Gestión del riego en el Valle del Jerte

Comunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de ExtremaduraLa alta variabilidad en las condiciones edafoclimáticas que caracterizan la agricultura de montaña hace que el cálculo de las necesidades hídricas de los cultivos sea complicada. Los parámetros necesarios para estimar la evapotranspiración de referencia varían con la altitud, la orientación y las condiciones de viento provocando grandes diferencias en su cálculo entre puntos relativamente próximos. Por otra parte, el estado de desarrollo de las plantas, así como los marcos de plantación son también heterogéneos, más aún cuando las parcelas agrícolas son de pequeñas dimensiones y con diferente propiedad como es el caso del Valle del Jerte en la zona norte de Cáceres. En estas condiciones, la información proporcionada por las imágenes de satélites abre nuevas posibilidades para el ajuste de las estimaciones de necesidades hídricas a las condiciones de las parcelas, fundamentales para una gestión eficiente de los recursos hídricos. Objetivos: Aplicar herramientas geoestadísticas e imágenes satelitales, para ajustar las diferentes necesidades hídricas en del Valle del Jerte

Manejo del riego en grandes superficies de olivar en seto

El cultivo superintensivo revolucionó la olivicultura en los años 90 siendo un sistema apoyado en dos pilares básicos: alta densidad de plantación y casi total mecanización de las operaciones culturales. Desde entonces se ha extendido rápidamente por todo el Mundo. El riego es una herramienta fundamental para la rentabilidad de la mayor parte de estas plantaciones, sin embargo, existen cuestiones importantes que todavía no han sido resueltas de forma satisfactoria. Uno de los grandes retos es transferir el conocimiento disponible en cuanto a la gestión del riego empleando estrategias que mejoren la eficiencia en el uso del agua a explotaciones comerciales. En este estudio se evalúa los resultados obtenidos al aplicar en una parcela comercial una estrategia de riego deficitario controlado combinando medidas de estado hídrico en planta con técnicas de teledetección y mapeos de suelo para caracterizar el terreno sobre la productividad de la misma. El estudio se llevó a cabo durante 3 años (2015-2017) en un olivar comercial superintensivo variedad ‘Arbequina’ en plena producción localizado en Talavera la Real (Badajoz) en la Finca Explojoz. Se dispuso de una parcela Control regada según el criterio del técnico de la finca, comparada con otra parcela colindante en la que se estableció un riego deficitario controlado (parcela RDC) utilizando como referencia medidas de Potencial Hídrico del Tronco y señalando diferentes niveles de estrés en función del estado fenológico: brotación a endurecimiento de hueso de -1.2 MPa; de endurecimiento del hueso a envero de -2.0MPa; de envero a recolección -1.6 MPa. Dentro de cada parcela se identificaron 2 zonas de referencia una que se denominó "buena" y otra "mala" con características "a priori" diferentes. La selección de estas zonas se realizó empleando técnicas de teledetección y mapeo de suelos. Los resultados muestran que hubo diferencias de partida en las características de las dos parcelas de forma que en el primer año, con un mismo riego, la parcela Control tuvo más producción utilizando en ambas el mismo criterio de riego. Sin embargo, en los años sucesivos con una gestión diferenciada del riego, las producciones se igualaron e incluso se superaron en el caso de la parcela gestionada con un riego deficitario controlado adaptado a las características concretas de la parcela y consiguiendo equilibrar la productividad de la finca.Comunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de Extremadur

Interacting Multiple Try Algorithms with Different Proposal Distributions

We propose a new class of interacting Markov chain Monte Carlo (MCMC) algorithms designed for increasing the efficiency of a modified multiple-try Metropolis (MTM) algorithm. The extension with respect to the existing MCMC literature is twofold. The sampler proposed extends the basic MTM algorithm by allowing different proposal distributions in the multiple-try generation step. We exploit the structure of the MTM algorithm with different proposal distributions to naturally introduce an interacting MTM mechanism (IMTM) that expands the class of population Monte Carlo methods. We show the validity of the algorithm and discuss the choice of the selection weights and of the different proposals. We provide numerical studies which show that the new algorithm can perform better than the basic MTM algorithm and that the interaction mechanism allows the IMTM to efficiently explore the state space

Evaluación de imágenes satelitales para el estudio de la distribución térmica en una parcela comercial de olivar en seto

CComunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de ExtremaduraEl conocimiento por parte del técnico de las zonas de la parcela que están en mejor y peor estado hídrico, resulta fundamental a la hora de establecer correcciones en relación a las programaciones de riego. El uso de imágenes aéreas con cámaras térmicas permite determinar la temperatura de cultivo y determinar que zonas están en mejor y peor estado hídrico. En los últimos años las imágenes satelitales han provocado un salto importante en el manejo de cultivos. El objetivo de este trabajo es evaluar la información obtenida de los satélites Landsat 8 y Sentinel 2 para identificación de zonas con diferentes temperaturas de cultivo en olivar en seto y poder ser utilizados para identificar zonas con diferente estado hídrico. El ensayo se desarrolló en 2017 en una explotación comercial de olivar en seto (superintensivo) de la variedad Arbequina. Para el estudio se seleccionaron dos parcelas cada una de ellas en un sector diferente de riego; Parcela 1 con una superficie de 10 ha, con una estrategia de riego deficitario controlado sin pérdida de producción y Parcela 2 con una superficie de 5 ha, con una gestión de riego realizada por el técnico de la finca. Las imágenes satelitales permitieron identificar zonas con mayor y menor temperatura de cultivo de manera similar a la que se obtuvieron con las imágenes aéreas, aunque estas últimas permitieron identifica las zonas con mayor precisión. Los datos indican que la utilización de las imágenes satelitales pueden ser un buen indicador inicial de las diferencias de estado hídrico dentro de los diferentes sectores de la parcela, sin embargo, la baja resolución de los satélites que proporcionan imágenes térmicas, obliga a la utilización de bandas del infrarrojo lejano relacionadas con el contenido de agua en el cultivo y tamaño de cultivo y no con el térmico.Junta de Extremadura: Ayuda a grupos de investigación (AGA001 proyecto GR18196), INIA (RTA 2013-00045-C04-02), Proyecto FERTINNOWA financiado por EU H2020 y proyecto CCESAGROS, todos ellos cofinanciados con fondos FEDER

Enhanced wheat yield by biochar addition under different mineral fertilization levels

Climate change and global warming have worldwide adverse consequences. Biochar production and its use in agriculture can play a key role in climate change mitigation and help improve the quality and management of waste materials coming from agriculture and forestry. Biochar is a carbonaceous material obtained from thermal decomposition of residual biomass at relatively low temperature and under oxygen limited conditions (pyrolysis). Biochar is currently a subject of active research worldwide because it can constitute a viable option for sustainable agriculture due to its potential as a long-term sink for carbon in soil and benefits for crops. However, to date, the results of research studies on biochar effects on crop production show great variability, depending on the biochar type and experimental conditions. Therefore, it is important to identify the beneficial aspects of biochar addition to soil on crop yield in order to promote the adoption of this practice in agriculture. In this study, the effects of two types of biochar from agricultural wastes typical of Southern Spain: wheat straw and olive tree pruning, combined with different mineral fertilization levels on the growth and yield of wheat (Triticum durum L. cv. Vitron) were evaluated. Durum wheat was pot-grown for 2 months in a growth chamber on a soil collected from an agricultural field near Córdoba, Southern Spain. Soil properties and plant growth variables were studied in order to assess the agronomic efficiency of biochar. Our results show that biochar addition to a nutrientpoor, slightly acidic loamy sand soil had little effect on wheat yield in the absence of mineral fertilization. However, at the highest mineral fertilizer rate, addition of biochar led to about 20–30 % increase in grain yield compared with the use of the mineral fertilizer alone. Both biochars acted as a source of available P, which led to beneficial effects on crop production. In contrast, the addition of biochar resulted in decreases in available N and Mn. A maximum reduction in plant nutrient concentration of 25 and 80% compared to nonbiochar-treated soils for N and Mn, respectively, was detected. This fact was related to the own nature of biochar: low available nitrogen content, high adsorption capacity, and low mineralization rate for N; and alkaline pH and high carbonate content for Mn. Our results indicate that biochar-based soil management strategies can enhance wheat production with the environmental benefits of global warming mitigation. This can contribute positively to the viability and benefits of agricultural production systems. However, the nutrient–biochar interactions should receive special attention due to the great variability in the properties of biochar-type materials

Identification of Niemann-Pick C1 protein as a potential novel SARS-CoV-2 intracellular target

Niemann-Pick type C1 (NPC1) receptor is an endosomal membrane protein that regulates intracellular cholesterol traffic. This protein has been shown to play an important role for several viruses. It has been reported that SARS-CoV-2 enters the cell through plasma membrane fusion and/or endosomal entry upon availability of proteases. However, the whole process is not fully understood yet and additional viral/host factors might be required for viral fusion and subsequent viral replication. Here, we report a novel interaction between the SARS-CoV-2 nucleoprotein (N) and the cholesterol transporter NPC1. Furthermore, we have found that some compounds reported to interact with NPC1, carbazole SC816 and sulfides SC198 and SC073, were able to reduce SARS-CoV-2 viral infection with a good selectivity index in human cell infection models. These findings suggest the importance of NPC1 for SARS-CoV-2 viral infection and a new possible potential therapeutic target to fight against COVID-19

Linfangioma lingual: caso clínico

Los linfangiomas son masas de mayor o menor extensión, de origen controvertido. Son malformaciones congénitas del sistema linfático, poco frecuentes, que distintos autores consideran de carácter neoplásico, hamartomatoso o de displasia congénita. Afectan piel o mucosas, así como tejidos subcutáneos o submucosos, en cualquier localización. Se clasifican en superficiales (circunscritos) y profundos (cavernosos, higromas, quísticos), en base a su asiento y al tamaño de las formaciones vasculares linfáticas

Bioinformatics analysis of mutations in SARSCoV- 2 and clinical phenotypes

1 p.-1 fig.-8 tab.Background: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), initially reported in Wuhan (China) hasspread worldwide. Like other viruses, SARS-CoV-2 accumulates mutations with each cycle of replication by continuously evolving a viral strain with one or more single nucleotide variants (SNVs). However, SNVs that cause severe COVID-19 or lead to immune escape or vaccine failure are not well understood. We aim to identify SNVs associated with severe clinical phenotypes.Methods: In this study, 27429 whole-genome aligned consensus sequences of SARS-CoV-2 were collected from genomic epidemiology of SARS-CoV-2 project in Spain (SeqCOVID) [1]. These samples were obtained from patients who required hospitalization and/or intensive care unit admission (ICU), excluding those registered in the first pandemic wave.Besides, 248 SARS-CoV-2 genomes were isolated from COVID-19 hospitalized patients from Gregorio Marañon General University Hospital (GMH) of which 142 were fully vaccinated. Bioinformatics tools using R and Python programming languages were developed and implemented comparing those to SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 (reference genome).Results: Using a selection threshold mutational frequency 10%, 27 SNVs were expected to have association with hospitalization and ICU risk. The reference haplotype differing at the SNV coding for lysine at the residue 203 (N:R203K) was found to have negative association with COVID-19 hospitalization risk (p = 5.37 x 10-04). Similarly, a negative association was observed when the residue at 501 is replaced by tyrosine (S:N501Y) (p = 1.33 x 10-02). The application of a Chi-square test suggested that SNV-haplotypes coding for mutants residues such as (S:A222V, N:A220V, ORF10:V30L) and (ORF1a:T1001I, ORF1a:I2230T, S:N501Y, S:T716S, S:S982A, ORF8:Q27*, N:R203K, N:S235F) have negative associations with COVID-19 hospitalization risk (p = 6.58 x 10-07 and p = 2.27 x 10-16, respectively) and COVID-19 ICU risk (p = 1.15 x 10-02 and p = 2.51 x 10-02, respectively). Focusing on the SNV-haplotype coding the mutations (S:A222V, N:A220V, N:D377Y, ORF10:V30L) were observed to increase the risk of COVID-19 hospitalization (p = 2.71 x 10-04). Results from SARS-CoV-2 genomes analysis from GMH showed 63 coding SNVs which met the established threshold value. Applying a Chi-square test, the SNV-haplotype carrying coding variants for mutant residues in 5 ORF proteins and surface and membrane glycoprotein and nucleocapsid phosphoprotein was significantly associated with vaccine failure in hospitalized COVID-19 patients (p = 7.91 x 10-04).Conclusions: SNV-haplotypes carrying variants lead to non-synonymous mutations located along SARS-CoV-2 wholeproteome may influence COVID-19 severity and vaccine failure suggesting a functional role in the clinical outcome for COVID-19 patients.This research work was funded by the European Commission-NextGenerationEU (Regulation EU 2020/2094), through CSIC’s Global Health Platform (PTI Salud Global)Peer reviewe