Method for orthorectification of terrestrial radar maps

International audienceThe vehicle-based PELICAN radar system is used in the context of mobile mapping. The R-SLAM algorithm allows simultaneous retrieval of the vehicle trajectory and of the map of the environment. As the purpose of PELICAN is to provide a means for gathering spatial information, the impact of distortion caused by the topography is not negligible. This article proposes an orthorectification process to correct panoramic radar images and the consequent R-SLAM trajectory and radar map. The a priori knowledge of the area topography is provided by a digital elevation model. By applying the method to the data obtained from a path with large variations in altitude it is shown that the corrected panoramic radar images are contracted by the orthorectification process. The efficiency of the orthorectification process is assessed firstly by comparing R-SLAM trajectories to a GPS trajectory and secondly by comparing the position of Ground Control Points on the radar map with their GPS position. The RMS positioning error moves from 5.56 m for the raw radar map to 0.75 m for the orthorectified radar map

Relevance of Lipid-Based Products in the Management of Dry Eye Disease

Components of the ocular surface synergistically contribute to maintaining and protecting a smooth refractive layer to facilitate the optimal transmission of light. At the air-water interface, the tear film lipid layer (TFLL), a mixture of lipids and proteins, plays a key role in tear surface tension and is important for the physiological hydration of the ocular surface and for ocular homeostasis. Alterations in tear fluid rheology, differences in lipid composition, or downregulation of specific tear proteins are found in most types of ocular surface disease, including dry eye disease (DED). Artificial tears have long been a first line of treatment in DED and aim to replace or supplement tears. More recently, lipid-containing eye drops have been developed to more closely mimic the combination of aqueous and lipid layers of the TFLL. Over the last 2 decades, our understanding of the nature and importance of lipids in the tear film in health and disease has increased substantially. The aim of this article is to provide a brief overview of our current understanding of tear film properties and review the effectiveness of lipid-based products in the treatment of DED. Liposome lid sprays, emulsion eye drops, and other lipid-containing formulations are discussed.Peer reviewe

Chronic pneumonia with Pseudomonas aeruginosa and impaired alveolar fluid clearance

BACKGROUND: While the functional consequences of acute pulmonary infections are widely documented, few studies focused on chronic pneumonia. We evaluated the consequences of chronic Pseudomonas lung infection on alveolar function. METHODS: P. aeruginosa, included in agar beads, was instilled intratracheally in Sprague Dawley rats. Analysis was performed from day 2 to 21, a control group received only sterile agar beads. Alveolar-capillary barrier permeability, lung liquid clearance (LLC) and distal alveolar fluid clearance (DAFC) were measured using a vascular ((131)I-Albumin) and an alveolar tracer ((125)I-Albumin). RESULTS: The increase in permeability and LLC peaked on the second day, to return to baseline on the fifth. DAFC increased independently of TNF-α or endogenous catecholamine production. Despite the persistence of the pathogen within the alveoli, DAFC returned to baseline on the 5(th )day. Stimulation with terbutaline failed to increase DAFC. Eradication of the pathogen with ceftazidime did not restore DAFC response. CONCLUSIONS: From these results, we observe an adequate initial alveolar response to increased permeability with an increase of DAFC. However, DAFC increase does not persist after the 5(th )day and remains unresponsive to stimulation. This impairment of DAFC may partly explain the higher susceptibility of chronically infected patients to subsequent lung injury

AFLP linkage map of the Japanese quail Coturnix japonica

The quail is a valuable farm and laboratory animal. Yet molecular information about this species remains scarce. We present here the first genetic linkage map of the Japanese quail. This comprehensive map is based solely on amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. These markers were developed and genotyped in an F2 progeny from a cross between two lines of quail differing in stress reactivity. A total of 432 polymorphic AFLP markers were detected with 24 TaqI/EcoRI primer combinations. On average, 18 markers were produced per primer combination. Two hundred and fifty eight of the polymorphic markers were assigned to 39 autosomal linkage groups plus the ZW sex chromosome linkage groups. The linkage groups range from 2 to 28 markers and from 0.0 to 195.5 cM. The AFLP map covers a total length of 1516 cM, with an average genetic distance between two consecutive markers of 7.6 cM. This AFLP map can be enriched with other marker types, especially mapped chicken genes that will enable to link the maps of both species and make use of the powerful comparative mapping approach. This AFLP map of the Japanese quail already provides an efficient tool for quantitative trait loci (QTL) mapping

COVID-19 symptoms at hospital admission vary with age and sex: results from the ISARIC prospective multinational observational study

Background: The ISARIC prospective multinational observational study is the largest cohort of hospitalized patients with COVID-19. We present relationships of age, sex, and nationality to presenting symptoms. Methods: International, prospective observational study of 60 109 hospitalized symptomatic patients with laboratory-confirmed COVID-19 recruited from 43 countries between 30 January and 3 August 2020. Logistic regression was performed to evaluate relationships of age and sex to published COVID-19 case definitions and the most commonly reported symptoms. Results: ‘Typical’ symptoms of fever (69%), cough (68%) and shortness of breath (66%) were the most commonly reported. 92% of patients experienced at least one of these. Prevalence of typical symptoms was greatest in 30- to 60-year-olds (respectively 80, 79, 69%; at least one 95%). They were reported less frequently in children (≤ 18 years: 69, 48, 23; 85%), older adults (≥ 70 years: 61, 62, 65; 90%), and women (66, 66, 64; 90%; vs. men 71, 70, 67; 93%, each P < 0.001). The most common atypical presentations under 60 years of age were nausea and vomiting and abdominal pain, and over 60 years was confusion. Regression models showed significant differences in symptoms with sex, age and country. Interpretation: This international collaboration has allowed us to report reliable symptom data from the largest cohort of patients admitted to hospital with COVID-19. Adults over 60 and children admitted to hospital with COVID-19 are less likely to present with typical symptoms. Nausea and vomiting are common atypical presentations under 30 years. Confusion is a frequent atypical presentation of COVID-19 in adults over 60 years. Women are less likely to experience typical symptoms than men

Bone Morphogenetic Proteins (BMPs): nouveaux modulateurs de la synthèse et de la libération de l'hormone folliculo- stimulante (FSH)

Reproductive function requires the secretion of the gonadotropins, luteinizing hormone (LH) and follicle -stimulating hormone (FSH) synthesized by the gonadotrope cells. A tight control of the production of these hormones is crucial, particularly in females, to coordinate the terminal follicular growth, the follicle selection as well as the timing and the number of ovulation. Synthesis and release of both gonadotropins are controlled by hypothalamic gonadotropin releasing hormone (GnRH) and gonadal steroids (progesterone and oestradiol). Despite these common regulators, divergences in the circulating patterns of LH and FSH are often encountered. Such divergences have suggested that other factors are specifically implicated in the control of FSH production. Inhibins and activins, members of the Transforming Growth Factor -Beta (TGF -(3) superfamily, inhibit and stimulate respectively FSH synthesis and release. These gonadal factors are also produced in the pituitary where they act as paracrine factors. Other molecules of the TGF -13 superfamily, the Bone Morphogenetic Proteins (BMPs) have recently been involved for their action in reproduction at ovary level. Whether BMPs act at pituitary level and participate with other factors to regulate FSH production in females is not elucidated. In order to extend our knowledge of the differential regulation of FSH and LH synthesis, this question was addressed in this study and developed around three purposes:ped around three purposes: - Are BMPs and receptors expressed in pituitary? What are their effects on gonadotropin production? Does the natural mutation of BMPR -IB in ewes have an effect at pituitary level?- What are the mechanisms of BMPs action at intracellular level?- Is the mouse gonadotrope cell line LΒT₂ a good model to analyse BMP action on FSH production?Answering to these questions should help to better understand the mechanisms which control the fertility in females.Before presenting the results, some data concerning the gonadotropins and the differential control of their synthesis and release are developed followed by a focus on BMP effects on reproduction. The mechanisms of action of BMPs, as well as activin are also detailed

Les mycoses superficielles cutanéo-muqueuses (enquête à l'officine et propositions de conseils aux patients)

La progression de l'incidence des mycoses cutanéo-muqueuses superficielles nous ont incité à réaliser une enquête en officine, afin d'établir les caractéristiques des mycoses superficielles rencontrées et leur prise en charge. Les résultats de cette enquête se révèlent globalement conformes aux caractéristiques des mycoses décrites dans la littérature. Ces mycoses sont difficiles à diagnostiquer et à traiter. Un prélèvement n'est effectué que dans 25 % des cas et 50 % des mycoses sont récidivantes. Elles ont des répercussions psychiques, physiques, sociales ou professionnelles très gênantes. Le rôle du pharmacien est primordial dans l'optimisation de la prise en charge de ces mycoses. Il doit orienter les malades vers un médecin spécialiste si nécessaire, contrôler les prescriptions, expliquer précisément les traitements aux malades et leur conseiller plus systématiquement un traitement limitant les facteurs favorisants. La diffusion de brochures de conseils est un des moyens permettant de lutter contre les facteurs favorisants ces mycoses, d'améliorer leur prise en charge et de prévenir leurs récidives.GRENOBLE1-BU Médecine pharm. (385162101) / SudocSudocFranceF

Apport d'une technique de biologie moléculaire (ONYCHODIAGÒ, Bioadvance) dans le diagnostic biologique des onychomycoses

Les onychomycoses sont des pathologies fréquemment rencontrées en dermatologie, représentant jusqu'à 50% des onychopathies. Leur prévalence est en constante augmentation depuis quelques années. Les facteurs de risque en sont multiples. Dans la majorité des cas c'est un dermatophyte qui est identifié, mais des levures et des moisissures peuvent également être isolées en culture. Parmi les dermatophytes, T.rubrum représente à lui seul de 70% à plus de 90% des identifications selon les études. Mais malgré l'aspect souvent très évocateur de certaines altérations unguéales, le diagnostic d'une onychopathie d'origine fongique nécessite l'identification du champignon en cause, afin de pouvoir mettre en place un traitement adapté. L'examen direct et la mise en culture de l'échantillon sont les deux techniques classiquement employées, mais directement conditionnées par la qualité du prélèvement. La technique que nous avons étudiée (ONYCHODIAGÒ, Bioadvance) est basée sur l'amplification, par PCR, du domaine V4 du gène de la sous-unité ribosomale 18S. La révélation de la présence d'ADN dermatophytique dans l'échantillon est ensuite effectuée en format microplaque de type ELISA. Une lecture de densité optique permet ensuite de classer les échantillons en trois groupes : échantillon contenant de l'ADN de dermatophyte, échantillon situé dans une zone douteuse et échantillon ne contenant pas d'ADN de dermatophyte. Nous avons comparé les résultats obtenus par cette technique à ceux des techniques classiques. Parmi les 100 échantillons étudiés, 56 se sont révélés positifs en culture. Un dermatophyte a été identifié dans 75% des cas, T.rubrum représentant 64,3% des cultures positives (36 échantillons) et T.mentagrophytes variété interdigitale (6 échantillons). Le dermatophyte peut être retrouvé seul, associé à une levure ou, à une moisissure. OnychodiagÒ confirme la présence de dermatophyte pour 81% des cultures ayant permis leur isolement. Le résultat est discordant pour 8 cultures : 2 échantillons sont classés en zone grise et 6 échantillons sont rendus négatifs par la PCR alors qu'un dermatophyte avait été mis en évidence en culture. Des levures et des moisissures ont été isolées dans 14 échantillons, la présence d'ADN de dermatophyte par PCR est mise en évidence pour 3 d'entre eux. Enfin, pour 44 échantillons dont la culture est restée stérile, la PCR détecte la présence d'ADN de dermatophyte pour 15 d'entre eux, 13 ayant un examen direct positif. La spécificité de 91 % et la sensibilité de 81% pour cette technique PCR la rend donc plus sensible et spécifique que les techniques de diagnostic classique. Même si elle nécessite quelques matériels spécifiques de biologie moléculaire, elle reste accessible. Son avantage est de permettre un diagnostic rapide d'une onychomycose à dermatophyte, par la mise en évidence de l'ADN fongique directement à partir du prélèvement. Le résultat peut être obtenu en 48h, mais elle ne permet pas un diagnostic d'espèce. Elle semble donc peu adaptable à d'autres prélèvements tels que la peau ou les cheveux, pour lesquels l'identification est indispensable. La PCR ne permettant pas de mettre en évidence la présence de levures et de moisissures, étiologie non exceptionnelle d'onychomycoses et ne pouvant être ignorée, elle ne remplace pas la culture mais vient en complément de celle-ci. Le coût élevé est également un élément à prendre en compte. Par contre, cette technique présente un grand intérêt pour les échantillons qui mettraient en défaut les techniques classiques de diagnostic, du fait d'un traitement antifongique ou par la mauvaise qualité du prélèvement effectué par du personnel non expérimenté.GRENOBLE1-BU Médecine pharm. (385162101) / SudocSudocFranceF

Diagnostic sérologique de l amibiase à Entamoeba histolytica (validation d un nouveau test ELISA au CHU de Grenoble)

L amibiase viscérale à Entamoeba histolytica est une protozoose dont la prévalence est élevée en milieu tropical en raison des mauvaises conditions d'hygiène fécale. Dans les pays tempérés, les patients concernés sont les immigrés et les touristes revenant des zones d endémies. Elle se manifeste par un abcès, le plus souvent hépatique. Les symptômes sont des douleurs abdominales, de la fièvre et une hépatomégalie. Pour le diagnostic, il faut intégrer les données symptomatologiques, épidémiologiques et biologiques des patients. La sérologie représente une grande part de cette équation. Le test évalué dans cette étude rétrospective est une technique immunoenzymatique, l ELISA. Cent soixante dix sérums de patients du CHU de Grenoble appartenant à 4 groupes : amibiase viscérale (n=52), amibiase intestinale (n=7), non amibiens (n=71), autres parasitoses (n=40), et un cinquième groupe constitué par des donneurs de sang (n=99), ont été étudiés. La sensibilité de ce test est de 100%, les spécificités sont de 88.7% (non amibiens) et de 96% (donneurs de sang). Les autres réactifs ELISA présents actuellement sur le marché international possèdent une sensibilité légèrement plus faible (95% en moyenne) et une spécificité équivalente (95% en moyenne chez les donneurs de sang). Les efficacités des deux techniques sérologiques utilisées en routine au CHU de Grenoble: immunofluorescence (95.1%) et latex (94.3%), sont sensiblement les mêmes que celle du test évalué (93.5%). Cette nouvelle trousse diagnostique est tout aussi performante que celles disponibles actuellement disponibles sur le marché. Elle trouvera toute sa place dans la stratégie diagnostique actuelle de l amibiase viscérale.GRENOBLE1-BU Médecine pharm. (385162101) / SudocSudocFranceF