Identification et impacts des anomalies génétiques dans la genèse, l'évolution clinique et le traitement des gliomes

Human gliomas represent the most common primary brain tumours in adults. According to World Health Organization classification, gliomas are divided into astrocytomas with four grades (I, II, III, and IV), oligodendrogliomas with two grades (II and III), and oligoastrocytomas with two grades (II and III) based on the tumor cell phenotype. Pathological classification remains controversial due to the lack of specific immunohistochemical biomarker to recognize gliomas. Also, due to their natural propriety to infiltrate the normal parenchyma and to migrate far from the first location, total surgical resection remains often impossible then adjuvant treatment is needed. The established therapies for gliomas include surgery, radiotherapy and chemotherapy. Despite this arsenal of therapies, median survival of the most malignant grade glioblastoma is approximately 15 months. This is why the attempts to better understand the molecular biology of gliomas in the aim to define new molecular targets is a holy grail. Using conventional and molecular cytogenetic approaches and molecular genetic methods, we have investigated patients bearing gliomas and followed at CHUS. Our results display that the codeletion 1p/19q (1p-/19-) is not only a prognostic and predictive biomarker of oligodendrogliomas but also a diagnostic tool of this tumor. Our study has allowed us to build a glioma-bank containing around 150 samples of patients, which we continued to populate. We have also defined the cut-off positivity of FISH on touch preparation slides, which is 20%. In addition, we have developed a new, fast and reliable method to retrieve the 1p-/19q- in all samples 24 hours after sampling. This method was transferred to the clinical lab. Furthermore, we have successfully cultured the brain tumor samples and analyzed their caryotypes. This has permitted us to discover a new alternative translocation, which is responsable of 1p deletion in one oligoastrocytoma case. Since glioblastoma is characterized by genomic instability, and telomere disruption is a main cause of genomic instability, we investigated the nuclear telomere architecture in this type of tumour. We found that nuclear telomeric architecture could be a biomarker of glioblastoma since it can subdivide glioblastoma patients in three categories with significantly different outcomes and time to progression. We used high-throughput methods (one manual and one semi-automatic) to characterize the nuclear telomeric architecture in glioblastoma. The semi-automatic method can be transfer to the clinical lab since it can deliver the results nine hours after sampling. Then, this approach is usable to monitor this tumor and to evaluate the impact of different treatment options. We need to search the putative tumor suppressor genes on chromosomes 1 and 19. Furthermore, trying to understand the molecular basis of nuclear telomeric architecture will bring up new molecular target therapies

Caractérisation de deux anneaux dérivés du chromosome 22 découverts en période prénatale à l'aide de techniques de cytogénétique et de génétique moléculaire

Les anomalies chromosomiques peuvent être classées en anomalies de nombre et en anomalies de structure. L’identification des remaniements chromosomiques de structure est facilitée par les techniques de caryotypage à haute résolution et de cytogénétique moléculaire. L’utilisation de ces techniques a été essentielle pour la détection et la caractérisation de deux anneaux issus du même chromosome 22 diagnostiqués en période prénatale. Une amniocentèse a été effectuée à 163/7 semaines chez une femme de 39 ans pour âge maternel avancé. Après investigation, la formule chromosomique du fœtus a été déterminée: 47, XY, r(22)(p11.1p11.2), +r(22)(q11.1q13.31). L’anomalie chromosomique d’origine maternelle est survenue de novo. Le nombre de cellules foetales circulant dans le sang maternel est de 10 cellules par ml. Ce premier cas de deux anneaux constitutionnels du chromosome 22 est un exemple exceptionnel de monosomie partielle avec très peu de manifestations cliniques, malgré la richesse en gènes du segment délété.Objective: Cytogenetic and molecular genetic characterization of two constitutional ring chromosomes 22 identified during prenatal diagnosis. Materials and Methods: A 39 year-old woman, G4P2A1, had amniocentesis at 163/7 weeks of gestation. Conventional and molecular cytogenetic studies with microsatellite analysis of the fetal and parental cells were performed. Results: The fetus had two ring chromosomes derived from chromosome 22 with three breakpoints: one located at the centromere, another, at the p11.2 subband and the third, at the q13.31 subband. The distal part of the two derivative chromosomes was lost. Then, two rings resulted: a small and a large one. The small ring was formed by joining the end of p11.2 subband to a portion of the centromere; the other by joining the second part of the centromere to the end of q13.31 subband. The male fetus presents the following karyotype: 47, XY, r(22)(p11.1p11.2), +r(22)(q11.1q13.31). The proband’s chromosome aberration occurred de novo from the maternal chromosome. At the autopsy, the fetus showed minor clinical features. The number of fetal nucleated blood cells detected in peripheral maternal circulation, showing positive signals for Y chromosome and DiGeorge/VCF.TUPLE1 probes and absence of ARSA control signal, was 10 cells per mL. Conclusion: Despite the haploinsufficiency of many active genes, the fetus showed minor congenital malformations

Метод анализа использования факторов производства экономики Украины в пятисекторной модели

У статті обґрунтовано використання нового методу аналізу факторів виробництва в інноваційній п’ятисекторній моделі. В основу побудови покладено ідеї п’ятисекторної моделі економіки країни Д. Белла, але докорінно змінено сегменти її складу. У інноваційну модель увійшли наступні сектори: виробництво засобів виробництва; виробництво предметів споживання; сектор всіх видів послуг для всіх секторів економіки і населення; формування людського капіталу, охорона здоров'я та створення інтелектуальних цінностей; державне управління. Таким чином, створюються основи нового підходу, що дозволяють дати оцінку рівню розвитку секторів економіки України та розкрити резерви, які сприяють її прискоренню. Вперше проаналізовано вплив факторів виробництва на економіку виділених секторів економіки та проведено апробацію методу за 2001-2010 рр.The aim of the article is to give reasons for preference of a new method of the production factors analysis in the innovative five-sector model. The model is based upon Daniel Bell’s ideas of five-sector economy model, but at the same time its consisting segments have been cardinally changed. The innovative model includes the following sectors: means of production manufacture, consumer goods production; all kinds of services sector for all economy sectors and population, formation of human capital assets, health protection and creation of intellectual property, government sector. Therefore, the new approach basis is made providing the evaluation of the level of the Ukraine economic sectors development and finding some reserves promoting its acceleration. The influence of the production factors on the economy of particular sectors has been analyzed for the first time and the approbation of the method for the 2001-2010 period has been done.В статье обоснован метод анализа использования факторов производства в инновационной пятисекторной модели. В основу построения положены идеи пятисекторной модели экономики страны Д. Белла, но при этом коренным образом изменены сегменты ее состава. В инновационную модель вошли следующие секторы: производство средств производства; производство предметов потребления; услуги всех видов для субъектов хозяйствования и населения; формирование человеческого капитала, охрана здоровья и создания интеллектуальных ценностей; государственное управление. Таким образом, создаются основы нового подхода, позволяющего дать оценку уровню развития секторов экономики Украины и раскрыть резервы, способствующие её ускорению. Впервые проанализировано влияние факторов производства на экономику выделенных секторов и проведена апробация метода за 2001-2010 гг

Activité dominante négative des protéines p53 mutées

La protéine p53 dispose d’une fonction activatrice de l’expression de nombreux gènes cibles. Le rôle de facteur de transcription joué par la protéine p53 nécessite la formation d’une structure homotétramérique. Les résultats de certaines expérimentations montrent que les monomères p53 mutés ont la capacité de se lier à des monomères p53 sauvages pour constituer des complexes hétérotétramériques. La présence de monomères p53 mutés au sein de ces complexes hétérotétramériques peut avoir pour conséquence immédiate une inactivation des monomères sauvages. Cette capacité de liaison et d’inactivation des p53 mutées à l’égard des p53 sauvages est qualifiée d’« effet dominant négatif ». Plusieurs facteurs enrôlés dans cette activité dominante négative ont été identifiés. La compréhension des fonctions moléculaires complexes qui régissent cette activité constitue un des aspects importants qui permettrait de mieux discerner les mécanismes biologiques en jeu dans la cancérogenèse. Le but de cet article est de mettre en lumière des aspects jusqu’à présent occultés de l’activité dominante négative des protéines p53 mutées. De plus, nous allons souligner comment cette activité contribue à la cancérogenèse induite par les rayons ultraviolets.Tumor suppressor gene inactivation as proposed by the Knudson model implies a sequential inactivation of two alleles of a gene. For example, the first allele is inactivated by a missense mutation, and the second one is inactivated by a deletion or insertion. The alteration of the p53 tumor suppressor gene is far to correspond only to this model. In the great majority of cancers, the mutated allele of p53 coexists with the normal allele. It is well known that the transcriptional activity is one of the most important functions of p53. The p53 protein is active as a tetramer (this complex activates the expression of targeted genes by binding to its consensus DNA sequence called the p53 response element). Experimental evidence shows that wild-type p53 interacts with mutant proteins to form heterotetramers. In association with wild-type proteins, mutant proteins drive the wild-type subunits into a mutant conformation. This association leads to a loss of trans-activating function. The capacity of mutant subunits to form heterotetramers with wild-type subunits and to commit them into a mutant conformation is called « dominant negative effect ». Many p53 mutant proteins possess this dominant negative activity. Recently, several factors, which are implicated in the control of the dominant negative activity of p53 mutants, have been identified. The elucidation of these complex molecular functions, which are implicated in the dominant negative activity of the p53 mutated protein represents an important aspect in the comprehension of the biological mechanisms involved in carcinogenesis

Caractérisation physico-chimique et bactériologique des eaux usées brutes du réseau d’égout de la ville d’Abidjan

La gestion des eaux résiduaires urbaines pose de nombreux problèmes environnementaux qui deviennent préoccupants pour la santé des populations d’Abidjan. Pour remédier à cela, il est souhaitable de mettre en place des stations d’épurations. Ainsi, notre étude se présente comme une étude préliminaire visant à caractériser sur le plan physico-chimique et bactériologique les effluents du réseau d’égout de la ville d’Abidjan. Pour ce faire, nous avons effectué six campagnes de  prélèvement d’eaux usées durant une  année (Décembre 2013-Novembre 2014) sur huit (8) sites spécifiques du réseau d’égout. Ces échantillons ont fait l’objet  d’analyses physico-chimiques et bactériologiques sur la base des normes Françaises, Canadiennes et celles décrites par Rodier. Les résultats obtenus indiquent qu’à l’exception du phosphore total (PT) dont les concentrations sont comprises entre 4,3±4 et 10,9±6,7mg/l, les autres principaux indicateurs de pollution que sont l’azote total (NTK, 73,3±32 à 118,2±37,6 mg/l), les matières en suspension (MES, 79±23,3 à325,2±270,3 mg/l), la demande biochimique en oxygène en 5 jours (DBO5, 127,3±87,7 à 863,7±262,2 mgO2/l) et la demande chimique en oxygène (DCO, 276,2±195,6 à 975,3±249,4 mgO2/l) sont au-delà des valeurs guidesrecommandées par l’Etat de Côte d’Ivoire à travers le service d’inspection des installations classées (SIIC) en matière de rejet des effluents en milieu récepteur. L’analyse de la flore bactérienne des effluents révèle que les concentrations de coliformes fécaux et les streptocoques fécaux excèdent les valeurs indicatives préconisées par l’OMS.Mots clés : Caractérisation, eaux usées, réseau d’égout, bactériologie, physico-chimie

Comment Reconnaitre Les Dégâts Causés Par Ootheca Mutabilis Sahlberg, (Coleoptera : Chrysomelidae) Sur Le Niébé Et Lutter Efficacement Contre Ce Ravageur Emergent Des Zones Tropicales d’Afrique

Le défoliateur du niébé (Ootheca mutabilis) qui était considéré comme ravageur mineur du niébé (Vigna unguiculata L. Walp) cause de nos jours des dégâts importants à cette culture dans les zones tropicales humides d’Afrique. Les attaques des adultes peuvent entraîner une réduction de la surface photosynthétisante (jusqu'à 95 %) des feuilles due à la multiplication des lésions foliaires et à la défoliation. Une infestation sévère peut détruire complètement la culture. Une bonne connaissance de l’insecte incriminé et la reconnaissance de ses dégâts sur les plants de niébé s’avère nécessaire pour un meilleur contrôle de ce ravageur. Cette fiche technique présente l’insecte nuisible, la reconnaissance de ses dégâts, ainsi qu’une stratégie de méthode de lutte efficace basée sur de bonnes pratiques agricoles et sur une utilisation rationnelle des insecticides chimiques de synthèse à base de cyperméthrine, de deltaméthrine, et de lambdacyhalothrine

Influence des substrats fibre de coco, coque d’arachide et compost de soja sur le comportement de deux variétés de tomates TMA97 et Lindo en culture hydroponique

Pour réduire les difficultés des populations urbaines à l’accès à la terre et aussi pour améliorer la qualité de la production maraîchère en évitant les maladies telluriques, la mise au point d’un substrat adapté pour la culture hydroponique a été entreprise. Deux variétés de tomate, TMA97 et Lindo ont été évaluées sur trois substrats : fibres de coco, compost de soja et coques d’arachide. Les observations et mesures ont porté sur la croissance végétative, le délai de floraison puis les paramètres du rendement. Les résultats obtenus ont montré que la meilleure croissance a été obtenue avec la variété Lindo sur les fibres de coco. Le taux de fruits avarié le plus élevé (37%) a également été produit par Lindo sur ce substrat. Par contre, la variété TMA97 cultivée sur le compost de soja en a donné le plus faible (1,3%). Statistiquement, les rendements potentiels et nets ont été identiques chez les variétés de tomates étudiées. Mais numériquement, les rendements nets ont été plus élevés chez TMA97 que chez Lindo quel que soit le substrat utilisé. Chez la variété Lindo, les rendements nets les plus importants ont été obtenus avec le compost de soja. Les coques d’arachide ont donné les faibles rendements. Concernant la variété TMA97, les valeurs les plus élevées ont été produites sur les fibres de coco ; alors que lesplus petites valeurs ont été observées sur les coques d’arachide. Mots clés : Tomate, hydroponie, solution nutritive, substrat, rendement.   English Title: Influence of coconut fiber, peanut shell and soybean compost substrates on the behavior of two tomato varieties TMA97 and Lindo in hydroponic cultivationTo reduce the urban population's difficulties in accessing land and also to improve the quality of vegetable production by avoiding telluric diseases, the development of a suitable substrate for hydroponic cultivation has been undertaken. Two varieties of tomato, TMA97 and Lindo were evaluated on three substrates: coconut fibers, soy compost and peanut shells. Observations and measurements focused on vegetative growth, flowering time, and yield parameters. The results obtained showed that the best growth was obtained with the Lindo variety on coconut fibres. The highest rate of damaged fruit (37%) was also produced by Lindo on this substrate. On the other hand, the variety TMA97 grown on soy compost gave the lowest (1.3%). Statistically, potential and net yields were identical in the tomato varieties studied. But numerically, the net yields are higher in TMA97 than in Lindo regardless of the substrate used. In the Lindo variety, the highest net yields were obtained with soy compost. Peanut shells gave low yields. For the TMA97 variety, the highest values were produced on coconut fibers; while the smallest values were observed on peanut shells. Keywords : Tomato, hydroponics, nutrient solution, substrate, yield

Utilisation du broyat de péricarpes des cabosses de cacao comme milieu de culture alternatif pour la production de Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1

La recherche de matières premières alternatives pour la production de biopesticides microbiens suscite beaucoup d’intérêts. La présente étude s’est proposée d’utiliser le broyat de péricarpes des cabosses de cacao comme substrat de fermentation pour produire Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1 (Btk HD-1). Les échantillons de péricarpes des cabosses ont été collectés dans une plantation cacaoyère de Toumokro à Yamoussoukro en Côte d’Ivoire. Les paramètres physico-chimiques ont été déterminés selon les méthodes standards. Le substrat de fermentation a été autoclavé, 2 fois successivement, à 121 °C pendant 30 min et ensemencé avec 4% de l’inoculum de Btk HD-1. Il ressort de cette étude que les teneurs en carbone et en azote total ont été respectivement de 79.7% et 1.4%. Les concentrations en minéraux du substrat ont été plus élevées en calcium (8406.5 mg/kg) et en potassium (8248.8 mg/kg) qu’en magnésium (632.6 mg/kg), sodium (471.5 mg/kg), fer (57 mg/kg), cuivre (52.8 mg/kg), zinc (51.8 mg/kg) et manganèse (44.3 mg/kg). Le dénombrement des cellules et des spores viables a donné respectivement 3.2.1011 et 3.02.1011 UFC/ml, pour le surnageant, et 6.5.1013 et 5.02.1013 UFC/ml, pour le culot. Ce substrat végétal offre une bonne perspective pour la production d’un biopesticide à base de Btk HD-1.© 2016 International Formulae Group. All rights reserved.Mots-clés: Péricarpes des cabosses de cacao, biopesticide, Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1, fermentation en milieu solide, Côte d’IvoireEnglish Title:  Use of crushed cocoa hulls as an alternative culture medium for Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1 productionEnglish AbstractResearch for alternative raw material for microbial biopesticides production raises outstanding interests.This study is proposed to use the crushed pericarps cocoa pods as fermentation substrate to produce Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1 (Btk HD-1). The samples pericarps pods were collected in a cocoa plantation of Toumokro in Yamoussoukro area, Côte d'Ivoire. The physico-chemical parameters were determined using standard methods. The fermentation substrate was autoclaved 2 times successively at 121 °C for 30 minutes and inoculated with 4% of Btk HD-1 inoculum. It appears from this study that the carbon and total nitrogen were 79.7% and 1.4% respectively. Mineral concentrations in substrate were higher in calcium (8406.5 mg/kg) and potassium (8248.8 mg/kg) than magnesium (632.6 mg/kg), sodium (471.5 mg/kg), iron (57 mg/kg), copper (52.8 mg/kg), zinc (51.8 mg/kg) and manganese (44.3 mg/kg). Cell counts and viable spores gave respectively 3.2.1011 and 3.02.1011 CFU/ml, to the supernatant, and 6.5.1013 and 5.02.1013 CFU/ml, for the pellet. This vegetal substrate offers a good prospect for Btk HD-1 based biopesticide production.© 2016 International Formulae Group. All rights reserved.Keywords: Cocoa hulls pod, biopesticide, Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1, solid medium fermentation, Côte d’Ivoir

Seroprevalence of transfusion-transmissible infections among family replacement donors and voluntary non-remunerated blood donors during the COVID-19 pandemic in sub Saharan Africa

Introduction : According to WHO,  regular, voluntary, unpaid blood donors are the safest group of donors, as they have the lowest prevalence of blood transmitted infections. However, family/replacement blood donors is widely used in sub Saharan Africa and this practice was exacerbated during the COVID 19 pandemic. This study aimed to compare the seroprevalence of infectious markers in family replacement blood donors and voluntary non-remunerated  blood donors during the COVID 19 pandemic in a country of sub Saharan Africa.   Materials and Methods Blood donors received at the National Centre of Blood Transfusion (NBTC) of Dakar from August 1st to October 31th 2021, were included in this study. All donors completed a pre-donation questionnaire. Donors identity, epidemiological parameters, reasons for donation and laboratory results were collected in the Inlog® software of the NBTC. The serological tests for HBV, HIV and HCV were performed with chemiluminescence technology. The Rapid Plasma Reagent test was used to find out treponemal antibodies. The determination of ABO and Rh blood groups was performed using monoclonal antisera following classical hemagglutination test on a plate. Results A total of 5002 donors were collected during this COVID-19 pandemic period. Blood family/replacement donors represented 54.0% and new voluntary donors represented 52.6%. Comparison of HIV, HCV and syphilis markers seroprevalence showed no statistically significant difference between new voluntary donors and new family replacement donors (p>0.05). However, for HBV the seroprevalence was significantly higher in new family replacement donors (p=0,002). Conclusion The proper supply of blood was impacted by the COVID-19 pandemic meanwhile replacement donations had contributed to limiting the damage observed with blood shortages. However, the significant differences noted on the seroprevalences of transfusion-transmissible infections between voluntary non-paid donors and family/replacement donors strengthens WHO recommendations for the selection of volunteer non-paid donors to lower transfusion-transmissible HBV in sub Saharan Africa.                

IN VITRO ASSESSMENT OF BIOPESTICIDE BACILLUS THURINGIENSIS VAR. KURSTAKI HD- 1 EFFECTIVENESS ON PHYTOPHTHORA PALMIVORA, AGENT OF COCOA BLACK POD ROT IN CÔTE D’IVOIRE

Phytophthora Palmivora is responsible for the cocoa black pod rot in Côte d'Ivoire, with production losses varying from 20 to 40% depending on the regions. Effectiveness of the environmentally friendly biopesticide Bacillus thuringiensis var. kurstaki HD-1 was evaluated in vitro on the pathogen. The medium pea supercooled has been incorporated with the bioproduct at different concentrations: C1 = 100%, C2 = 50%, C3 =25%, C4 = 12.5% and C5 = 6.25%. This medium into Petri dishes was inoculated either by spreading, with 0.1 mL of P. palmivora inoculum at103 zoospores /mL, or with a mycelial disc of P. palmivora calibrated at 6 mm diameter in the center of the box. The results showed that the germination of zoospores was inhibited at the rate of 100% in the presence of the concentrations C1 and C2. This rate was 74.82 ± 21.53%, 73.17 ± 20.88% and 59.12 ± 39.05%, respectively, for C3, C4 and C5. The efficacy of the bioproduct is revealed by a significant reduction of mycelia growth ranging between 57.77± 2.4 to 100% in the presence of the concentrations C5 to C1. The IC50 of germination was 3.36% of concentration and the IC90 was 43.22%; while those which inhibit 50% and 90% of mycelial growth were 5.67% and 77.94% respectively. The biopesticide Btk HD-1 has a proven fungistatic effect against P. palmivora. Its effectiveness increases with its concentration. So it can be a valuable component of an integrated cocoa black pod management