103 research outputs found

    Development of Grb2 SH2 Domain Signaling Antagonists: A Potential New Class of Antiproliferative Agents

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    Aberrant signaling through protein-tyrosine kinase (PTK)-dependent pathways is associated with several proliferative diseases. Accordingly, PTK inhibitors are being developed as new approaches for the treatment of certain cancers. Growth factor receptor bound protein 2 (Grb2) is an important downstream mediator of PTK signaling that serves obligatory roles in many pathogenic processes. One of the primary functions of Grb2 is to bind to specific phosphotyrosyl (pTyr)-containing sequences through its Src homology 2 (SH2) domain. Agents that bind to the Grb2 SH2 domain and prevent its normal function could disrupt associated PTK signaling and serve as alternatives to kinase-directed inhibitors. Starting from the X-ray crystal structure of a lead peptide bound to the Grb2 SH2 domain, this review will summarize important contributions to these efforts. The presentation will be thematically arranged according to the region of peptide modified, proceeding from the N-terminus to the C-terminus, with a special section devoted to aspects of conformational constraint

    A human glomerular SAGE transcriptome database

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    Background: To facilitate in the identification of gene products important in regulating renal glomerular structure and function, we have produced an annotated transcriptome database for normal human glomeruli using the SAGE approach. Description: The database contains 22,907 unique SAGE tag sequences, with a total tag count of 48,905. For each SAGE tag, the ratio of its frequency in glomeruli relative to that in 115 non-glomerular tissues or cells, a measure of transcript enrichment in glomeruli, was calculated. A total of 133 SAGE tags representing well-characterized transcripts were enriched 10-fold or more in glomeruli compared to other tissues. Comparison of data from this study with a previous human glomerular Sau3A-anchored SAGE library reveals that 47 of the highly enriched transcripts are common to both libraries. Among these are the SAGE tags representing many podocyte-predominant transcripts like WT-1, podocin and synaptopodin. Enrichment of podocyte transcript tags SAGE library indicates that other SAGE tags observed at much higher frequencies in this glomerular compared to non-glomerular SAGE libraries are likely to be glomerulus-predominant. A higher level of mRNA expression for 19 transcripts represented by glomerulus-enriched SAGE tags was verified by RT-PCR comparing glomeruli to lung, liver and spleen. Conclusions: The database can be retrieved from, or interrogated online at http://cgap.nci.nih.gov/SAGE. The annotated database is also provided as an additional file with gene identification for 9,022, and matches to the human genome or transcript homologs in other species for 1,433 tags. It should be a useful tool for in silico mining of glomerular gene expression

    Novel non-phosphorylated peptides binding to the Grb2-SH2 domain

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    18 -Développement et transfert international des technologies avancées dans le domaine de la télématique pour l'environnement -L'expérience du L.H.F.

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    Depuis sa création en 1987, en poursuivant la tradition de SOGREAH dans ce domaine, le «fond de commerce » du LHF a consisté à élaborer et implanter , dans le domaine des ressources en eau, des applications des Technologies d’informations et des Communications (TIC) intégrées avec l’hydraulique et l’hydrologie. Notamment en forgeant, avec d’autres sociétés et instituts européens, la nouvelle technologie qui n’est pas une application des TIC aux ressources en eau mais plutôt une intégration synergique des deux : Hydroinformatique. Cette activité innovante a permis au LHF d’influencer jusqu’à un certain point l’évolution de la pensée dans le domaine de l’eau en France, d’une part, et de porter les idées et les solutions de l’Ecole française de l’Eau à l’étranger, d’autre part. Pour illustrer ces propos quatre points suivants sont exposés dans cet article : participation à la définition et à l’exécution du 4e Programme Cadre de Recherche et Développement (PCRD )de l’Union Européenne ; mise en place des systèmes Hydro informatique s opérationnels (gestion des risques d’inondation à Shanghai ) ou prototypes (prévision des crues éclairs en France ), développement des méthodologies et de systèmes hydroinformatiques nouveaux, porteurs de l’avenir opérationnel : gestion de pollutions agricoles (EUREKA/ISMAP), méthodes d’interprétation des résultats d’ études fondées sur la logique floue , une nouvelle approche bi-dimensionnelle des études fluviales.Cunge Jean A., Erlich Marc, Rahuel J. L. 18 -Développement et transfert international des technologies avancées dans le domaine de la télématique pour l'environnement -L'expérience du L.H.F. In: L'école française de l'eau au service du développement mondial. Congrès de la Société Hydrotechnique de France. 25èmes journées de l'hydraulique. Chambéry, du 15 au 18 septembre 1996. Tome 2, 1998
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