Características reprodutivas possuem alto valor econômico e são interessantes de serem incluídas nos objetivos de seleção. Marcadores moleculares podem ser inseridos na avaliação genética a fim de melhorar a acurácia de predição. A proteína JY-1 tem sua expressão no óvulo e está associada à foliculogênese e ao desenvolvimento inicial do embrião, podendo afetar as características reprodutivas. 385 fêmeas bovinas da raça Nelore foram estudadas para as regiões dos éxons um e dois do gene JY-1 pela técnica de PCR-sequenciamento. Foram descobertos 17 polimorfismos. Após as análises de desequilíbrio de ligação, foram feitos testes de associação com oito SNPs com as características de ocorrência de prenhez precoce e idade ao primeiro parto. Quatro SNPs foram significativos para cada uma das características, sendo que o mais significativo para ocorrência de prenhez precoce, o SNP 12.999 (p=0,003) pode estar relacionado ao silenciamento do gene, pois afeta o códon da metionina inicial. O gene JY-1 mostrou influenciar as características reprodutivas, sendo que o estudo de outras regiões e a influência em outras características são interessantes de serem feitos