Genotype and environment interaction in Colombian Holstein cattle

The existence of Genotype-Environment Interactions among four regions of Colombia was investigated. The information was obtained from records of Holstein cattle in Cundinamarca (C), Valle del Cauca(V), Antioquia (A) and Nariño (N). A mixed models multivariate analysis methodology, applied to an animal model for repeated measures was used. Variance components were estimated by Derivative Free Restricted Maximum Likelihood algorithm (DFREML). Contemporary group (Herd-year) and genetic group of the sires (origin-year of birth) were fixed effects, and the genetic additive, permanent environment and temporary environment were included as random effects. Production records (n = 69464) of 25 608 daughters of 594 sires were used. Genetic correlation coefficients of milk production between regions were 0.70, 0.83, 0.73, 0.95, 0.97 and 0.99 for C-V, C-A, C-N, V-A, V-N and A-N, respectively. Different genetic, permanent environment and residual variances among areas were observed, but heritabilities and repetibilities were similar. Genotype and Environment Interaction exists, mainly between Cundinamarca and the other three regions

Polimorfismos no gene JY-1 e suas associações com ocorrência de prenhez precoce e idade ao primeiro parto em fêmeas bovinas.

Características reprodutivas possuem alto valor econômico e são interessantes de serem incluídas nos objetivos de seleção. Marcadores moleculares podem ser inseridos na avaliação genética a fim de melhorar a acurácia de predição. A proteína JY-1 tem sua expressão no óvulo e está associada à foliculogênese e ao desenvolvimento inicial do embrião, podendo afetar as características reprodutivas. 385 fêmeas bovinas da raça Nelore foram estudadas para as regiões dos éxons um e dois do gene JY-1 pela técnica de PCR-sequenciamento. Foram descobertos 17 polimorfismos. Após as análises de desequilíbrio de ligação, foram feitos testes de associação com oito SNPs com as características de ocorrência de prenhez precoce e idade ao primeiro parto. Quatro SNPs foram significativos para cada uma das características, sendo que o mais significativo para ocorrência de prenhez precoce, o SNP 12.999 (p=0,003) pode estar relacionado ao silenciamento do gene, pois afeta o códon da metionina inicial. O gene JY-1 mostrou influenciar as características reprodutivas, sendo que o estudo de outras regiões e a influência em outras características são interessantes de serem feitos

Polimorfismos no éxon 3 do gene JY-1 e suas associações com probabilidade de prenhez precoce e características de crescimento em novilhas da raça Nelore.

A probabilidade de prenhez precoce é uma característica importante devido ao alto valor econômico associado. Marcadores moleculares promovem diminuição do intervalo de gerações e aumento de ganho genético. A proteína JY-1 é uma proteína específica dos oócitos e atua nas células da granulosa e no desenvolvimento embrionário inicial. Marcadores moleculares foram usados para estudar o gene JY-1 e foram encontrados quatro polimorfismos do tipo SNP no éxon 3. As posições dos SNPs no referido éxon e as substituições são: 163 (T/C), 281(T/C), 321(T/C) e 679(T/C). O SNP 163 está em região codificante e causa substituição de uma prolina por uma leucina. Os demais SNPs estão em região 3?UTR. Os SNPs foram genotipados em 297 novilhas da raça Nelore. Os SNPs 163, 321 e 679 estavam em desequilíbrio de ligação entre si e em equilíbrio com o 281. Os genótipos foram correlacionados com probabilidade de prenhez precoce e características de crescimento, mas não se apresentaram significativos

Componentes de variância para o período de gestação em bovinos de corte.

Estimaram-se os componentes de variância do período de gestação (PG) considerando-se o efeito direto do bezerro e os efeitos direto da vaca e aleatório do touro (pai do bezerro). Além dos efeitos aleatórios, os modelos estatísticos incluíram os efeitos fixos de grupo de contemporâneos, composto pela data juliana de inseminação, ano de nascimento e sexo do bezerro, e a idade da vaca ao parto (covariável linear e quadrática). As médias de PG para os animais da raça Nelore foram 294,55 dias (machos) e 293,34 dias (fêmeas) e para os animais cruzados, 292,49 dias (machos) e 292,55 dias (fêmeas). Os componentes de variância observados no Nelore, utilizando-se o modelo 1, que considerou o PG como característica do bezerro, foram 14,47; 72,78 e 57,31 para os componentes aditivo direto (s2a), fenotípico total (s2p) e residual (s2e), respectivamente, e a herdabilidade foi 0,21. Para os animais cruzados, pelo mesmo modelo, os componentes de variância foram 90,40 (s2a), 127,35 (s2p ) e 36,95 (s2e), e a herdabilidade, 0,71. Os componentes de variância do PG do Nelore sob o modelo 2, que considerou o PG como característica da vaca, foram 12,78; 5,01; 74,84 e 57,05, para s2a; s2pb (variância do pai do bezerro); s2p e s2e, respectivamente. A fração fenotípica atribuída ao touro (c2) foi 0,07 e a repetibilidade, 0,17. Para os cruzados, estimaram-se 22,11; 22,97; 127,70 e 82,61 para s2a; s2pb; s2p e s2e, respectivamente, enquanto o c2 foi 0,18 e o coeficiente de repetibilidade, 0,17. Sugere-se, para fins de seleção, que o coeficiente de herdabilidade utilizado seja o obtido na análise em que PG foi considerado como característica do bezerro

Use of some mathematical models to study the lactation curve of Murrah buffaloes and their crossbreeds under a semi-extensive system in the state of Sao Paulo

In the present study, five mathematical models, two of which were linear: linear hyperbolic (FLH) and quadratic logarithmic (FQL); and three non linear: parabolic exponential (FPE), incomplete gamma (FIG), and inverse polynomial (FIP), were used to determine which of them gave best fit to the mean lactation curve, using data from three buffalo herds of the Murrah breed and its crossbreds, under a semi-extensive production system employing twice daily milking. Information was obtained on 3267 lactations, including 27600 test day milk weights. Milk testing was done at 30-day intervals over the period from 1990 to 2001. Lactations utilized in the analysis were based on a minimum of four and maximum of nine test days. Criteria used to verify the goodness of fit of the curve generated by each model were: adjusted coefficient of determination (R2A), lack of fit test (LDF), and graphs of the distribution of residuals and of residual lag. The highest R2A 86.29%, was obtained with both FQL and FLH, which also yielded the lowest residuals and not significant results (P>.05) in the LOF test

Effect of lactation length adjustment procedures on genetic parameter estimates for buffalo milk yield

The objectives of this study were to estimate the genetic parameters for milk yield unadjusted and adjusted for days in milk and, subsequently, to assess the influence of adjusting for days in milk on sire rank. Complete lactations from 90 or 150 days of lactation to 270 or 350 days in milk were considered in these analyses. Milk yield was adjusted for days in milk by multiplicative correction factors, or by including lactation length as a covariable in the model. Milk yields adjusted by different procedures were considered as different traits. Heritability estimates varied from 0.17 to 0.28. Genetic correlation estimates between milk yields unadjusted and adjusted for days in milk were greater than 0.82. Adjusting for days in milk affected the parameter estimates. Multiplicative correction factors produced the highest heritability estimates. More reliable breeding value estimates can be expected by including short length lactation records in the analyses and adjusting the milk yields for days in milk, regardless of the method used for the adjustment. High selection intensity coupled to the inclusion of short length lactations and adjustment with multiplicative factors can change the sire rank.

Use of segmented polynomials to study the lactation curve of Murrah and their crossed breeds of buffaloes under an extensive production system in the State of Sao Paulo

The objective of this study was to evaluate the use of segmented polynomials, described by the two models quadratic-quadratic (PSQQ) and that with three quadratic segments (PSQQQ), for adjustment of the mean lactation curve of Murrah females and their crosses under a system of extensive production, with once daily milking. Studies of this nature in buffaloes are practically non-existent. Milk production data from twelve herds, including 1280 lactations and 8839 test-day milk weights were analyzed. Test days were spaced at 30-day intervals, during the period from 1995 to 2001. Lactations included in the analysis were based on a minimum of four and a maximum of nine test days. For the PSQQ model, the mean curve reached its “Knot” (junction point between the segments) in the second month of lactation, while for the PSQQ model the “Knots” were estimated to be in the second and fourth months. The parameters of each function were estimated by interactive procedures, using PROC REG of SAS. Criteria used to verify the goodness of fit for each function were: adjusted coefficient of determination (R2A); lack of fit test (LOF); and graphic distribution of residuals and of residual lag. The two models closely described variations in milk production throughout the lactation with the lack of fit tests not significant. The coefficients of determination were practically identical for both models under study (R2A = 91.3%). (Text in Portuguese)

A study on the growth hormone gene within a herd of female buffaloes of the Murrah breed (Bubalus bubalis)

O hormônio GH é um dos principais reguladores do crescimento pós-natal e do metabolismo em mamíferos, sendo proposto como gene candidato para identificação de marcadores genéticosrelacionados a características de crescimento, carcaça e produção de leite. Dessa forma, o presente estudo objetivou estudar possíveis polimorfismos na parte final da região 5´-flanqueadora, primeiro exon e parte do primeiro intron do gene do hormônio de crescimento de uma população de búfalas da raça Murrah, buscando futuras associações com características de produção de leite e seus constituintes. Para tanto, foram utilizadas amostras de sangue de 115 búfalas. Mediante reação em cadeia da polimerase (PCR), foi amplificado um fragmento com 450 pb, o qual foi analisado pela técnica de seqüenciamento e de RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), utilizando a endonuclease de restrição DdeI. Como resultado, a seqüência denucleotídeos do gene GH de búfalos será submetida a GenBank. No entanto, verificou-se que os bubalinos apresentaram monomorfismo, para a região estudada, do gene do hormônio de crescimento. Assim sendo, não foi possível quantificar a ação desse gene sobre a produção de leite e seus constituintes.The growth hormone is one of the main regulators for post-natal growth, and also plays a major role in the metabolism of mammals; it has been proposed as candidate gene for genetic identification markers on the following characteristics: growth, carcass, and milk production. Thus, the present study has focusedon observing the likely polymorphisms at the end of the 5´- flank region, firstly exon, and part of the first intron* of the growth hormone gene within a herd of female buffaloes of the Murrah breed. It has been done with a view to spotting future associations, such as characteristics of milk production and its constituents. In order to do that, blood samples of 115 female buffaloes have been used. Through a polimerasis chain reaction,a fragment of 450 pb has been enlarged, and it has been analyzed through the sequencing technique, and through the RFLP, utilizing restriction endonucleasis Ddel. As a result, the sequence of the nucleotides of the growth hormone of the female buffaloes will be submitted to the Genbank. Nevertheless, it has been noted that bubalines have showed monomorphism, in the region which was studied, towards the growth hormone gene.Therefore, it hasn´t been possible to quantify the action of this gene on the production of milk and its constituents