Male song variation of Green Violetear (Colibri thalassinus) in the Talamanca Mountain Range, Costa Rica

We studied variation in acoustic and temporal characteristics of the static male song of the Green Violetear (Colibri thalassinus) in a single population in Costa Rica. The static song of 19 males was extremely variable. The song has two elements: the first was delivered exclusively at the beginning of each song while the second was present once, twice, or three times in the song of different males. Low frequency (LF), song duration (ΔT), and high frequency (HF) varied significantly among most individuals. The male population of Green Violetear has four song types that differ in acoustic and temporal characteristics. The great inter-male song variation suggests this type of vocalization may be under sexual selection.Universidad de Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

Amphibians and Reptiles of the Tirimbina Biological Reserve: a baseline for conservation, research and environmental education in a lowland tropical wet forest in Costa Rica

The Tirimbina Biological Reserve is located in the lowlands on the Atlantic versant of Costa Rica. This study provides an updated comprehensive herpetofauna species list and summarizes the results of all the herpetofauna research conducted at Tirimbina over the last ten years (2009–2019) across various microhabitats, both daytime and nighttime. We also added historical records from occasional sightings and reports from researchers, staff, visitors, interns, fellows, and volunteers since the 1990’s. We found 52 amphibian and 78 reptile species on the reserve, including a few species considered at–risk according to the IUCN Red List. We conclude that Tirimbina is a herpetofauna biodiversity hot spot in Costa Rica because it provides unique habitat characteristics for a variety of species, including habitat for both forest and forest–edge specialists.Tirimbina Biological Reserve for the Tirimbina–UCR research grant.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Biodiversidad y Ecología Tropical (CIBET)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

Monitoreo de procesos de ecológicos del Bosque Seco Tropical: Aplicaciones de sensores remotos para estimaciones a nivel de paisaje y el cambio global

Proyecto de Investigación. y extensión (Código VIE: 5402-1401-1012) Instituto Tecnológico de Costa Rica. Vicerrectoría de Investigación y Extensión (VIE). Escuela de Ingeniería Forestal; Alberta University, Canadá; University of Wisconsin; University of Virginia; Universidad Nacional Autónoma de México; Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas; Agencia de Medio Ambiente. Cuba; Universidad Estatal de Belo Horizonte. Brasil; Universidad de Montes Claros. Brasil; Universidad de Pernambuco. Brasil; Universidad Estatal de Río de Janeiro. Brasil, 2014Este proyecto se encadenó al proyecto ya concluido "Dimensiones humanas, ecológicas y biofísicas de los bosques secos tropicales (código VIE 5402-1401-9001)". Durante su ejecución fue posible dar continuidad al análisis de datos y preparación de publicaciones científicas y académicas pendientes como fenología, dinámica de hojarasca, tasas de crecimiento, mortalidad y reingreso en el bosque seco tropical. También el proyecto trabajo en la preparación de artículos que integran los resultados de tres países: México, Costa Rica y Brasil. Así mismo se continuó con las mediciones de campo de las parcelas y procesos ecológicos para crear una base de datos robusta, actualmente y después de 10 años, estas bases permiten modelar los efectos de cambios climáticos en el comportamiento de los procesos ecológicos de los bosques secos tropicales (Bst). El elemento novedoso de este proyecto fue la instalación de torres de fenología por medio de financiamiento externo y que miden sobre el dosel del bosques seco tropical los cambios temporales de la radiación de onda corta y onda larga, tanto de entrada como de salida. Los cambios en la reflectancia de las hojas se relacionan tanto con el ángulo del sol (que podemos corregir automáticamente) como con la biomasa de hojas. Las torres permiten la colección de datos de campo a cada 15 minutos y estos datos se pueden calibrar con los índices de reflectancia de varios sensores espaciales. Una buena calibración para los diferentes tipos de bosques secos tropicales (las torres operan en Brasil, México y Costa Rica) puede permitir hacer simulaciones del efecto del cambio climático en la productividad de los bosques, su impacto en el ciclo del agua y por ende en las capacidades de fijar carbono. Además, el proyecto fue capaz de instalar una torre con equipo altamente especializado que permite determinar los flujos de CO2 y de vapor de agua del bosque seco tropical mediante la técnica de Covarianza de Flujos Turbulentos. Asociada a esta torre de 22 metros se estableció una parcela de una hectárea que permite caracterizar la huella de CO2 del ecosistema de forma más precisa. Esta hectárea permitirá mejorar la clasificación de imágenes satelitales y aéreas, así como también facilitara el uso de sensores remotos y otras técnicas de teledetección. Desde la perspectiva de los recursos naturales, se aplicó un protocolo comprensivo y estandarizado para reconocer y comparar las clasificaciones espaciales de los Bst, la estructura y composición florística de sus etapas sucesionales, dinámica de la hojarasca, fenología y tasas de crecimiento. Desde la perspectiva de las ciencias sociales, el trabajo que se realizó fue innovador dado que se crearon vínculos con el gobierno, los científicos y las comunidades. Se estudió las interacciones de las comunidades vecinas con los Bst, así como los factores socioeconómicos, políticos y legales que controlan su conservación y manejo. El proyecto fue capaz de generar la siguiente producción académica y científica: 9 artículos indexados, 2 artículos en español, 5 capítulos en libros en inglés, 1 capitulo en un enciclopedia, 20 ponencias en evento nacional, 6 ponencias en eventos internacionales, 10 artículos en borrador, 5 Tesis de pregrado y 2 Tesis de Doctorado. En medios de comunicación, el proyecto decidió ser más austero debido al alto valor de los equipos instalados en el Parque Nacional Santa Rosa para así no llamar la atención para provocar los robos o daños, sin embargo fue posible generar 7 publicaciones en medios impresos/Web y una intervención en radio nacional. En cuanto a la participación de talleres de incidencia política fueron organizados 3 talleres con decisores sobre el estado de los bosques secos en Costa Rica y sobre el potencial de trabajo conjunto entre organizaciones y el proyecto de investigación. Además se organizó una sesión de Simposio en el Congreso indexado de la ATBC y la OET en el año 2013. Adicionalmente se participó en otros 5 talleres organizados por otras instituciones. En total el proyecto recibió y entrenó a 29 estudiantes, de los cuales 9 fueron extranjeros y 20 del TEC, los cuales trabajaron como asistentes de laboratorio y campo entrenándose en el uso de instrumentos, montaje y medición de diseños experimentales, colección y procesamiento de datos y muestras. Actualmente se cuenta con una base de datos de crecimiento de 10 años, así como 4 años de datos de torres de fenología y 1 año y 3 meses de datos de flujos de carbono y vapor de agua, los cuales continuaran siendo analizados en la siguiente etapa del proyecto (código VIE 5402-1401-1028).Instituto Tecnológico de Costa Rica

The PREDICTS database: a global database of how local terrestrial biodiversity responds to human impacts

Biodiversity continues to decline in the face of increasing anthropogenic pressures such as habitat destruction, exploitation, pollution and introduction of alien species. Existing global databases of species’ threat status or population time series are dominated by charismatic species. The collation of datasets with broad taxonomic and biogeographic extents, and that support computation of a range of biodiversity indicators, is necessary to enable better understanding of historical declines and to project – and avert – future declines. We describe and assess a new database of more than 1.6 million samples from 78 countries representing over 28,000 species, collated from existing spatial comparisons of local-scale biodiversity exposed to different intensities and types of anthropogenic pressures, from terrestrial sites around the world. The database contains measurements taken in 208 (of 814) ecoregions, 13 (of 14) biomes, 25 (of 35) biodiversity hotspots and 16 (of 17) megadiverse countries. The database contains more than 1% of the total number of all species described, and more than 1% of the described species within many taxonomic groups – including flowering plants, gymnosperms, birds, mammals, reptiles, amphibians, beetles, lepidopterans and hymenopterans. The dataset, which is still being added to, is therefore already considerably larger and more representative than those used by previous quantitative models of biodiversity trends and responses. The database is being assembled as part of the PREDICTS project (Projecting Responses of Ecological Diversity In Changing Terrestrial Systems – www.predicts.org.uk). We make site-level summary data available alongside this article. The full database will be publicly available in 2015

Is mating in the Túngara Frog (Engystomops pustulosus: Leptodactylidae) random or non-random?

Random and non-random mating result from sexual selection, and both can occur across populations of the same species. Body size is a trait commonly used to determine if mating is random or non-random, and for the latter there are two possible outcomes: size-assortative mating and size-dependent mating. Females of the Túngara Frog (Engystomops putulosus) from Panama are larger than males, although no correlation in the body size of amplectant individuals has been reported, which suggests random mating. Here, we evaluate whether random or non-random mating (i.e. size-assortative or size-dependent mating) occurs in a population of E. pustulosus from southwestern Costa Rica. We measured the body size of amplectant individuals in the field, and did not find a significant difference between the snout–vent length (SVL) of paired males and females or a correlation among the SVLs of all paired individuals. When we considered body size differences among paired males and females, however, we observed size-dependent mating. We suggest that non-random mating must be determined by using more robust analyses, and that a comparison of life-history traits and mating strategies among populations is necessary to determine divergence.El apareamiento aleatorio y no aleatorio resultan de la selección sexual y ambos pueden ocurrir entre poblaciones de la misma especie. El tamaño del cuerpo es un rasgo comúnmente utilizado para determinar si el apareamiento es aleatorio o no aleatorio, y para el este último hay dos resultados posibles: el apareamiento basado en el tamaño y el apareamiento dependiente del tamaño. Las hembras de la Rana Túngara, (Engystomops putulosus) procedentes de Panamá son más grandes que los machos, aunque no se ha reportado una correlación en el tamaño corporal de individuos amplectantes, lo que sugiere un apareamiento al azar. Evaluamos si se produce apareamiento aleatorio o no aleatorio (es decir, apareamiento basado en el tamaño o apareamiento dependiente del tamaño) en una población de E. pustulosus del suroeste de Costa Rica. Medimos los tamaños corporales en el campo de individuos amplectantes y no encontramos diferencia significativa en la longitud hocico–cloaca (LHA) de machos y hembras apareados o una correlación entre las LHA de los individuos apareados. Sin embargo, al considerar las diferencias de tamaño corporal entre parejas de machos y hembras, observamos apareamiento dependiente del tamaño. Sugerimos que el apareamiento no aleatorio debe ser determinado usando un análisis más profundo y que una comparación de los caracteres de historia de vida y estrategias de apareamiento entre poblaciones es necesaria para determinar su divergencia.UCR::Sedes Regionales::Sede del Carib

Data from: Lianas abundance is positively related with the avian acoustic community in tropical dry forests

The file includes information about the name of the forest sites where we evaluated liana abundance and the avian acoustic community at Santa Rosa National Park, Costa Rica, and also data about the number of lianas (the number of lianas divided by the number of trees observed in each plot), the total number of sounds detected in recordings, the total number of bird species detected in recordings, the Acoustic Complexity Index (ACI) generated from recordings, Tree Basal Area, Tree Canopy Height, and Plant Area Index

Lianas Abundance is Positively Related with the Avian Acoustic Community in Tropical Dry Forests

Dry forests are important sources of biodiversity where lianas are highly abundant given their ability to grow during times of drought and as a result of secondary growth processes. Lianas provide food and shelter for fauna such as birds, but there are no studies assessing the influence of liana abundance on birds in dry forests. Here we evaluate the influence of liana abundance on the avian acoustic community in the dry forests of Costa Rica at Santa Rosa National Park. We selected forest sites with different levels of liana abundance and set up automated sound recorders for data collection, analysis and estimation of the avian acoustic community. When the number of lianas increases, the avian acoustic community becomes more complex. Lianas could provide important direct and indirect resources for birds such as structure for shelter, protection, nesting and roosting, and food. The positive relationship that lianas have with birds is particularly important in dry forests where lianas are becoming highly abundant due to the level of forest disturbance and climate change, especially for some bird species that are restricted to this ecosystem. By validating the number of bird species detected in the recordings with the acoustic complexity index, we found that a higher acoustic complexity means higher species richness

Data from: Lianas abundance is positively related with the avian acoustic community in tropical dry forests

Dry forests are important sources of biodiversity where lianas are highly abundant given their ability to grow during times of drought and as a result of secondary growth processes. Lianas provide food and shelter for fauna such as birds, but there are no studies assessing the influence of liana abundance on birds in dry forests. Here we evaluate the influence of liana abundance on the avian acoustic community in the dry forests of Costa Rica at Santa Rosa National Park. We selected forest sites with different levels of liana abundance and set up automated sound recorders for data collection, analysis and estimation of the avian acoustic community. When the number of lianas increases, the avian acoustic community becomes more complex. Lianas could provide important direct and indirect resources for birds such as structure for shelter, protection, nesting and roosting, and food. The positive relationship that lianas have with birds is particularly important in dry forests where lianas are becoming highly abundant due to the level of forest disturbance and climate change, especially for some bird species that are restricted to this ecosystem. By validating the number of bird species detected in the recordings with the acoustic complexity index, we found that a higher acoustic complexity means higher species richness

Replication Data for: Lianas Abundance is Positively Related with the Avian Acoustic Community in Tropical Dry Forests

ABSTRACT Dry forests are important sources of biodiversity where lianas are highly abundant given their ability to grow during times of drought and as a result of secondary growth processes. Lianas provide food and shelter for fauna such as birds, but there are no studies assessing the influence of liana abundance on birds in dry forests. Here we evaluate the influence of liana abundance on the avian acoustic community in the dry forests of Costa Rica at Santa Rosa National Park. We selected forest sites with different levels of liana abundance and set up automated sound recorders for data collection, analysis and estimation of the avian acoustic community. When the number of lianas increases, the avian acoustic community becomes more complex. Lianas could provide important direct and indirect resources for birds such as structure for shelter, protection, nesting and roosting, and food. The positive relationship that lianas have with birds is particularly important in dry forests where lianas are becoming highly abundant due to the level of forest disturbance and climate change, especially for some bird species that are restricted to this ecosystem. By validating the number of bird species detected in the recordings with the acoustic complexity index, we found that a higher acoustic complexity means higher species richness

Tree species composition, breeding systems, and pollination and dispersal syndromes in three forest successional stages in a tropical dry forest in Mesoamerica

Tropical dry forests (TDF) in Mesoamerica are highly endangered by the expansion of human activities (e.g., agriculture and cattle ranching). In contrast, TDF in Costa Rica have experienced outstanding restoration due to changes in economic and conservation policies. Currently TDF landscapes in Costa Rica are a mosaic of different successional stages. Tree breeding systems and pollination and dispersal syndromes are key elements for understanding restoration processes in TDFs. In this study we describe and compare tree species composition and diversity in three TDF successional stages (early, intermediate and late) in Guanacaste, Costa Rica. We describe for the first time tree species breeding systems and pollination and dispersal syndromes for the largest and most significant TDF remnant in Mesoamerica. We set up nine plots, three per successional stage, and we measured and identified 1,072 trees from 96 species. Species richness and diversity indices were higher for the intermediate stage. Monoecy was the most common breeding system, as in other tropical life zones. Insects were the dominant pollinators, facilitated by the trees’ small inflorescences. Wind was found to be not only the next most influential pollinator, mainly in open and disturbed early forests, but also it was also a good seed dispersal agent. As TDF age increases so does the relevancy of birds and mammals as dispersers; the late stage therefore has more tree species with adaptations to these dispersers. © Branko Hilje, Julio Calvo-Alvarado, César Jiménez-Rodríguez and Arturo Sánchez-Azofeifa