RNAi screen to identify SUN-1 interaction partners in meiosis of Caenorhabditis elegans

Meiose (vom grich. meionon = vermindern ) bezeichnet eine spezielle Form der Zellteilung, durch die es zur Halbierung des ursprünglichen Chromosomensatzes kommt. Diese Reduktionsteilung dient, sich geschlechtlich vermehrenden Organismen zur Erhaltung der Genomgröße über Generationen und der Durchmischung des Erbgutes. Diese Variation, fungiert als Motor der Evolution, da die Anpassungsfähigkeit an veränderte Habitate und Umweltbedingungen gefördert und die Wahrscheinlichkeit für ein Überleben der gesamt Population stark erhöht wird. Die Meiose lässt sich grob in eine prä-meiotische Duplikation und zwei meiotische Teilungen gliedern, wobei die zweite meiotische Teilung grundsätzlich einer mitotischen Teilung entspricht. Anschließend an die Duplikation des Genoms, tritt die Zelle in die sogenannte Prophase der ersten meiotischen Teilung ein. Die wesentlichen Ziele dieser Phase sind die Paarung der homologen Chromosomen und der Austausch genetischen Materials mittels „crossingover“. Die Paarung von Homologen verlangt die gerichtete Bewegung, Erkennung und Synapse der Chromosomen. Dies wird durch das nukleäre Transmembranprotein SUN-1 gefördert. SUN-1 bildet gemeinsam mit ZYG-12 eine Brücke vom Zytoskelett zu den Chromosomen und übermittelt so die zytosolischen Bewegungen in das innere des Zellkerns. Diese Diplomarbeit war der Suche nach potentiellen Interaktionspartnern von SUN-1 gewidmet. Hierfür wurden 39 Kandidaten, welche zuvor in einem Präzipitat mit SUN-1 gefunden wurden, auf eine mögliche Rolle in der Meiose untersucht. Die Genprodukte wurden mittels RNA Interferenz depletiert und die Folgen dieser Depletierung, auf die Meiose, untersucht. Als Modellorganismus wurde der Fadenwurm Caenorhabditis elegans gewählt, da dieser, neben grundlegenden Vorteilen als Modellorganismus, durch den großen Anteil an meiotischen Kernen und ihre außergewöhnliche Anordnung im adulten Tier, einen optimalen Einblick in den zeitlichen Ablauf der Meiose erlaubt.Meiosis (from the greek meionon = decrease) refers to a specialized form of cell division by which the initial set of chromosomes is halved. This reductive division is used by sexually reproducing organisms, in order to maintain genome size over generations and exchange genetic material. The variation of the genome functions as a motor of evolution. Since the ability to adapt to changing habitats and environmental conditions increases and therefore, survival of the total population is greatly increased. Meiosis can be divided into a pre-meiotic duplication and two meiotic divisions, whereas the second meiotic division resembles a mitotic division. Subsequent to the duplication of the genome, the cell enters prophase of the first meiotic division. The main objectives of this phase are the pairing of homologous chromosomes and the exchange of genetic material by "crossing over". The pairing of homologs requires directed movement, recognition and synapsis of chromosomes. The nuclear trans membrane protein SUN-1 supports this essential movement. SUN- 1, together with ZYG-12, forms a bridge between the cytoskeleton and the chromosomes and therefore transmits cytoplasmic forces into the interior of the nucleus. This thesis was devoted to the search for potential interaction partners of SUN-1. For this purpose 39 candidates that were previously found in a precipitate with SUN-1, were examined for a possible role in meiosis. The gene products were depleted by RNA interference and the consequences of this depletion, examined. We chose Caenorhabditis elegans as a model organism. Because, in addition to its fundamental advantages as a model organism, it allows the observation of meiotic stages due to the temporal and special order of germ cells in the gonad

An auto-regulatory module controls fat metabolism in "Caenorhabditis elegans"

Obesity and obesity-related diseases such as type-2 diabetes or metabolic syndrome are on the rise word-wide (Ng et al. 2014). The negative aspects of obesity on the health of individuals is accompanied by an increasing financial burden for the global economy. Excess adipose tissue is often perceived as an indication of poor dietary choices and a sedentary lifestyle. However, compelling evidence from diverse model organisms and humans suggest that genetic make-up influences most aspects of fat metabolism and therefore the likelihood to develop obesity (Min, Chiu, and Wang 2013; Yazdi, Clee, and Meyre 2015). Hence, careful dissection of the underlying genetic regulations of fat metabolism to identify new putative targets for treatment is essential. We successfully used Caenorhabditis elegans as a model organism to uncover and describe a novel auto-regulatory module, which we found is essential for wild-type levels of body fat. Utilizing cold-sensitivity as readout, we identified a hitherto uncharacterized gene, C30F12.1, which we named rege-1 (REGnasE-1 homolog) after its mammalian homolog the PIN-domain endonuclease ZC3H12A/Regnase-1/MCPIP1. Regnase-1 negatively regulates pro-inflammatory cytokines via internal cleavage of their 3` untranslated region (3`UTR) (Iwasaki et al. 2011; Matsushita et al. 2009). Similarly, C. elegans REGE-1 targets the transcription factor ETS-4 and cleaves its mRNA within the first third of its 3`UTR. Knockout of rege-1 causes a strong loss in overall body fat, developmental delay and a transcriptional upregulation of fat metabolic and innate immunity genes, depending on ETS-4. We also provide evidence that ETS-4 transcriptionally activates (directly or indirectly) rege-1, thereby forming an auto-regulatory feedback loop. REGE-1::GFP is mainly localized in the first four cells of the intestine adjacent to the pharynx and the ETS-4/REGE-1 module is transcriptionally upregulated upon re-feeding following long-term starvation. This, together with the observation that metabolic and immunity genes are induced upon loss of rege-1 suggests that the ETS-4/REGE-1 module might have a role in bacteria clearance, nutrient uptake and/or defense against pathogens

Risk Factors for Development of Chronic Kidney Disease in Cats

BACKGROUND: Identification of risk factors for development of chronic kidney disease (CKD) in cats may aid in its earlier detection. HYPOTHESIS/OBJECTIVES: Evaluation of clinical and questionnaire data will identify risk factors for development of azotemic CKD in cats. ANIMALS: One hundred and forty‐eight client‐owned geriatric (>9 years) cats. METHODS: Cats were recruited into the study and followed longitudinally for a variable time. Owners were asked to complete a questionnaire regarding their pet at enrollment. Additional data regarding dental disease were obtained when available by development of a dental categorization system. Variables were explored in univariable and multivariable Cox regression models. RESULTS: In the final multivariable Cox regression model, annual/frequent vaccination (P value, .003; hazard ratio, 5.68; 95% confidence interval, 1.83–17.64), moderate dental disease (P value, .008; hazard ratio, 13.83; 95% confidence interval, 2.01–94.99), and severe dental disease (P value, .001; hazard ratio, 35.35; 95% confidence interval, 4.31–289.73) predicted development of azotemic CKD. CONCLUSION: Our study suggests independent associations between both vaccination frequency and severity of dental disease and development of CKD. Further studies to explore the pathophysiological mechanism of renal injury for these risk factors are warranted

Comparison of Pharmacopuncture, Aquapuncture and Acepromazine for Sedation of Horses

Pharmacopuncture, the injection of subclinical doses of drugs into acupoints reduces drug undesirable side effects, residues in animal consumption products and treatment costs in large animals. Acepromazine (Acp) produces several undesirable effects, such as hypotension. Previous studies with the injection of 1/10 of Acp dose in dog acupoints showed its advantage for sedation, minimizing undesirable effects. Eight horses were randomly submitted to four different treatment protocols according to a Latin Square double-blind design: (i) 0.1 ml kg−1 of saline subcutaneously injected at the cervical region, (ii) 0.1 mg kg−1 of Acp injected subcutaneously at the cervical region, (iii) 0.01 ml kg−1 of saline injected into GV1 acupoint (aquapuncture) and (iv) 0.01 mg kg−1 of Acp injected into GV1 acupoint (pharmacopuncture). Heart rate, respiratory rate, head height and degree of sedation were measured before and at 30, 60 and 90 min after treatments. Signs of sedation were observed in all treated groups at 30 min and only in 1/10Acp-GV1 at 60 min after the treatments. Only the group treated with 0.1 mg kg−1 of Acp s.c. had significantly lower values of head height at 30 min. Respiratory rate tended to reduce in all groups but was significantly lower only in horses treated with 0.1 mg kg−1 of Acp s.c. Heart rate remained unchanged in all groups. Acp-pharmacopuncture on GV1 in horses produced a mild sedation when compared with the conventional dose of Acp. More investigations are necessary to determine the optimal dosage of Acp-pharmacopuncture for sedation in horses

Nonstandard-Lexik in den österreichischen "Qualitätszeitungen" Die Presse und Der Standard

Die vorliegende Arbeit befasst sich mit dem pragmatischen Einsatz nichtstan-dardsprachlicher Lexik in den österreichischen ‚Qualitätszeitungen’ Die Presse und Der Standard. Es wird untersucht, welche Funktion(en) nichtstandardsprachliche Lexeme, die drucktechnisch (etwa durch Anführungszeichen oder Kursivierung) nicht gekenn-zeichnet werden, in einer standardsprachlichen Grundmatrix der hoch elaborierten kon-zeptionellen Schriftlichkeit erfüllen. Mithilfe der Zusammenführung des soziolinguistischen Varietätenmodells und der Kon-textualisierungstheorie werden die nichtstandardsprachlichen Lexeme als Kontextuali-sierungshinweise im Rahmen eines Code-Switching-Kontextualisierungsverfahrens interpretiert. Nachdem die Kontextualisierungstheorie als ein Analysemodell für die (konzeptionell) mündliche Sprache gilt, wird zum Teil Neuland betreten, indem die Theorie für sprachvariationsbasierte Kontextualisierung in konzeptionell schriftlichen Texten adaptiert Anwendung findet. Somit kann die Funktion der Nonstandard-Lexik auch in prototypisch geschriebener Sprache auf der Rahmen- und der Textfunktionsebe-ne analysiert werden. Der funktionale Gebrauch von nichtstandardsprachlicher Lexik als varietätenspezifisch ‚markierte’ Sprachmaterial ist typisch für die deutsche Sprache in Wien und ein grup-penspezifisches Merkmal bestimmter Teile der Wiener Bevölkerung, das Solidarität und Nähe erzeugt. Zusätzlich bewirkt der Kontrast zwischen Nonstandard-Lexik und der elaborierten Matrixvarietät der ‚Qualitätszeitungen’ Ironie. Die quanitative Analyse der Arbeit zeigt, dass die ausgewählten Lexeme in den Print-medien Die Presse und Der Standard mit Abstand am häufigsten im Ressort ‚Kultur’ unmarkiert verwendet werden. Häufig sind die nichtstandardsprachlichen Lexeme auch in den Rubriken ‚Meinung’, ‚Leben’, ‚Sport’ und ‚Politik’ zu finden. In der qualtitativen Inhaltsanalyse von ausgewählten Zeitungsbelegen kann innerhalb des gewählten Theorierahmens gezeigt werden, dass die untersuchte Nonstandard-Lexik in den konzeptionell schriftlichen Texten Ironie erzeugt. Die Insertion entsprechender Lexeme modifiziert die primär informative oder appellative Textfunktion häufig im Sinn einer (primär) kontaktorientierten Textfunktion