Impact of the introduction of an automated microbiologic system on the clinical outcomes of bloodstream infections caused by Enterobacteriaceae strains

INTRODUCTION: Enterobacteriaceae strains are a leading cause of bloodstream infections (BSI). The aim of this study is to assess differences in clinical outcomes of patients with BSI caused by Enterobacteriaceae strains before and after introduction of an automated microbiologic system by the microbiology laboratory. METHODS: We conducted a retrospective cohort study aimed to evaluate the impact of the introduction of an automated microbiologic system (Phoenix(tm) automated microbiology system, Becton, Dickinson and Company (BD) - Diagnostic Systems, Sparks, MD, USA) on the outcomes of BSIs caused by Enterobacteriaceae strains. The study was undertaken at Hospital São Paulo, a 750-bed teaching hospital in São Paulo, Brazil. Patients with BSI caused by Enterobacteriaceae strains before the introduction of the automated system were compared with patients with BSI caused by the same pathogens after the introduction of the automated system with regard to treatment adequacy, clinical cure/improvement and 14- and 28-day mortality rates. RESULTS: We evaluated 90 and 106 patients in the non-automated and automated testing periods, respectively. The most prevalent species in both periods were Klebsiella spp. and Proteus spp. Clinical cure/improvement occurred in 70% and 67.9% in non-automated and automated period, respectively (p=0.75). 14-day mortality rates were 22.2% and 30% (p=0.94) and 28-day mortality rates were 24.5% and 40.5% (p= 0.12). There were no significant differences between the two testing periods with regard to treatment adequacy, clinical cure/improvement and 14- and 28-day mortality rates. CONCLUSIONS: Introduction of the BD Phoenix(tm) automated microbiology system did not impact the clinical outcomes of BSIs caused by Enterobacteriaceae strains in our setting.Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Escola Paulista de Medicina Hospital São PauloUNIFESP, EPM, Hospital São PauloSciEL

Prevalência e evolução clínica de episódios de pneumonia associada à ventilação mecânica causada por Pseudomonas aeruginosa resistente a imipenem produtoras e não-produtoras de SPM-1

INTRODUCTION: Pseudomonas aeruginosa is a leading cause of ventilator-associated pneumonia (VAP) and exhibits high rates of resistance to several antimicrobial drugs. The carbapenens are usually the drugs of choice against this microorganism. However, the carbapenem resistance has increased among these strains worldwide. The presence of metallo-β-lactamases (MBL) has been pointed out as a major mechanism of resistance among these strains. No previous study addressed outcomes of respiratory infections caused by these strains. METHODS: Our group sought to analyze the epidemiology and clinical outcomes of patients with VAP caused by imipenem-resistant P. aeruginosa. A total of 29 clinical isolates of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa were screened for metallo-β-lactamase (MBL) genes. RESULTS: Demographic and clinical variables were similar between the SPM-1-producing and non-SPM-1-producing group. Five (17.2%) isolates were positive for blaSPM-1. No other MBL gene was found. All patients were treated with polymyxin B. The infection-related mortality was 40% and 54.2% for SPM-1-producing and -non-producing isolates, respectively. CONCLUSIONS: There were no differences in epidemiological and clinical outcomes between the two groups.INTRODUÇÃO: Pseudomonas aeruginosa é uma importante causa de pneumonia associada à ventilação mecânica (PAV) e exibe altas taxas de resistência a vários antimicrobianos. Os carbapenens são usualmente as drogas de escolha para esse microorganismo. Contudo, a resistência a carbapenens tem crescido entre essas amostras em todo o mundo. A presença de metalo- β-lactamase (MBL) tem sido apontado como um importante mecanismo de resistência nessas cepas. Nenhum estudo prévio avaliou desfechos clínicos de infecções respiratórias causadas por essas amostras MÉTODOS: Nosso grupo analisou a epidemiologia e evolução clínica de episódios de PAV causada por P. aeruginosa resistente a imipenem. Um total de vinte e nove isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa resistente a carbapenem foram avaliados quanto à presença de genes para metalo-β-lactamase (MBL). RESULTADOS: Variáveis clínicas e demográficas foram similares entre o grupo produtor de SPM-1 e o não-produtor. Cinco (17,2%) isolados foram positivos para blaSPM-1. Nenhum outro gene para MBL foi encontrado. Todos os pacientes foram tratados com polimixina B. A mortalidade relacionada à infecção foi de 40% e 50% respectivamente para os isolados produtores de SPM-1 e não-produtores de SPM-1. CONCLUSÕES: Nao houve diferença entre os dados epidemiológicos e a evolução clínica entre os dois grupos.Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Divisão de Doenças Infecciosas Comissão de Epidemiologia HospitalarUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Divisão de Doenças Infecciosas Laboratório de AlertaUNIFESP, Divisão de Doenças Infecciosas Comissão de Epidemiologia HospitalarUNIFESP, Divisão de Doenças Infecciosas Laboratório de AlertaSciEL

Prevalence and factors associated with rectal vancomycin-resistant enterococci colonization in two intensive care units in São Paulo, Brazil

Vancomycin-resistant enterococci (VRE) are important pathogens causing nosocomial infections, and there is reason for concern about their resistance and great ability to spread in hospital environments, especially intensive-care units (ICU). To determine the prevalence of rectal colonization by VRE, and the risk factors associated with their presence, rectal surveillance swabs were taken from patients under treatment in two intensive-care units (one medical and another both medical and surgical) at São Paulo Hospital, over a two-year period. Thirty-three percent of the 147 patients evaluated had VRE. The only significant variable in the logistic regression was the length of stay in the ICU.Federal University of São Paulo Hospital Epidemiology Committee Division of Infectious DiseasesUNIFESP, Hospital Epidemiology Committee Division of Infectious DiseasesSciEL

Compliance with handwashing at two intensive care units in São Paulo

Handwashing compliance was compared at two medical- surgical intensive care units (ICUs) of a teaching and a non-teaching hospital. The mean compliance was 22.2% and 42.6%, respectively. Respiratory therapists at the non-teaching hospital had the best handwashing compliance (52.6%). Nursing assistants at the teaching hospital had the worst compliance (11.5%). Nursing assistant was the only health-care worker category with a significant difference between the two ICUs (odds ratio = 6.0; 95% confidence interval = 3.83-9.43; p< 0.001).Federal University of São Paulo Division of Infectious Diseases Healthcare Epidemiology CommitteeFederal University of São Paulo Diadema State Hospital Infection Control CommitteeUNIFESP, Division of Infectious Diseases Healthcare Epidemiology CommitteeUNIFESP, Diadema State Hospital Infection Control CommitteeSciEL

Produção de heteroagregados de gotas lipídicas e emulsões gel-like em diferentes condições de emulsificação

Orientador: Rosiane Lopes da CunhaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de AlimentosResumo: Dentre as estratégias de redução de gordura em alimentos, destacam-se a heteroagregação de gotas lipídicas e a gelificação de emulsões. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo produzir heteroagregados de gotas lipídicas e emulsões gel-like utilizando proteínas lácteas como agentes emulsificantes e diferentes métodos de emulsificação. Inicialmente emulsões foram produzidas com o intuito de caracterizar estruturalmente os sistemas obtidos e avaliar o efeito do ultrassom sobre as propriedades estruturais e tecnológicas das proteínas. O caseinato de sódio sofreu redução significativa de tamanho em sua estrutura molecular, o que não foi observado para a lactoferrina. A hidrofobicidade superficial foi afetada positivamente pelo aumento do tempo de ultrassom e foram observadas diferenças mínimas na eletroforese em gel da lactoferrina. Não foram detectadas diferenças no sinal dicróico para o caseinato de sódio, mas uma leve mudança conformacional foi observada para a lactoferrina. Emulsões com tamanho de gotas reduzido foram obtidas com maiores tempos de sonicação para ambas as proteínas, no entanto, a lactoferrina levou à formação de emulsões mais estáveis. O tratamento ultrassônico prévio das proteínas melhorou suas propriedades emulsificantes, mas este tratamento ultrassônico em conjunto com o processo de formação de gotas resultou em emulsões mais estáveis, facilitando a deposição dos emulsificantes na interface óleo/água. A partir desses resultados, as emulsões foram misturadas em diferentes razões de volume, permitindo a formação de heteroagregados. As características desses heteroagregados dependeram fortemente da razão de volume das emulsões misturadas. Além disso, variações de força iônica não influenciaram a estabilidade dos heteroagregados. Na etapa seguinte os heteroagregados foram caracterizados frente às condições do trato gastrointestinal. A digestão lipídica dependeu do tipo de emulsificante que recobria as gotas, bem como da ação das enzimas digestivas e dos sais biliares. Os heteroagregados apresentaram o menor percentual de digestão lipídica, possivelmente devido a interação dos lipídeos com os peptídeos que foram digeridos. Na última etapa, foram produzidas emulsões gel-like através de uma técnica a frio. Para isso, dispersões de lactoferrina foram previamente aquecidas por aquecimento ôhmico ou convencional. O efeito do aquecimento na agregação da lactoferrina foi avaliado a fim de fornecer conhecimento sobre os mecanismos que podem influenciar nas propriedades das emulsões gelificadas. A formação das emulsões foi atribuída à capacidade emulsificante da lactoferrina, combinada com o método de emulsificação e o tratamento térmico da proteína. O aquecimento ôhmico influenciou no desdobramento e agregação das moléculas de lactoferrina. Comparado ao aquecimento convencional, foi possível obter moléculas menos agregadas, o que foi confirmado pelo menor aumento de tamanho, turbidez e fluorescência, refletindo diretamente nas emulsões obtidas. As propriedades reológicas e microestruturais dependeram do tipo de aquecimento, onde o aquecimento convencional possibilitou a formação de emulsões gel-like com uma estrutura mais forte. De uma forma geral, foi possível avaliar o efeito do ultrassom e do aquecimento nas propriedades estruturais e tecnológicas das proteínas, bem como propor estratégias de estruturação de emulsões visando a substituição e redução de gorduras em produtos alimentíciosAbstract: Among the fat reduction strategies in foods, the heteroaggregation of lipid droplets and the gelation of emulsions stand out. Thus, the aim of this work was to produce heteroaggregates of lipid droplets and gel-like emulsions using milk proteins as emulsifying agents and different emulsification methods. Initially, emulsions were produced with the purpose of characterizing structurally the obtained systems and evaluate the effect of ultrasound on the structural and technological properties of proteins. Sodium caseinate molecular structure showed a significantly reduce in size, which was not observed for lactoferrin. Surface hydrophobicity was positively affected by the increase in the duration of ultrasonic treatment and minimal differences were observed in lactoferrin gel electrophoresis. No differences were detected in the dichroic signal for sodium caseinate, but a slight conformational change was observed for lactoferrin. Emulsions with reduced droplet size were obtained with higher sonication times for both proteins, however, lactoferrin led to the formation of more stable emulsions. Previous ultrasonic treatment of the proteins improved their emulsifying properties, but this ultrasonic treatment associated to the droplet formation process resulted in more stable emulsions, facilitating the deposition of the emulsifiers at the oil/water interface. From these results, the emulsions were mixed in different volume ratios, allowing the formation of heteroaggregates. The characteristics of these heteroaggregates strongly depended on the volume ratio of the mixed emulsions. In addition, variations in ionic strength did not influence the stability of heteroaggregates. In the next step the heteroaggregates were characterized against conditions of the gastrointestinal tract. Lipid digestion depended on the type of emulsifier that covered the drops, as well as the action of digestive enzymes and bile salts. Heteroaggregates presented the lowest percentage of lipid digestion, possibly due to the interaction of the lipids with the peptides that were digested. In the latter step, gel-like emulsions were produced by a cold technique. For this, lactoferrin dispersions were preheated by ohmic or conventional heating. The effect of heating on aggregation of lactoferrin was evaluated in order to provide knowledge about the mechanisms that may influence the properties of the gelled emulsions. The formation of the emulsions was attributed to the emulsifying ability of lactoferrin, combined with the emulsification method and the heat treatment of the protein. The ohmic heating influenced the unfolding and aggregation of the lactoferrin molecules. Compared to conventional heating, it was possible to obtain less aggregate molecules, which was confirmed by the smaller increase in size, turbidity and fluorescence, directly reflecting the obtained emulsions. The rheological and microstructural properties depended on the type of heating, since conventional heating allowed the formation of gel-like emulsions with a stronger structure. In general, it was possible to evaluate the effect of ultrasound and heating on the structural and technological properties of proteins, as well as to propose strategies for structuring emulsions aiming at the substitution and reduction of fats in food productsDoutoradoEngenharia de AlimentosDoutor em Engenharia de Alimentos140271/2014-7CAPESFAPESPCNP

Application of control measures for infections caused by multi-resistant gram-negative bacteria in intensive care unit patients

Multi-resistant gram-negative rods are important pathogens in intensive care units (ICU), cause high rates of mortality, and need infection control measures to avoid spread to another patients. This study was undertaken prospectively with all of the patients hospitalized at ICU, Anesthesiology of the Hospital São Paulo, using the ICU component of the National Nosocomial Infection Surveillance System (NNIS) methodology, between March 1, 1997 and June 30, 1998. Hospital infections occurring during the first three months after the establishment of prevention and control measures (3/1/97 to 5/31/97) were compared to those of the last three months (3/1/98 to 5/31/98). In this period, 933 NNIS patients were studied, with 139 during the first period and 211 in the second period. The overall rates of infection by multi-resistant microorganisms in the first and second periods were, respectively, urinary tract infection: 3.28/1000 patients/day; 2.5/1000 patients/day; pneumonia: 2.10/1000 patients/day; 5.0/1000 patients/day; bloodstream infection: 1.09/1000 patients/day; 2.5/1000 patients/day. A comparison between overall infection rates of both periods (Wilcoxon test) showed no statistical significance (p = 0.067). The use of intervention measures effectively decreased the hospital bloodstream infection rate (p < 0.001), which shows that control measures in ICU can contribute to preventing hospital infections.Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Departamento de Medicina Comissão de Epidemiologia HospitalarUNIFESP, Depto. de Medicina Comissão de Epidemiologia HospitalarSciEL

Community-acquired invasive liver abscess syndrome caused by a K1 serotype Klebsiella pneumoniae isolate in Brazil: a case report of hypervirulent ST23

Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Departamento de MedicinaUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Departamento de Medicina Divisão de Doenças InfecciosasUNIFESP, Depto. de MedicinaUNIFESP, Depto. de Medicina Divisão de Doenças InfecciosasSciEL

Vivendo de música : trabalho, profissão e identidade uma etnografia da Orquestra de Câmara Theatro São Pedro, de Porto Alegre

A presente dissertação corresponde a uma etnografia da Orquestra de Câmara Theatro São Pedro, grupo sediado em Porto Alegre, no Brasil. Trata-se de uma pesquisa sobre como ocorre a atuação profissional dos músicos que compõem a orquestra, tanto no âmbito deste conjunto quanto em outros contextos de trabalho dos quais eles também participam. Buscou-se compreender, por meio do conceito de identidade profissional, como estes indivíduos formulam para si e para os outros uma concepção de seu próprio trabalho. Nesse sentido, foram considerados tanto os aspectos materiais de sua atividade laboral (econômicos e práticos, por exemplo) quanto os componentes imateriais (simbólicos, artísticos e estéticos). O trabalho musical, no contexto investigado, é caracterizado por uma grande flexibilidade, no qual predominam as atuações por projetos. As múltiplas formas de emprego, a incerteza econômica e a falta de garantias profissionais marcam esse setor, sendo fatores que influenciam diretamente no modo como esses músicos de orquestra percebem e encaram a sua profissão.This dissertation corresponds to an ethnography of the Orquestra de Câmara Theatro São Pedro, a group based in Porto Alegre, Brazil. It is a research about how the professional performance of the musicians that integrate the orchestra takes place, both within this group and in other work contexts in which they also participate. It was sought to understand, through the concept of professional identity, how these individuals formulate for themselves and for others a conception of their own work. In this sense, both the material aspects of their work activity (economic and practical, for example) and the immaterial components (symbolic, artistic and aesthetic) were considered. The musical work, in the context investigated, is characterized by a great flexibility, in which the performances by projects predominate. The multiple forms of employment, economic uncertainty and lack of professional guarantees mark this sector, being factors that directly influence the way these orchestra musicians perceive and face their profession

Rapid detection of Vancomycin-Resistant Enterococci (VRE) in rectal samples from patients admitted to intensive care units

ABSTRACT: The reduction in time required to identify vancomycin-resistant enterococci (VRE) has gained increased importance during hospital outbreaks. In the present study, we implemented a laboratory protocol to speed up the VRE screening from rectal samples. The protocol combines a medium for selective VRE isolation (VREBAC®, Probac, São Paulo) and a multiplex PCR for detection and identification of vanA and vanB resistance genes. The screening performance was analyzed in 114 specimens collected from four intensive care units. The swabs were collected at two periods: (1) during a VRE outbreak (February 2006, n=83 patients) and (2) at the post-outbreak period, after adoption of infection control measures (June 2006, n=31 patients). Forty-one/83 VRE (49.4%) and 3/31(9.7%) VRE were found at the first and second period, respectively. All isolates harbored the vanA gene. In both periods, detection of the gene vanA parallels to the minimum inhibitory concentration values of >256 µg/mL and >48 µg/mL for vancomycin and teicoplanin, respectively. Multiplex PCR and conventional methods agreed in 90.2% for enterococci identification. Besides this accuracy, we also found a remarkable reduction in time to obtain results. Detection of enterococcal species and identification of vancomycin resistance genes were ready in 29.5 hours, in comparison to 72 hours needed by the conventional methods. In conclusion, our protocol identified properly and rapidly enterococci species and vancomycin-resistance genes. The results strongly encourage its adoption by microbiology laboratories for VRE screenning in rectal samples

Síntese telescópica de 2-amino-selenazóis mediada pelo ácido tribromoisocianúrico e síntese de fenil-selenoureia

A abordagem telescópica em síntese orgânica se destaca por minimizar a produção de rejeitos químicos, reduzir custos operacionais e evitar o contato com intermediários tóxicos e/ ou instáveis. Os selenazóis constituem uma classe de compostos de grande interesse medicinal. Tradicionalmente, eles são preparados via condensação de selenoureias com compostos alfahalo-carbonilados (síntese de Hanztsch). Todavia, essa metodologia apresenta algumas desvantagens, como a utilização de reagentes tóxicos e de difícil acesso. Ademais, fontes de Br2 mais facilmente manipuláveis estão sendo investigadas. Nesse contexto, surge a opção de se utilizar o ácido tribromo-isocianúrico (TBCA) para realizar a halogenação, que é mais seguro e estável do que o halogênio em sua forma molecular. Já as selenoureias são usadas em síntese orgânica para produzir heterociclos seleniados. O substrato da reação pode ser comprado comercialmente, entretanto, possui um alto valor e pouca disponibilidade. Uma nova metodologia de síntese eficiente de selenoureia é de suma importância. Esse trabalho estuda a síntese telescópica de 2-amino-selenazóis mediada pelo TBCA, além deseja-se propor uma metodologia para a síntese de fenil-selenoureia. Os resultados demonstraram que o TBCA pode ser empregada na preparação de 2-amino-selenazóis. Além disso, os resultados indicam que a metodologia aplicada à síntese de 2-amino-selenazóis é válida e eficiente, passível de replicação. Destaca-se que o procedimento experimental é simples, e não há contato com os intermediários lacrimejantes. Vale ressaltar também a gama de resultados obtidos, onde foram sintetizados selenazóis a partir de selenoureias mono e di –substituídas, ressaltando a abrangência do método. Outrossim, o método pôde ser utilizado na síntese de 2-aminoselenazóis a partir não só de derivados de estireno, mas também de acetil-acetona. Além disso, pode-se também desenvolver uma rota sintética eficiente para a fenil-selenoureia, a qual não é encontrada comercialmente