Identificación y caracterización de una proteína de unión al gen icaA y evaluación de su potencial participación en la formación de biofilm en Staphylococcus aureus

Resumen: El biofilm es definido como una comunidad microbiana altamente estructurada, compleja, inmersas dentro de una matriz de biopolímeros y adheridas a un sustrato o interfase inerte o viviente. Las bacterias dentro del biofilm están protegidas del ataque del sistema inmune del hospedero, de los antibióticos y otros agentes antimicrobianos. Staphylococcus aureus es una bacteria Gram positiva considerada como un patógeno oportunista, ya que hace parte del microbioma humano pero tiene la capacidad de causar infecciones. Esta bacteria genera un gran impacto en la salud pública mundial, ya que es el cuarto microorganismo recuperado de infecciones de pacientes hospitalizados. Adicionalmente, S. aureus tiene la capacidad de formar biofilm sobre diferentes superficies, incluyendo implantes médicos. El biofilm en S. aureus es producido por el operón ica, el cual está conformado por los genes icaA, icaB, icaC e icaD, que codifican las enzimas relacionadas con la producción del polisacárido de adhesión intercelular (PIA), componente principal de la matriz extracelular del biofilm en este microorganismo. En trabajos realizados previamente en el Laboratorio de Genética Molecular Bacteriana (LGMB) de la Universidad el Bosque se determinó la existencia de una región dentro del gen icaA altamente conservada en varias especies de Staphylococcus spp y que además contiene una secuencia palindrómica. Además existen indicios de proteínas que se unen de manera específica a esta secuencia palindrómica. El objetivo de este estudio fue identificar y caracterizar una proteína de unión a esta secuencia palindrómica del gen icaA y determinar su posible participación en la formación del biofilm en S. aureus. A partir de ensayos de retardamiento en gel y un proceso de purificación basado en cromatografía de proteínas de alta resolución se logró establecer la existencia de dos proteínas que reconocen esta secuencia palindrómica, SarX y una proteína hipotética, previamente no descrita. Ya se ha determinado que SarX tiene la habilidad para unirse al gen icaA. Sin embargo, la proteína hipotética correspondió a un ortólogo de la proteína YheA de Bacillus subtilis y además contiene un dominio denominado com_ylbF, el cual también está presente en las proteínas YlbF y YmcA de esta misma bacteria. Adicionalmente, se realizó un análisis estructural “in silico” de la proteína YheA, y de las proteínas YlbF y YmcA de S. aureus y B. subtilis. Modelos tridimensionales (3D) de las tres proteínas fueron construidos usando los programas I-TASSER y Quark. A partir de este análisis dos nuevas características de YheA, YlbF y YmcA fueron encontradas: una estructura 3D altamente conservada, a pesar de sus bajos porcentajes de identidad 16% y la presencia de un motivo putativo específico de cada proteína localizado dentro del dominio com_ylbF. Esta proteína YheA tiene un alto contenido de glutamina (13,2%), a nivel general y en su motivo putativo (QQKQMQ), lo cual sugiere que este aminoácido podría estar participando en la función de la proteína. Basados en estos hallazgos, se sugiere renombrar YheA como proteína rica en glutamina o Qrp (por su nombre en inglés Glutamine-rich protein) en S. aureus. Usando ensayos de mutagénesis dirigida, la deleción del gen yheA/qrp, que codifica para la proteína Qrp/YheA, produce una disminución en la formación del biofilm y un aumento en la hemólisis de eritrocitos por S. aureus. Estos resultados señalan que S. aureus posee una nueva familia de proteínas que contienen el dominio com_ylbF, de las cuales una de ellas, Qrp/YheA, está participando en la formación de biofilm a través de una interacción, directa o indirecta, con una secuencia palindrómica presente dentro del gen icaA.Abstract: The biofilm is a complex and high structured microbial community, which is immersed within a matrix composed of biopolymers with ability to adhere to inert or living substrates. The bacteria within the biofilm are protected the host defenses, antibiotics and other antimicrobial compounds. Staphylococcus aureus is a Gram positive bacterium, an opportunistic pathogen that generates a high clinic impact in the public health due to that it is the fourth bacterium recovered from infections in hospitalized patients. In addition, S. aureus has the ability to form biofilm on different substrates, including medical implants. The biofilm in S. aureus is produced by ica operon, which is composed for the icaA, icaB, icaC and icaD genes, encoding the enzymes responsible for the Polysaccharide Intercellular Adhesin (PIA) synthesis, principal biopolymer of the biofilm. In previous studies performed in the Laboratorio de Genetica Molecular Bacteriana of the Universidad El Bosque, a high conserved region was identified within icaA gene of the several Staphylococcal species, and interestingly, this region contained a palindromic sequence. There are experimental evidences that suggest the existence of proteins that recognize specifically this palindromic sequence. For these reasons, the objective of this study was to identify and to characterize one protein that recognizes this palindromic sequence and to establish whether it participates in the biofilm formation in S. aureus. Using Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) and FPLC-based protein purification, we achieve to identify two proteins that recognize this palindromic sequence, SarX and a hypothetical protein, which has not been previously described. It is known that SarX protein has the ability for binding to icaA gene. However, the hypothetical protein was an ortholog of the YheA protein of Bacillus subtilis and it contains the com_ylbF domain, which has also been identified in the proteins YlbF and YmcA in this same bacterium. Then, we performed an “in silico” structural analysis of the YheA protein, as well as the YlbF and YmcA. Three-dimensional (3D) models of these three proteins, in both S. aureus and B. subtilis, were built using the I-TASSER and Quark programs. From these analysis two new and important characteristics for YheA, YlbF and YmcA were found: a highly conserved 3D structure (despite their low amino acid identity, 16%) and the presence of a putative conserved motif located in the central region of the domain, which could be involved in its function. The YheA protein has a high content of glutamine (13.2%), even within its putative motif (QQKQMQ), which suggests that this amino acid could to be participating in the protein function. Based on these findings, we suggest renaming YheA as glutamine-rich protein (Qrp) in S. aureus. Interestingly, the yheA/qrp gene deletion in the S. aureus genome produces a decrease in the biofilm formation but an increase in the red blood cells hemolysis. Our results indicate that S. aureus possesses a new protein family that contain the com_ylbF domain, and that least one of these, Qrp/YheA, is participating in the biofilm formation through either direct or indirect interaction with a palindromic sequence located within the icaA gene.Doctorad

Lavados por aspiración colonoscópica para el perfil metataxonómico mucoso de las alteraciones del tracto gastrointestinal asociadas a la espondiloartritis

El estudio de la microbiota del tracto GI de pacientes con espondiloartritis (SpA) se ha centrado en el análisis de muestras de heces, que retratan principalmente la microbiota luminal. El objetivo de este estudio era determinar la contribución de la microbiota de la mucosa y la microbiota luminal a la disbiosis intestinal en la espondiloartritis, utilizando lavados por aspiración colonoscópica (LAC), una alternativa reciente para los estudios regionales del tracto gastrointestinal. Se analizaron 59 CAL (de colon sigmoide e íleon distal), y 41 muestras de heces, de 32 pacientes con SpA y 7 individuos sanos, utilizando perfiles metataxonómicos dirigidos al gen 16S rRNA. Se halló una alta prevalencia de manifestaciones del tracto gastrointestinal entre los pacientes con SpA (65,3%). El perfil metataxonómico confirmó que las muestras de CAL del tracto GI inferior (colon o íleon) presentaban un bacterioma distintivo e indiferenciado, distinto del encontrado en las muestras de heces o en el inicio del tracto GI (cavidad oral [OC]). Las muestras del tracto gastrointestinal inferior y las heces de los pacientes con EI mostraron un comportamiento similar al de la microbiota del grupo con EII, con una riqueza y diversidad microbianas reducidas, en comparación con los controles sanos. Curiosamente, se observó un aumento de los taxones proinflamatorios en los pacientes con EI, como la familia Enterobacteriaceae (principalmente en el íleon), Succinivibrio spp. y Prevotella stercorea. Por el contrario, los pacientes con EA presentaron una disminución significativa de los productores de AGCC Coprococcus catus y Eubacterium biforme. Nuestros datos apoyan el valor de las muestras de CAL para el estudio regional del tracto gastrointestinal y aportan información sobre los posibles "taxones perturbadores" implicados en los trastornos asociados al tracto gastrointestinal observados en los pacientes con SpA.he study of the GI-tract microbiota of spondylarthritis (SpA) patients has focused on the analysis of feces samples, that picture mostly the luminal microbiota. The aim of this study was to determine the contribution of mucosal and luminal microbiome to the gut dysbiosis in SpA, using colonoscopy aspiration lavages (CAL), a recent alternative for regional studies of the GI-tract. We analyzed 59 CAL (from sigmoid colon and distal ileum), and 41 feces samples, from 32 SpA patients and 7 healthy individuals, using 16S rRNA gene-targeted metataxonomic profiling. It was found high prevalence of GI-tract manifestations among SpA patients (65.3%). Metataxonomic profiling, confirmed CAL samples from the lower GI tract (colon or ileum) presented a distinctive and undifferentiated bacteriome and separate from that found in feces’ samples or in the beginning of the GI tract (oral cavity (OC)). Lower GI-tract samples and feces of SpA patients exhibited similar behavior to the microbiota of IBD group with reduced microbial richness and diversity, comparing to the healthy controls. Interestingly, it was found increase in proinflammatory taxa in SpA patients, such as Enterobacteriaceae family (mostly in the ileum), Succinivibrio spp. and Prevotella stercorea. Conversely, SpA patients presented significant decrease in the SCFA producers Coprococcus catus and Eubacterium biforme. Our data support the value of CAL samples for the regional study of GI-tract and contribute with information of potential “disruptor taxa” involved in the GI-tract associated disorders observed in SpA patients

Intramuscular Stimulation of Muscle Afferents Attains Prolonged Tremor Reduction in Essential Tremor Patients

This study proposes and clinically tests intramuscular electrical stimulation below motor threshold to achieve prolonged reduction of wrist flexion/extension tremor in Essential Tremor (ET) patients. The developed system consisted of an intramuscular thin-film electrode structure that included both stimulation and electromyography (EMG) recording electrodes, and a control algorithm for the timing of intramuscular stimulation based on EMG (closed-loop stimulation). Data were recorded from nine ET patients with wrist flexion/extension tremor recruited from the Gregorio Mara\uf1\uf3n Hospital (Madrid, Spain). Patients participated in two experimental sessions comprising: 1) sensory stimulation of wrist flexors/extensors via thin-film multichannel intramuscular electrodes; and 2) surface stimulation of the nerves innervating the same target muscles. For each session, four of these patients underwent random 60-s trials of two stimulation strategies for each target muscle: 1) selective and adaptive timely stimulation (SATS) - based on EMG of the antagonist muscle; and 2) continuous stimulation (CON) of target muscles. Two patients underwent SATS stimulation trials alone while the other three underwent CON stimulation trials alone in each session. Kinematics of wrist, elbow, and shoulder, together with clinical scales, were used to assess tremor before, right after, and 24 h after each session. Intramuscular SATS achieved, on average, 32% acute (during stimulation) tremor reduction on each trial, while continuous stimulation augmented tremorgenic activity. Furthermore, tremor reduction was significantly higher using intramuscular than surface stimulation. Prolonged reduction of tremor amplitude (24 h after the experiment) was observed in four patients. These results showed acute and prolonged (24 h) tremor reduction using a minimally invasive neurostimulation technology based on SATS of primary sensory afferents of wrist muscles. This strategy might open the possibility of an alternative therapeutic approach for ET patients

Genomic epidemiology of NDM-1-encoding plasmids in latin American clinical isolates reveals insights into the evolution of multidrug resistance

Bacteria that produce the broad-spectrum Carbapenem antibiotic NewDelhi Metallo-b-lactamase (NDM) place a burden on health care systems worldwide, due to the limited treatment options for infections caused by them and the rapid global spread of this antibiotic resistancemechanism.Although it is believed that theassociated resistancegenebla NDM-1 originated inAcinetobacter spp., the role of Enterobacteriaceae in its dissemination remains unclear. In this study, we usedwhole genome sequencing to investigate the dissemination dynamics of blaNDM-1-positive plasmids in a set of 21 clinical NDM-1-positive isolates from Colombia and Mexico (Providencia rettgeri, Klebsiella pneumoniae, and Acinetobacter baumannii) aswell as six representative NDM-1-positive Escherichia coli transconjugants. Additionally, the plasmids from three representative P. rettgeri isolates were sequenced by PacBio sequencing and finished. Our results demonstrate the presence of previously reported plasmids from K. pneumoniae and A. baumannii in different genetic backgrounds and geographically distant locations in Colombia. Three new previously unclassified plasmids were also identified in P. rettgeri from Colombia and Mexico, plus an interesting genetic link between NDM-1-positive P. rettgeri from distant geographic locations (Canada, Mexico, Colombia, and Israel) without any reported epidemiological links was discovered. Finally, we detected a relationship between plasmids present in P. rettgeri and plasmids from A. baumannii and K. pneumoniae. Overall, our findings suggest a Russian dollmodel for the dissemination of blaNDM-1 in LatinAmerica,with P. rettgeri playing a central role in this process, andrevealnewinsights into the evolution and disseminationof plasmids carrying such antibiotic resistance genes

YouTube y la economía del algoritmo

YouTube navega entre aguas revueltas pese a la solidez de la marca y de su altísimo consumo. Siendo la segunda página web más visitada del mundo según el índice Alexa, sólo tras el buscador de Google –propietaria de la plataforma de vídeo, además-, los nuevos competidores del vídeo online han creado un escenario de fuerte rivalidad en la que conviven diferentes modelos de negocio, contenedores de productos muy diversos, con una más que evidente identidad mutante. A YouTube se le suponía un modelo definido y una identidad consolidada: era el espacio en el que los usuarios compartían sus vídeos de manera más o menos altruista, donde las discográficas rompían los records de reproducciones con las estrellas de moda y con vídeo-eventos viralizados por sorpresa como Gangnam Style o Despacito, o donde los usuarios seguían vídeo-tutoriales o unboxings de los temas más diversos. Sin embargo, desde el momento en que la plataforma de vídeo de Google comenzó a incentivar la producción de sus usuarios más seguidos a través del patrocinio (mediante el programa de Partners) y, con más fuerza, cuando YouTube empezó a producir contenidos propios, evidenció que los vídeos virales de gatitos, los tutoriales de maquillaje y los clips de intérpretes emergentes del k-pop eran insuficientes para sostener una inversión que se adivina multimillonaria. YouTube no quiere quedarse atrás en la batalla de las OTTs comerciales y se reivindica como marca consolidada capaz de lograr el compromiso de sus clientes a través del pago de una cuota

Natural History of MYH7-Related Dilated Cardiomyopathy

BACKGROUND Variants in myosin heavy chain 7 (MYH7) are responsible for disease in 1% to 5% of patients with dilated cardiomyopathy (DCM); however, the clinical characteristics and natural history of MYH7-related DCM are poorly described. OBJECTIVES We sought to determine the phenotype and prognosis of MYH7-related DCM. We also evaluated the influence of variant location on phenotypic expression. METHODS We studied clinical data from 147 individuals with DCM-causing MYH7 variants (47.6% female; 35.6 +/- 19.2 years) recruited from 29 international centers. RESULTS At initial evaluation, 106 (72.1%) patients had DCM (left ventricular ejection fraction: 34.5% +/- 11.7%). Median follow-up was 4.5 years (IQR: 1.7-8.0 years), and 23.7% of carriers who were initially phenotype-negative developed DCM. Phenotypic expression by 40 and 60 years was 46% and 88%, respectively, with 18 patients (16%) first diagnosed at <18 years of age. Thirty-six percent of patients with DCM met imaging criteria for LV noncompaction. During follow-up, 28% showed left ventricular reverse remodeling. Incidence of adverse cardiac events among patients with DCM at 5 years was 11.6%, with 5 (4.6%) deaths caused by end-stage heart failure (ESHF) and 5 patients (4.6%) requiring heart transplantation. The major ventricular arrhythmia rate was low (1.0% and 2.1% at 5 years in patients with DCM and in those with LVEF of <= 35%, respectively). ESHF and major ventricular arrhythmia were significantly lower compared with LMNA-related DCM and similar to DCM caused by TTN truncating variants. CONCLUSIONS MYH7-related DCM is characterized by early age of onset, high phenotypic expression, low left ventricular reverse remodeling, and frequent progression to ESHF. Heart failure complications predominate over ventricular arrhythmias, which are rare. (C) 2022 The Authors. Published by Elsevier on behalf of the American College of Cardiology Foundation

Relaciones interculturales, mercado de trabajo y localización socio-espacial de los inmigrantes bolivianos que residen en áreas urbanas y periurbanas de la ciudad de Córdoba

Este proyecto estudiará los procesos de segmentación del mercado laboral y de segregación socio-espacial de los inmigrantes bolivianos en áreas urbanas y peri-urbanas de la ciudad de Córdoba, y las maneras en que dichos procesos son justificados a través de estereotipos basados en distinciones culturales y/o raciales. Focalizaremos sobre las relaciones de desigualdad y de explotación que signan el mercado de trabajo y otros espacios de sociabilidad en el contexto actual de acumulación del capital. Nos planteamos las siguientes hipótesis: 1) Los inmigrantes bolivianos que residen en la ciudad de Córdoba se vinculan, como mano de obra no calificada, con un mercado laboral informal segmentado étnicamente, en el marco de procesos discriminatorios basados en estereotipos étnico-raciales. 2) Algunos inmigrantes bolivianos lograron cierta movilidad económicoproductiva, convirtiéndose en patrones de sus co-nacionales en diferentes sectores (construcción, horticultura, comercio informal, industria de indumentaria), hecho que es facilitado por la activación de redes migratorias. 3) Los estereotipos sobre los bolivianos son re-significados y, a veces, confrontados por agentes vinculados con los medios y con organismos gubernamentales y no gubernamentales. 4) La segregación residencial es otro mecanismo discriminatorio que favorece la exclusión de los inmigrantes trabajadores. Nuestro objetivo principal es caracterizar los diferentes ámbitos laborales en los que se desempeñan los inmigrantes bolivianos en la ciudad de Córdoba y conceptualizar las relaciones inter e intra culturales que se dan en ese marco, teniendo en cuenta la incidencia de: las redes migratorias, las trayectorias migratorias y laborales, y la heterogeneidad de los capitales de los inmigrantes; la localización socio-espacial de los lugares de trabajo y de otros espacios de sociabilidad; y, las maneras en que diversos agentes reproducen o confrontan los estereotipos sobre los bolivianos. Se aplicará una estrategia de triangulación de métodos y de técnicas. Desde un enfoque cuantitativo analizaremos los aspectos socio-demográficos de la población de origen boliviano que reside en la ciudad de Córdoba, teniendo en cuenta su inserción laboral y ubicación socio-espacial en áreas urbanas y peri-urbanas. Se analizarán periódicos de edición provincial y aquellos editados por organizaciones de inmigrantes bolivianos en Córdoba y en Buenos Aires. Se caracterizarán las acciones y políticas destinadas a inmigrantes bolivianos. Se realizarán estudios etnográficos de casos en las áreas urbanas y peri-urbanas en donde residen y/o trabajan inmigrantes bolivianos. Se desarrollarán talleres destinados a inmigrantes bolivianos con el objetivo de reflexionar sobre sus derechos laborales y sus derechos como inmigrantes.Fil: Pizarro, Cynthia Alejandra. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencia Política y Relaciones Internacionales; ArgentinaFil: Fontana, Silvia Esther. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencia Política y Relaciones Internacionales; ArgentinaFil: Conrero, Sofía. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencia Política y Relaciones Internacionales; ArgentinaFil: Universidad Católica de Córdoba; Argentina

Enabling planetary science across light-years. Ariel Definition Study Report

Ariel, the Atmospheric Remote-sensing Infrared Exoplanet Large-survey, was adopted as the fourth medium-class mission in ESA's Cosmic Vision programme to be launched in 2029. During its 4-year mission, Ariel will study what exoplanets are made of, how they formed and how they evolve, by surveying a diverse sample of about 1000 extrasolar planets, simultaneously in visible and infrared wavelengths. It is the first mission dedicated to measuring the chemical composition and thermal structures of hundreds of transiting exoplanets, enabling planetary science far beyond the boundaries of the Solar System. The payload consists of an off-axis Cassegrain telescope (primary mirror 1100 mm x 730 mm ellipse) and two separate instruments (FGS and AIRS) covering simultaneously 0.5-7.8 micron spectral range. The satellite is best placed into an L2 orbit to maximise the thermal stability and the field of regard. The payload module is passively cooled via a series of V-Groove radiators; the detectors for the AIRS are the only items that require active cooling via an active Ne JT cooler. The Ariel payload is developed by a consortium of more than 50 institutes from 16 ESA countries, which include the UK, France, Italy, Belgium, Poland, Spain, Austria, Denmark, Ireland, Portugal, Czech Republic, Hungary, the Netherlands, Sweden, Norway, Estonia, and a NASA contribution