Reflexión de un colega que vuelve a casa

RESUMEN: Son pocas las oportunidades que da la vida para mirar la cotidianidad desde dos perspectivas culturales diferentes. Ver a Colombia desde adentro, luego desde afuera, y después volver para mirarla una vez más desde adentro, otorga una perspectiva privilegiada. Como este punto de vista es pasajero, antes de verme reabsorbido completamente por mi propia cultura, me atrevo a escribir estas líneas, que más allá de pretender cuestionar el presente incierto en el cual vivimos, plantean un plan de vuelo hacia el futuro, también incierto, pero siempre prolífico en novedades y generador por excelencia de promisorias expectativas

La Medicina Veterinaria en el contexto del municipio colombiano: conversaciones con la ruralidad desde la práctica académica profesionalizante de pregrado Administración en Salud Animal de la Universidad de Antioquia (2005-2015)

La sistematización es un proceso investigativo, reflexivo, crítico y propositivo, mediante el cual se pretende estudiar, comprender, criticar, cuestionar y aprender de las prácticas. Este estudio pretendió sistematizar la experiencia de la práctica académica profesionalizante de pregrado Administración en Salud Animal (ASA) de la Universidad de Antioquia (UdeA), la cual se desarrolla en municipios antioqueños. La ruta metodológica comprendió tres etapas: la construcción histórica de la práctica desde la memoria colectiva, el análisis crítico de la práctica y aprender desde la práctica para mejorarla. Se utilizaron los dispositivos de flujo del proceso, la entrevista semiestructurada, la conversación, el relato, la entrevista de salida a los expracticantes, el taller, la revisión e interpretación de documentos y el diario de campo. En total se visitaron 17 municipios y se entrevistaron 74 personas. Dentro de los resultados están la construcción del marco contextual de ASA, el listado y ubicación de municipios con presencia histórica de ASA, la construcción de la línea de tiempo con red de actores y sucesos, la construcción y análisis del discurso ordenador, la identificación de las fortalezas, las limitaciones y carencias de la práctica en los ámbitos universitario y municipal y las contribuciones para trascender las carencias y fortalecer la práctica. La práctica de ASA representa la materialización del potencial de la Universidad para propiciar el diálogo entre la Universidad y la sociedad por medio del apoyo a la función de los municipios en salud animal y salud pública, aunque requiere profundas intervenciones para explotar al máximo su potencial transformador y formativo

Factores asociados con el estatus serológico de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis en vacas lecheras del norte de Antioquia, Colombia

ABSTRACT: Johne´s disease (JD) is a severe enteritis that affects ruminants and has been diagnosed in cattle and sheep in Colombia. However, epidemiological information on the disease in this country is scarce. Objective: to identify factors associated with the JD serum enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) status of dairy cows. Methods: a cross-sectional study was carried out in 307 asymptomatic adult Holstein dairy cows from 14 herds in nine districts of Belmira and San Pedro de los Milagros municipalities during November, 2007. From 19 to 25 cows, ≥ 2 years of age were randomly selected and blood sampled from every herd. A commercial ELISA kit was used to analyze sera. Information regarding cow related factors (age, farm-born, parity, and daily milk yield) and herd management practices (i.e. herd size, herd average milk production, current presence of symptomatic animals, cattle purchase, own animals grazing in foreign pastures, feeding of calves before weaning, manure spread on pastures, and sighting of birds in feed storing areas) was collected using questionnaires. Descriptive statistics were computed for all variables and a multivariable logistic regression model was constructed (p 1 parity. The OR was 0.74 times lower (OR = 0.26; 95% CI: 0.096-0.70; p<0.01) in herds feeding calves with pooled colostrum from several cows, compared to herds feeding calves with colostrum from their own dams. Conclusion: JD seroprevalence was 10 and 70% at animal and herd-level, respectively. Cow and herd factors “parity” and “feeding of calves before weaning” showed weak and strong association with positive results, respectively.RESUMEN: la enfermedad de Johne (EJ) es una enteritis severa que afecta rumiantes y ha sido diagnosticada en bovinos y ovejas en Colombia. Sin embargo, la información epidemiológica de la enfermedad en el país es escasa. Objetivo: identificar los factores asociados con el estatus serológico de la EJ mediante ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA) en vacas lecheras. Métodos: se realizó un estudio transversal en 307 vacas lecheras adultas asintomáticas de 14 hatos en 9 veredas en los municipios de Belmira y San Pedro de los Milagros, en noviembre de 2007. De cada hato se seleccionaron aleatoriamente 19-29 vacas mayores de 2 años de edad y se tomaron muestras de sangre. Se utilizó un kit comercial de ELISA para analizar el suero. Se recolectó información mediante cuestionarios sobre características individuales de las vacas y prácticas de manejo de los hatos. Se realizó un estudio estadístico descriptivo para todas las variables de interés y se construyó un modelo de regresión logística multivariada, considerando un nivel de significancia de p<0,05. Resultados: el 10% de los animales fue positivo a ELISA (31/307; 95% CI: 7-14%). En el 70% (10/14) de los hatos, al menos un animal fue detectado como positivo por ELISA. Los factores a nivel individual y a nivel hato “número de partos” y “tipo de alimentación de terneras antes del destete” mostraron una asociación débil y fuerte con los resultados positivos de ELISA, respectivamente. El odds ratio (OR) para la seropositividad a EJ aumentó en un 20% (OR = 1,20; 95% CI: 0,98-1,47; p = 0,067) en vacas con más de un parto, mientras que fue 0,74 veces menor (OR = 0,26; 95% CI: 0,096-0,70; p<0,01) en hatos que alimentan sus terneras con mezcla de calostro proveniente de varias vacas, en comparación con aquellos hatos que solo utilizan el calostro de la propia madre. Conclusión: la seroprevalencia de EJ fue del 10 y del 70% a nivel individual y a nivel hato, respectivamente. Los factores a nivel individual y a nivel hato “número de partos” y “tipo de alimentación de terneras antes del destete” mostraron una asociación débil y fuerte con los resultados positivos de ELISA, respectivamente

Presencia de Enterobacteriaceae productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en tanques de leche de fincas lecheras de Antioquia, Colombia

ABSTRACT: antibiotic resistance is spreading worldwide. It is important to evaluate whether foods of animal origin constitute a reservoir of resistance genes. Objective: to assess the occurrence and characterize extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae from bulk-tank milk samples of dairy farms located in Entrerríos, Antioquia (Colombia). Methods: a total of 120 randomly selected raw milk samples (one bulk-tank milk sample per dairy farm) were collected between September and October, 2013. A commercial chromogenic agar was used for screening presumptive ESBL-E. Identification of genus and species of isolates was performed with a commercial biochemical identification kit. The ESBL production was confirmed using the double disc synergy test. An antimicrobial susceptibility test was performed by the agar disc diffusion method and the automatized broth microdilution method. The ESBL-positive isolates were analyzed for the presence of bla genes by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. For the exploration of risk factors, information on dairy farm management practices wasrecorded using a questionnaire and the associations of predictors and results were tested with a logistic regression analysis. Results: the ESBL-E were isolated from 3.3% (4/120; CI 95%: 3-3.5%) of the samples. Farm size was the only factor associated with the presence of ESBL-E (OR = 11.5; CI 95%: 1.14-115.54; p = 0.038). All isolates were resistant to several antibiotics and harbored blaCTX-M-96 (alternate name CTX-M-12a) enzymes. Conclusion: although apparent frequency of ESBL-E waslow, the presence of these resistant bacteria in milk may constitute a public health risk and should be further investigated.RESUMEN: la resistencia a antibioticos se está diseminando en el mundo. Es importante evaluar si los alimentos de origen animal constituyen un reservorio de genes de resistencia. Objetivo: evaluar la presentación y caracterizar las Enterobacteriaceae productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) a partir de muestras de leche de tanque de hatos lecheros localizados en Entrerríos, Antioquia (Colombia). Métodos: ciento veinte muestras de leche cruda (una muestra por tanque) de hatos seleccionados al azar fueron colectadas entre septiembre y octubre de 2013. Para el tamizaje de presuntiva BLEE se utilizó un agar cromogénico comercial. La identificación de los aislamientos se realizó utilizando un kit de identificación bioquímica comercial. La confirmación de la producción de BLEE fue confirmada con la prueba de sinergia de doble disco. La susceptibilidad antimicrobiana fue evaluada por el método de difusión de disco en agar y por el método de microdilución en caldo automatizado. Aislamientos positivos para BLEE fueron analizados para presencia de genes bla por PCR y secuenciación. Para la exploración de los factores de riesgo se registró la información sobre las prácticas de manejo del hato mediante cuestionario y se probó la asociación entre predictores y resultados mediante análisis de regresión logística. Resultados: las BLEE fueron aisladas de 3,3% (4/120; IC 95%: 3-3,5%) de las muestras de leche de tanque y el tamaño del hato fue el único factor que se encontró asociado con un incremento en su presencia (OR = 11,5; IC 95%: 1,14-115,54; p = 0.038). Todos los aislamientos fueron resistentes a varios antibióticos y albergaban enzimas blaCTX-M-96 (nombre alternativo CTX-M-12a). Conclusión: aunque se observó una baja frecuencia aparente de BLEE, la presencia de estas bacterias resistentes en los alimentos de origen animal puede constituir un riesgo para la salud publica y debe seguir siendo investigada

Cultivo fecal y dos metodos de PCR en materia fecal para el diagnostico de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis en un hato seropositivo

ABSTRACT: paratuberculosis is a slow-developing infectious disease, characterized by chronic granulomatous enterocolitis. This disease has a variable incubation period from 6 months to over 15 years, and is caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Its detection by direct and indirect diagnostic techniques has been of special interest. Objective: to report the diagnosis and detection of MAP using several diagnostic testsin a herd of the Northern region ofAntioquia, Colombia. Methods:serum samples from the study herd were analyzed, using a commercial ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) kit. Fecalsamples were cultured by duplicate using Herrold ́s egg yolk medium (HEYM), and analyzed by an end- point IS900-specific nested PCR protocol, and a commercial F57-real-time PCR kit. Results: eight out of 27 serum samples in the study herd resulted ELISA-positive. None of fecal samples resulted positive to HEYM culture by duplicate and none were found to be positive by F57-real-time PCR. Were found to be positive by end-point IS900-specific nested PCR.Agreement was found between ELISA and end-point IS900-specific nested PCR in one of the animals. Conclusion: the present study gives information about the agreement between direct and indirect MAP-detection techniques, using different matrixes from animals under the same husbandry conditions.RESUMEN: la paratuberculosis es una enfermedad infecciosa de desarrollo lento, caracterizada por una enterocolitis granulomatosa crónica. Esta enfermedad tiene un periodo de incubación que varía entre los 6 meses hasta por más de 15 años, y es causada por Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Su detección por técnicas diagnósticas directas e indirectas ha sido de interés especial. Objetivo: reportar el diagnóstico y detección de MAP utilizando varias técnicas diagnósticas en un hato de la región norte de Antioquia, Colombia. Métodos: se analizaron las muestras de suero del hato de estudio utilizando un kit comercial de ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay). Las muestras de materia fecal fueron cultivadas por duplicado en Herrold´s egg yolk medium (HEYM), y analizadas mediante un protocolo de PCR anidado específico de IS900 y un kit comercial de PCR en tiempo real para F57. Resultados: ocho de las 27 muestras de suero resultaron positivas por ELISA. Ninguna de las muestras de materia fecal resultó positiva al cultivo en HEYM por duplicado ni por PCR en tiempo real para F57. Siete de las 27 muestras de materia fecal resultaron positivas a PCR anidado específico de IS900. Se encontró concordancia entre el resultado de ELISA y de PCR anidado específico de IS900 en uno de los animales. Conclusión: el presente estudio brinda información acerca de la concordancia entre técnicas directas e indirectas de detección de MAP, utilizando diferentes matrices a partir de animales bajo las mismas condiciones de manej

Variables associated PSE (Pale, Soft, Exudative) to meat in porcine carcasses

ABSTRACT: The presence of the PSE (pale, soft and exudative exudative) condition in porcine carcass causes high economic losses to the meat industry. The PSE appearance depends on many variables, some of which are intrinsic of the animal, and others are related to transportation conditions to the slaughterhouse. The aim of the present study was to determine if there is or not an association between some of the above mentioned variables and the PSE condition. The studied variables were: genetic, sex, food, weight, time of fasting, time of transportation, density, temperature and humidity during transportation, type of truck, resting time, dorsal fat, carcass efficiency and carcass weight losses. Carcasses of commercial genetic pigs (n = 474) were tested and semimembranous muscle pH was done at 45 minutes (pH45 ) and then at 24 h post-sacrifice, using IQ 200 Scientific Instruments®, with an ISFET® type probe. Test of principal components of GLM with contrast test of Tukey with 95% of significance, and univariate and divariate frequencies distribution was applied. The results demonstrate that there was highly significant association (p < 0.01) between pH45 and variables as density, food, type of truck, genetic and the resting time. The sex and the time of transportation also had significant association (p < 0.05), but only with pH45. Additionally, differences between genetic, sex (highest values of pH45 to males) and food (p < 0.05) were found. Also, there were interactions between: sex - fasting, sex - food, sex - resting and sex - transportation (p < 0.05). According to the results, PSE condition is not a unicausal phenomenon and consequently it needs an integral managment.RESUMEN: La presencia de la condición PSE (pálida, suave, exudativa) en canales porcinas causa altas pérdidas económicas a la industria cárnica y según estudios presenta asociación con muchas variables. Para analizarlas se muestrearon 474 canales de cerdos comerciales y se les midió el pH (pHmetro IQ 200 Scientific Instruments®, con sonda de silicio tipo ISFET®) a 45 minutos (pH45) y a 24 horas post-sacrificio en el músculo semimembranoso. Las variables analizadas fueron genética, sexo, alimento, tiempo de ayuno, peso vivo; duración del transporte, densidad, temperatura y humedad relativa durante el transporte; tipo de camión, tiempo de reposo, grasa dorsal, rendimiento en canal y mermas. En el análisis estadístico se aplicó la técnica de componentes principales, GLM con prueba de contraste de Tukey con un 95% de significancia, y distribución de frecuencias univariada y bivariada. Los resultados demuestran que hubo asociación altamente significativa (p < 0.01) entre el pH45 y la densidad, alimento, camión, genética y reposo; el sexo y el tiempo de transporte tuvieron asociación significativa (p < 0.05). Se encontró diferencia entre los tipos de genética, entre los sexos y entre los tipos de alimento (p < 0.05). Se presentaron las interacciones sexo-ayuno, sexo-alimento, sexo-reposo y sexo-transporte (p < 0.05). Esto indica que la condición PSE no es unicausal y como tal debe ser manejada

Seroprevalencia de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis en pequeños rumiantes de un aprisco de Antioquia, Colombia

1 recurso en línea (páginas 49-58).La paratuberculosis es una enfermedad infecciosa crónica causada por Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). El objetivo de este estudio fue determinar la seroprevalencia de MAP y la asociación existente entre el estatus serológico a MAP y factores individuales en cabras y ovejas de un aprisco en Antioquia, Colombia. Se estudiaron 53 caprinos y 6 ovinos mayores a dos años de edad, de los cuales se tomó información sobre factores individuales y una muestra de sangre para obtener suero sanguíneo. La presencia de anticuerpos contra MAP se determinó por medio de una prueba de ELISA, mientras que la información se analizó descriptivamente. La prueba de ELISA no detectó ningún animal positivo o sospechoso entre los 59 analizados, por lo que no se pudo establecer asociación entre el estatus serológico a MAP y factores individuales. Este es el primer estudio que reporta la búsqueda de anticuerpos contra MAP en una población caprina, y el cuarto en una población ovina en Colombia. Diversos factores pueden explicar el estatus serológico de los animales muestreados. Es necesario continuar con estudios similares en otros apriscos de la región y del país para determinar el estatus real de la infección en pequeños rumiantes en Colombia.Paratuberculosis is a chronic infectious disease caused by Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP). This study aimed at determining the presence of antibodies against MAP, and the association between the serological status of MAP and individual factors in goats and sheep in a flock in Antioquia, Colombia. We studied fifty-three goats and 6 sheep over two years old, and took blood samples to obtain serum and information on individual factors. The presence of antibodies against MAP was determined by ELISA, whereas the information was descriptively analyzed. ELISA did not detect any positive or suspect animal among the 59 tested animals, so an association between serological status to MAP and individual factors could not be established. This is the first and the fourth study reporting the search for antibodies against MAP in a goat and in a sheep population in Colombia, respectively. Several factors may explain the serological status of the sampled animals. It is necessary to continue with similar studies in other flocks of the region and the country to determine the current MAP infection status in small ruminants in Colombia.Bibliografía y webgrafía: páginas 56-58

Seroprevalence of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis in small ruminants in a flock in Antioquia, Colombia

Paratuberculosis is a chronic infectious disease caused by Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP). This study aimed at determining the presence of antibodies against MAP, and the association between the serological status of MAP and individual factors in goats and sheep in a flock in Antioquia, Colombia. We studied fifty-three goats and 6 sheep over two years old, and took blood samples to obtain serum and information on individual factors. The presence of antibodies against MAP was determined by ELISA, whereas the information was descriptively analyzed. ELISA did not detect any positive or suspect animal among the 59 tested animals, so an association between serological status to MAP and individual factors could not be established. This is the first and the fourth study reporting the search for antibodies against MAP in a goat and in a sheep population in Colombia, respectively. Several factors may explain the serological status of the sampled animals. It is necessary to continue with similar studies in other flocks of the region and the country to determine the current MAP infection status in small ruminants in Colombia

Characterization of decontamination procedure of beef carcasses at slaughterhouses in the province of Antioquia, Colombia

BACKGROUND: Beef slaughterhouses must use a carcass decontamination procedure to control pathogens and thus prevent foodborne diseases transmitted by meat. OBJECTIVES: This study aimed to characterize beef carcass decontamination procedures at slaughterhouses located in the province of Antioquia (Colombia). All the slaughterhouses were open, registered, and approved by Invima (Instituto Nacional de Vigilancia de Medicamentos y Alimentos in Spanish) at the time of the study. METHODS: This descriptive study collected information from 23 beef slaughterhouses between July 2019 and April 2021 through documentary reviews and visits to slaughterhouses, using forms and questionnaires. RESULTS: The study allowed the characterization of the procedures used to decontaminate beef carcasses, showing that the chemical disinfection of the carcasses is used to control microorganisms in at least 73.9% of the slaughterhouses analyzed. According to secondary sources, it was found that most of the slaughterhouses are small (slaughter volume <50,000 heads per year); 10 of them use citric acid, lactic acid, peracetic acid, and a mixture of organic acids in concentrations between 900 and 1,200 ppm, 1.5 and 1.7%, 180 and 190 ppm, and 900 and 1,200 ppm, respectively, as carcass disinfectants and according to the technical data sheet of the product. During the visits and through the application of the questionnaire, it was found that the 12 slaughterhouses had implemented chemical disinfection which is not scientifically based, using manual devices as an intervention method to control pathogenic microorganisms. It was found that the type of company, slaughter volume, and the lack of financial resources are the determining factors in the selection of decontamination procedures. The validation of the beef carcass decontamination procedures in the different slaughterhouses in the study was demonstrated. CONCLUSIONS:Although it was established that at least one decontamination procedure, such as chemical disinfection, is used in the slaughterhouses of study, this option is not supported by scientific or technical evidence. The findings support the need for improvements in the slaughterhouses of the province of Antioquia, including the improvement of surveillance programs to reduce pathogens in the meat chain effectively

Diversidad genómica en SARS-CoV-2: Mutaciones y variantes

Background: The genetic variability of SARS-CoV-2 has increased notably since the pandemic was declared, which has allowed it to represent a continuous challenge for health policies aimed at its control. Objective. Describe the genomic nomenclature used for general and scientific communication about SARS-CoV-2, as well as describe the mutations, evolution, origin and variants of the virus. Material and Methods. A narrative literature review was carried out, for which a search and analysis of the information was carried out until December 15, 2021. 74 sources selected from the MEDLINE / PubMed, SciELO, LILACS databases and official web pages were reviewed; no language restrictions. Results. Mutations are changes in the nucleotide sequence of the viral genome, which, by affecting the epidemiological dynamics in a population, give rise to variants, and these in turn to differentiated clades. Among the variants of interest, Lambda and Mu stand out, identified for the first time in Peru and Colombia, respectively. While, the variants of concern, in chronological order, are Alpha (British), Beta (South African), Gamma (Brazilian), Delta (Indian) and recently Ómicron. Conclusions. It is concluded that the genomic diversity of SARS-CoV-2 is due to its high rate of mutations that can constitute variants and clades. A better understanding of this diversity allows more effective control measures to be taken, guiding the development and use of vaccines, therapies, diagnostics and health policies.Introducción: La variabilidad genética del SARS-CoV-2 ha incrementado notablemente desde que se declaró la pandemia, lo que le ha permitido representar un continuo desafió para las políticas de salud destinadas a su control. Objetivo. Describir la nomenclatura genómica utilizada para la comunicación general y científica sobre el SARS-CoV-2, así como describir las mutaciones, evolución, origen y variantes del virus. Material y Metodos. Se realizó una revisión narrativa de literatura, para el cual se realizó una búsqueda y análisis de la información hasta el 15 de diciembre de 2021. Se revisaron 74 fuentes seleccionados desde las bases de datos MEDLINE/ PubMed, SciELO, LILACS y páginas web oficiales; sin restricciones de idioma. Resultados. Las mutaciones son cambios en la secuencia de nucleótidos del genoma viral, que, al producir afectación de la dinámica epidemiológica en una población, dan lugar a variantes, y estos a su vez a clados diferenciados. Entre las variantes de interés destacan Lambda y Mu, identificadas por primera vez en Perú y Colombia, respectivamente. Mientras que, las variantes de preocupación, en orden cronológico, son la Alfa (británica), Beta (sudafricana), Gamma (brasilera), Delta (india) y recientemente Ómicron. Conclusiones. Se concluye que la diversidad genómica del SARS-CoV-2 se debe a su elevada tasa de mutaciones que pueden constituirse en variantes y clados. La mejor comprensión de esta diversidad permite tomar medidas de control más eficaces, guiando el desarrollo y uso de vacunas, terapias, diagnóstico y políticas en salud