Effects of Saturn's magnetospheric dynamics on Titan's ionosphere

We use the Cassini Radio and Plasma Wave Science/Langmuir probe measurements of the electron density from the first 110 flybys of Titan to study how Saturn´s magnetosphere influences Titan´s ionosphere. The data is first corrected for biased sampling due to varying solar zenith angle and solar energy flux (solar cycle effects). We then present results showing that the electron density in Titan´s ionosphere, in the altitude range 1600-2400 km, is increased by about a factor of 2.5 when Titan is located on the nightside of Saturn (Saturn local time (SLT) 21-03 h) compared to when on the dayside (SLT 09-15 h). For lower altitudes (1100-1600 km) the main dividing factor for the ionospheric density is the ambient magnetospheric conditions. When Titan is located in the magnetospheric current sheet, the electron density in Titan´s ionosphere is about a factor of 1.4 higher compared to when Titan is located in the magnetospheric lobes. The factor of 1.4 increase in between sheet and lobe flybys is interpreted as an effect of increased particle impact ionization from 200 eV sheet electrons. The factor of 2.5 increase in electron density between flybys on Saturn´s nightside and dayside is suggested to be an effect of the pressure balance between thermal plus magnetic pressure in Titan´s ionosphere against the dynamic pressure and energetic particle pressure in Saturn´s magnetosphere.Fil: Edberg, N. J. T.. University of Iowa; Estados Unidos. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Andrews, D. J.. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Bertucci, Cesar. Consejo Nacional de Investigaciónes Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Astronomía y Física del Espacio. - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Astronomía y Física del Espacio; ArgentinaFil: Gurnett, D. A.. University of Iowa; Estados UnidosFil: Holmberg, M. K. G.. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Jackman, C. M.. University Of Southampton; Reino UnidoFil: Kurth, W. S.. University of Iowa; Estados UnidosFil: Menietti, J. D.. University Of Iowa; Estados UnidosFil: Opgenoorth, H. J.. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Shebanits, O.. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Vigren, E.. Swedish Institute of Space Physics; SueciaFil: Wahlund, J. E.. Swedish Institute of Space Physics; Sueci

An alginate-layer technique for culture of Brassica oleracea L. protoplasts

Ten accessions belonging to the Brassica oleracea subspecies alba and rubra, and to B. oleracea var. sabauda were used in this study. Protoplasts were isolated from leaves and hypocotyls of in vitro grown plants. The influence of selected factors on the yield, viability, and mitotic activity of protoplasts immobilized in calcium alginate layers was investigated. The efficiency of protoplast isolation from hypocotyls was lower (0.7 ± 0.1 × 106 ml−1) than for protoplasts isolated from leaf mesophyll tissue (2 ± 0.1 × 106 ml−1). High (70–90%) viabilities of immobilized protoplasts were recorded, independent of the explant sources. The highest proportion of protoplasts undergoing divisions was noted for cv. Reball F1, both from mesophyll (29.8 ± 2.2%) and hypocotyl (17.5 ± 0.3%) tissues. Developed colonies of callus tissue were subjected to regeneration and as a result plants from six accessions were obtained

Population studies of fungal plant pathogens: Perspectives for control with specific reference to grey leafspot

Plant diseases hinder food production globally. Of the known crop plant pathogens, fungi are perhaps the most widely adapted organisms. For disease control, host resistance has been the main method used through major gene deployment. Equally important, has been the use of fungicides. Over the last two decades these two control strategies have been fraught with rapid resistance erosion commonly referred to as the “boom and burst cycle,”. This raises urgent concerns with regard to development of effective alternative strategies such as use of fungicides. The use of fungicides is an effective strategy but they are potential sources of pollution into the environment, pose serious health risks to humans and are uneconomical for low-resource farmers. In this article the potential of how improved disease management strategies embodied in integrated disease management (IDM) can be developed based on a clear understanding of the pathosystem is discussed. We demonstrate that population and molecular genetics can be used to define pathosystems, estimate the evolutionary responsiveness of pathogens and from the data, design appropriate durable control methods. Various population and molecular genetic methodologies are described and how they can be incorporated into standard pathogen characterisation studies. Using grey leaf spot of maize (Cercospora zeae-maydis) as a case study, we show how these techniques can be used to generate information on genetic variability, providing for logical development of a durable IDM programme. Key words: Cercospora zeae-maydis, disease management, genetic tools, molecular markers RÉSUMÉ Les maladies de plante entravent globalement la production de nourriture. Des pathogènes de plante connus, les champignons sont peut être les plus rependus organismes adaptés. Pour le contrôle de maladie, la résistance hôte a été la méthode principale utilisée à travers le déploiement de gène majeur. Egalement important, a été l'usage des fongicides. Pour plus de deux décennies ces deux stratégies de contrôle ont été angoissées avec une rapide érosion de résistance communément connu à nous comme “boom and burst cycle” (cycle de boom et d'explosion). Ceci soulève les inquiétudes urgentes avec respect au développement des stratégies alternatives effectives comme l'usage des fongicides. L'usage des fongicides est une stratégie effective mais ces fongicides sont des sources potentielles de pollution dans l'environnement, pose des risques sérieux de santé aux humains et ne sont pas économiques pour les fermiers de faibles ressources. Dans cet article le potentiel de comment les stratégies améliorées de gestion des maladies incarnées dans une gestion intégrée des maladies (IDM) peut être développé basé sur une compréhension claire du pathosystème est discutée. Nous démontrons que la population et les génétiques moléculaires peuvent être utilisés pour définir les pathosystèmes, estimer les non réponses évolutionnaires des pathogènes et à partir des données, concevoir des méthodes de contrôle durables. Diverses populations et méthodologies génétiques moléculaires sont décrites et comment elles peuvent être incorporées dans les études de caractérisation de pathogène standard. Utilisant la tache grise de feuille de maïs (Cercospora zeae-maydis) comme cas d'étude, nous montrons comment ces techniques peuvent être utilisées pour générer l'information sur la variabilité génétique, pourvoyant le développement logique d'un programme d'IDM durable. Mots clés: Cercospora zeae-maydis, gestion de maladie, outils génétiques, indicateur moléculaire African Crop Science Journal Vol.12(4) 2004: 327-34

Assessment of Genetic Variation Among East African Cercospora zeae-maydis Populations

Rapid flagement length polymorphism (RFLP) and amplified flagement length polymorphism (AFLP) analyses were used to study genetic diversity of Cercospora zeae-maydis isolates collected from Uganda, Kenya and Rwanda. For comparative purposes, isolates from Zimbabwe and the United States of America (USA) were included. Phylogenetic analysis of AFLP data revealed two major clusters. One large cluster comprised of 75 African and US group II isolates and the second comprised cluster of 4 USA group I isolates. Similar groupings were observed with RFLP data. Analysis of molecular variation (AMOVA) based on AFLP data revealed a significant population structure between American and African populations (φ FST = 0.07). No population structure was detected, among African isolates (φ FST = 0.01), while a strong and significant structure was obtained between the two pathotypes (φ FST = 0.19). The AMOVA using RFLP data, showed absence of a population structure among African populations (φ FST = 0.01), and gene flow among African populations was high (49.5). These findings suggest that group II pathotype is predominant in East Africa and gene flow appears to be the fundamental evolutionary force accounting for the current genetic structure. A regional approach to abate epidemics is most suitable. Key Words: AFLP, AMOVA, gene flow, isolates, RFP, Zea mays Résumé Les analyses de polymorphisme rapide de flagellation de longueur (RFLP) et le polymorphisme amplifié e flagellation de longueur (AFLP) étaient utilisées pour étudier la diversité génetique des substances de Cercospora zeae-maydis collectées à partir de l\'Ouganda, Kenya et Rwanda. Pour des raisons comparatives, les substances de Zimbabwe et des Etats-unis d\'Amérique étaient inclues. L\'analyse phylogénique de donnée de l\'AFLP a révélée deux bouquets majeurs. Un large bouquet a compris des substances de 75 Africaines et groupe II des US et le second bouquet a compris des substances de 4 USA groupe I. Des groupements similaires étaient observés avec la donnée de RFLP. L\'analyse de variation moléculaire (AMOVA) basée sur la donnée d\'AFLP a révelé une structure significative de population entre les population Américaine et Africaine (φ FST =0,07). Aucune structure de population était détectée parmi les substances Africaines (φ FST =0,19). L\'AMOVA utilisant la donnée de RFLP, a montré une absence d\'une structure de population parmi les populations Africaines (φ FST =0,01), et un volume des génes parmi les populations Africaines était élevé (49.5). Les résultats suggèrent que le pathotype de groupe II est prédominant en Afrique de l\'Est et le volume de gènes apparait être la force évolutive fondamentale comptant pour la structure génetique courante. Une approache régionale de baisser les épidémies est plus valable. Mots Clés: AFLP, AMOVA, volume de gènes, substances, RFP, Zea mays (Af Crop Sci J 2003 Vol 11 No 2 pp75-86

Population Studies of Fungal Plant Pathogens: Perspectives for Control With Specific Reference to Grey Leafspot

Plant diseases hinder food production globally. Of the known crop plant pathogens, fungi are perhaps the most widely adapted organisms. For disease control, host resistance has been the main method used through major gene deployment. Equally important, has been the use of fungicides. Over the last two decades these two control strategies have been fraught with rapid resistance erosion commonly referred to as the “boom and burst cycle,”. This raises urgent concerns with regard to development of effective alternative strategies such as use of fungicides. The use of fungicides is an effective strategy but they are potential sources of pollution into the environment, pose serious health risks to humans and are uneconomical for low-resource farmers. In this article the potential of how improved disease management strategies embodied in integrated disease management (IDM) can be developed based on a clear understanding of the pathosystem is discussed. We demonstrate that population and molecular genetics can be used to define pathosystems, estimate the evolutionary responsiveness of pathogens and from the data, design appropriate durable control methods. Various population and molecular genetic methodologies are described and how they can be incorporated into standard pathogen characterisation studies. Using grey leaf spot of maize ( Cercospora zeae-maydis ) as a case study, we show how these techniques can be used to generate information on genetic variability, providing for logical development of a durable IDM programme.Les maladies de plante entravent globalement la production de nourriture. Des pathogènes de plante connus, les champignons sont peut être les plus rependus organismes adaptés. Pour le contrôle de maladie, la résistance hôte a été la méthode principale utilisée à travers le déploiement de gène majeur. Egalement important, a été l'usage des fongicides. Pour plus de deux décennies ces deux stratégies de contrôle ont été angoissées avec une rapide érosion de résistance communément connu à nous comme “boom and burst cycle” (cycle de boom et d'explosion). Ceci soulève les inquiétudes urgentes avec respect au développement des stratégies alternatives effectives comme l'usage des fongicides. L'usage des fongicides est une stratégie effective mais ces fongicides sont des sources potentielles de pollution dans l'environnement, pose des risques sérieux de santé aux humains et ne sont pas économiques pour les fermiers de faibles ressources. Dans cet article le potentiel de comment les stratégies améliorées de gestion des maladies incarnées dans une gestion intégrée des maladies (IDM) peut être développé basé sur une compréhension claire du pathosystème est discutée. Nous démontrons que la population et les génétiques moléculaires peuvent être utilisés pour définir les pathosystèmes, estimer les non réponses évolutionnaires des pathogènes et à partir des données, concevoir des méthodes de contrôle durables. Diverses populations et méthodologies génétiques moléculaires sont décrites et comment elles peuvent être incorporées dans les études de caractérisation de pathogène standard. Utilisant la tache grise de feuille de maïs ( Cercospora zeae-maydis ) comme cas d'étude, nous montrons comment ces techniques peuvent être utilisées pour générer l'information sur la variabilité génétique, pourvoyant le développement logique d'un programme d'IDM durable

ASSESSMENT OF GENETIC VARIATION AMONG EAST AFRICAN Cercospora zeae-maydis

Rapid flagement length polymorphism (RFLP) and amplified flagement length polymorphism (AFLP) analyses were used to study genetic diversity of Cercospora zeae-maydis   isolates collected from Uganda, Kenya and Rwanda. For comparative purposes, isolates from Zimbabwe and the United States of America (USA) were included. Phylogenetic analysis of AFLP data revealed two major clusters. One large cluster comprised of 75 African and US group II isolates and the second comprised cluster of 4 USA group I isolates. Similar groupings were observed with RFLP data. Analysis of molecular variation (AMOVA) based on AFLP data revealed a significant population structure between American and African populations (ϕ FST = 0.07). No population structure was detected, among African isolates (ϕFST = 0.01), while a strong and significant structure was obtained between the two pathotypes (ϕ FST = 0.19). The AMOVA using RFLP data, showed absence of a population structure among African populations (ϕ FST = 0.01), and gene flow among African populations was high (49.5). These findings suggest that group II pathotype is predominant in East Africa and gene flow appears to be the fundamental evolutionary force accounting for the current genetic structure. A regional approach to abate epidemics is most suitable