Contrast media volume is significantly related to patient lung volume during CT pulmonary angiography when employing a patient-specific contrast protocol

Aim: The purpose of this study is to investigate the relationship between contrast media volume and patient lung volume when employing a patient-specific contrast media formula during pulmonary computed tomography angiography (CTA). Materials and methods: IRB approved this retrospective study. CTA of the pulmonary arteries was performed on 200 patients with suspected pulmonary embolism (PE). The contrast media volume (CMV) was calculted by employing a patient-specific contrast formula. Lung volume was quantified employing semi-automated lung software that calculated lung volumes (intellispace -Philips). The mean cross-sectional opacification profile of central and peripheral pulmonary arteries and veins were measured for each patient and arteriovenous contrast ratio (AVCR) calculated for each lung segment.  Mean body mass index (BMI) and lung volume were quantified. Receiver operating (ROC) and visual grading characteristics (VGC) measured reader confidence in emboli detection and image quality respectively. Inter and intra-observer variations were investigated employing Cohen’s kappa methodology. Results: Results showed that the mean pulmonary arterial opacification of the main pulmonary circulation (343.88±73HU), right lung; upper (316.51±23HU), middle (312.5±39HU) and lower (315.23±65HU) lobes and left; upper (318.76±83HU), and lower (321.91±12HU) lobes. The mean venous opacification of all pulmonary veins was below 182±72HU. AVCR was observed at all anatomic locations (p<0.0002) where this ratio was calculated. Moreover, larger volumes of contrast significantly correlated with larger lung volumes (r=0.89, p<0.03) and radiation dose (p<0.03). VGC and ROC analysis demonstrated increased area under the curve: 0.831 and 0.99 respectively (p<0.02). Inter-observer variation was observed as excellent (κ = 0.71). Conclusion: We conclude that increased CMV is significantly correlated to increased patient lung volume and radiation dose when employing a patient-specific contrast formula. The effects patient habitus is highlighted

Lung density in the trajectory path — a strong indicator of patients sustaining a pneumothorax during CT-guided lung biopsy

Introduction: The purpose is to evaluate the prognostic significance of lung parenchymal density during percutaneous coaxial cutting needle lung biopsy (PNLB). Materials and methods: Retrospective analysis of 179 consecutive patients (106 males, 73 females; mean age 59.16 ± 16.34 years) undergoing PNLB was included. Mean lobar parenchymal lung density, mean densities anterior to the lesion and posterior to the chest wall in the needle trajectory path were measured in HU. Lesion location and needle trajectory were also measured. Fisher’s exact test and Chi-square test were conducted to analyze the categorical variables. ANOVA test was done to examine continuous and normally distributed variables. Statistical significance was considered when p < 0.05. Results: Mean lobar parenchymal lung density (p < 0.05) and mean parenchymal lung density relative to the needle trajectory path were below -800 HU in patients who sustained a pneumothorax. Increase in the number of pleural passes was significantly associated with the risk of patients having pneumothorax (p < 0.05). The mean distance from the skin to the lesion and needle trajectory angle were not statistically different among patients with and without pneumothorax (p > 0.05). Conclusion: Lobar parenchymal density and lung parenchymal density anterior to the lesion and posterior to the chest wall in the needle trajectory path could be used as predicting parameters in patients undergoing PNLB who sustained a pneumothorax. These findings can help interventional radiologist further assess risk of pneumothorax when preforming such procedure

Meta-analysis and systematic review of skin graft donor-site dressings with future guidelines.

Background: Many types of split-thickness skin graft (STSG) donor-site dressings are available with little consensus from the literature on the optimal dressing type. The purpose of this systematic review was to analyze the most recent outcomes regarding moist and nonmoist dressings for STSG donor sites. Methods: A comprehensive systematic review was conducted across PubMed/MEDLINE, EMBASE, and Cochrane Library databases to search for comparative studies evaluating different STSG donor-site dressings in adult subjects published between 2008 and 2017. The quality of randomized controlled trials was assessed using the Jadad scale. Data were collected on donor-site pain, rate of epithelialization, infection rate, cosmetic appearance, and cost. Meta-analysis was performed for reported pain scores. Results: A total of 41 articles were included comparing 44 dressings. Selected studies included analysis of donor-site pain (36 of 41 articles), rate of epithelialization (38 of 41), infection rate (25 of 41), cosmetic appearance (20 of 41), and cost (10 of 41). Meta-analysis revealed moist dressings result in lower pain (pooled effect size = 1.44). A majority of articles (73%) reported better reepithelialization rates with moist dressings. Conclusion: The literature on STSG donor-site dressings has not yet identified an ideal dressing. Although moist dressings provide superior outcomes with regard to pain control and wound healing, there continues to be a lack of standardization. The increasing commercial availability and marketing of novel dressings necessitates the development of standardized research protocols to design better comparison studies and assess true efficacy.R01 EB021308 - NIBIB NIH HHSPublished versio

The Use of Stem Cells in Burn Wound Healing: A Review

Burn wound healing involves a series of complex processes which are subject to intensive investigations to improve the outcomes, in particular, the healing time and the quality of the scar. Burn injuries, especially severe ones, are proving to have devastating effects on the affected patients. Stem cells have been recently applied in the field to promote superior healing of the wounds. Not only have stem cells been shown to promote better and faster healing of the burn wounds, but also they have decreased the inflammation levels with less scar progression and fibrosis. This review aims to highlight the beneficial therapeutic effect of stem cells in burn wound healing and to discuss the involved pathways and signaling molecules. The review covers various types of burn wound healing like skin and corneal burns, along with the alternative recent therapies being studied in the field of burn wound healing. The current reflection of the attitudes of people regarding the use of stem cells in burn wound healing is also stated

Meiotic arrests : from gene defects identification to therapeutic approaches

L’azoospermie, définie comme l’absence de spermatozoïde dans l’éjaculat, concerne 1% des hommes. Elle est soit liée à un défaut de la spermatogénèse, soit à un obstacle sur les voies éjaculatrices. Pour ces patients, seul le recours à un geste chirurgical invasif, une biopsie testiculaire (BT), permettra de retrouver des spermatozoïdes et de proposer une prise en charge en fécondation in vitro. En cas d’azoospermie non-obstructive (ANO) par troubles de la spermatogenèse, les chances de succès ont été estimées à 40%. Or, il n’existe pas de critères prédictifs permettant de récuser un tel geste, et de nouveau marqueurs sont donc nécessaires.Les données récentes de la littérature montrent que l’analyse du génome entier permettrait d’identifier des anomalies génétiques et en particulier en cas d’arrêt de maturation (AM) testiculaire, un phénotype histologique d’ANO, où aucun spermatozoïde n’est retrouvé.L’objectif de mon travail a été de réaliser des investigations génétiques sur ce phénotype d’AM complet et de démontrer que la réalisation d’une analyse complète du génome permettrait une meilleure prise en charge de ces patients. Sur la base d'une altération d’un gène unique par patient, nous avons cherché à confirmer l'hétérogénéité génétique de l’AM complet, et de valider le phénotype humain en reproduisant, dans un modèle murin, une altération génétique connue dans l’AM humain.Pour le premier axe de ce projet nous avons :1 : identifier, pour la première fois, un variant homozygote délétère dans le gène MEI1, qui code pour une protéine connue seulement dans la méiose murine, par l’analyse de deux frères infertiles nés de parents consanguins.2 : réalisé le séquençage exomique complet d’une cohorte de 26 individus AM non apparentés et avons identifié chez 15 sujets des mutations bi-alléliques délétères dans 16 gènes candidats. Au total, une altération a été identifiée chez 58% des patients, et 100% chez les patients consanguins. Nous avons identifié des variants pathogènes dans des gènes méiotiques précédemment décrits dans la littérature, soutenant la signification clinique de ces gènes dans l’AM. De plus, nous avons trouvé des preuves solides de variants pathogènes sur d'autres gènes à expression testiculaire, responsables d’AM. L’effet pathogène des variants identifiés a été validé par l'absence ou la réduction de l'expression des protéines altérées dans les biopsies testiculaires des patients. Ceci a permis de proposer une nouvelle approche dans la prise en charge des patients.3 : identifier une mutation délétère du gène RBMXL2, conduisant à une altération de l’expression de nombreuses protéines essentielles à la spermatogenèse, par dérégulation du spliceosome testiculaire.4- démontrer la possibilité de l’occurrence de plusieurs anomalies par l’étude de patients porteurs d’un remaniement chromosomique.Pour le deuxième axe de ce projet, nous avons généré un modèle murin de la délétion récurrente du gène TEX11 dans l’AM humain, en utilisant la technologie CRISPR/Cas9, pour valider son impact sur la spermatogenèse. Étonnamment, aucune différence n’a été observée dans les résultats de fertilité, de spermatogenèse ou de séquençage d'ARN entre les souris sauvages et les souris Tex11del/Y. Ces résultats interrogent sur la validité de l'utilisation du modèle murin et/ou sur l'impact d'une telle délétion sur la spermatogenèse chez l’humain et/ou sur les mécanismes génétiques et moléculaires d’AM chez la souris.Finalement, ces travaux montrent l’intérêt et l’efficacité de la combinaison du séquençage exomique et de la technologie CRISPR/Cas9 pour explorer les AM complets. Nous avons démontré l’hétérogénéité génétique de l’AM complet, et montré l'importance du diagnostic génétique de ce phénotype pour une meilleure prise en charge des patients. De plus, notre premier modèle murin généré a montré la nécessité de valider les variants humains identifiés.Azoospermia, defined as the absence of sperm in the ejaculate, affects 1% of men. It is either linked to a defect in spermatogenesis, or to an obstacle on the ejaculatory tract. For these patients, only the recourse to an invasive surgical procedure, a testicular biopsy (BT), will make it possible to find spermatozoa and to offer in vitro fertilization treatment. In case of non-obstructive azoospermia (NOA) due to impaired spermatogenesis, the chances of success have been estimated at 40%. However, there are no predictive criteria for rejecting such a gesture, and new markers are therefore necessary.Recent data in the literature show that whole-genome analysis would identify genetic abnormalities, particularly in the event of testicular maturation arrest (MA), a histological phenotype where no spermatozoa are found.The objective of my work was to carry out genetic investigations on this complete MA phenotype and to demonstrate that performing a complete genome analysis would allow better clinical management of these patients. Based on an alteration of a single gene per patient, we sought to confirm the genetic heterogeneity of the complete MA, and to validate the human phenotype by reproducing, in a mouse model, a genetic alteration known in the human MA.For the first axis of this project, we have:1: Identified, for the first time, a deleterious homozygous variant in the MEI1 gene, which encodes a protein known only in murine meiosis, by analyzing two infertile brothers born to consanguineous parents.2: Performed whole-exome sequencing of a cohort of 26 unrelated MA individuals and identified deleterious bi-allelic mutations in 16 candidate genes in 15 subjects. In total, a genetic alteration alteration was identified in 58% of patients, and 100% in consanguineous patients. First, we identified pathogenic variants in meiotic genes previously described in the literature, supporting the clinical significance of these genes in human MA. Additionally, we found strong evidence for testicular genes responsible for MA. The pathogenic effect of the identified variants was validated by the absence or reduction in the expression of altered proteins in testicular biopsies from patients. This made it possible to propose a new approach in the clinical care of MA patients.3: Identified a deleterious mutation in the RBMXL2 gene, leading to an alteration in the expression of many proteins essential for spermatogenesis, including MLH1, MEI1, MEIOC, and STAG3, by deregulation of the testicular spliceosome.4- Demonstrated the possibility of the occurrence of several abnormalities by studying patients with a chromosomal rearrangement.For the second axis of this project, we generated a mouse model of the recurrent deletion of the TEX11 gene in human MA, using CRISPR/Cas9 technology, to validate its impact on spermatogenesis. Surprisingly, no difference was observed in fertility, spermatogenesis or RNA sequencing results between wild-type mice and Tex11del/Y mice. These results question the validity of the use of the mouse model and/or the impact of such a deletion on spermatogenesis in humans, and/or the genetic and molecular mechanisms of MA in mice.Finally, this work shows the interest and efficiency of the combination of whole-exome sequencing and CRISPR/Cas9 technology to explore complete MA. We have demonstrated the genetic heterogeneity of complete MA and shown the importance of genetic diagnosis of this phenotype for better patients’ management. In addition, our first generated murine model showed the need to validate the human variants identified in vivo

Male Infertility and Genetic screening: Guidelines in 2021

International audienceFor many years, genetic screening for male infertility was limited to a few analyses: karyotyping, screening for Y microdeletions, and tests for the most frequent cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene variants. The development of newtechnologies, such as chromosome microarray or new genome sequencing, has broadened access to wholegenome analyses. Over the last decade, many genetic defects have been described, and new strategies seem to emerge. Hence, by focusing on peripheral (rather than central) failures of spermatogenesis, the objectives of the present study were to review the latest data on clinical practice (rather than the physiopathology of these genetic abnormalities) and suggest new guidelines for the genetic screening of male infertility

Genetic defects in human azoospermia

Résumé Comme pour beaucoup de maladies humaines, les analyses génétiques en cas d’azoospermie étaient initialement limitées à la réalisation d’un caryotype, conduisant au diagnostic de réarrangements chromosomiques comme pour le syndrome de Klinefelter ou autres syndromes. L’avènement de la biologie moléculaire, dans les années 1980, a permis l’élargissement du dépistage génétique à la recherche des microdélétions du chromosome Y et aux anomalies du gène CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator). Il a fallu attendre plusieurs décennies et l’apparition des techniques d’analyses du génome entier pour que soit réalisée l’identification d’autres anomalies génétiques associés à l’azoospermie humaine. Si les anomalies des gènes TEX11 et ADGRG2 sont fréquemment décrites dans la littérature pour les hommes présentant une azoospermie, la plupart des altérations génétiques découvertes à ce jour sont privées, identifiées dans un petit nombre de familles souvent consanguines. L’objectif dans cette revue est de fournir un aperçu actualisé de toutes les anomalies génétiques décrites dans la littérature et associées à l’azoospermie humaine tout en essayant de fournir des guides de conduite diagnostique en fonction du phénotype de l’azoospermie. En plus des mutations homozygotes et délétères, les polymorphismes et les défauts épigénétiques sont également brièvement abordés. Néanmoins, comme ces variations ne sont que de potentiels facteurs de prédisposition à l’azoospermie, une étude spécifique sera nécessaire pour compiler l’ensemble des données de la littérature pour chaque variant génétique

Human testis-expressed (TEX) genes: a review focused on spermatogenesis and male fertility

International audienceAbstract Spermatogenesis is a complex process regulated by a multitude of genes. The identification and characterization of male-germ-cell-specific genes is crucial to understanding the mechanisms through which the cells develop. The term “ TEX gene” was coined by Wang et al. (Nat Genet. 2001; 27: 422–6) after they used cDNA suppression subtractive hybridization (SSH) to identify new transcripts that were present only in purified mouse spermatogonia. TEX ( Testis expressed ) orthologues have been found in other vertebrates (mammals, birds, and reptiles), invertebrates, and yeasts. To date, 69 TEX genes have been described in different species and different tissues. To evaluate the expression of each TEX/tex gene, we compiled data from 7 different RNA-Seq mRNA databases in humans, and 4 in the mouse according to the expression atlas database. Various studies have highlighted a role for many of these genes in spermatogenesis. Here, we review current knowledge on the TEX genes and their roles in spermatogenesis and fertilization in humans and, comparatively, in other species (notably the mouse). As expected, TEX genes appear to have a major role in reproduction in general and in spermatogenesis in humans but also in all mammals such as the mouse. Most of them are expressed specifically or predominantly in the testis. As most of the TEX genes are highly conserved in mammals, defects in the male (gene mutations in humans and gene-null mice) lead to infertility. In the future, cumulative data on the human TEX genes’ physiological functions and pathophysiological dysfunctions should become available and is likely to confirm the essential role of this family in the reproductive process. Thirteen TEX genes are now referenced in the OMIM database, and 3 have been linked to a specific phenotype. TEX11 (on Xq13.1) is currently the gene most frequently reported as being associated with azoospermia.La spermatogenèse est un processus complexe régulé par une multitude de gènes. L’identification et la caractérisation des gènes spécifiques des cellules germinales mâles sont essentielles pour comprendre les mécanismes par lesquels les cellules se développent. Le terme «gène TEX » a été inventé par Wang et al. (Nat Genet. 2001; 27: 422–6) après avoir utilisé l’hybridation soustractive d’ADNc (SSH) pour identifier de nouveaux transcrits qui n’étaient présents que dans la spermatogonie de souris. Puis, des orthologues TEX ont été trouvés chez d’autres vertébrés (mammifères, oiseaux et reptiles), des invertébrés et des levures. À ce jour, 69 gènes TEX ( Testis expressed ) ont été décrits dans différentes espèces et différents tissus. Pour évaluer l’expression de chaque gène TEX/tex , nous avons compilé les données de 7 bases de données différentes d’ARNm RNA-Seq chez l’homme, et 4 chez la souris selon la base de données de l’atlas d’expression. Diverses études ont mis en évidence le rôle de plusieurs de ces gènes dans la spermatogenèse. Ici, nous passons en revue les connaissances actuelles sur les gènes TEX et leurs rôles dans la spermatogenèse et la fécondation chez l’humain et, comparativement, chez d’autres espèces (notamment la souris). Comme prévu, les gènes TEX semblent avoir un rôle majeur dans la reproduction en général et dans la spermatogenèse chez l’homme, mais aussi chez d’autres mammifères comme la souris. La plupart d’entre eux sont exprimés spécifiquement ou principalement dans les testicules. Comme la plupart des gènes TEX sont hautement conservés chez les mammifères, des défauts chez le mâle (mutations géniques chez l’homme et KO murin) conduisent à l’infertilité. À l’avenir, l’accumulation des données sur les fonctions physiologiques et les dysfonctionnements physiopathologiques des gènes TEX humains devraient devenir disponibles et confirmer le rôle essentiel de cette famille dans le processus de reproduction. Treize gènes TEX sont désormais référencés dans la base de données OMIM, et 3 ont été liés à un phénotype spécifique. TEX11 (sur Xq13.1) est. actuellement le gène le plus fréquemment rapporté comme étant associé à l’azoospermie