Análisis de imágenes de resonancia magnética funcional del cerebro humano mediante procesos gaussianos

En este proyecto se estudia el uso de procesos gaussianos como una alternativa a los métodos basados en SPM para la generación de mapas de actividad cerebral a partir de secuencias de resonancia magnética funcional. Los tests que se han llevado a cabo consisten en la estimación de estímulos en experimentos monosujeto y multisujeto en fMRI. Las gráficas muestran que los valores de los mapas β producidos por el método GP son similares a las estimaciones del método SPM, que consisten en mapas de t de Student. A la vista de los resultados se puede afirmar que es posible establecer una metodología alternativa a las técnicas actuales de SPM obteniendo resultados competitivos. Las líneas sobre las que se basarían trabajos futuros consistirían en el estudio de modelos alternativos para el ruido, que pueden ser iguales a los usados en SPM. También se podrían establecer métodos de umbralización de los mapas basándose en la estimación de los intervalos de confianza de los resultados.Ingeniería Técnica en Sistemas de Telecomunicació

Kinematics of Herbig-Haro Objects and Jets in the Orion Nebula

We have surveyed the inner 5' of the Orion Nebula by means of Halpha and [NII] Fabry-Perot imaging spectroscopy to present a kinematical study of the Herbig-Haro objects in the nebula. The objects studied in this work are HH 202, 203, 204, 529, 269 and other associated features. For HH 202 we find new features that, because of their high velocities (up to 100 km/seg) indicate the presence of an outflow that probably is a HH flow not catalogued previously. HH 202 could be only a part of this larger outflow. Large internal motions are found in the fainter regions of HH 203-204, as well as evidence of transverse density gradients that could account for the asymmetry in the brightness distribution of HH 204. We report for the first time a high blueshifted velocity (-118 km/seg) associated with HH 204, and show that the apex of HH 204 is indeed the zone of maximum velocity, in agreement with bow shock models. We also studied the radial velocity field of HH 269 finding features associated with the HH object. From our studies, we find kinematic evidence that suggests that HH 203-204 and HH 202 are part of a big (aprox. 0.55 pc) bipolar HH outflow.Comment: 24 pages, 10 figures (in three jpg files). To be Published in Astronomical Journa

Diseño de un sistema de gestion integrado de medioambiente y calidad para la empresa Pinturas Iris S.A.

149 p.Este estudio contempla el diseño de un Sistema de Gestión Integrado de Calidad y Medioambiente para la empresa Pinturas Iris S.A. según las normas ISO 9001:2000 “Sistemas de Gestión de la Calidad” e ISO 14001:1996 “Sistemas de Gestión Medioambiental”. A partir de los datos entregados por la dirección general de la empresa, se realizó una identificación y un análisis de las características principales de la organización, para así, poder trabajar en el diseño y la elaboración del Sistema de Gestión Integrado de Calidad y Medioambiente. El desarrollo consistió en la creación de un Mapa de Procesos, el cual se realizó identificando los procesos existentes en la organización, posteriormente se seleccionaron aquellos más relevantes los cuales pasaron a conforman el Mapa de Procesos. Además se elaboro un Manual de Gestión Integrado, en él cual se describe cada uno de los procesos, su importancia y las responsabilidades del personal en cada uno de estos. Posteriormente, debido a la importancia en la empresa y los requisitos de las normas mencionadas anteriormente, se efectuaron cinco procedimientos, éstos fueron los siguientes: Control de la Documentación, Conocer Grado Satisfacción del Cliente, Comunicación Interna, Auditorias Internas y Evaluación e Identificación de los Aspectos Ambientales. Finalmente se realizó un análisis del trabajo efectuado en su totalidad y se observó, que el enfoque basado en los procesos de la organización, para la elaboración de los sistemas de gestión, es actualmente uno de los principios básicos y fundamentales para orientar a la empresa a la obtención de los resultados esperados. También se ha comprobado la posibilidad de integrar las dos normas mencionadas anteriormente y las ventajas del funcionamiento de estas en un Sistema de Gestión Integrado, las cuales pueden ser, simplificación de la documentación, optimización de los recursos, disminución de costos y beneficios socioeconómicos para la organizació

Revisión sistemática y clínica de la disartría flácida

La disartria flácida es un trastorno motor del habla caracterizado por anomalías en la articulación. Numerosos autores y especialistas se han centrado en la sintomatología general y el tratamiento farmacológico recibido por los pacientes estudiados, pero ninguno de estos estudios incluye el tratamiento logopédico en ninguno de dichos pacientes. Objetivo: Este estudio tiene como objetivo dar atención a la necesidad del tratamiento logopédico en pacientes con disartria, así como la necesidad de incluir al logopeda como profesional sanitario, para mejorar la articulación y el habla de los pacientes afectados de disartria flácida. Metodología: Análisis de veinte artículos científicos que tratan sobre los síntomas logopédicos y los diferentes tratamientos recibidos en estos pacientes, especialmente el tratamiento logopédico. Resultados: Los resultados obtenidos eran los esperados, puesto que en ninguno de los artículos analizados se remite a tratamiento logopédico ni se menciona al logopeda como profesional sanitario clave para tratar e intervenir en este tipo de trastornos motores. Todos los tratamientos recibidos por los pacientes eran farmacológicos, incluso quirúrgicos. Conclusiones: Concienciar a la gente sobre la importancia de los logopedas y de los tratamientos logopédicos en todos los tipos de trastornos que afecten al habla y al lenguaje.OtroGrado en Logopedi

Trayectorias de clase y consumo : Un intento de caracterización de los procesos de movilidad social intergeneracional en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires. 2012-2013

En esta ponencia se aborda el estudio de los procesos de estructuración de clase, desde una perspectiva que considera a la movilidad social como un elemento constitutivo de las relaciones sociales de clase. En este marco consideramos a la movilidad social como un proceso que pone en evidencia trayectorias de clase, en las cuales el origen social se imbrica con factores políticos, institucionales, culturales, económicos, etc. (Cachón Rodríguez, 1989; Filgueira; 2007; Echeverría Zabalza, 1999). Estas, a su vez, dan cuenta de procesos en los cuales estructura y agencia se relacionan para dar lugar a la formación de un espacio social, en el que priman mecanismos de competencia y distinción. En particular, se examina el modo en que dichas trayectorias se relacionan con aspectos vinculados al consumo y la riqueza, entendiendo a éstos como elementos que permiten comprender el sentido que adquiere la movilidad social en el contexto estudiado. Para cumplir con dichos objetivos se utilizaron datos provenientes tanto de entrevistas en profundidad como del relevamiento por encuesta, es decir que se parte de una estrategia metodológica de combinación de técnica

Development of a bioinformatics approach for the functional analysis of alternative splicing

[ES] Uno de los aspectos más apasionantes de la transcripción es la plasticidad transcriptómica y proteómica mediada por los procesos de regulación post-transcripcional (PTR). Los mecanismos PTR como el splicing alternativo (AS) y la poliadenilación alternativa (APA) han emergido como procesos estrechamente regulados que juegan un papel clave en la generación de la complejidad transcriptómica y están asociados con la coordinación de la diferenciación celular o el desarrollo de tejidos. Sin embargo nuestro conocimiento sobre cómo estos mecanismos regulan las propiedades de los productos resultantes para definir el fenotipo es aún muy reducido. La cantidad de variantes existentes y el amplio rango de posibles consecuencias funcionales, hacen su validación funcional una tarea impracticable si se realiza caso por caso. Además, la falta de herramientas para la evaluación funcional orientada a isoformas ha provocado que gran parte del trabajo computacional haya empleado pipelines ad-hoc aplicadas a sistemas biológicos específicos o simplemente hayan confiado en análisis de enriquecimiento GO, los cuales no son informativos del impacto en las propiedades de las isoformas que hay detrás de la regulación PTR. De hecho, a pesar de las más de sesenta mil publicaciones relativas al AS, muy pocas isoformas se han asociado con propiedades específicas, mientras que el número de nuevas variantes AS/APA con function desconocida crece exponencialmente debido a las técnicas de secuenciación de segunda generación (NGS). Además, y debido a limitaciones técnicas de las NGS para reconstruir la estructura de los transcritos, las tecnologías de secuenciación de tercera generación (TGS) están definiendo una nueva era en la que, por primera vez, es posible conocer la secuencia de elementos estructurales y funcionales en los mRNAs. En esta tesis se han abordado tres propósitos principales para poder avanzar en el estudio funcional de las isoformas. En primer lugar, con las TGS siendo cada vez más utilizadas, la evaluación de la calidad de los transcriptomas \textit{de novo} es esencial para asegurar la fiabilidad de la diversidad transcriptómica encontrada. La falta de análisis de calidad orientados a secuencias largas ha motivado el desarrollo de SQANTI, una pipeline automatizado para la exhaustiva evaluación de TGS transcriptomas. En segundo lugar, la información a nivel de gen de la mayoría de bases de datos funcionales sigue siendo el principal escollo para el estudio de la variabilidad entre isoformas, especialmente en el caso de las isoformas nuevas, en las que las bases de datos estáticas impiden su caracterización. Así, hemos diseñado IsoAnnot, que construye una base de datos de anotaciones funcionales con resolución a nivel de isoformas integrando información diseminada por múltiples bases de datos y métodos de predicción. Finalmente, la indisponibilidad de métodos para estudiar el impacto funcional de la regulación de isoformas, nos ha motivado a desarrollar tappAS, una herramienta dinámica, flexible y diseñada para facilitar el abordaje de este tipo de estudios. Por lo tanto, durante esta tesis hemos desarrollado una infraestructura que resuelve los retos principales del análisis funcional de isoformas, proporcionando un conjunto de nuevos métodos y herramientas que ofrecen una oportunidad única para explorar cómo el fenotipo se especifica post-transcripcionalmente, mediante la alteración de las propiedades funcionales de las isoformas expresadas. La aplicación de nuestro análisis a un doble sistema de diferenciación neuronal en ratón definió el efecto de la regulación de isoformas entre la diferenciación de motoneuronas y oligodendrocitos para múltiples elementos funcionales. Entre ellos, hemos descubierto regiones transmembrana que son diferencialmente incluidas en las isoformas expresadas entre ambos tipos celulares y cuya regulación podría estar contribuyendo al control de[CA] Un dels aspectes més emocionants de la biologia del transcriptoma és l'adaptabilitat contextual de transcriptomes i proteomes eucariotes mitjançant la regulació post-transcripcional (PTR). Els mecanismes PTR, com el splicing alternatiu (AS) i la poliadenilació alternativa (APA), s'han convertit en processos molt regulats que juguen un paper clau en la generació de la complexitat del transcriptoma i en la coordinació de la diferenciació cel·lular o del desenvolupament de teixits. No obstant això, el nostre coneixement de com aquests mecanismes imprimeixen característiques funcionals diferents al conjunt resultant d'isoformes per definir el fenotip observat és encara escàs. El nombre de variants de PTR i les seues conseqüències potencialment funcionals fa que la validació funcional sigui una tasca poc pràctica si es fa cas per cas. A més, la manca d'enfocaments funcionals orientats a isoformes ha fet que gran part del treballs computacionals per esbrinar qüestions funcionals a nivell de transcriptoma siguen estratègies computacionals ad hoc aplicades a sistemes biològics específics o bé basats en un simple anàlisi d'enriquiment GO, que no aporten informació sobre l'impacte de la PTR sobre les propietats de les isoformes. Així, malgrat les més de 60.000 publicacions existents sobre AS, poques de les isoformes existents s'han associat a propietats específiques, mentre que el nombre de noves variants AS/APA amb funcions desconegudes i fins i tot inexplorades augmenta de manera exponencial gràcies a la seqüenciació de nova generació (NGS). A causa de les limitacions tècniques del NGS per reconstruir l'estructura dels transcrits, la seqüenciació d'alt rendiment de transcrits de longitud completa mitjançant tecnologies de tercera generació (TGS) obre una nova era en la transcriptòmica, ja que millora la definició dels models genètics i, per primera vegada, permet associar amb precisió esdeveniments funcionals dins de la molècula d'ARN. Aquesta tesi aborda tres grans reptes per a progressar en l'estudi de la funció de les isoformes. En primer lloc, amb l'aparició i la popularitat creixent del TGS, la definició precisa i la caracterització completa dels transcriptomes de novo són essencials per garantir la qualitat de qualsevol conclusió sobre la diversitat del transcriptoma. La manca d'anàlisis de qualitat orientats a lectures llargues va motivar el desenvolupament de SQANTI (https://bitbucket.org/ ConesaLab / sqanti), una estratègia computacional automatitzada per a la caracterització estructural i l'avaluació de la qualitat dels transcriptomes de longitud completa. En segon lloc, els recursos funcionals existents centrats en el gen suposen una gran limitació per a l'estudi extensiu de la variabilitat funcional de les isoformes, especialment en les noves isoformes, que no es poden caracteritzar per bases de dades estàtiques. Per tant, vam dissenyar IsoAnnot, que construeix dinàmicament una base de dades amb anotacions funcionals a nivell d'isoforma, que utilitza com a informació d'entrada les seqüències dels transcrits i integra informació de diverses bases de dades i mètodes de predicció. Finalment, com no hi havia cap mètode per interrogar l'impacte funcional del PTR, vam desenvolupar nous enfocaments i eines fàcils d'utilitzar, com ara tappAS (http://tappas.org/), dissenyada per facilitar als investigadors els estudis funcionals de transcriptoma complet i de regulació d'isoformes en contexts específics. Per tant, aquesta tesi descriu el desenvolupament d'un marc d'anàlisi que aborda els reptes fonamentals de l'anàlisi funcional d'isoformes. Aplicada a un sistema de diferenciació neuronal murina, vam descobrir regions transmembrana específiques d'isoformes, la modulació de les quals per PTR podria contribuir a controlar la dinàmica mitocondrial específica del tipus cel·lular durant la determinació del destí neuronal.[EN] One of the most exciting aspects of transcriptome biology is the contextual adaptability of eukaryotic transcriptomes and proteomes by post-transcriptional regulation (PTR). PTR mechanisms such as alternative splicing (AS) and alternative polyadenylation (APA) have emerged as tightly regulated processes playing a key role in generating transcriptome complexity and coordinating cell differentiation or tissue development. However, how these mechanisms imprint distinct functional characteristics on the resulting set of isoforms to define the observed phenotype remains poorly understood. The number of PTR variants and their resulting range of potentially functional consequences makes their functional validation an impractical task if done on a case-by-case basis. Besides, the lack of isoform-oriented functional profiling approaches has made that much of the computational work done to elucidate transcriptome-wide functional questions has either involved ad hoc computational pipelines applied to specific biological systems or has relied on simple GO-enrichment analysis that are not informative about the PTR impact on isoform properties. Thus, even though more than 60,000 publications on AS, a few number of existing isoforms have been associated with specific properties while the number of novel AS/APA variants with unknown and even unexplored functions is exponentially increasing thanks to the use of next-generation sequencing (NGS). Due to the technical limitations of NGS to reconstruct the transcript structure, high-throughput sequencing of full-length transcripts using third-generation technologies (TGS) is opening up a new transcriptomics era that enhances the definition of gene models and, for the first time, enables to precisely associate functional events within the RNA molecule. This thesis addresses three major challenges to the progression of the study of isoform function. First, with the emergence and increasing popularity of TGS, the accurate definition and comprehensive characterisation of de novo transcriptomes is essential to ensure the quality of any conclusions on transcriptome diversity drawn from these data. The lack of long-read oriented quality aware analysis motivated the development of SQANTI \url{(https://bitbucket.org/ConesaLab/sqanti)}, an automated pipeline for the structural characterization and quality assessment of full-length transcriptomes. Secondly, the gene-centric nature of functional resources remained the major limitation to the extended study of functional isoform variability, especially for novel isoforms, which cannot be characterised by static databases. Thus, we designed IsoAnnot, which dynamically constructs an isoform-resolved rich database of functional annotations by using as input transcript sequences and integrating information disseminated across several databases and prediction methods. Finally, because no methods to interrogate the functional impact of PTR were available, we developed novel approaches and user-friendly tools such as tappAS \url{(http://tappas.org/)}, designed to facilitate researchers the transcriptome-wide functional study of context-specific isoform regulation. Thereby, this thesis describes the development of an analysis framework that tackles the fundamental challenges of the isoform functional analysis by providing a set of novel methods and tools that offer an unique opportunity to explore how the phenotype is specified by altering the functional characteristics of expressed isoforms. Applied to a murine neural differentiation system, our pipeline profiled the effect of isoform regulation on the inclusion of several functional elements within transcripts between motor-neuron and oligodendrocyte differentiation systems and specifically, we discovered isoform-specific transmembrane regions whose modulation by PTR might contribute to control cell type-specific mitochondrial dynamics during neural fate determination.This work was funded by the following grants: From 2014 to 2018. FPU: Training programme for Academic Staff. Spanish Ministry of Education, FPU2013/02348. From 2016 to 2019. NOVELSEQ: Novel methods for new challenges in the analysis of high-throughput sequencing data. MINECO, BIO2015-1658-R. From 2014 to 2017. DEANN: Developing a European American NGS Network. EU Marie Curie IRSES, GA-612583.Fuente Lorente, LDL. (2019). Development of a bioinformatics approach for the functional analysis of alternative splicing [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/124974TESI

Discurso pronunciado en el 30° Aniversario de la Fundación de la Escuela de Enfermeras Carlos Van Buren

Discurso pronunciado por Primer Director de la Escuela de Enfermeras “Carlos Van Buren” de Valparaís

Recuerdos, encantos y alegrías de los pasados días de la Escuela de Enfermería “Carlos Van Buren”

Siguiendo con la revisión de artículos históricos y, en el afán de contribuir a uno de los propósitos de esta revista que apunta a rescatar la herencia de la profesión enfermera, me encontré con este escrito que fue publicado en la otrora revista de la Escuela de Enfermeras Carlos Van Buren, con ocasión de la muerte del Dr. Rudecindo de la Fuente, acaecida el 28 de abril de 1967, como homenaje a quien fuera el primer director de la Escuela de Enfermeras