Complexity and algorithms related to two classes of graph problems

This thesis addresses the problems associated with conversions on graphs and editing by removing a matching. We study the f-reversible processes, which are those associated with a threshold value for each vertex, and whose dynamics depends on the number of neighbors with different state for each vertex. We set a tight upper bound for the period and transient lengths, characterize all trees that reach the maximum transient length for 2-reversible processes, and we show that determining the size of a minimum conversion set is NP-hard. We show that the AND-OR model defines a convexity on graphs. We show results of NP-completeness and efficient algorithms for certain convexity parameters for this new one, as well as approximate algorithms. We introduce the concept of generalized threshold processes, where the results are NP-completeness and efficient algorithms for both non relaxed and relaxed versions. We study the problem of deciding whether a given graph admits a removal of a matching in order to destroy all cycles. We show that this problem is NP-hard even for subcubic graphs, but admits efficient solution for several graph classes. We study the problem of deciding whether a given graph admits a removal of a matching in order to destroy all odd cycles. We show that this problem is NP-hard even for planar graphs with bounded degree, but admits efficient solution for some graph classes. We also show parameterized results.Esta tese aborda problemas associados a conversões em grafos e de edição pela remoção de um emparelhamento. Estudamos processos f-reversíveis, que são aqueles associados a um valor de limiar para cada vértice e cuja dinâmica depende da quantidade de vizinhos com estado contrário para cada vértice. Estabelecemos um limite superior justo para o tamanho do período e transiente, caracterizamos todas as árvores que alcançam o transiente máximo em processos 2-reversíveis e mostramos que determinar o tamanho de um conjunto conversor mínimo é NP-difícil. Mostramos que o modelo AND-OR define uma convexidade sobre grafos. Mostramos resultados de NP-completude e algoritmos eficientes para certos parâmetros de convexidade para esta nova, assim como algoritmos aproximativos. Introduzimos o conceito de processos de limiar generalizados, onde mostramos resultados de NP-completude e algoritmos eficientes para ambas as versões não relaxada e relaxada. Estudamos o problema de decidir se um dado grafo admite uma remoção de um emparelhamento de modo a remover todos os ciclos. Mostramos que este problema é NP-difícil mesmo para grafos subcúbicos, mas admite solução eficiente para várias classes de grafos. Estudamos o problema de decidir se um dado grafo admite uma remoção de um emparelhamento de modo a remover todos os ciclos ímpares. Mostramos que este problema é NP-difícil mesmo para grafos planares com grau limitado, mas admite solução eficiente para algumas classes de grafos. Mostramos também resultados parametrizados

Parameterized Complexity of Equitable Coloring

A graph on $n$ vertices is equitably $k$-colorable if it is $k$-colorable and every color is used either $\left\lfloor n/k \right\rfloor$ or $\left\lceil n/k \right\rceil$ times. Such a problem appears to be considerably harder than vertex coloring, being $\mathsf{NP\text{-}Complete}$ even for cographs and interval graphs. In this work, we prove that it is $\mathsf{W[1]\text{-}Hard}$ for block graphs and for disjoint union of split graphs when parameterized by the number of colors; and $\mathsf{W[1]\text{-}Hard}$ for $K_{1,4}$-free interval graphs when parameterized by treewidth, number of colors and maximum degree, generalizing a result by Fellows et al. (2014) through a much simpler reduction. Using a previous result due to Dominique de Werra (1985), we establish a dichotomy for the complexity of equitable coloring of chordal graphs based on the size of the largest induced star. Finally, we show that \textsc{equitable coloring} is $\mathsf{FPT}$ when parameterized by the treewidth of the complement graph

High-energy extracorporeal shockwave therapy in a patellar tendon animal model: a vascularization-focused study

OBJECTIVE: The aim of this study was to analyze the effect of high-energy extracorporeal shockwave therapy on tendon angiogenesis in the patellar tendons of rabbits. We sought to investigate whether different voltage and number pulses modify the angiogenesis pattern. INTRODUCTION: High-energy extracorporeal shockwave therapy is an option in the treatment of orthopedic diseases such as chronic tendonitis. Despite its potential clinical applicability, there have been few studies on this technique that examine both its clinical effectiveness and its effect on angiogenesis. METHODS: High-energy extracorporeal shockwave therapy was applied at the tibial insertion of the left patellar ligament in 30 rabbits that were separated into six groups that differed in terms of the voltage and number of pulses that were applied by high-energy extracorporeal shockwave therapy. The tibial insertion in the right legs of the animals was used as the control. After six weeks, we performed histological analysis on the region and quantified the number of blood vessels. RESULTS: No significant differences in the number of blood vessels between the left and right patellar tendons were found within groups. Additionally, no significant differences in the number of blood vessels in the left patellar tendons were found between groups. CONCLUSIONS: The application of high-energy extracorporeal shockwave therapy did not cause a change in vascularization in the patellar tendon in rabbits

SPACE PATTERN OF FOREST SPECIES AND ITS RELATIONSHIP WITH AGRICULTURAL FACTORS AGROFLORESTAL SYSTEM

The objective of this work was to describe the spatial distribution pattern of the arboreal and regenerating forest stratum and its relationship with edaphic factors in a multistratified agroforestry system without management. The data were obtained by means of a census of the arboreal and regenerating plants, in which the variables diameter were measured at 1.30m of the soil and total height, besides the botanical identification. The plants of the arboreal stratum were grouped in diameter and height classes and the regenerating plants in height classes. In both strata, the horizontal structure indicators were estimated and the species of higher Importance Value Index (IVI) were selected to perform the spatial analysis. The K Ripley function was applied in the univariate case to test the hypothesis of complete randomness in the groups and in the arboreal and regenerating species of higher IVI. In the bivariate case, the Ripley K function was applied to test the hypothesis of complete spatial independence between groups or aggregate pattern species, with edaphic attributes. The results indicated random spatial pattern for most of the tested groups, with only the species Gliricidia sepium and Archontophoenix alexandrae with aggregate spatial pattern, up to 30m distance, in the arboreal and regenerating strata, respectively. However, no spatial relationship was observed between the pattern of distribution of the species and the soil factors of agroforestry system (SAF). In general, it is concluded that edaphic factors were fundamental in the development of plants, but not for the formation of aggregate

Perfil nutricional de pacientes oncológicos em duas Instituições hospitalares: Série de casos / Evaluation of the nutritional profile of oncological patients in two hospital institutions: case series

Mundialmente, o câncer é uma das Doenças Crônicas Não Transmissíveis (DCNT) com maiores índices de mortalidade. É caracterizado pela multiplicação celular desordenada, com capacidade de invadir tecidos e órgãos, provocando mais de 100 doenças. Essa patologia afeta diretamente a vida social, física e psicológica dos indivíduos acometidos, principalmente o estado nutricional e a qualidade de vida dos mesmos. Diante disso, o objetivo do presente estudo foi relatar o caso de quatro pacientes portadores de neoplasia, (mama, estômago e cabeça), de ambos os sexos, com idade entre 43 a 68 anos, através da análise de prontuários e laudos laboratoriais, antropometria e aplicação de questionários subjetivos. Com base na avaliação nutricional realizada, foi possível identificar pacientes com risco nutricional, sendo a maioria com perda de peso (moderada ou grave), dois pacientes com quadro de desnutrição, uma com uma possível anemia e três com redução nos níveis de linfócitos, além de vários sintomas nutricionais e redução da ingestão alimentar. Dessa forma, ao longo do tratamento oncológico, a avaliação nutricional é uma ferramenta importante para identificar os déficits nutricionais, possibilitando a escolha da terapêutica adequada e aumento da qualidade de vida do paciente

A hierarquia das evidências em cirurgia da mão nas revistas ortopédicas nacionais

CONTEXT AND OBJECTIVE: There is no systematic assessment of the quality of scientific production in the specialty of hand surgery in our setting. This study aimed to systematically assess the status of evidence generation relating to hand surgery and to evaluate the reproducibility of the classification method based on an evidence pyramid. DESIGN AND SETTING: Secondary study conducted at Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) and Faculdade Estadual de Medicina de Marília (Famema). METHODS: Two researchers independently conducted an electronic database search for hand surgery studies published between 2000 and 2009 in the two main Brazilian orthopedic journals (Acta Ortopédica Brasileira and Revista Brasileira de Ortopedia). The studies identified were subsequently classified according to methodological design (systematic review of the literature, randomized clinical trial, cohort study, case-control study, case series and other studies) and evidence level (I to V). RESULTS: A total of 1,150 articles were evaluated, and 83 (7.2%) were included in the final analysis. Studies with evidence level IV (case series) accounted for 41 (49%) of the published papers. Studies with evidence level V (other studies) accounted for 12 (14.5%) of the papers. Only two studies (2.4%) were ranked as level I or II. The inter-rater reproducibility was excellent (k = 0.94). CONCLUSIONS: Hand surgery articles corresponded to less than one tenth of Brazilian orthopedic production. Studies with evidence level IV were the commonest type. The reproducibility of the classification stratified by evidence level was almost perfect.CONTEXTO E OBJETIVO: Não há uma avaliação sistemática da qualidade da produção científica na especialidade de cirurgia da mão em nosso meio. Este estudo objetiva analisar o status da geração de evidências em cirurgia da mão, por meio de avaliação sistematizada, além de avaliar a reprodutibilidade da classificação baseada na pirâmide das evidências. TIPO DE ESTUDO E LOCAL: Estudo secundário realizado pela Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) e Faculdade Estadual de Medicina de Marília (Famema). MÉTODOS: De forma independente, dois pesquisadores promoveram uma busca eletrônica dos trabalhos envolvendo cirurgia da mão, no período de 2000-2009, para duas principais revistas na literatura ortopédica nacional (Acta Ortopédica Brasileira e Revista Brasileira de Ortopedia). Os trabalhos identificados foram subsequentemente classificados pelo tipo de delineamento metodológico (revisões sistemáticas da literatura, estudos clínicos randomizados, estudos de coorte, estudos caso-controle, séries de casos e outros estudos) e nível de evidência (I a V). RESULTADOS: Foram avaliados 1.150 artigos, sendo 83 (7,2%) considerados para a análise final. Estudos com nível de evidência IV (séries de caso) correspondem a 41 (49%) das publicações. Estudos nível de evidência V (outros estudos), corresponderam a 12 (14,5%) da amostra. Apenas dois estudos (2,4%) foram identificados como nível I ou II. A reprodutibilidade interobservadores foi excelente (k = 0.94). CONCLUSÕES: Os artigos de cirurgia da mão correspondem a menos de um décimo da produção ortopédica nacional. Estudos nível de evidência IV foram os mais encontrados na literatura nacional. A classificação estratificada por níveis de evidência apresenta reprodutibilidade quase perfeita.Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Escola Paulista de MedicinaUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Department of Orthopedics and TraumatologyFaculdade Estadual de Medicina de MaríliaFaculdade Estadual de Medicina de Marília Department of Orthopedics and TraumatologyUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)UNIFESP, EPMUNIFESP, Department of Orthopedics and TraumatologyUNIFESPSciEL