Color tunable pressure sensors based on polymer nanostructured membranes for optofluidic applications

We demonstrate an integrated optical pressure sensing platform for multiplexed optofluidics applications. The sensing platform consists in an array of elastomeric on-side nanostructured membranes -effectively 2D photonic crystal- which present colour shifts in response to mechanical stress that alter their nanostructure characteristical dimensions, pitch or orientation. The photonic membranes are prepared by a simple and cost-effective method based on the infiltration of a 2D colloidal photonic crystal (CPC) with PDMS and their integration with a microfluidic system. We explore the changes in the white light diffraction produced by the nanostructured membranes when varying the pneumatic pressure in the microfluidics channels as a way to achieve a power-free array of pressure sensors that change their reflective colour depending on the bending produced on each sensor. The structural characterization of these membranes was performed by SEM, while the optical properties and the pressure-colour relation were evaluated via UV-Vis reflection spectrometry. Maximum sensitivities of 0.17 kPa is obtained when measuring at Littrow configuration (θ = −θ ), and close to the border of the membranes. The reflected colour change with pressure is as well monitorized by using a smartphone camera

The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics.

ABSTRACT: A global genome database of all of Earth’s species diversity could be a treasure trove of scientific discoveries. However, regardless of the major advances in genome sequencing technologies, only a tiny fraction of species have genomic information available. To contribute to a more complete planetary genomic database, scientists and institutions across the world have united under the Earth BioGenome Project (EBP), which plans to sequence and assemble high-quality reference genomes for all ∼1.5 million recognized eukaryotic species through a stepwise phased approach. As the initiative transitions into Phase II, where 150,000 species are to be sequenced in just four years, worldwide participation in the project will be fundamental to success. As the European node of the EBP, the European Reference Genome Atlas (ERGA) seeks to implement a new decentralised, accessible, equitable and inclusive model for producing high-quality reference genomes, which will inform EBP as it scales. To embark on this mission, ERGA launched a Pilot Project to establish a network across Europe to develop and test the first infrastructure of its kind for the coordinated and distributed reference genome production on 98 European eukaryotic species from sample providers across 33 European countries. Here we outline the process and challenges faced during the development of a pilot infrastructure for the production of reference genome resources, and explore the effectiveness of this approach in terms of high-quality reference genome production, considering also equity and inclusion. The outcomes and lessons learned during this pilot provide a solid foundation for ERGA while offering key learnings to other transnational and national genomic resource projects.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

CARB-ES-19 Multicenter Study of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli From All Spanish Provinces Reveals Interregional Spread of High-Risk Clones Such as ST307/OXA-48 and ST512/KPC-3

ObjectivesCARB-ES-19 is a comprehensive, multicenter, nationwide study integrating whole-genome sequencing (WGS) in the surveillance of carbapenemase-producing K. pneumoniae (CP-Kpn) and E. coli (CP-Eco) to determine their incidence, geographical distribution, phylogeny, and resistance mechanisms in Spain.MethodsIn total, 71 hospitals, representing all 50 Spanish provinces, collected the first 10 isolates per hospital (February to May 2019); CPE isolates were first identified according to EUCAST (meropenem MIC > 0.12 mg/L with immunochromatography, colorimetric tests, carbapenem inactivation, or carbapenem hydrolysis with MALDI-TOF). Prevalence and incidence were calculated according to population denominators. Antibiotic susceptibility testing was performed using the microdilution method (EUCAST). All 403 isolates collected were sequenced for high-resolution single-nucleotide polymorphism (SNP) typing, core genome multilocus sequence typing (cgMLST), and resistome analysis.ResultsIn total, 377 (93.5%) CP-Kpn and 26 (6.5%) CP-Eco isolates were collected from 62 (87.3%) hospitals in 46 (92%) provinces. CP-Kpn was more prevalent in the blood (5.8%, 50/853) than in the urine (1.4%, 201/14,464). The cumulative incidence for both CP-Kpn and CP-Eco was 0.05 per 100 admitted patients. The main carbapenemase genes identified in CP-Kpn were blaOXA–48 (263/377), blaKPC–3 (62/377), blaVIM–1 (28/377), and blaNDM–1 (12/377). All isolates were susceptible to at least two antibiotics. Interregional dissemination of eight high-risk CP-Kpn clones was detected, mainly ST307/OXA-48 (16.4%), ST11/OXA-48 (16.4%), and ST512-ST258/KPC (13.8%). ST512/KPC and ST15/OXA-48 were the most frequent bacteremia-causative clones. The average number of acquired resistance genes was higher in CP-Kpn (7.9) than in CP-Eco (5.5).ConclusionThis study serves as a first step toward WGS integration in the surveillance of carbapenemase-producing Enterobacterales in Spain. We detected important epidemiological changes, including increased CP-Kpn and CP-Eco prevalence and incidence compared to previous studies, wide interregional dissemination, and increased dissemination of high-risk clones, such as ST307/OXA-48 and ST512/KPC-3

Development of sensors based in MEMS with mechanochromic response

Els sensors nanomecànics han estat reportats històricament com una eina atractiva per a la biodetecció degut a la seva alta sensibilitat, alt rendiment i alta integració. La majoria dels sensors nanomecànics s'han fabricat amb tecnologia basada en silici, podent integrar milers de sensors en un sol xip. No obstant això, el desenvolupament d'aquest tipus de sistemes implica no només la fabricació de matrius de transductors mecànics, que actualment és un procés molt establert i de baix cost, sinó també l'implementació d'un sistema de lectura per llegir independentment la resposta de cada transductor. Aquesta tesi doctoral es va centrar en el desenvolupament d'un nou enfocament per a la detecció de la resposta mecànica d'una matriu de sensors mecànics mitjançant l'ús d'instrumentació senzilla. Aquest enfocament consisteix en el desenvolupament de sensors mecànics (microcantilevers i micromembranes) amb resposta mecanocròmica, és a dir, sensors mecànics que canvien el seu color intrínsecament davant l'estimulació mecànica. El desenvolupament de sensors basats en MEMS amb resposta mecanocrómica és el resultat d'una combinació efectiva de la coloració estructural produïda per xarxes de difracció o cristalls fotònics, amb el rendiment dels transductors mecànics. Els sensors mecànics amb una nanoestructura periòdica disposada en una cara del sensor, es van fabricar i caracteritzar. El color mostrat pels sensors canvia intrínsecament per l'acció d'un estímul mecànic extern (càrrega de pressió o tensió superficial) quan el transductor es deforma, i el canvi de color es recollit per un LED i una càmera RGB de baix cost. Per dur a terme aquest desenvolupament, es realitza un estudi teòric de la física de coloració estructural i de models matemàtics que descriuen el principi de funcionament del dispositiu mecanocròmic. Amb aquests elements bàsics, els materials mecanocròmics basats en dos tipus d'estructures fotòniques, xarxes de difracció 1D i acoblaments col·loïdals, són fabricats i caracteritzats per espectrometria UV-Visible, identificant els principals contribuents del canvi de color (variacions en el període de la nanoestructura i canvis en l'angle d'il·luminació de punt de vista). Aquests materials a continuació són integrats a matrius de sensors mecànics colorimètrics per ser caracteritzats per mitjà de tensió biaxial. Es fabrica, caracteritza i avalua una matriu de sensors de pressió colorimètrics basats en membranes flexibles nanoestructurades i suspeses, lliures de marcatges i d'alimentació d'energia orientat a les aplicacions optofluídiques multiplexades. La plataforma mostra una sensibilitat de 0.17 kPa-1 en la detecció de pressions pneumàtiques baixes o de fluids (en un rang entre -1 i 1 kPa) i es demostra l'idoneïtat del mètode de detecció colorimètric mesurant el canvi de color de les membranes que mostren una sensibilitat de 117 nm \/ kPa. Finalment, es realitza un estudi teòric d'un sensor nanomecrònic colorimètric de tensió superficial basat en cantilevers i es demostra la seva utilitat a la detecció de canvis conformacionals moleculars fotoinduïts. D'aquesta manera, el mètode de detecció és capaç de detectar canvis de 1° en l'escala de to (HSV), o 0.75 nm de longitud d'ona en el rang visible (400 nm a 650 nm). El desenvolupament de sensors basats en MEMS amb resposta mecanocròmica es presenta com una eina útil que compleix amb els requisits per al desenvolupament d'un dispositiu de punt d'atenció.Los sensores nanomecánicos han sido reportados históricamente como una herramienta atractiva para la biodetección debido a su alta sensibilidad, alto rendimiento y alta integración. La mayoría de los sensores nanomecánicos se han fabricado con tecnología basada en silicio, pudiendo integrar miles de sensores en un solo chip. Sin embargo, el desarrollo de este tipo de sistemas implica no solo la fabricación de matrices de transductores mecánicos, que actualmente es un proceso muy establecido y de bajo costo, sino también la implementación de un sistema de lectura para leer independientemente la respuesta de cada transductor. Esta tesis doctoral se centró en el desarrollo de un nuevo enfoque para la detección de la respuesta mecánica de una matriz de sensores mecánicos mediante el uso de instrumentación sencilla. Este enfoque consiste en el desarrollo de sensores mecánicos (microcantilevers y micromembranas) con respuesta mecanocrómica, es decir, sensores mecánicos que cambian su color intrínsecamente ante estimulación mecánica. El desarrollo de sensores basados en MEMS con respuesta mecanocrómica es el resultado de una combinación efectiva de la coloración estructural producida por redes de difracción o cristales fotónicos, con el rendimiento de los transductores mecánicos. Los sensores mecánicos con una nanoestructura periódica dispuesta en una cara del sensor, son fabricados y caracterizados. El color mostrado por los sensores cambia intrínsecamente por la acción de un estímulo mecánico externo (carga de presión o tensión superficial) cuando el transductor se deforma, siendo el cambio de color recogido por el uso de un LED y una cámara RGB de bajo costo. Para llevar a cabo este desarrollo, se realiza un estudio teórico de la física de coloración estructural y de modelos matemáticos que describen el principio de funcionamiento del dispositivo mecanocrómico. Con estos elementos básicos, los materiales mecanocrómicos basados en dos tipos de estructuras fotónicas, redes de difracción 1D y ensamblajes coloidales, son fabricados y caracterizados por espectrometría UV-Visible, identificando los principales contribuyentes del cambio de color (variaciones en el período de la nanoestructura y cambios en el ángulo de iluminación de punto de vista). Estos materiales a continuación son integrados a matrices de sensores mecánicos colorimétricos para ser caracterizados por medio de tensión biaxial. Se fabrica, caracteriza y evalúa una matriz de sensores de presión colorimétricos basados en membranas flexibles nanoestructuradas y suspendidas, libres de marcajes y de alimentación de energía orientado a las aplicaciones optofluídicas multiplexadas. La plataforma muestra una sensibilidad de 0.17 kPa-1 en la detección de presiones neumáticas bajas o de fluidos (en un rango entre -1 y 1 kPa) y se demuestra la idoneidad del método de detección colorimétrico midiendo el cambio de color de las membranas que muestran una sensibilidad de 117 nmkPa-1. Finalmente, se realiza un estudio teórico de un sensor nanomecánico colorimétrico de tensión superficial basado en cantilevers y se demuestra su desempeño en la detección de cambios conformacionales moleculares fotoinducidos. De esta manera, el método de detección es capaz de detectar cambios de 1o en la escala de tono (HSV), o 0.75 nm de longitud de onda en el rango visible (400 nm a 650 nm). El desarrollo de sensores basados en MEMS con respuesta mecanocrómica se presenta como una herramienta útil que cumple con los requisitos para el desarrollo de un dispositivo de punto de atención.Nanomechanical sensors have been historically reported as an attractive tool for biodetecction due to its high sensitivity, high throughput, and high integration. Most of nanomechanical sensors have been fabricated using silicon based technology being able to integrate thousands of sensors in a single chip. However, the development of this kind of systems involves not only the fabrication of arrays of mechanical transducers, which is currently a well-established and low-cost process, but also the implementation of a read-out system to independently read each transducer response. This Doctoral Thesis focused on the development of a new approach for the detection of the mechanical response of an array of mechanical sensors by using simple instrumentation. This approach consists in the development of mechanical sensors (microcantilevers and micromembranes) with mechanochromic response, i.e. mechanical sensors with an intrinsic tunable colour under mechanical stimulation. The development of sensors based in MEMS with mechanochromic response is a result of an effective combination of the structural coloration produce by diffraction gratings or photonic crystals, with the performance of mechanical transducers. Mechanical sensors with a periodical nanostructuration disposed on one face of the sensor, are fabricated and characterized. The colour displayed by the sensors change intrinsically by the action of an external mechanical stimulus (pressure load or surface stress) when the transducer deflects, being the colour change collected by the use of a LED and a low cost RGB camera. In order to carry out this development, a theoretical study of the physics of structural coloration and the mathematical models that describe the working principle of the mechanochromic device is performed. With these basics, the mechanochromic materials based on two types of photonic structures, linear 1D gratings and colloidal assemblies, are fabricated and characterized by UV-Visible spectrometry, finding the main contributors of colour change (variations in the nanostructure period and changes in the illumination and point of view angle). These materials are then integrated into arrays of coloured mechanical sensors and characterised under bi-axial strain. A label-free and power-free array of colour tunable pressure sensors based on flexible nanostructured suspended membranes is fabricated, characterized and evaluated for multiplexed optofluidics applications. The platform shows a sensitivity of 0.17 kPa^(-1) for the detection of low pneumatic or fluid pressures (in a range between -1 and 1 kPa) and the suitability of colorimetric detection method is demonstrated by measuring the membrane colour change with a sensitivity of 117 nm\/kPa. Finally, a theoretical study of a surface stress colorimetric nanomechanical sensor based in cantilevers is performed and demonstrated its performance for the detection of photo-induced molecular conformational changes. In this case, the detection method is able to detect changes of 1^o in the hue scale (HSV) or 0.75 nm for the visible band in wavelengths (400 nm to 650 nm). The development of sensors based in MEMS with mechanochromic response is presented as a useful tool that fulfils the requirements for the development of a point-of-care device, such as: high sensitivity, low-cost, high throughput, label-free, out of the shelf, disposable, multidetection, and also that does not require a sophisticated detection system

Implementación de un Sistema de Grabación Remota de un AVR Mediante Ethernet para Controlar un Motor CC

El presente proyecto muestra el diseño y la implementación de un sistema de grabación remota de un AVR que se comunique mediante Ethernet dentro de una red local, para el control de un motor de Corriente Continua de 5 Voltios. Para cumplir con este objetivo, se recurrió al uso de Networking Embebido para establecer comunicación con la red local mediante protocolos de comunicación como ICMP, ARP y UDP, a través de una interfaz de adaptación ENC28J60, controlada por medio de un microcontrolador ATMega32 programado en ANSI C, que hace las funciones de cerebro dentro del sistema. Obteniendo así un diseño a bajo costo por los materiales utilizados, una implementación sencilla y fácil de realizar por el estudio de selección de la mejor alternativa en componentes electrónicos, obteniendo así un tiempo de implementación de 3 horas, un tiempo de programación en ANSI C máximo de 30 horas, demostrando eficiencia y confiabilidad de uso del diseño e implementación según parámetros como: tiempo máximo de grabación remota del microcontrolador 3.92093 segundos, tiempo de comunicación con la interfaz Ethernet 20µs, 32µs y 10ms para los protocolos ARP, ICMP, UDP respectivamente. Valores obtenidos al realizar pruebas utilizando un analizador de protocolos de comunicación y tráfico de red Wireshark, en una red local pública con altos márgenes de tráfico de internet. El diseño y la implementación realizada alcanzó el objetivo de demostrar confiabilidad y eficiencia al poder controlar un motor de corriente continua de 5 voltios dentro de una red local, mediante un sistema de grabación remota de un microcontrolador utilizando protocolos de comunicación de red

Does tension keep you in shape? Relevance of Drosophila melanogaster peripodial epithelium on final organ size

Resumen del póster presentado al 11th Meeting of the Spanish Society for Developmental Biology, celebrado en Girona (España) del 19 al 21 de octubre de 2016.How animal organs sense and control that they have reached their species specific target size is a longstanding biological question that hasn¿t been fully addressed yet. Possible mechanisms have been proposed in which molecular concentrations vary throughout organ development and regulate the termination of the process. But during growth, organs not only experience chemical variations but also undergo mechanical stress. We are currently exploring the role tension may play regulating organ growth. Most of what is currently known about growth control mechanisms has been deciphered using the primordia of the adult organs in Drosophila, called imaginal discs. Drosophila imaginal discs are flat sacs of monolayered epithelium. Of the two epithelial sheets, the Peripodial epithelium (PE) plays an ancillary role, not giving rise to adult structures, but participating in the final eversion of the discs during metamorphosis. Therefore, the PE has a mechanical role. We have shown that PE cells accumulate thick acto-myosin bundles with an anterior-posterior orientation, indicative of a strong polarized tension. Therefore, the PE could exert some mechanical influence during disc growth. We will present data on the quantitative characterization of cell and tissue parameters (size, polarity, acto-myosin accumulation, neighbors distribution, cell connectivity, etc) of the PE during disc development, with the aim to infer global properties of the tissue. To relate cell/tissue properties with tension sensing, we will analyze how the subcellular localization of Yki, the co-transcriptional activator of the Hippo pathway and tension sensor, correlates with those properties.Peer Reviewe

Título: Historia ilustrada y descriptiva de sus provincias, sus poblaciones más importantes y posesiones de ultramar

Otros editores: Rubio : Vitturi : GriloTexto a dos colContiene lám., mapas y retr. firmados que no forman parte de la secuencia de págContiene lám., retr. firmados que no forman parte de la secuencia de pagContiene: Crónica de la provincia de Madrid / Cayetano Rossell -- Crónica de la provincia de Guadalajara / José María Escudero (66 p., [3] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Cuenca / Pedro Pruneda (78 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Toledo / Eduardo de Mariátegui (112 p., [6] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Ciudad Real / Jose de Hosta (95 p., [5] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de La Coruña / Fernando Fulgosio (128 p., [7] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Orense / Fernando Fulgosio (48 p., [2] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Lugo / José Villa-amil y Castro (80 p.) -- Crónica de la provincia de Pontevedra / Fernando Fulgosio (94 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Gerona / Narciso Blanch é Illa (176 p., [10] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia Lérida / Enrique Blanch (63 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.)-- Crónica de la provincia de Tarragona / Fernando Fulgosio (96 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Barcelona / Manuel Angelón (159 p., [9] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de León / José García de la Foz (95 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Palencia / Federico Villalva (VIII, 80 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Valladolid / Fernando Fulgosio (78 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Zamora / Fernando Fulgosio (80 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Salamanca / Manuel González de la Llana (63 p., [3] h. de lám., [2] h. de map.) -- Crónica del Principado de Asturias / Evaristo Escalera (192 p., [11] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Valencia / Vicente Boix (111 p., [6] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Alicante / Vicente Boix (62 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Castellón de la Plana / Adolfo Miralles de Imperial (80 p., [2] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Zaragoza / José Fernando González (158 p., [9] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Huesca / José Fernando González (80 p., [4] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Teruel / Pedro Pruneda (95 p., [3] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Navarra / Julio Nombela, 1868 (VIII, 112 p., [6] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Guipúzcoa / Fernando Fulgosio (80 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica del Señorío de Vizcaya / Francisco Rodríguez García (160 p., [7] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Álava / José Bisso (78 p., [4] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Sevilla / José Bisso (94 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Córdoba / Manuel González Llana (95 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Cádiz / José Bisso (127 p., [7] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Huelva / Manuel Climent (63 p., [2] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Almería / Enrique Santoyo (63 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Jaén / Francisco Lozano Muñoz (79 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Málaga / José Bisso (99 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Granada / Juan de Dios de la Rada y Delgado (191 p., [9] h. de lám.) -- Crónica de la provincia de Ávila / Fernando Fulgosio (64 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Segovia / Luis Carreras (95 p., [5] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Burgos / Joaquín Maldonado Macanaz (112 p., [6] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Logroño / Waldo Gímenez Romera (63 p., [3] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Soria / Antonio Pérez Rioja -- Crónica de la provincia de Santander / Manuel de Assas (126 p., [7] h. de lám., [1] h. de map.) -- Crónica de la provincia de Cáceres / Juan P. de GuzmánContiene: Crónica de la provincia de Madrid / Cayetano Rossell -- Crónica de la provincia de Guadalajara / José María Escudero -- Crónica de la provincia de Cuenca / Pedro Pruneda -- Crónica de la provincia de Toledo / Eduardo de Mariátegui -- Crónica de la provincia de Ciudad Real / Jose de Hosta -- Crónica de la provincia de la Coruña / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Orense / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Lugo / José Villa-amil y Castro -- Crónica de la provincia de Pontevedra / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Gerona / Narciso Blanch é Illa -- Crónica de la provincia Lérida / Enrique Blanch -- Crónica de la provincia de Tarragona / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Barcelona / Manuel Angelón -- Crónica de la provincia de León / José García de la Foz -- Crónica de la provincia de Palencia / Federico Villalva -- Crónica de la provincia de Valladolid / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Zamora / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Salamanca / Manuel González de la Llana -- Crónica del Principado de Asturias / Evaristo Escalera -- Crónica de la provincia de Valencia / Vicente Boix -- Crónica de la provincia de Alicante / Vicente Boix -- Crónica de la provincia de Castellón de la Plana / Adolfo Miralles de Imperial -- Crónica de la provincia de Zaragoza / José Fernando González -- Crónica de la provincia de Huesca / José Fernando González -- Crónica de la provincia de Teruel / Pedro Pruneda -- Crónica de la provincia de Navarra / Julio Nombela -- Crónica de la provincia de Guipuzcoa / Fernando Fulgosio -- Crónica del Señorío de Vizcaya / Francisco Rodríguez García -- Crónica de la provincia de Alava / José Bisso -- Crónica de la provincia de Sevilla / José Bisso -- Crónica de la provincia de Córdoba / Manuel González Llana -- Crónica de la provincia de Cádiz / José Bisso -- Crónica de la provincia de Huelva / Manuel Climent -- Crónica de la provincia de Almeria / Enrique Santoyo -- Crónica de la provincia de Jaen / Francisco Lozano Muñoz -- Crónica de la provincia de Málaga / José Bisso -- Crónica de la provincia de Granada / Juan de Dios de la Rada y Delgado -- Crónica de la provincia de Avila / Fernando Fulgosio -- Crónica de la provincia de Segovia / Luis Carreras -- Crónica de la provincia de Burgos / Joaquín Maldonado Macanaz -- Crónica de la provincia de Logroño / Waldo Gímenez Romera -- Crónica de la provincia de Soria / Antonio Pérez Rioja -- Crónica de la provincia de Santander / Manuel de Assas -- Crónica de la provincia de Cáceres / Juan P. de Guzmán -- Crónica de la provincia de Badajoz / Manuel Henao y Muñoz -- Crónica de la provincia de Albacete / Narciso Blanch é Illa -- Crónica de la provincia de Murcia / José Bisso -- Crónica de Las Antillas / Jacobo de la Pezuela -- Crónica de las Islas Canarias / Waldo Gímenez Romera -- Crónica de las Islas Baleares / Fernando Fulgosio -- Africa : Islas de Fernando Póo, Corisco y Annobon / José Muñoz y Gaviri

The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics

A global genome database of all of Earth’s species diversity could be a treasure trove of scientific discoveries. However, regardless of the major advances in genome sequencing technologies, only a tiny fraction of species have genomic information available. To contribute to a more complete planetary genomic database, scientists and institutions across the world have united under the Earth BioGenome Project (EBP), which plans to sequence and assemble high-quality reference genomes for all ∼1.5 million recognized eukaryotic species through a stepwise phased approach. As the initiative transitions into Phase II, where 150,000 species are to be sequenced in just four years, worldwide participation in the project will be fundamental to success. As the European node of the EBP, the European Reference Genome Atlas (ERGA) seeks to implement a new decentralised, accessible, equitable and inclusive model for producing high-quality reference genomes, which will inform EBP as it scales. To embark on this mission, ERGA launched a Pilot Project to establish a network across Europe to develop and test the first infrastructure of its kind for the coordinated and distributed reference genome production on 98 European eukaryotic species from sample providers across 33 European countries. Here we outline the process and challenges faced during the development of a pilot infrastructure for the production of reference genome resources, and explore the effectiveness of this approach in terms of high-quality reference genome production, considering also equity and inclusion. The outcomes and lessons learned during this pilot provide a solid foundation for ERGA while offering key learnings to other transnational and national genomic resource projects