Combining deep learning and X-ray imaging technology to assess tomato seed quality

ABSTRACT Traditional germination tests which assess seed quality are costly and time-consuming, mainly when performed on a large scale. In this study, we assessed the efficiency of X-ray imaging analyses in predicting the physiological quality of tomato seeds. A convolutional neural network (CNN) called mask region convolutional neural network (MaskRCNN) was also tested for its precision in adequately classifying tomato seeds into four seed quality categories. For this purpose, X-ray images were taken of seeds of 49 tomato genotypes (46 Solanum pennellii introgression lines) from two different growing seasons. Four replicates of 25 seeds for each genotype were analyzed. These seeds were further assessed for germination and seedling vigor-related traits in two independent trials. Correlation analysis revealed significant linear association between germination and image-based variables. Most genotypes differed in terms of germination and seed development performance considering the two independent trials, except LA 4046, LA 4043, and LA4047, which showed similar behavior. Our findings point out that seeds with low opacity and percentage of damaged seed tissue and high values for living tissue opacity have greater physiological quality. In short, our work confirms the reliability of X-ray imaging and deep learning methodologies in predicting the physiological quality of tomato seeds

O implante de valva aórtica transcateter no tratamento da estenose aórtica: perspectivas e desafios / Transcatheter aortic valve implantation in the treatment of aortic stenosis: perspectives and challenges

INTRODUÇÃO: A estenose aórtica é a valvopatia grave mais prevalente na população, caracterizada pela obstrução fixa da valva aórtica. Assintomática nos estágios iniciais, pode cursar com a tríade de dispneia, síncope e dor torácica. Como tratamento, a cirurgia de substituição da valva é uma das opções. METODOLOGIA: Trata-se de uma revisão narrativa, com pesquisas nas bases de dados SciELO, LILACS e PubMed e recorte temporal de 2016 a 2021. Os  descritores utilizados foram “aortic valve stenosis”, " transcatheter aortic valve replacement "e “indicators of morbidity and mortality”, nas línguas inglesa e portuguesa.  RESULTADOS: Os artigos analisados foram publicados em periódicos nacionais e internacionais. Foram selecionados artigos de revisões sistemáticas, ensaios clínicos, editorial, relatos de caso, estudos comparativos, estudos observacionais, revisão narrativa e estudos prognósticos. DISCUSSÃO:  A bibliografia consultada  afirma que o implante de valva aórtica transcateter - TAVI surgiu como um tratamento menos invasivo nos casos de estenose aórtica grave, sendo uma alternativa para pacientes com alto risco cirúrgico ou considerados ‘inoperáveis’.  CONCLUSÃO: De acordo com estudos, o uso de TAVI apresenta benefícios em alguns casos bem como tem impactos positivos na sobrevida de pacientes submetidos ao tratamento cirúrgico da estenose aórtica. Contudo, assim como qualquer procedimento tem várias possíveis complicações

Síndrome de Cockayne: Cockayne syndrome

INTRODUÇÃO: A Síndrome de Cocayne (SC) é um distúrbio raro, hereditário, autossômico recessivo que está associado a mutações em dois genes envolvidos no reparo do DNA. Ela é caracterizada por alterações, como nanismo, atraso no desenvolvimento neuropsicomotor, deficiência intelectual, marcha deficiente, anomalias oculares, microcefalia e surdez. Existem 3 tipos de apresentações dessa síndrome que podem ser do tipo I (clássica) , do tipo II (congênita) ou do tipo III ( de início tardio). APRESENTAÇÃO DO CASO: Paciente com 4 anos e 2 meses, feminina, procedente de Januária-MG, foi encaminhada ao HC de São Paulo por deficiência global do desenvolvimento. Apresentava  microcefalia, atraso motor, face triangular, cáries nos dentes e pavilhões auriculares aumentados. Aos 3 anos foi diagnosticada surdez neurossensorial bilateral. DISCUSSÃO: A SC apresenta uma falha de crescimento somático e cerebral no período pós-natal, acompanhado de degeneração de múltiplos tecidos A patologia possui um reparo deficiente do DNA o que aumenta sua vulnerabilidade ao estresse oxidativo e envelhecimento. A síndrome não possui tratamento curativo, tendo como objetivo melhorar a qualidade de vida do paciente, tratando possíveis complicações e retardando a sua progressão. CONCLUSÃO: A avaliação do paciente com suspeita de SC deve incluir história clínica completa e um exame físico detalhado devido ao seu difícil diagnóstico, com um enfoque no  sistema neurológico, oftalmológico, dermatológico  e odontológico. Além disso, a medicina oferece tratamentos sintomáticos e, também, para suas possíveis complicações

Osteíte tuberculosa: Tuberculous osteitis

Introdução: A osteíte tuberculosa é uma condição rara e de difícil diagnóstico, causada por lesões ósseas associadas ao agente etiológico Mycobacterium tuberculosis. Os locais mais acometidos são joelhos, tornozelos, quadris e vértebras. Apresentação do caso: XXX, sexo feminino, 2 anos de idade,  admitida com dor em membro inferior direito com edema em joelho associada a deambulação prejudicada há 15 dias. Ao quadro, associavam-se picos de febre baixa, principalmente noturna.  Realizada radiografia que discriminou lesão osteolítica na epífise distal do fêmur. Discussão: O tratamento inicial com antibioticoterapia é muito comum devido à dificuldade em diagnosticar essa condição precocemente. Atualmente, o tratamento tem como base antibacilares por tempo variado, com média de um ano. Além disso, um cuidado abrangente, com pilares ortopédicos e fisioterápicos deve ser ofertado visando alívio da dor e evitar sequelas. Conclusão: A principal causa de falha do tratamento é a demora diagnóstica. Sendo assim, devido ao grande potencial benéfico da vacina e à boa resposta terapêutica da osteíte tuberculosa, a vacina não deve ser descontinuada mas se faz de suma importância a disseminação de informações claras e pertinentes a respeito dessa patologia desconhecida

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear un derstanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5–7 vast areas of the tropics remain understudied.8–11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world’s most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepre sented in biodiversity databases.13–15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may elim inate pieces of the Amazon’s biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological com munities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple or ganism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region’s vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most ne glected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lostinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Os desafios do atendimento de pacientes com sequelas cardiovasculares decorrentes de trauma do tórax / Challenges in the care of patients with cardiovascular sequels resulting from chest trauma

Introdução: O tórax apresenta estruturas de diversos sistemas de sustentação da vida, dentre eles o respiratório e o cardiovascular. Por conter, estruturas nobres para a manutenção da vida, os potenciais para ocorrer lesões graves em decorrência de traumas são muito grandes, como dados mostram, 25% das mortes são secundárias a trauma torácico. Dentro deste contexto, questiona-se quais os desafios no atendimento de pacientes com sequelas cardiovasculares decorrentes de traumas torácicos? Portanto, esse estudo tem como objetivo identificar as dificuldades enfrentadas na assistência de saúde de pacientes com repercussões cardiovasculares devido a trauma de tórax, através da elaboração de um formulário baseado em revisão bibliográfica de dados da literatura científica publicados sobre esse tema. Metodologia: O trabalho baseia-se numa revisão integrativa de literatura, na qual foram analisados artigos publicados em revistas científicas, utilizando-se das bases de dados da BVS (Biblioteca Virtual da Saúde), como: Lilacs (Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde) e Scielo (Scientific Electronic Library Online). Resultados: Após as análises e seleção, restaram-se sete artigos para integrar a discussão. Os artigos selecionados, estão descritos na tabela, com autores, título, metodologia, resultados e conclusão. Em seguida, foi realizada uma discussão acerca destes artigos. Conclusão: Cada um dos casos revisados neste estudo demonstra a necessidade e a importância de acompanhamento cuidadoso de todos os pacientes que sofreram trauma torácico fechado, mesmo que a avaliação cardíaca inicial possa ser negativa.

The Eighteenth Data Release of the Sloan Digital Sky Surveys: Targeting and First Spectra from SDSS-V

The eighteenth data release of the Sloan Digital Sky Surveys (SDSS) is the first one for SDSS-V, the fifth generation of the survey. SDSS-V comprises three primary scientific programs, or "Mappers": Milky Way Mapper (MWM), Black Hole Mapper (BHM), and Local Volume Mapper (LVM). This data release contains extensive targeting information for the two multi-object spectroscopy programs (MWM and BHM), including input catalogs and selection functions for their numerous scientific objectives. We describe the production of the targeting databases and their calibration- and scientifically-focused components. DR18 also includes ~25,000 new SDSS spectra and supplemental information for X-ray sources identified by eROSITA in its eFEDS field. We present updates to some of the SDSS software pipelines and preview changes anticipated for DR19. We also describe three value-added catalogs (VACs) based on SDSS-IV data that have been published since DR17, and one VAC based on the SDSS-V data in the eFEDS field.Comment: Accepted to ApJ

Consistent patterns of common species across tropical tree communities

Trees structure the Earth’s most biodiverse ecosystem, tropical forests. The vast number of tree species presents a formidable challenge to understanding these forests, including their response to environmental change, as very little is known about most tropical tree species. A focus on the common species may circumvent this challenge. Here we investigate abundance patterns of common tree species using inventory data on 1,003,805 trees with trunk diameters of at least 10 cm across 1,568 locations1,2,3,4,5,6 in closed-canopy, structurally intact old-growth tropical forests in Africa, Amazonia and Southeast Asia. We estimate that 2.2%, 2.2% and 2.3% of species comprise 50% of the tropical trees in these regions, respectively. Extrapolating across all closed-canopy tropical forests, we estimate that just 1,053 species comprise half of Earth’s 800 billion tropical trees with trunk diameters of at least 10 cm. Despite differing biogeographic, climatic and anthropogenic histories7, we find notably consistent patterns of common species and species abundance distributions across the continents. This suggests that fundamental mechanisms of tree community assembly may apply to all tropical forests. Resampling analyses show that the most common species are likely to belong to a manageable list of known species, enabling targeted efforts to understand their ecology. Although they do not detract from the importance of rare species, our results open new opportunities to understand the world’s most diverse forests, including modelling their response to environmental change, by focusing on the common species that constitute the majority of their trees.Publisher PDFPeer reviewe