Vers la labellisation de la race ovine Sardi à travers l’évaluation du savoir-faire local en pratique d’élevage et la caractérisation des carcasses et des viandes

La race Sardi est l’une des principales ressources génétiques ovines produisant par excellence le mouton pour la fête religieuse du sacrifice qui est considéré parmi les meilleures races et il est prisé par tous les marocains. Même si elle se trouve dans plusieurs régions, elle reste historiquement rattachée à la tribu des Béni Meskine (province de Settat). Cette étude s’est fixée comme objectifs : 1) d’identifier les pratiques de l’élevage, la commercialisation des animaux et la perception du consommateur vis-à-vis des viandes Sardi; 2) de réaliser un suivi des performances des animaux destinés à la fête du sacrifice tout en analysant les aliments utilisés dans les rations d’engraissement ; 3) d’analyser les abattages dans les différentes communes des Béni Meskine et de caractériser les viandes du Sardi de la fête du sacrifice. La méthodologie utilisée dans ce travail a combiné différentes approches (réalisation d’une enquête à différents niveaux de la chaîne de production, suivi des animaux d’engraissement et détermination des critères physiques et physicochimiques de qualité des carcasses et des viandes). Les résultats ont mis l’accent sur les principaux facteurs en faveur de la labellisation du Sardi des Béni Meskine sous un signe distinctif d’origine et de qualité. D’abord sa notoriété, son ancrage historique dans les Béni Meskine, sa beauté phénotypique et la particularité de l’environnement global d’élevage de cette race (appelé localement El Mergued) qui confère une typicité à sa viande. En outre, l’engraissement est basé sur des aliments produits localement. L’antenaise a été dominante dans les abattages au cours de l’année alors que l’antenais et le bélier ont été destinés dans leur totalité à la fête du sacrifice. Les paramètres physiques enregistrés pour les carcasses (un rendement de 49 %, une longueur de 70 cm et une longueur de la cuisse de 36,5 cm) et ceux de la qualité de la viande (une humidité de 72 %, un pH de 5,5, une teneur en cendres de 4,14 % et une teneur en jus de 18 ml/100 g) peuvent être qualifiés de très satisfaisants

Étude de la variabilité phénotypique du fruit de figuier de Barbarie d’une collection ex-situ d’accessions locales dans le contexte oasien du Tafilalet - Maroc

Prickly pear especially Opuntia ficus-indica species could be an economically important alternative crop in irrigated oasis zones, as it tolerates very well extreme droughts. In order to select the most promising fruits for the Tafilalet oasis context, 36 accessions of the prickly pear (28 accessions of Opuntia ficus-indica f. ficus-indica and 8 accessions of Opuntia ficus-indica f. amyclaea) from different regions of Morocco and cultivated in Tafilalet region were evaluated. Seventeen fruit morphological traits and four physical and physicochemical criteria of pulp including firmness, colour, pH, and degree Brix were analysed. All the observed criteria recorded a significant variation within and between the forms of cacti. As an example, the weight of the fruit varies significantly between 73.9 g and 132.8 g. Likewise, the degree Brix varies from 9.3 ° to 13.6 ° Bx. The form of the prickly pear (ficus-indica and amyclaea) and the geographical origin affected the characteristics of the fruit. Compared to other study on the same accessions in Agadir region revealed significant differences regarding fruit weight, pH and degree Brix in favour of Agadir environment. Five groups were proposed using agglomerative hierarchical clustering. Seven accessions were thus selected for the production of the fruit for Tafilalet oasis context.Vu sa grande tolérance aux sécheresses extrêmes, le figuier de Barbarie (FB) notamment l’espèce Opuntia ficus-indica pourrait être une culture alternative économiquement importante dans les zones oasiennes irriguées. Dans l’objectif de sélectionner les fruits les plus prometteurs pour le contexte oasien du Tafilalet, 36 accessions du FB (28 accessions d’Opuntia ficus-indica f. ficus-indica et 8 accessions d’Opuntia ficus-indica f. amyclaea) issues de différentes régions du Maroc et cultivées au niveau de la région de Tafilalet ont été évaluées. Dix-sept critères morphologiques du fruit et quatre critères physiques et physico-chimiques incluant la fermeté, la couleur, le pH et le degré Brix de la pulpe ont été analysés. Tous les critères étudiés ont enregistré une variation significative intra et inter-formes du cactus. Ainsi par exemple, le poids du fruit varie significativement entre 73,9 g et 132,8 g. De même le degré Brix varie de 9,3 ° à 13,6 °Bx. La forme du FB (f. ficus-indica et f. amyclaea) et l'origine géographique ont affecté ces caractéristiques. La comparaison des résultats de cette étude avec ceux obtenus pour les mêmes accessions d’Opuntia cultivées dans la région d’Agadir ont révélé des différences significatives en termes de poids des fruits, de pH et de degré Brix en faveur de l’environnement d’Agadir. La classification ascendante hiérarchique permet de séparer cinq groupes. Sept accessions ont ainsi été sélectionnées pour le contexte oasien de la région du Tafilalet

Waterborne Exophiala species causing disease in cold-blooded animals

The majority of mesophilic waterborne species of the black yeast genus Exophiala (Chaetothyriales) belong to a single clade judging from SSU rDNA data. Most taxa are also found to cause cutaneous or disseminated infections in cold-blooded, water animals, occasionally reaching epidemic proportions. Hosts are mainly fish, frogs, toads, turtles or crabs, all sharing smooth, moist or mucous skins and waterborne or amphibian lifestyles; occasionally superficial infections in humans are noted. Cold-blooded animals with strictly terrestrial life styles, such as reptiles and birds are missing. It is concluded that animals with moist skins, i.e. those being waterborne and those possessing sweat glands, are more susceptible to black yeast infection. Melanin and the ability to assimilate alkylbenzenes are purported general virulence factors. Thermotolerance influences the choice of host. Exophiala species in ocean water mostly have maximum growth temperatures below 30 °C, whereas those able to grow until 33(−36) °C are found in shallow waters and occasionally on humans. Tissue responses vary with the phylogenetic position of the host, the lower animals showing poor granulome formation. Species circumscriptions have been determined by multilocus analyses involving partial ITS, TEF1, BT2 and ACT1

Évaluation de l’application de la technique "Scozzolatura" sur la qualité des fruits des accessions de figuier de Barbarie dans le contexte oasien du Tafilalet

Prickly pear cladodes could bloom several times during the same season, either naturally or after applying inductive practices such as Scozzolatura technique; this allows extending fruiting season of cactus pear. The study of the effect of the Scozzolatura technique on the quality of the fruits was determined on 10 accessions (Opuntia ficus-indica form ficus-indica) from different regions of the south of Morocco and cultivated in Errachidia Experimental Station (31.91"N 4.44"W). The evaluation of the quality of the fruits was carried out on the morphological characteristics (length, equatorial width, thickness of the bark, depth of the scar of the receptacle, length of the fruit peduncle, diameter of the fruit crown, volume, weight of the fruit, rind and seeds and the number of seeds), physical (firmness) and physicochemical (color, pH and Brix). Certainly, the yield and the unit weight of the fruits following the application the Scozzolatura were lower comparatively to seasonal fruit production. However, several quality traits were found to be significantly different between the seasonal fruits and the fruits of Scozzolatura. The most important traits are the number and weight of seeds, which have decreased on average by 35.7 and 32.8%, respectively. The thickness of the skin and the length of the fruit peduncle significantly increased on average by 10.4% and 57.0%, respectively after the application of the Scozzolatura. The color of the pulp changed completely after the application of the Scozzolatura. As for the physicochemical character, the pH was reduced, the Brix degree increased by three to five units compared to the seasonal fruit. As a result, the fruits of Scozzolatura were superiorly of better quality.Les cladodes du figuier de Barbarie peuvent refleurir plusieurs fois au cours d'une même saison, soit d’une façon naturelle, soit après application des pratiques inductives comme la technique de Scozzolatura ; ceci permet d’étendre la production des fruits au-delà de la saison de production habituelle du cactus. L’étude de l’effet de la technique de Scozzolatura sur la qualité des fruits a été réalisée sur 10 accessions de figuier de Barbarie (Opuntia ficus-indica forme ficus-indica) provenant de différentes régions du Sud du Maroc et cultivées au niveau du domaine expérimental de l’INRA d’Errachidia (31,91"N 4,44"O). L’évaluation de la qualité des fruits a été faite sur les caractéristiques morphologiques (longueur, largeur équatoriale, épaisseur de l’écorce, profondeur de la cicatrice du réceptacle, longueur du pédoncule du fruit, diamètre de la couronne du fruit, volume, le nombre de graines et poids du fruit, d’écorce et de graines), physiques (fermeté) et physicochimiques (couleur, pH et Brix). Cette étude montre que le rendement et le poids moyen du fruit obtenus suite à l’application de cette technique ont enregistré des valeurs plus faibles comparativement aux fruits de saison. Néanmoins, plusieurs attributs de qualité se sont révélés significativement différents entre les fruits de saison et les fruits de la Scozzolatura. Les plus remarquables sont le nombre et le poids des graines qui ont en moyenne diminué de 35,7 et 32,8 % respectivement. L’épaisseur de la peau et la longueur du pédoncule du fruit ont par contre augmenté en moyenne de 10,4 et 57,0 % respectivement. La couleur de la pulpe a complètement changé après l’application de la Scozzolatura. Quant aux critères physicochimiques de la pulpe, le pH a légèrement diminué de 0,1 à 0,4 et le degré Brix a augmenté de trois à cinq unités par rapport au fruit de saison. De ce fait, les fruits issus de la Scozzolatura ont été montrés une qualité supérieure comparativement aux fruits de saison

Evaluation des critères physiques, physicochimiques et biochimiques et des activités biologiques des graines et des huiles des graines du fenouil (Foeniculum vulgare Mill.)

The fennel is a typical plant of the Mediterranean region used in traditional pharmacopoeia and as an aromatic spice. This study was interested in an evaluation of the physical, physicochemical and biochemical criteria and the biological activities of the seeds and seeds oils of local (beldi) fennel produced at four stages of maturity in four terroirs of Essaouira province (Central West, Morocco), compared to those of a local fennel produced in a neighboring terroir and an imported fennel. Seeds of different maturity stages and geographic origins were clearly differentiated into homogeneous groups according to studied criteria. The water activity of these seeds is between 0.43 and 0.51 with an average ash content of 6.24 g/100 g of dry matter (DM) containing fairly high contents of potassium, calcium, sodium and baryum. Seed total polyphenols recorded interesting levels ranging between 623.64 and 959.24 mg gallic acid equivalent/100 g DM. The antioxidant activity is estimated between 23.53 and 43.83 mg ascorbic acid equivalent/g DM. Yields of vegetable and essential oils varied from 8.55 to 16.28 % and from 1.4 to 2.7 %, respectively. However, the high values recorded for free acidity, peroxide index and specific extinction of vegetable oil indicate that it cannot be considered as edible oil. Concerning the essential oil, significant increases in the aroma compounds s-limonene and fenchone were noted during maturity. Besides, the antibacterial activity tests have shown that Staphylococcus aureus is sensitive to the action of this essential oil. Moreover, the quality criteria of the studied fennel seeds and seed oils showed the influence of the geographical origin. These results would make it possible to propose ways of valorizing, quality control and labeling of beldi fennel under a distinctive sign of origin and quality.Le fenouil est une plante typique de la région méditerranéenne utilisée dans la pharmacopée traditionnelle et comme épice aromatique. Cette étude s’est intéressée à une évaluation des critères physiques, physicochimiques, biochimiques et des activités biologiques des graines et des huiles des graines du fenouil local (beldi) produit à quatre stades de maturité dans quatre terroirs de la province d’Essaouira (Centre-Ouest du Maroc), comparées à celles d’un fenouil local produit dans un terroir limitrophe et d’un fenouil importé. Les graines de stades de maturité et d’origines géographiques différents ont été nettement différenciées dans des groupes homogènes selon les critères étudiés. L’activité de l’eau de ces graines est comprise entre 0,43 et 0,51 avec une teneur moyenne en cendres de 6,24 g/100 g de la matière sèche (MS) renfermant des teneurs assez importantes en potassium, calcium, sodium et baryum. Les polyphénols totaux des graines ont enregistré des teneurs intéressantes variant entre 623,64 et 959,24 mg équivalent acide gallique/100 g MS et l’activité antioxydante de ces graines est estimée entre 23,53 et 43,83 mg équivalent acide ascorbique/g MS. Les rendements en huile végétale et huile essentielle ont varié de 8,55 à 16,28 % et de 1,4 à 2,7 %, respectivement. Toutefois, les valeurs élevées enregistrées pour l’acidité libre, l’indice de peroxyde et l’extinction spécifique de l’huile végétale renseignent qu’elle ne peut être considérée comme une huile alimentaire. Concernant l’huile essentielle, des augmentations significatives des composés d’arôme s-limonène et fenchone ont été notées au cours de la maturité. En outre, les tests de l’activité antibactérienne ont montré que Staphylococcus aureus est sensible à l’action de cette huile essentielle. Par ailleurs, les critères de qualité des graines et des huiles des graines de fenouil étudiés ont montré l’influence de l’origine géographique. Ces résultats permettraient de proposer des voies de valorisation, de contrôle de qualité et de labellisation du fenouil beldi sous un signe distinctif d’origine et de qualité

Analysis of cell wall proteins regulated in stem of susceptible and resistant tomato species after inoculation with Ralstonia solanacearum: a proteomic approach

Proteomics approach was used to elucidate the molecular interactions taking place at the stem cell wall level when tomato species were inoculated with Ralstonia solanacearum, a causative agent of bacterial wilt. Cell wall proteins from both resistant and susceptible plants before and after the bacterial inoculation were extracted from purified cell wall with salt buffers and separated with 2-D IEF/SDS–PAGE and with 3-D IEF/SDS/SDS–PAGE for basic proteins. The gels stained with colloidal Coomassie revealed varied abundance of protein spots between two species (eight proteins in higher abundance in resistant and six other in susceptible). Moreover, proteins were regulated differentially in response to bacterial inoculation in resistant (seven proteins increased and eight other decreased) as well as in susceptible plants (five proteins elevated and eight other suppressed). Combination of MALDI-TOF/TOF MS and LC-ESI-IonTrap MS/MS lead to the identification of those proteins. Plants responded to pathogen inoculation by elevating the expression of pathogenesis related, other defense related and glycolytic proteins in both species. However, cell wall metabolic proteins in susceptible, and antioxidant, stress related as well as energy metabolism proteins in resistant lines were suppressed. Most of the proteins of the comparative analysis and other randomly picked spots were predicted to have secretion signals except some classical cytosolic proteins

Identification of Gene Modules Associated with Drought Response in Rice by Network-Based Analysis

Understanding the molecular mechanisms that underlie plant responses to drought stress is challenging due to the complex interplay of numerous different genes. Here, we used network-based gene clustering to uncover the relationships between drought-responsive genes from large microarray datasets. We identified 2,607 rice genes that showed significant changes in gene expression under drought stress; 1,392 genes were highly intercorrelated to form 15 gene modules. These drought-responsive gene modules are biologically plausible, with enrichments for genes in common functional categories, stress response changes, tissue-specific expression and transcription factor binding sites. We observed that a gene module (referred to as module 4) consisting of 134 genes was significantly associated with drought response in both drought-tolerant and drought-sensitive rice varieties. This module is enriched for genes involved in controlling the response of the plant to water and embryonic development, including a heat shock transcription factor as the key regulator in the expression of ABRE-containing genes. These results suggest that module 4 is highly conserved in the ABA-mediated drought response pathway in different rice varieties. Moreover, our study showed that many hub genes clustered in rice chromosomes had significant associations with QTLs for drought stress tolerance. The relationship between hub gene clusters and drought tolerance QTLs may provide a key to understand the genetic basis of drought tolerance in rice

A Role in Immunity for Arabidopsis Cysteine Protease RD21, the Ortholog of the Tomato Immune Protease C14

Secreted papain-like Cys proteases are important players in plant immunity. We previously reported that the C14 protease of tomato is targeted by cystatin-like EPIC proteins that are secreted by the oomycete pathogen Phytophthora infestans (Pinf) during infection. C14 has been under diversifying selection in wild potato species coevolving with Pinf and reduced C14 levels result in enhanced susceptibility for Pinf. Here, we investigated the role C14-EPIC-like interactions in the natural pathosystem of Arabidopsis with the oomycete pathogen Hyaloperonospora arabidopsidis (Hpa). In contrast to the Pinf-solanaceae pathosystem, the C14 orthologous protease of Arabidopsis, RD21, does not evolve under diversifying selection in Arabidopsis, and rd21 null mutants do not show phenotypes upon compatible and incompatible Hpa interactions, despite the evident lack of a major leaf protease. Hpa isolates express highly conserved EPIC-like proteins during infections, but it is unknown if these HpaEPICs can inhibit RD21 and one of these HpaEPICs even lacks the canonical cystatin motifs. The rd21 mutants are unaffected in compatible and incompatible interactions with Pseudomonas syringae pv. tomato, but are significantly more susceptible for the necrotrophic fungal pathogen Botrytis cinerea, demonstrating that RD21 provides immunity to a necrotrophic pathogen

Mind the bubbles: achieving stable measurements of maximum hydraulic conductivity through woody plant samples

The maximum specific hydraulic conductivity (kmax) of a plant sample is a measure of the ability of a plants’ vascular system to transport water and dissolved nutrients under optimum conditions. Precise measurements of kmax are needed in comparative studies of hydraulic conductivity, as well as for measuring the formation and repair of xylem embolisms. Unstable measurements of kmax are a common problem when measuring woody plant samples and it is commonly observed that kmax declines from initially high values, especially when positive water pressure is used to flush out embolisms. This study was designed to test five hypotheses that could potentially explain declines in kmax under positive pressure: (i) non-steady-state flow; (ii) swelling of pectin hydrogels in inter-vessel pit membranes; (iii) nucleation and coalescence of bubbles at constrictions in the xylem; (iv) physiological wounding responses; and (v) passive wounding responses, such as clogging of the xylem by debris. Prehydrated woody stems from Laurus nobilis (Lauraceae) and Encelia farinosa (Asteraceae) collected from plants grown in the Fullerton Arboretum in Southern California, were used to test these hypotheses using a xylem embolism meter (XYL'EM). Treatments included simultaneous measurements of stem inflow and outflow, enzyme inhibitors, stem-debarking, low water temperatures, different water degassing techniques, and varied concentrations of calcium, potassium, magnesium, and copper salts in aqueous measurement solutions. Stable measurements of kmax were observed at concentrations of calcium, potassium, and magnesium salts high enough to suppress bubble coalescence, as well as with deionized water that was degassed using a membrane contactor under strong vacuum. Bubble formation and coalescence under positive pressure in the xylem therefore appear to be the main cause for declining kmax values. Our findings suggest that degassing of water is essential for achieving stable and precise measurements of kmax through woody plant samples. For complete rehydration of woody samples, incubation in water under vacuum for 24 h is suggested as a reliable technique that avoids bubble problems associated with flushing under high positive pressure