Comparative in silico analysis of SSRs in coding regions of high confidence predicted genes in Norway spruce (Picea abies) and Loblolly pine (Pinus taeda)

Background: Microsatellites or simple sequence repeats (SSRs) are DNA sequences consisting of 1-6 bp tandem repeat motifs present in the genome. SSRs are considered to be one of the most powerful tools in genetic studies. We carried out a comparative study of perfect SSR loci belonging to class I (>= 20) and class II (>= 12 and < 20 bp) types located in coding regions of high confidence genes in Picea abies and Pinus taeda. SSRLocator was used to retrieve SSRs from the full length CDS of predicted genes in both species. Results: Trimers were the most abundant motifs in class I followed by hexamers in Picea abies, while trimers and hexamers were equally abundant in Pinus taeda class I SSRs. Hexamers were most frequent within class II SSRs followed by trimers, in both species. Although the frequency of genes containing SSRs was slightly higher in Pinus taeda, SSR counts per Mbp for class I was similar in both species (P-value = 0.22); while for class II SSRs, it was significantly higher in Picea abies (P-value = 0.00009). AT-rich motifs were higher in abundance than the GC-rich motifs, within class II SSRs in both the species (P-values = 10(-9) and 0). With reference to class I SSRs, AT-rich and GC-rich motifs were detected with equal frequency in Pinus taeda (P-value = 0.24); while in Picea abies, GC-rich motifs were detected with higher frequency than the AT-rich motifs (P-value = 0.0005). Conclusions: Our study gives a comparative overview of the genome SSRs composition based on high confidence genes in the two recently sequenced and economically important conifers and, also provides information on functional molecular markers that can be applied in genetic studies in Pinus and Picea species

Doctoral dissertation management at the University of Granada

La Universidad de Granada (UGR) cuenta desde 2005 con el Proyecto DIGIBUG, un modelo que mejora la visibilidad y accesibilidad de su producción científica, con el objetivo de acercarla a los investigadores, doctorandos, estudiantes y a la sociedad en general, ofreciendo una nueva perspectiva de difusión, utilización, citación y seguimiento de las diferentes líneas de investigación existentes en la UGR.Since 2005 the University of Granada (UGR) has implemented the DIGIBUG Project, which aims to improve visibility of and access to its scientific output so as to bring it closer to researchers, doctorate and undergraduate students and society in general, providing a new way of disseminating, using, citing and following up the different lines of enquiry at the UGR

Artistas y artistas-docentes en Chile: agentes que posibilitan cambios desde las artes

Este artículo presenta parte de los resultados de la investigación que se desarrolló en Chile con artistas y artistas-docentes titulada "Nuevos vínculos entre lo artístico y lo pedagógico. Abriendo campos hacia una reconceptualización del arte y el rol del/la artista en la sociedad actual", entre 2018 y 2021. El estudio busca comprender los cruces entre las prácticas artísticas y pedagógicas y cómo estos cruces tienen el potencial de generar nuevas ideas para las áreas de las artes y la educación en Chile. Para ello, se desarrolló una metodología cualitativa y se realizaron talleres artísticos de discusión con diversos grupos de artistas-docentes en Chile. Dentro de los principales resultados, se destaca la percepción de artistas y artistas-docentes como agentes de cambio, quienes a través de su labor artística, pedagógica y de mediación, promueven posibilidades transformativas desde las artes y perciben que las artes son prácticas de cambio social y cultural.

Análisis del abandono en los estudios de ingeniería y arquitectura en la Universidad Politécnica de Madrid

El abandono académico preocupa en todas las universidades y tiene especial incidencia en los estudios de Ingeniería y Arquitectura. En este trabajo se presentan los resultados de un estudio exhaustivo del abandono desarrollado en el marco de un proyecto transversal de Innovación Educativa, con la participación de más de 80 profesores de la Universidad Politécnica de Madrid (UPM), que pretende analizar los factores más influyentes en el abandono y, en particular, su relación con el absentismo académico. Se toma como población de estudio el colectivo de estudiantes de nuevo ingreso del curso 2010-11 en la UPM, que no se han matriculado en el curso 2011-12 en la misma carrera. Es lo que técnicamente se conoce como pre-abandono y que, en la inmensa mayoría de los casos, se convierte en abandono definitivo de la titulación iniciada.Se han usado dos metodologías: 1. Análisis de la información objetiva procedente de bases de datos de la UPM relativa a variables académicas (nota y opción de acceso, rendimiento académico, ...)y de componente social (sexo, nacionalidad, ...),así como de la información sobre absentismo solicitada a los profesores de las diferentes asignaturas, para la población de estudio. 2. Análisis de la información subjetiva recogida mediante trabajo de campo, a través de encuestas telefónicas(CATI) y entrevistasen profundidad, de los estudiantes en situación de pre-abandono. Entre las conclusiones más relevantes del estudio cabe señalar: En un porcentaje significativo el pre-abandono corresponde a un cambio para continuar estudios del mismo nivel en la misma u otra institución. El absentismo se identifica como predictor del abandono. El factor académico más relacionado con el abandono de una titulación es la nota de acceso. Los alumnos de la población de estudio tienen nota de acceso y rendimiento académico inferiores a los de los alumnos que continúan sus estudios. También presentan mayores índices de absentismo académico y menor participación en las actividades de aprendizaje y evaluación. Respecto a los factores de componente social y personal, se ha observado menor abandono entre las mujeres y mayor abandono entre los estudiantes extranjeros. En cuanto a la integración en la universidad y la relación con los compañeros, se ha detectado que los estudiantes de la población de pre-abandono perciben su integración en la comunidad universitaria como menos efectiva

Influence of immigration on tuberculosis transmission patterns in Castellón, Spain (2004–2007)

Objetivo Describir los patrones de transmisión de la tuberculosis en Castellón en un periodo de importantes cambios demográficos. Métodos Estudio prospectivo descriptivo de los pacientes con cultivo positivo en la provincia de Castellón entre 2004 y2007. Se describen los pacientes por año y nacionalidad, y se cotejan con los casos declarados a la Dirección General de Salud Pública (DGSP). Se estudia la población con patrón molecular disponible por RFLP (restriction fragment length polymorphism) y se analizan las variables de los pacientes agrupados (clusters) a partir de los datos de la DGSP y del Programa de Gestión del Laboratorio. Resultados Según la DGSP, la tasa global de tuberculosis por 100.000 habitantes en la provincia de Castellón fue de 15,7 en 2004, 19,9 en 2005, 18,2 en 2006 y 17,5 en 2007. En nuestro laboratorio se identificaron las cepas de 301 pacientes, que suponen el 77% (301/390) de los casos declarados y el 94% (301/321) aquellos con cultivo positivo. El porcentaje de tuberculosis en extranjeros aumentó hasta superar el 50% en 2007. Se disponía de estudio molecular en el 95% de los casos (286), con un 58% de españoles y un 42% de extranjeros. El porcentaje de agregación fue del 40%, con un 30% de clusters mixtos. Según el estudio convencional de contactos, el 85% de los pacientes en cluster habían sido considerados casos aislados. Conclusiones El aumento de la tasa de tuberculosis en Castellón se debe, principalmente, al creciente número de los casos en extranjeros. Disponer del estudio molecular de todos los pacientes con cultivo positivo nos ha permitido analizar cómo y dónde se transmite la tuberculosis. El 40% de los pacientes se agruparon en clusters, y eran mixtos un tercio de ellos, lo que indica una elevada integración de los inmigrantes.Background This study aimed to identify tuberculosis transmission patterns in Castellón in a period of major demographic changes. Methods A prospective study of patients with positive culture in the province of Castellon over a 4-year period (2004–2007) was carried out. Cases were described by year and nationality and were compared with those reported to the Department of Public Health. We studied the population with available molecular patterns, identified through restriction fragment length polymorphism (RFLP) and analyzed the variables from patient clusters, based on data collected in surveys of the Department of Health and the Laboratory Management Program. Results According to data from the Department of Public Health, the overall rate of tuberculosis per 100,000 inhabitants in the province of Castellón was 15.7 in 2004, 19.9 in 2005, 18.2 in 2006 and 17.5 in 2007. In our laboratory, strains were identified from 301 patients, representing 77% (301/390) of reported cases and 94% (301/321) of reported cases with a positive culture. The percentage of tuberculosis among foreigners increased with age, exceeding 50% in 2007. Molecular studies were available in 95% of patients (286); 58% were Spanish and 42% were foreigners, of whom 54% were Romanians. The cluster percentage was 40%, with 30% of mixed clusters. According to conventional contact studies, 85% of patients in clusters had been considered isolated cases. Conclusions The increased rate of tuberculosis in Castellón was mainly due to the increasing number of cases among foreigners, mostly Romanians. The availability of molecular studies in all patients with a positive culture allowed us to analyze how and where tuberculosis is transmitted in our province. Forty percent of the patients were grouped into clusters; of these, mixed clusters accounted for one third, indicating the high integration of immigrants in our area

Gut Microbiota Cannot Compensate the Impact of (quasi) Aposymbiosis in Blattella germanica

The German cockroach Blattella germanica is a good model to study complex symbiotic relationships because the following two symbiotic systems coexist in a single individual: the endosymbiont Blattabacterium (living inside specialized cells called bacteriocytes) and the gut microbiota. Although the role of the endosymbiont has been fully elucidated, the function of the gut microbiota remains unclear. The study of the gut microbiota will benefit from the availability of insects deprived of Blattabacterium. Our goal is to determine the effect of the removal (or, at least, the reduction) of the endosymbiont population on the cockroach's fitness, in a normal gut microbiota community. For this purpose, we treated our cockroach population with rifampicin to decrease the amount of endosymbiont in the following generation. As the treatment also affects rifampicin-sensitive gut bacteria, we allowed it to recover for at least 20 days before sampling. We found that after this antibiotic treatment, the endosymbiont population remained extremely reduced and only the microbiota were able to recover, although it could not compensate for the endosymbiont role, and the host's fitness was drastically affected. This accomplished reduction, however, is not homogenous and requires further study to develop stable quasi-aposymbiotic cockroaches

Derivados de 1,3-dioxoperhidropirido[1,2-c]pirimidinas como antagonistas de colecistoquinina

Referencia OEPM: P9501857.-- Fecha de solicitud: 26/09/1995.-- Titulares: Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Universidad de Navarra.Derivados de 1,3-dioxoperhidropirido[1,2-c]pirimidinas como antagonistas de colecistoquinina (ver figura en archivo de texto adjunto). La presente invención se refiere a derivados de 1,3- dioxoperhidropirido [1,2,-c] piriminas, e intermedios para su preparación de fórmula general (I). Dichos derivados son útiles como antagonistas de colecistoquinina (CCK) y por lo tanto como agentes activos sobre el sistema nervioso central y el periférico.Peer reviewe