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Localización cromosómica de cuatro genes de peroxidasa de Clase III en trigo
In previous work, deduced amino acid sequences from twenty wheat peroxidase genes were assigned to seven groups designated as TaPrx108 to TaPrx114. Some of these apoplastic peroxidases, have previously shown to play different roles in the plant defense responses to infection by the cereal cyst nematode Heterodera avenae. In the present study, PCR marker analysis using Sears’s aneuploid wheat lines cv. ‘Chinese Spring’, was used to locate four genes encoding peroxidase isozymes. The TaPrx111-A, TaPrx112-D and TaPrx113-F genes were located on the short arm of chromosome 2B and the TaPrx109-C on the long arm of chromosome 1B. These results would agree with the synteny between wheat and rice chromosomes previously established in other studies.En un estudio previo se caracterizaron, alinearon y relacionaron 20 genes que codifican para peroxidasas en trigo. Las proteÃnas resultantes se asignaron a siete grupos, denominados TaPrx108 a TaPrx114, de acuerdo a la similitud entre ellas y con peroxidasas de Clase III de otras especies. En lÃneas de trigo resistentes al nemátodo Heterodera avenae, se ha demostrado que algunas de estas peroxidasas apoplásticas están relacionadas con las respuestas de defensa frente a la infección por dicho nematodo. En el presente estudio se localizaron cromosómicamente cuatro genes que codifican para enzimas peroxidasas mediante la reacción de PCR, utilizando pares de cebadores especÃficos para cada gen y ADN aislado de lineas de trigo aneuploides del cultivar Chinese Spring. Los genes TaPrx111-A, TaPrx112-D y TaPrx113-F fueron asignados al brazo corto del cromosoma 2B, mientras que el gen TaPrx109-C se localizó en el brazo largo del cromosoma 1B. Estos resultados mantendrÃan la sintenia previamente establecida entre los cromosomas de trigo y arroz.Fil: Simonetti, Ester. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias AgrÃcolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Instituto de Investigaciones en Biociencias AgrÃcolas y Ambientales; ArgentinaFil: Alba, E.. Universidad Politécnica de Madrid; EspañaFil: Delibes, A.. Universidad Politécnica de Madrid; Españ
Cromosomal location of four genes encoding Class III peroxidases in wheat
In a previous work, deduced amino acid sequences from twenty wheat peroxidase genes were assigned to seven groups designated as TaPrx108 to TaPrx114. Some of these apoplastic peroxidases have previously shown to play different roles in the plant defense responses to infection by the cereal cyst nematode Heterodera avenae. In the present study, PCR marker analysis using Sears’s aneuploid wheat lines cv. ‘Chinese Spring’ was used to locate four genes encoding peroxidase isozymes. The TaPrx111-A, TaPrx112-D and TaPrx113-F genes were located on the short arm of chromosome 2B and the TaPrx109-C on the long arm of chromosome 1B. These results would agree with the synteny between wheat and rice chromosomes previously established in other studies
Actividad fungicida/fungistática in vitro del fosfito de manganeso contra hongos patógenos habitantes del suelo con soja
Las pudriciones de raÃz y tallo (PRYT) en el cultivo de soja causadas por patógenos habitantes del suelo son enfermedades comúnmente encontradas en campos de soja y son una de las causas más importantes de pérdidas económicas. La sensibilidad micelial de Fusarium virguliforme, Fusarium tucumaniae, Sclerotinia sclerotiorum y Macrophomina phaseolina fue evaluada en medio de cultivo agar papa glucosa (25 mL) suplementado con diferentes concentraciones (µg mL-1) de fosfito de manganeso (PhiMn) diluido en agua (0; 25; 37.5; 50; 100; 200; 300; 400; 500; 800 y 1000). La sensibilidad del crecimiento micelial fue analizada usando análisis de regresión lineal logarÃtmico. La concentración de PhiMn necesaria para inhibir el 50% del crecimiento micelial (CI50) fue calculada. Los valores de CI50 fueron desde 105 µg mL-1 (Fusarium spp.) hasta 409 µg mL-1 (M. phaseolina). La formación de esclerocios fue completamente inhibida a 500 µg mL-1. Los resultados del presente estudio representan el primer reporte de la acción fungicida/fungistática in vitro del Phi contra los hongos agentes causales de PRYT en el cultivo de soja.Soybean root and stem rots caused by soil-borne pathogens are diseases commonly found in soybean fields, and one of the most important causes of crop losses. In the present study, the mycelial sensitivity of Fusarium virguliforme, F. tucumaniae, Sclerotinia sclerotiorum and Macrophomina phaseolina was evaluated on potato dextrose agar media (25 mL) supplemented with different concentrations of manganese phosphite (MnPhi) diluted in water (0, 25, 37.5, 50, 100, 200, 300, 400, 500, 800 and 1000 µg/mL). Mycelial growth sensitivity was analyzed using logarithmic linear regression analysis. The MnPhi concentration needed to inhibit 50% of the mycelial growth (IC50) ranged from 105 µg/mL (Fusarium spp.) to 409 µg/mL (M. phaseolina). Sclerotia were completely inhibited at 500 µg/mL. The results of our study represent the first report on the direct in vitro fungicidal/fungistatic action of MnPhi against fungi that are causal agents of soil-borne diseases.Fil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de FitopatologÃa; ArgentinaFil: Simonetti, Ester. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones en Biociencias AgrÃcolas y Ambientales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Instituto de Investigaciones en Biociencias AgrÃcolas y Ambientales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Departamento de BiologÃa Aplicada y Alimentos. Cátedra de MicrobiologÃa AgrÃcola; ArgentinaFil: Ravotti, M. E.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de FitopatologÃa; ArgentinaFil: Scandiani, MarÃa Mercedes. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias BioquÃmicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Luque, A. G.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias BioquÃmicas y Farmacéuticas; ArgentinaFil: Formento, N. A.. Instituto Nacional de TecnologÃa Agropecuaria. Centro Regional Entre RÃos. Estación Experimental Agropecuaria Paraná; ArgentinaFil: Sautua, Francisco. Universidad de Buenos Aires. Facultad de AgronomÃa. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de FitopatologÃa; Argentin
Localización cromosómica de una peroxidasa de la Clase III de trigo.
En un estudio previo se caracterizaron, alinearon y relacionaron 20 genes que codifican para peroxidasas de trigo. Las secuencias deducidas de estos genes se agruparon en siete grupos, TaPrx108 a TaPrx114, de acuerdo a la similitud entre ellas y con peroxidasas de la Clase III de otras especies. Los genes correspondientes a tres de estos grupos (TaPrx111, TaPrx112 y TaPrx113) mostraron inducción en respuesta a la infección por Heterodera avenae en una lÃnea de trigo resistente. Tres de los genes, TaPrx111-A, TaPrx112-D y TaPrx113-F, fueron localizados en el cromosoma 2BS y posiblemente estén ligados entre si. En el presente estudio, el gen de la peroxidasa TaPrx109-C, fue asignado al brazo largo del cromosoma 1B
Effects of introgressed 4Nv Aegilops ventricosa chromosome on yield and yield components in bread wheat.
Effects of introgressed 4Nv Aegilops ventricosa chromosome on yield and yield components in bread whea
Analysis of Ascorbate Peroxidase Genes Expressed in Resistant and Susceptible Wheat Lines Infected by Heterodera avenae.
Changes in ascorbate peroxidase (APX) enzyme activity in response to nematode (Heterodera avenae) attack were studied in roots of three hexaploid wheat lines carrying Cre2, Cre5, or Cre7 nematode resistance genes and the susceptible Triticum aestivum cv. Anza. A spectrophotometric analysis was carried out with root extracts of infected plants 4, 7, 11, and 14 days after nematode inoculation using uninfected plant as control. APX induction in infected resistant genotypes was similar and higher than in the susceptible control. The introgression wheat/Aegilops ventricosa H-93-8 line, carrying the Cre2 gene, and its parental line H-10-15 as susceptible control were used to analyze whether this increase of activity was correlated with the induction of APX gene expression. Genes encoding cytosolic forms of APX were induced in roots of both lines in response to nematode infection. This induction took place both earlier and with greater intensity in the resistant line than in the susceptible one, and it was also higher in the root area at the site of nematode attachment
New records of species of Viola (Violaceae) for northwestern Argentina
Se citan por primera vez para Argentina Viola micranthella y V. pygmaea, ambas pertenecientes a la Sección Andinium. La primera se halla en las provincias de Salta y Jujuy mientras que V. pygmaea crece en Salta. Los taxones se describen e ilustran y se proveen los mapas de distribución geográfica en Sudamérica y, con mayor detalle, en Argentina.Viola micranthella and V. pygmaea, both entities belonging to section Andinium, are reported for the first time for Argentina. The first one occurs in Salta and Jujuy provinces and the second one in Salta. Both species are described and illustrated and distribution maps are provided.Fil: Sanso, Andrea Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, FÃsicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion; ArgentinaFil: Simonetti, Ester. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Instituto de Botánica Darwinion. Academia Nacional de Ciencias Exactas, FÃsicas y Naturales. Instituto de Botánica Darwinion; Argentina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones CientÃficas; ArgentinaFil: Xifreda, Cecilia Carmen. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Laboratorio de Etnobotánica y Botánica Aplicada; Argentina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones CientÃficas; Argentin
I-COMS: Interprotein-COrrelated Mutations Server
Interprotein contact prediction using multiple sequence alignments (MSAs) is a useful approach to help detect protein-protein interfaces. Different computational methods have been developed in recent years as an approximation to solve this problem. However, as there are discrepancies in the results provided by them, there is still no consensus on which is the best performing methodology. To address this problem, I-COMS (interprotein COrrelated Mutations Server) is presented. I-COMS allows to estimate covariation between residues of different proteins by four different covariation methods. It provides a graphical and interactive output that helps compare results obtained using different methods. I-COMS automatically builds the required MSA for the calculation and produces a rich visualization of either intraprotein and/or interprotein covariating positions in a circos representation. Furthermore, comparison between any two methods is available as well as the overlap between any or all four methodologies. In addition, as a complementary source of information, a matrix visualization of the corresponding scores is made available and the density plot distribution of the inter, intra and inter+intra scores are calculated. Finally, all the results can be downloaded (including MSAs, scores and graphics) for comparison and visualization and/or for further analysis.Fil: Iserte, Javier Alonso. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Simonetti, Franco Lucio. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Zea, Diego Javier. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: Teppa, Roxana Elin. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Marino, Cristina Ester. Consejo Nacional de Investigaciones CientÃficas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentin
New records of species of Viola (Violaceae) for northwestern Argentina
Viola micranthella and V. pygmaea, both entities belonging to section Andinium, are reported for the first time for Argentina. The first one occurs in Salta and Jujuy provinces and the second one in Salta. Both species are described and illustrated and distribution maps are provided.Se citan por primera vez para Argentina Viola micranthella y V. pygmaea, ambas pertenecientes a la Sección Andinium. La primera se halla en las provincias de Salta y Jujuy mientras que V. pygmaea crece en Salta. Los taxones se describen e ilustran y se proveen los mapas de distribución geográfica en Sudamérica y, con mayor detalle, en Argentina.Facultad de Ciencias Naturales y MuseoLaboratorio de Etnobotánica y Botánica Aplicad
Peroxidase expression in a cereal cyst nematode (Heterodera avenae) resistant hexaploid wheat line.
The incompatible interaction between plant and pathogen is often determined by the hypersensitive reaction (HR). This response is associated with accumulation of reactive oxygen species (ROS), which results in adverse growth conditions for pathogens. Two major mechanisms involving either NADPH oxidases or peroxidases have been proposed for generation of ROS. Peroxidases (PER, EC 1.11.1.7), present in all land plants, are members of a large multigenic family with high number of isoforms involved in a broad range of physiological processes. PER genes, which are expressed in nematode feeding sites, have been identified in several plant species (Zacheo et al. 1997). A strong correlation between HR and PER activities at four and seven days post nematode infection, was detected in roots of wheat lines carrying Cre2, Cre5 (from Ae. ventricosa) or Cre7 (from Ae. triuncialis) Heterodera avenae resistance genes (Andrés et al. 2001; Montes et al. 2003, 2004). We have studied changes in root of peroxidase mRNAs levels after infection by H. avenae of a wheat/Ae. ven¬tricosa introgression line (H-93-8) carrying Cre2 (Delibes et al. 1993). We also report and classify the predicted protein sequences derived from complete peroxidase transcripts
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