Algoritmos de minería de datos para el análisis del riesgo de desastre fitosanitario en el municipio Nueva Paz.

El desastre es función del proceso de riesgo y resultado de la combinación de amenazas, condiciones de vulnerabilidad e insuficiente capacidad o medidas para reducir las consecuencias negativas y potenciales del riesgo. Ante estas emergencias surgen estudios de peligro, vulnerabilidad y riesgos de desastres sanitarios que hoy en día juegan un rol muy importante para todos los sectores, tanto de la comunidad internacional como nacional. Esta temática de considerable interés constituye el objetivo de esta investigación que permite la gestión de los indicadores de riesgo de desastres fitosanitarios (epifitias) en el municipio Nueva Paz. Se realizó un estudio sobre las diferentes dimensiones que contemplan los algoritmos de minería de datos para el análisis del riesgo de desastre, definiéndose las tecnologías y metodologías a utilizar en conjunto con los algoritmos matemáticos y computacionales mediante técnicas de Minería de Datos implementadas a través de algoritmos matemáticos: Apriori, J48, BsyesNet, Ridor, Perceptrón Multicapa y SimpleKMeans para analizar la información y así descubrir tendencias y comportamientos de los datos y a su vez facilitar el proceso de toma de decisiones por parte de los especialistas del municipio Nueva Paz

SISTEMA INFORMÁTICO PARA EL ANÁLISIS DE LAS PERCEPCIONES SOCIOAMBIENTALES

En la medida en que crece la preocupación por mantener y mejorar la calidad del medio ambiente y proteger la salud humana, diversas instituciones se enfocan en el desarrollo de aplicaciones que satisfagan dichas necesidades. Siendo una de estas instituciones AMA (Agencia del Medio Ambiente) en conjunto con las diferentes dependencias del CITMA (Ciencia, Innovación, Tecnología y Medio Ambiente), donde  el objetivo de esta investigación fue desarrollar un sistema informático para el análisis de la percepción socio-ambiental de los Deslizamientos de tierra. Se realizó un estudio sobre las diferentes dimensiones que contempla la percepción socio-ambiental, definiéndose las tecnologías y metodologías a utilizar en conjunto con los algoritmos matemáticos y computacionales, se elaboró el software SIAPSADT 1.0 que permitió analizar de forma automática la información. Esta investigación resulta de gran importancia para facilitar el proceso de toma de decisiones por parte de los directivos de AMA y de los CITMA provinciales

Patogenicidad de hongos asociados a plantas de fresa (Fragaria ananassa) y descripción ultraestructural del patosistema

Introducción. La fresa es importante en Costa Rica por su alta demanda como fruta fresca y para elaboración de mermeladas. En 2015 empezaron reportes de muerte de plantas, presumiblemente, asociada a complejos de hongos habitantes del suelo. Los síntomas eran enrojecimiento y necrosis de hojas, coronas y raíces; luego, el desplome de las plantas. Con pérdidas hasta del 90% en plantaciones nuevas. Objetivo. Determinar la patogenicidad de hongos asociados a plantas de fresa enfermas y describir la micro morfología del patosistema. Materiales y métodos. Se colectaron plantas enfermas variedad Festival, y se realizaron aislamientos a partir de corona y raíz. Se clasificaron los morfotipos recuperados, se eligieron tres para secuenciación del espaciador interno transcrito del ADN nuclear ribosomal (nrDNA ITS por sus siglas en inglés) y ejecución de los Postulados de Koch, con 3,5 x 105 conidios/ml inoculados en gránulos de alfalfa. Las plantas se mantuvieron 19 semanas en ambiente protegido. Luego, se realizó el reaislamiento y la secuenciación de los hongos inoculados, y se describió el patosistema, por medio de microscopía electrónica de barrido. Resultados. Se obtuvieron diez aislamientos de hongos de corona y 22 de raíz, que se clasificaron en nueve morfotipos. Se eligieron tres, que, de acuerdo con el ITS, se ubicaron en las unidades taxonómicas operativas Fusarium oxysporum, Neonectria/Dactylonectria y Sydowia polyspora. Se registró 100% de incidencia en todas las plantas inoculadas y los síntomas coincidieron con los de campo, mientras que, el testigo permaneció sano. Los porcentajes de similitud de las secuencias de ITS de los hongos aislados de plantas enfermas, provenientes de campo y de los hongos recuperados de la prueba de patogenicidad, fueron > 99%. A nivel ultraestructural se observó que las raíces pierden la epidermis y son colonizadas por los hongos. Conclusión. Los hongos inoculados fueron patogénicos a plantas de fresa variedad Festival, tuvieron la capacidad de dañar la epidermis radical y multiplicarse internamente.Pathogenicity of fungi associated with strawberry plants (Fragaria ananassa) and ultrastructural description of the pathosystem. Introduction. Strawberries are important in Costa Rica due to their high demand as fresh fruit and for making jams. In 2015, reports of plant death began, presumably associated with soil-dwelling fungal complexes. The symptoms were redness and necrosis of leaves, crowns, and roots, then the collapse of the plants. With losses of up to 90% in new plantations. Objective. To determine the pathogenicity of fungi associated with diseased strawberry plants and to describe the micromorphology of the pathosystem. Materials and methods. Diseased Festival variety plants were collected, and isolations were made from crown and root. The recovered morphotypes were classified, three were chosen for sequencing of the internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA (nrDNA ITS) and execution of Koch’s Postulates, with 3.5 x 105conidia/ml inoculated in alfalfa granules. The plants were kept for 19 weeks in a protected environment. Then, reisolation and sequencing of the inoculated fungi was performed, and the pathosystem was described by means of scanning electron microscopy. Results. Ten isolates of crown and 22 root fungi were obtained, which were classified into 9 morphotypes. Three were chosen, which, according to the ITS, were in the operational taxonomic units Fusarium oxysporum, Neonectria/Dactylonectria and Sydowia polyspora. The 100% incidence was recorded in all the inoculated plants and the symptoms coincided with those in the field, while the control remained healthy. The similarity percentages of the ITS sequences of the fungi isolated from diseased plants, from the field, and of the fungi recovered from the pathogenicity test, were > 99%. At the ultrastructural level, it was observed that the roots lose the epidermis and are colonized by fungi. Conclusion. The inoculated fungi were pathogenic to Festival variety strawberry plants, they had the ability to damage the root epidermis and multiply internallyUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Estructuras Microscópicas (CIEMIC)UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigaciones en Productos Naturales (CIPRONA)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

Fungi associated with common bean (Phaseolus vulgaris) wilt in Costa Rica

En este trabajo se identifica por primera vez a nivel molecular en Costa Rica los patógenos asociados a la marchitez del frijol en las principales zonas de cultivo.Las pudriciones radicales limitan el rendimiento del frijol (Phaseolus vulgaris), y aunque en Costa Rica son frecuentes, la identidad de los hongos asociados a ellas es incierta. El objetivo de esta investigación fue identifcar molecularmente los hongos asociados a las pudriciones radicales y marchitez del frijol en las dos principales zonas productoras del país. Entre 2017 y 2020 se recolectaron 120 plantas en 20 fncas de las regiones Huetar Norte y Brunca. Se muestrearon líneas experimentales (IBC 302-29 y ALS 0536-6) y variedades comerciales (Brunca, Cabécar, Chánguena, Guaymí, Nambí y Tayní). Se describieron los síntomas observados en campo y se efectuaron aislamientos en agar agua rosa de bengala cloranfenicol, luego cultivos puros de punta de hifa en agar agua, que se trasfrieron a papa dextrosa agar para determinar morfotipos con el uso de claves taxonómicas. Los hongos aislados también se identifcaron mediante secuenciación de la región ITS del ADN nuclear ribosomal. Se calculó el porcentaje de frecuencia relativa de morfotipos. Los más frecuentes fueron Macrophomina phaseolina (26.7%), Fusarium oxysporum (13.6%) y Athelia rolfsii (5.6%). A partir de los síntomas de marchitez observados en campo se aislaron los hongos comúnmente descritos en frijol para esas patologías. Es necesario realizar pruebas de patogenicidad para confrmar que son los agentes causales.Fundación para el Fomento y Promoción de la Investigación y Transferencia de Tecnología Agropecuaria de Costa Rica (FITTACORI)UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Centro de Investigación en Protección de Cultivos (CIPROC)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Agroalimentarias::Facultad de Ciencias Agroalimentarias::Escuela de Agronomí

Evaluación comparativa de los parámetros reproductivos entre el método de auto inseminación cervical GEDIS y el tradicional en cerdas multíparas

The research was carried out in Ecuador, in the province of Tungurahua, Cevallos county. A comparison of reproductive parameters between the cervical selfinsemination method and the traditional one in multiparous sows was performed using 12 sows (hybrid females between the second and fourth calving), dividingIn two groups of 6 sows respectively, using the insemination protocol 12h - 24h - 36h. Fresh semen was prepared with long-term diluent + bidistilled water, at aconcentration of 3 x 109spermatozoa/mL in total volume per 100 mL straw. At the time of insemination the amount of seminal reflux was determined and whenthe Student's T test was applied with paired observations in the results, they statistically reported a significant difference at 5% among the evaluated methods, thecalculated T value was 9.50 Which is greater than the T of tables at 5% of 2.57. The duration of each method was determined, results that reported similaritybetween the two methods (15 min). At 21 days post insemination pregnancy was diagnosed by ultrasound and evaluation of no return of heat, results that reportedin both methods 100% effectiveness. Subsequently, at the time of delivery, the number of total born piglets was evaluated, using the Student's T-test with pairedobservations that statistically there was no significant difference at 5% between the two methods, the calculated T value was 0, 14 which is less than the T oftables at 5% of 2.57. We also determined the weight of piglets at birth, reported by Student's t-test with paired observations that there is a statistically significantdifference to 5% among the evaluated methods, the calculated T value was 5.17, which is higher than the T Of tables at 5% of 2.57. As for costs there is noconsiderable difference.La investigación se realizó en Ecuador, provincia de Tungurahua, cantón Cevallos, se evaluó comparativamente losparámetros reproductivos entre el método de auto inseminación cervical y el tradicional en cerdas multíparas, se utilizó12 cerdas (hembras híbridas entre el segundo y cuarto parto), dividiéndose en dos grupos de 6 cerdas respectivamente,utilizando el protocolo de inseminación 12h - 24h - 36 h. Se preparó semen fresco con diluyente de larga duración + aguabidestilada, a una concentración de 3 x 109 de espermatozoides/mL en volumen total por pajuela de 100 mL. Al momentode la inseminación se determinó la cantidad de reflujo seminal y al aplicar la prueba T de Student con observacionespareadas en los resultados, estos reportaron estadísticamente una diferencia significativa al 5% entre los métodos evaluados, el valor de T calculado fue 9.50 que es superior al T de tablas al 5% de 2.57. Se determinó el tiempo de duración decada método, resultados que reportaron similitud entre los dos métodos (15 min). A los 21 días post inseminación sediagnosticó preñez mediante ultrasonido y evaluación del no retorno de celo, resultados que reportaron en los dos métodos el 100% de efectividad. Posteriormente, al momento del parto se evaluó la cantidad de lechones nacidos totales,resultados que al utilizar la prueba T de Student con observaciones pareadas reportaron que estadísticamente no existediferencia significativa al 5% entre los dos métodos, el valor de T calculado fue 0.14 que es inferior al T de tablas al 5%de 2.57. También se determinó el peso de lechones al nacimiento, reportándose mediante la prueba T de Student conobservaciones pareadas que existe estadísticamente una diferencia significativa al 5% entre los métodos evaluados, elvalor de T calculado fue de 5.17, que es superior al T de tablas al 5% de 2.57. En cuanto a los costos no existe diferenciaconsiderable

Perspectivas de la enseñanza en educación infantil

PublishedEl presente escrito nace de las reflexiones de dos trabajos de investigación que giran alrededor de los temas de escritura y lectura en los universitarios y de la concepción de formación docente, vinculada a la idea de ensoñación desde Bachelard; a partir de ahí, se desarrolla una reflexión alrededor de la misma temática pero en la etapa inicial donde se tejen las estructuras fundamentales de los procesos de constitución del sujeto. En ambos trabajos el lenguaje y la didáctica hacen parte primordial del sustento de los mismos. En esas relaciones simbióticas entre sujeto, aprendizaje, didáctica y ensoñación se presenta el tema de la escritura en la búsqueda de generar una idea diferente a asumirla como proceso netamente instrumental, sino unirlo a formas diferentes de su abordaje; siendo la niñez una época de mayor apertura al aprendizaje, concebir la escritura desde estos lugares puede hacer la diferencia de mejorar los procesos escriturales en los años posteriores

Improvements in the electrochemical generation of arsine at gold electrodes as a sample introduction strategy for arsenic determination in well-water samples by atomic absorption spectrometry

The development and evaluation of a cathode consisting of a gold electrode covered by a polyaniline film, PANI/Au modified electrode, for electrochemical generation of arsine is described. The efficiency of arsine production using the new electrode was ascertained by comparison with corresponding hydride generation atomic absorption spectroscopy determinations of arsenic (As) in aqueous standards. The PANI/Au modified electrodes provide better sensitivity, accuracy and precision than the pure Au cathodes. The PANI/Au cathodes were prepared by controlled electrodeposition cycles of polyaniline films on top of Au electrodes. Cathodes obtained after 10 electrodeposition cycles showed the best performance, while the ones obtained after five voltammetry cycles produced films too thin and those obtained after 20 voltammetry cycles produced films too thick for the purpose of this work. Under optimised conditions, the As limit of detection in aqueous solutions, according to the (3σ) criterion, was 2.48 µg L−1. For accuracy determination, the modified electrode was applied to quantification of As(III) in acidified aqueous solutions of the certified standard reference material, NIST SRM 1643d, and in well-water samples containing possible interfering ions. Application of the Student’s t-test showed no significant difference between the expected and obtained results of the NIST SRM standard analysis at the 95% confidence level. Values for six replicate determinations of As(III) in the well-water samples showed close agreement with values obtained by analyses using hydride generation atomic absorption. Recoveries were in the range of 95–105% at test for acceptable accuracy in the analysis of real samples

Evaluación de electrodos de carbono vítreo modificados con bimetálicos Ag-Hg y Ag-Bi en la detección de Pb(II) en agua potable

En este trabajo se reporta la modificación de un electrodo de carbono vítreo (CV) con nanopartículas bimetálicas plata-mercurio (Ag-Hg) y plata-bismuto (Ag-Bi) y su evaluación en la cuantificación del Pb(II) en muestras de agua potable. La modificación de la superficie electródica con bimetálicos generó un aumento en el sobre-potencial de evolución de hidrógeno, lo que favorece la detección de metálicos a altos potenciales de reducción. Los bimetálicos fueron preparados de forma nano-estructurada mediante la asistencia de una plantilla de película de nafion. Para la detección de Pb(II) se utilizó la técnica de voltametría de redisolución anódica, lográndose límites de detección (LD) de 0,66 μg L-1 sobre el electrodo nano-estructurado AgBiNpNf/CV y 0,24 μg L-1 sobre el electrodo AgHgNpNf/CV. Los electrodos fueron evaluados en la cuantificación de Pb(II) en muestras de agua potable provenientes de la ciudad de Quito-Ecuador. Los porcentajes de recuperación (%R) en cinco determinaciones se encontraron entre 96% y 98%, indicando buena exactitud en el análisis de la muestra

Step‐by‐Step Pipeline for the Ecological Analysis of Endophytic Fungi using ITS nrDNA Data

The nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) is accepted as the genetic marker or barcode of choice for the identification of fungal samples. Here, we present a protocol to analyze fungal ITS data, from quality preprocessing of raw sequences to identification of operational taxonomic units (OTUs), taxonomic classification, and assignment of functional traits. The pipeline relies on well‐established and manually curated data collections, namely the UNITE database and the FUNGuild script. As an example, real ITS data from culturable endophytic fungi were analyzed, providing detailed descriptions for every step, parameter, and downstream analysis, and finishing with a phylogenetic analysis of the sequences and assigned ecological roles. This article constitutes a comprehensive guide for researchers that have little familiarity with bioinformatic analysis of essential steps required in further ecological studies of fungal communities. © 2020 by John Wiley & Sons, IncCentro Nacional de Alta Tecnología/[]/CeNAT/Costa RicaUniversidad de Costa Rica/[111-B7-176]/UCR/Costa RicaUniversidad de Costa Rica/[809‐B9‐662]/UCR/Costa RicaNational Sanitation Foundation/[DEB‐1638976]/NSF/Estados UnidosUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigaciones en Productos Naturales (CIPRONA)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

Análisis filogenético de secuencias ITS provenientes de hongos endófitos utilizando Inferencia Bayesiana Paralela de Árboles con Exabayes

Ecological studies of fungal communities have been favored thanks to the emergence and improvement of independent culture techniques that use the ITS region as a molecular marker. This has allowed a more accurate identification compared to traditional culture-dependent methods.Next-generation sequencing techniques have increased the amount of data available for the understanding of endophytic fungal communities. An important part of this process is the phylogenetic inference to decipher how the different taxa are related and interact, however, this may become one of the bioinformatic analysis that demands more time.In response to this, the bioinformatics along with high-performance computing offer solutions to accelerate and make more efficient the tools available for data processing through the implementation of supercomputers and the parallelization of toolsIn this study we carried out the processing of ITS sequences to then use the parallelization of Exabayes, software specialized in the analysis and creation of phylogenetic trees.Thanks to the use of this technique, it was possible to reduce the running time of Exabayes from more than 400 hours to 6 hours, which demonstrates the benefits of the use of high-performance computing platforms.Los estudios ecológicos de las comunidades fúngicas se han visto favorecidos gracias a la aparición y mejora de técnicas independientes de cultivo que utilizan la región ITS como marcador molecular. Esto ha permitido una identificación más precisa en comparación con los métodos tradicionales dependientes de la cultura.Las técnicas de secuenciación de próxima generación han aumentado la cantidad de datos disponibles para la comprensión de las comunidades de hongos endofíticos. Una parte importante de este proceso es la inferencia filogenética para descifrar cómo se relacionan e interactúan los diferentes taxones, sin embargo, este puede convertirse en uno de los análisis bioinformáticos que exige más tiempo.En respuesta a esto, la bioinformática junto con la informática de alto rendimiento ofrecen soluciones para acelerar y hacer más eficientes las herramientas disponibles para el procesamiento de datos a través de la implementación de supercomputadoras y la paralelización de herramientas.En este estudio llevamos a cabo el procesamiento de secuencias ITS para luego utilizar la paralelización de Exabayes, software especializado en el análisis y creación de árboles filogenéticos.Gracias al uso de esta técnica, fue posible reducir el tiempo de ejecución de Exabayes de más de 400 horas a 6 horas, lo que demuestra los beneficios del uso de plataformas informáticas de alto rendimiento