The relevance of the British royal family today

Tato práce se zabývá významem britské monarchie v současné době. První část je věnována historii monarchie od jejího vzniku až do první poloviny 20. století. Druhá část se zabývá osobnostmi a problémy královské rodiny v 21. století. Poslední část je věnována dotazníku, jehož účelem bylo zjistit názory obyvatel Spojeného království na vliv, problémy a budoucnost monarchie.ObhájenoThis thesis deals with the importance of the British monarchy today. The first part is devoted to the history of the monarchy from its inception until the first half of the 20th century. The second part deals with the personalities and problems of the royal family in the 21st century. The last part is devoted to a questionnaire, the purpose of which was to find out the views of the residents of the United Kingdom on the influence, problems and future of the monarchy

Poruchy epigenetické regulace na úrovní modifikací histonů u lymfomů

Lymphomas are a diverse group of malignant tumors that arise from lymphocytes, commonly affecting lymph nodes or the spleen. They are one of the most common types of tumors worldwide. Unfortunately, many subtypes have a poor prognosis, or are not currently fully curable with standard therapeutic approaches. Mutations in enzymes responsible for posttranslational modifications of histones are very common in certain subtypes of lymphoma, as well as in many other cancer types. These enzymes directly affect gene expression by changing the condensation state, and thus the accessibility, of chromatin. Some of these enzymes have been found to play an important role in the formation of germinal centers in lymphoid follicles. Therefore, their mutations can lead to uncontrolled proliferation and cancer development. Since many conventional therapeutic strategies are incapable of curing a large portion of lymphomas, novel and more targeted approaches are needed. Inhibition and/or modulation of the function of the aforementioned enzymes may be a basis for such approaches. Key words: lymphomas, epigenetic regulation, histone modifications, KMT2D, EZH2, CREBBP, EP300Lymfomy jsou různorodá skupina nádorů, které vznikají z lymfocytů a často se tvoří v lymfatických uzlinách nebo ve slezině. Lymfomy jednak patří mezi jedny z nejčastějších druhů zhoubných nádorů ve světě, a spousta typů má špatnou prognózu anebo není zatím možné jejich úplné vyléčení. U některých typů lymfomů, stejně tak jako u spousty jiných druhů nádorových onemocnění, jsou velmi časté mutace enzymů, které se funkčně podílejí na post-translačních modifikacích histonových proteinů. Tyto enzymy přímo ovlivňují genovou expresi tím, že mění kondenzaci a tím i přístupnost chromatinu. Vzhledem k tomu, že některé z těchto enzymů hrají důležitou roli při vzniku zárodečných center v lymfoidních folikulech, jejich mutace mohou vést k nekontrolované proliferaci a vzniku nádorového onemocnění. Standardní léčebné přístupy pomocí chemo-imunoterapie nejsou u podstatné části lymfomů dostatečné k jejich vyléčení. Nové a více cílené postupy s případnou inhibicí nebo modulací funkce těchto enzymů jsou tak nadějné cíle při hledání nových forem léčby. Klíčová slova: lymfomy, epigenetická regulace, histonové modifikace, KMT2D, EZH2, CREBBP, EP300Katedra buněčné biologieDepartment of Cell BiologyFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Přesné kvantově mechanické výpočty nekovalentních interakcí: Racionalizace rentgenových krystalových geometrií aparátem kvantové chemie

Spolehlivá a jednoduše aplikovatelná pravidla jsou potřebná v oblasti biochemie, supramolekulární chemie i materiálových vědách. Zároveň množství informací, které můžeme získat z rentgenových krystalových struktur o povaze rozpoznávacích procesů, je omezené. Lepší pochopení nekovalentních interakcí, které hrají nejdůležitější roli, je potřebné pro přezkoumání univerzálních pravidel, řídících jakékoliv rozpoznávací procesy. V této práci je prezentován systematický vývoj a studium přesnosti výpočetních metod, doplněný aplikacemi na systémech bílkovina DNA a hostitel host. Ne-empirické kvantově mechanické nástroje (metody DFT-D, MP2.5, CCSD(T) atd.) byly využity v několika projektech. Našli a potvrdili jsme existenci unikátních nízko ležících interakčních energií, vzdálených od zbývajících distribucí v několika párech aminokyselina−báze, které otevírají cestu k univerzálním pravidlům řídícím selektivní navázání jakékoliv sekvence DNA. Dále byly v několika případech provedeny predikce a ověřeny změny Gibbsovy energie (ΔG) a jejich komponentů a nakonec byly pečlivě porovnány s experimenty. Stanovili jsme, že molekula cholinu (Ch+) je vázána o 2.8 kcal/mol silněji (vypočtením ΔG) než acetylcholin (ACh+) v samo-uspořádané tří helikální rigidní kleci, odpovídající K(Ch+)/K(ACh+) = 109, což je v poměrně...There is a need for reliable rules of thumb for various applications in the area of biochemistry, supramolecular chemistry and material sciences. Simultaneously, the amount of information, which we can gather from X-ray crystal geometries about the nature of recognition processes, is limited. Deeper insight into the noncovalent interactions playing the most important role is needed in order to revise these universal rules governing any recognition process. In this thesis, systematic development and study of the accuracy of the computational chemistry methods followed by their applications in protein DNA and host guest systems, are presented. The non-empirical quantum mechanical tools (DFT-D, MP2.5, CCSD(T) etc. methods) were utilized in several projects. We found and confirmed unique low lying interaction energies distinct from the rest of the distributions in several amino acid−base pairs opening a way toward universal rules governing the selective binding of any DNA sequence. Further, the predictions and examination of changes of Gibbs energies (ΔG) and its subcomponents have been made in several cases and carefully compared with experiments. We determined that the choline (Ch+) guest is bound 2.8 kcal/mol stronger (calculated ΔG) than acetylcholine (ACh+) to self-assembled triple helicate rigid...Katedra fyzikální a makromol. chemieDepartment of Physical and Macromolecular ChemistryPřírodovědecká fakultaFaculty of Scienc

Influence of Metal, Ligand and Solvent on Supramolecular Polymerizations with Transition-Metal Compounds: A Theoretical Study

The nature of intermolecular interactions governing supramolecular polymerizations is very important to control their cooperativity. In order to address this problem, supramolecular columns made of Pt(II) and Pd(II) complexes of oligo(phenyleneethynylene)-based pyridine (OPE) and tetrazolyl-pyridine ligands (TEP) were investigated through the dispersion-corrected PM6 method. Aromatic, CH-π, M-Cl and metallophilic interactions helped stabilize the supramolecules studied, and their geometries and associated cooperativities were in excellent agreement with experimental data. The OPE ligand and/or the presence of Pt(II) have led to stronger metallophilic interactions and also to cooperative supramolecular polymerizations, which clearly suggests that metallophilic interactions are a key factor to control cooperativity. The results indicate that sequential monomer addition is in general less spontaneous than the combination of two larger pre-formed stacks. The present theoretical investigations contribute to the further understanding of the relation between the thermodynamics of supramolecular polymerizations and the nature of different synthons

IT infrastructure operating method - aspects influencing decision making

Tato diplomová práce je zaměřena na oblast IT infrastruktury a zejména na výběr nejvhodnější varianty. Jejím účelem je poskytnout vhodný metodický postup, který zajistí a napomůže nalezení té nejvýhodnější varianty provozu IT infrastruktury prostřednictvím aplikace identifikovaných aspektů, které jsou v různé míře zastoupeny v rámci definované množiny variant, které různou měrou kombinují tradiční model provozu IT infrastruktury s Cloud Computing službami. Možnost reálného využití postupu je zkoumána na základě dostupných dat o několika organizacích.This thesis is focused on the IT infrastructure field, mainly on the selection of its optimal variant. Its goal is to provide a suitable methodical procedure, which ensures and supports the most appropriate IT infrastructure operational model variant. It seeks to find it by way of identified aspects in use, which are, to various extents, incorporated within a defined variant set. These variants, in varying degrees, combine a traditional IT infrastructure operation model with Cloud Computing services. The possibility of application within real terms is examined based on available data of a few organizations

The relevance of the British royal family today

Tato práce se zabývá významem britské monarchie v současné době. První část je věnována historii monarchie od jejího vzniku až do první poloviny 20. století. Druhá část se zabývá osobnostmi a problémy královské rodiny v 21. století. Poslední část je věnována dotazníku, jehož účelem bylo zjistit názory obyvatel Spojeného království na vliv, problémy a budoucnost monarchie.ObhájenoThis thesis deals with the importance of the British monarchy today. The first part is devoted to the history of the monarchy from its inception until the first half of the 20th century. The second part deals with the personalities and problems of the royal family in the 21st century. The last part is devoted to a questionnaire, the purpose of which was to find out the views of the residents of the United Kingdom on the influence, problems and future of the monarchy

Přesné kvantově mechanické výpočty nekovalentních interakcí: Racionalizace rentgenových krystalových geometrií aparátem kvantové chemie

Spolehlivá a jednoduše aplikovatelná pravidla jsou potřebná v oblasti biochemie, supramoleculární chemie i materiálových vědách. Zároveň množství informací, které můžeme získat z rentgenových krystalových struktur o povaze rozpoznávacích procesů, je omezené. Lepší pochopení nekovalentních interakcí, které hrají nejdůležitější roli, je potřebný pro přezkoumání univerzálních pravidel řídících jakékoliv rozpoznávací procesy. V této práci je prezentován systematický vývoj a studium přesnosti výpočetních metod doplněný aplikacemi na systémech bílkovina DNA a hostitel host. Ne-empirické kvantově mechanické nástroje (metody DFT-D, MP2.5, CCSD(T) atd.) byly využity v několika projektech. Našli a potvrdili jsme existenci unikátních nízko ležících interakčních energií vzdálených od zbývajících distribucí v několika párech aminokyselina−báze, které otevírají cestu cestu k univerzálním pravidlům řídící selektivní navázání jakékoliv sekvence DNA. Dále byly v několika případech provedeny predikce a ověřeny změny Gibbsovy energie (ΔG), jejích komponentů a nakonec pečlivě porovnány s experimenty. Stanovili jsme, že molekula cholinu je vázána o 2.8 kcal/mol silněji (vypočtením ΔG) než acetylcholin v samo-uspořádané tří helikální rigidní kleci, odpovídající Kch/Kach = 109, což je v poměrně dobrém souhlasu s...There is a need for reliable rules of thumb for various applications in the area of biochemistry, supramolecular chemistry and material sciences. Simultaneously, the amount of information, which we can gather from X-ray crystal geometries about the nature of recognition processes, is limited. Deeper insight into the noncovalent interactions playing the most important role is needed in order to revise these universal rules governing any recognition process. In this thesis, systematic development and study of the accuracy of the computational chemistry methods followed by their applications in protein DNA and host guest systems, are presented. The non-empirical quantum mechanical tools (DFT-D, MP2.5, CCSD(T) etc. methods) were utilized in several projects. We found and confirmed unique low lying interaction energies distinct from the rest of the distributions in several amino acid−base pairs opening a way toward universal rules governing the selective binding of any DNA sequence. Further, the predictions and examination of changes of Gibbs energies (ΔG) and its subcomponents have been made in several cases and carefully compared with experiments. We determined that the choline guest is bound 2.8 kcal/mol stronger (calculated ΔG) than acetylcholine to self-assembled triple helicate rigid cage,...Katedra fyzikální a makromol. chemieDepartment of Physical and Macromolecular ChemistryFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Epigenetic Dysregulation through Histone Modifications in Lymphoma

Lymphomas are a diverse group of malignant tumors that arise from lymphocytes, commonly affecting lymph nodes or the spleen. They are one of the most common types of tumors worldwide. Unfortunately, many subtypes have a poor prognosis, or are not currently fully curable with standard therapeutic approaches. Mutations in enzymes responsible for posttranslational modifications of histones are very common in certain subtypes of lymphoma, as well as in many other cancer types. These enzymes directly affect gene expression by changing the condensation state, and thus the accessibility, of chromatin. Some of these enzymes have been found to play an important role in the formation of germinal centers in lymphoid follicles. Therefore, their mutations can lead to uncontrolled proliferation and cancer development. Since many conventional therapeutic strategies are incapable of curing a large portion of lymphomas, novel and more targeted approaches are needed. Inhibition and/or modulation of the function of the aforementioned enzymes may be a basis for such approaches. Key words: lymphomas, epigenetic regulation, histone modifications, KMT2D, EZH2, CREBBP, EP30

Variational and perturbational calculations of interaction energies of noncovalent clusters

Calculation of noncovalent interactions in set of complexes containing halogen atom (called Halogensx10) is the main subject of this thesis. Wide variety of semiempirical quantum mechanical (SQM) methods (AM1, RM1, PM3, PM6 and SCC-DFTB augmented with empirical correction for dispersion interaction and hydrogen bonding (D3H4)) have been tested and their accuracy was discussed. The SCC-DFTB-D3H4 method showed the advantage of no artificial behaviour for other types of interactions with exception of halogen bonding which is underestimated. Specific correction for halogen bonding was designed as a purely empirical fix of serious underestimation of interaction energy in halogen bonded complexes that yields results for validation set very close to benchmark interaction energies with average error is 0.3 kcal/mol ~ 6% of the interaction energy. As a benchmark method the CCSD(T) extrapolated to the CBS limit, according to Helgaker's scheme with rather large correlation consistent basis sets has been used. The results presented herein can be used in the rational design of halogenated ligands as well as in research of another halogen enriched compounds

E-government India

Tato práce má primárně za cíl vysvětlit pojem e-government a poskytnout ucelený pohled na počátky a následný vývoj e-governmentu v Indii. Práce dokládá přínosy i rizika a současně poukazuje na překážky v dalším rozvoji, které mohou vést k selhání celých projektů. Jsou tu uvedeny příklady tří úspěšně implementovaných a fungujících projektů spolu s různými metodami klasifikace a hodnocení jejich úspěšnosti. Pro srovnání je v této práci zahrnut evropský přístup k problematice e-governmentu, kterým je t-government užívaný ve Velké Británii a použití e-governmentu na Slovensku. Výsledná podoba a dosavadní stav implementace e-governmentu v Evropě je do velké míry ovlivněn typem ekonomiky, což je zřetelné u porovnání obou evropských států. Na závěr práce je uvedeno srovnání uplatnění a míry úspěšnosti e-governmentu v indických a evropských podmínkách.The primary objective of this work is to explain a conception of the e-government and to provide a complex view on its origins and the subsequent development of the e-government in India. The work proves benefits as well as risks and also illustrates barriers in further development which can result in a total failure of the whole projects. Here there are examples of the three successfully implemented and functioning projects along with a variety of methods of classification and evaluation of their success-rate. As a comparison, this work deals with European approach towards the problems of the e-government, by which the t-government is used in Great Britain and the use of the e-government in Slovakia. The final form and the existing conditions of the implementation of the e-government in Europe are highly influenced by the type of the economy, which is obvious while comparing both of the European countries. In conclusion, there is a comparison of the use and the success-rate of the e-government under the conditions of India and Europe