpG-saarien metylaatioiden puuttumisesta sekä toistoelementtien epänormaalista jakautumisesta. Epigeneettisten prosessien säätelyn epäonnistuminen voi myös johtaa erilaisiin sairauksiin, kuten Rett-oireyhtymään, tai jopa kasvainten kehitykseen. Nisäkkäiden annoskompensaatiomekanismin tutkiminen on tuottanut paljon tietoa muilla epigenetiikan osa-alueilla, syöpädiagnostiikassa sekä geeniekspression säännöstelystä. Lukuisista löydöksistä ja havainnoista huolimatta X-kromosomin inaktivaatio herättää vielä useita vastaamattomia kysymyksiä ja aihetta läpikohtaiselle tutkimukselle

β-adrenoseptorit ja niiden merkitys astmassa sekä sydänsairauksissa

Tiivistelmä. β-adrenoseptorit, eli β-adrenergiset reseptorit ovat G-proteiinikytkentäntäisiä reseptoreita, jotka ohjaavat soluissa erilaisia katekoliamiinien tuomia signaaleja. β-adrenoseptoreita nähdään useissa eri kudoksissa ja niitä koodaa kolme eri geeniä, jotka tuottavat β1-, β2- ja β3-adrenoseptoreita. Näiden β-adrenoseptorien välittämät signaalit ovat merkittävässä osassa sydämen toiminnan sekä hengitysteiden laajentumisen säätelyssä. β-adrenoseptorit ovatkin farmakologisesti erittäin tärkeitä ja niihin kohdistuvilla lääkkeillä on jo pitkään hoidettu sydänsairauksia sekä astmaa. Vaikka sairauksien patofysiologiaa ei aina voidakkaan selittää yksin β-adrenoseptorien toiminnalla, häiriöt näiden reseptorien toiminnassa on liitettyinä monien sairauksien kulkuun ja oireisiin

Mixing height determination by ceilometer

International audienceA novel method for estimating the mixing height based on ceilometer measurements is described and tested against commonly used methods for determining mixing height. In this method an idealised backscatter profile is fitted to the observed backscatter profile. The mixing height is one of the idealised backscatter profile parameters. An extensive amount of ceilometer data and vertical soundings data from the Helsinki area in 2002 is utilized to test the applicability of the ceilometer for mixing height determination. The results, including 71 convective and 38 stable cases, show that in clear sky conditions the mixing heights determined from ceilometer based aerosol profiles and BL-height estimates based on sounding data are in a good agreement. Rejected outlier cases corresponded to very low aerosol concentrations in the mixed layer leading to a very weak aerosol backscatter signal in the lowest layer

Interaction between clients and physiotherapists in group exercise classes in geriatric rehabilitation

The aim of this paper is to explore how older people construct their interaction in group exercise classes in geriatric rehabilitation and what is their contribution to the interaction. Discourse analysis was employed and data, consisting of seven videotaped group-based exercise sessions, were collected from 52 older people (aged 66–93 years) and nine rehabilitation professionals in seven rehabilitation centres. Four discourse categories were found. In “taciturn exercising”, older people remained verbally silent but physically active. In “submissive disagreeing”, older people opposed the professionals’ agenda by displaying reluctant consent to proposals. In “resilient endeavouring”, older adults persisted on their course of action, regardless of the disapproval of the professionals. In “lay helping”, older people initiated spontaneous encouragement, but also gave verbal and physical assistance to their peers. Older people's meaningful contribution to interaction, whilst it may challenge the institutional flow of activities, can constitute an integral part of the re-ablement process of rehabilitation

Modeling phosphorus diffusion gettering of iron in single crystal silicon

We propose a quantitative model for phosphorus diffusion gettering (PDG) of iron in silicon, which is based on a special fitting procedure to experimental data. We discuss the possibilities of the underlying physics of the segregation coefficient. Finally, we show that the proposed PDG model allows quantitative analysis of gettering efficiency of iron at various processing conditions.Peer reviewe

Modeling boron diffusion gettering of iron in silicon solar cells

In this paper, a model is presented for boron diffusion gettering of iron in silicon during thermal processing. In the model, both the segregation of iron due to high boron doping concentration and heterogeneous precipitation of iron to the surface of the wafer are taken into account. It is shown, by comparing simulated results with experimental ones, that this model can be used to estimate boron diffusion gettering efficiency of iron under a variety of processing conditions. Finally, the application of the model to phosphorus diffusion gettering is discussed.Peer reviewe

Ownership and governance of Finnish infrastructure networks

This research report investigates and analyzes the pros and cons of different ownership and governance models of infrastructure networks. The report covers most infrastructure networks: transportation networks (roads, streets, railways, airports, harbors) and utility networks (water and sewage, energy and electricity). There is no unifying solution that would fit all sectors in terms of the most efficient ownership model. However, in many sectors reforms are needed towards more elaborated client-supplier frameworks to ensure greater efficiency and cost transparency. Surprisingly, traditional organizational structures do not seem to impact on financial returns of those networks that provide user-financed services. In Finland technical infrastructure networks are typically owned, administered and managed by the public sector as they are considered public goods and critical assets for the wellbeing of citizens. In many ways the sectors have remained passive and with little interaction towards more innovative service provision solutions or organizational models. In terms of developing the networks’ services and their profitability, the greatest business opportunity would result from allowing open entry to market and competition in contracting. This would mean abandonment of negotiated contracts and proactive evolution of functional markets. The scope of business opportunities will increase in all aspect of service delivery; from management to engineering and economic studies, asset management systems, construction and maintenance works, and the labor to do all that

HybridDeepRx: Deep Learning Receiver for High-EVM Signals

In this paper, we propose a machine learning (ML) based physical layer receiver solution for demodulating OFDM signals that are subject to a high level of nonlinear distortion. Specifically, a novel deep learning based convolutional neural network receiver is devised, containing layers in both time- and frequency domains, allowing to demodulate and decode the transmitted bits reliably despite the high error vector magnitude (EVM) in the transmit signal. Extensive set of numerical results is provided, in the context of 5G NR uplink incorporating also measured terminal power amplifier characteristics. The obtained results show that the proposed receiver system is able to clearly outperform classical linear receivers as well as existing ML receiver approaches, especially when the EVM is high in comparison with modulation order. The proposed ML receiver can thus facilitate pushing the terminal power amplifier (PA) systems deeper into saturation, and thereon improve the terminal power-efficiency, radiated power and network coverage.Comment: To be presented in the 2021 IEEE International Symposium on Personal, Indoor and Mobile Radio Communication

Principal-component analysis of two-particle azimuthal correlations in PbPb and pPb collisions at CMS

Peer reviewe