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Gestión del riego en el Valle del Jerte
Comunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de ExtremaduraLa alta variabilidad en las condiciones edafoclimáticas que caracterizan la agricultura de montaña hace que el cálculo de las necesidades hídricas de los cultivos sea complicada. Los parámetros necesarios para estimar la evapotranspiración de referencia varían con la altitud, la orientación y las condiciones de viento provocando grandes diferencias en su cálculo entre puntos relativamente próximos. Por otra parte, el estado de desarrollo de las plantas, así como los marcos de plantación son también heterogéneos, más aún cuando las parcelas agrícolas son de pequeñas dimensiones y con diferente propiedad como es el caso del Valle del Jerte en la zona norte de Cáceres. En estas condiciones, la información proporcionada por las imágenes de satélites abre nuevas posibilidades para el ajuste de las estimaciones de necesidades hídricas a las condiciones de las parcelas, fundamentales para una gestión eficiente de los recursos hídricos. Objetivos: Aplicar herramientas geoestadísticas e imágenes satelitales, para ajustar las diferentes necesidades hídricas en del Valle del Jerte
Manejo del riego en grandes superficies de olivar en seto
El cultivo superintensivo revolucionó la olivicultura en los años 90 siendo un sistema apoyado en dos pilares básicos: alta densidad de plantación y casi total mecanización de las operaciones culturales. Desde entonces se ha extendido rápidamente por todo el Mundo. El riego es una herramienta fundamental para la rentabilidad de la mayor parte de estas plantaciones, sin embargo, existen cuestiones importantes que todavía no han sido resueltas de forma satisfactoria. Uno de los grandes retos es transferir el conocimiento disponible en cuanto a la gestión del riego empleando estrategias que mejoren la eficiencia en el uso del agua a explotaciones comerciales. En este estudio se evalúa los resultados obtenidos al aplicar en una parcela comercial una estrategia de riego deficitario controlado combinando medidas de estado hídrico en planta con técnicas de teledetección y mapeos de suelo para caracterizar el terreno sobre la productividad de la misma.
El estudio se llevó a cabo durante 3 años (2015-2017) en un olivar comercial superintensivo variedad ‘Arbequina’ en plena producción localizado en Talavera la Real (Badajoz) en la Finca Explojoz. Se dispuso de una parcela Control regada según el criterio del técnico de la finca, comparada con otra parcela colindante en la que se estableció un riego deficitario controlado (parcela RDC) utilizando como referencia medidas de Potencial Hídrico del Tronco y señalando diferentes niveles de estrés en función del estado fenológico: brotación a endurecimiento de hueso de -1.2 MPa; de endurecimiento del hueso a envero de -2.0MPa; de envero a recolección -1.6 MPa. Dentro de cada parcela se identificaron 2 zonas de referencia una que se denominó "buena" y otra "mala" con características "a priori" diferentes. La selección de estas zonas se realizó empleando técnicas de teledetección y mapeo de suelos.
Los resultados muestran que hubo diferencias de partida en las características de las dos parcelas de forma que en el primer año, con un mismo riego, la parcela Control tuvo más producción utilizando en ambas el mismo criterio de riego. Sin embargo, en los años sucesivos con una gestión diferenciada del riego, las producciones se igualaron e incluso se superaron en el caso de la parcela gestionada con un riego deficitario controlado adaptado a las características concretas de la parcela y consiguiendo equilibrar la productividad de la finca.Comunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de Extremadur
Interacting Multiple Try Algorithms with Different Proposal Distributions
We propose a new class of interacting Markov chain Monte Carlo (MCMC)
algorithms designed for increasing the efficiency of a modified multiple-try
Metropolis (MTM) algorithm. The extension with respect to the existing MCMC
literature is twofold. The sampler proposed extends the basic MTM algorithm by
allowing different proposal distributions in the multiple-try generation step.
We exploit the structure of the MTM algorithm with different proposal
distributions to naturally introduce an interacting MTM mechanism (IMTM) that
expands the class of population Monte Carlo methods. We show the validity of
the algorithm and discuss the choice of the selection weights and of the
different proposals. We provide numerical studies which show that the new
algorithm can perform better than the basic MTM algorithm and that the
interaction mechanism allows the IMTM to efficiently explore the state space
Evaluación de imágenes satelitales para el estudio de la distribución térmica en una parcela comercial de olivar en seto
CComunicación presentada al XXXVII Congreso Nacional de Riegos, celebrado en Don Benito del 4 al 6 de Junio de 2019 y organizada por la Asociación Española de Riegos y Drenajes y la Universidad de ExtremaduraEl conocimiento por parte del técnico de las zonas de la parcela que están en mejor y peor estado hídrico, resulta fundamental a la hora de establecer correcciones en relación a las programaciones de riego. El uso de imágenes aéreas con cámaras térmicas permite determinar la temperatura de cultivo y determinar que zonas están en mejor y peor estado hídrico. En los últimos años las imágenes satelitales han provocado un salto importante en el manejo de cultivos. El objetivo de este trabajo es evaluar la información obtenida de los satélites Landsat 8 y Sentinel 2 para identificación de zonas con diferentes temperaturas de cultivo en olivar en seto y poder ser utilizados para identificar zonas con diferente estado hídrico. El ensayo se desarrolló en 2017 en una explotación comercial de olivar en seto (superintensivo) de la variedad Arbequina. Para el estudio se seleccionaron dos parcelas cada una de ellas en un sector diferente de riego; Parcela 1 con una superficie de 10 ha, con una estrategia de riego deficitario controlado sin pérdida de producción y Parcela 2 con una superficie de 5 ha, con una gestión de riego realizada por el técnico de la finca. Las imágenes satelitales permitieron identificar zonas con mayor y menor temperatura de cultivo de manera similar a la que se obtuvieron con las imágenes aéreas, aunque estas últimas permitieron identifica las zonas con mayor precisión. Los datos indican que la utilización de las imágenes satelitales pueden ser un buen indicador inicial de las diferencias de estado hídrico dentro de los diferentes sectores de la parcela, sin embargo, la baja resolución de los satélites que proporcionan imágenes térmicas, obliga a la utilización de bandas del infrarrojo lejano relacionadas con el contenido de agua en el cultivo y tamaño de cultivo y no con el térmico.Junta de Extremadura: Ayuda a grupos de investigación (AGA001 proyecto GR18196), INIA (RTA 2013-00045-C04-02), Proyecto FERTINNOWA financiado por EU H2020 y proyecto CCESAGROS, todos ellos cofinanciados con fondos FEDER
Unlocking the puzzle: non-defining mutations in SARS-CoV-2 proteome may affect vaccine effectiveness
IntroductionSARS-CoV-2 variants are defined by specific genome-wide mutations compared to the Wuhan genome. However, non-clade-defining mutations may also impact protein structure and function, potentially leading to reduced vaccine effectiveness. Our objective is to identify mutations across the entire viral genome rather than focus on individual mutations that may be associated with vaccine failure and to examine the physicochemical properties of the resulting amino acid changes.Materials and methodsWhole-genome consensus sequences of SARS-CoV-2 from COVID-19 patients were retrieved from the GISAID database. Analysis focused on Dataset_1 (7,154 genomes from Italy) and Dataset_2 (8,819 sequences from Spain). Bioinformatic tools identified amino acid changes resulting from codon mutations with frequencies of 10% or higher, and sequences were organized into sets based on identical amino acid combinations.ResultsNon-defining mutations in SARS-CoV-2 genomes belonging to clades 21 L (Omicron), 22B/22E (Omicron), 22F/23A (Omicron) and 21J (Delta) were associated with vaccine failure. Four sets of sequences from Dataset_1 were significantly linked to low vaccine coverage: one from clade 21L with mutations L3201F (ORF1a), A27- (S) and G30- (N); two sets shared by clades 22B and 22E with changes A27- (S), I68- (S), R346T (S) and G30- (N); and one set shared by clades 22F and 23A containing changes A27- (S), F486P (S) and G30- (N). Booster doses showed a slight improvement in protection against Omicron clades. Regarding 21J (Delta) two sets of sequences from Dataset_2 exhibited the combination of non-clade mutations P2046L (ORF1a), P2287S (ORF1a), L829I (ORF1b), T95I (S), Y145H (S), R158- (S) and Q9L (N), that was associated with vaccine failure.DiscussionVaccine coverage associations appear to be influenced by the mutations harbored by marketed vaccines. An analysis of the physicochemical properties of amino acid revealed that primarily hydrophobic and polar amino acid substitutions occurred. Our results suggest that non-defining mutations across the proteome of SARS-CoV-2 variants could affect the extent of protection of the COVID-19 vaccine. In addition, alteration of the physicochemical characteristics of viral amino acids could potentially disrupt protein structure or function or both
Enhanced wheat yield by biochar addition under different mineral fertilization levels
Climate change and global warming have worldwide
adverse consequences. Biochar production and its use in
agriculture can play a key role in climate change mitigation
and help improve the quality and management of waste materials
coming from agriculture and forestry. Biochar is a carbonaceous
material obtained from thermal decomposition of
residual biomass at relatively low temperature and under
oxygen limited conditions (pyrolysis). Biochar is currently a
subject of active research worldwide because it can constitute
a viable option for sustainable agriculture due to its potential
as a long-term sink for carbon in soil and benefits for crops.
However, to date, the results of research studies on biochar
effects on crop production show great variability, depending
on the biochar type and experimental conditions. Therefore, it
is important to identify the beneficial aspects of biochar addition
to soil on crop yield in order to promote the adoption of
this practice in agriculture. In this study, the effects of two
types of biochar from agricultural wastes typical of Southern
Spain: wheat straw and olive tree pruning, combined with
different mineral fertilization levels on the growth and yield
of wheat (Triticum durum L. cv. Vitron) were evaluated.
Durum wheat was pot-grown for 2 months in a growth chamber
on a soil collected from an agricultural field near Córdoba,
Southern Spain. Soil properties and plant growth variables
were studied in order to assess the agronomic efficiency of
biochar. Our results show that biochar addition to a nutrientpoor,
slightly acidic loamy sand soil had little effect on wheat
yield in the absence of mineral fertilization. However, at the
highest mineral fertilizer rate, addition of biochar led to about
20–30 % increase in grain yield compared with the use of the
mineral fertilizer alone. Both biochars acted as a source of
available P, which led to beneficial effects on crop production.
In contrast, the addition of biochar resulted in decreases in
available N and Mn. A maximum reduction in plant nutrient
concentration of 25 and 80% compared to nonbiochar-treated
soils for N and Mn, respectively, was detected. This fact was
related to the own nature of biochar: low available nitrogen
content, high adsorption capacity, and low mineralization rate
for N; and alkaline pH and high carbonate content for Mn. Our
results indicate that biochar-based soil management strategies
can enhance wheat production with the environmental benefits
of global warming mitigation. This can contribute positively
to the viability and benefits of agricultural production
systems. However, the nutrient–biochar interactions should
receive special attention due to the great variability in the
properties of biochar-type materials
Identification of Niemann-Pick C1 protein as a potential novel SARS-CoV-2 intracellular target
Niemann-Pick type C1 (NPC1) receptor is an endosomal membrane protein that regulates intracellular cholesterol traffic. This protein has been shown to play an important role for several viruses. It has been reported that SARS-CoV-2 enters the cell through plasma membrane fusion and/or endosomal entry upon availability of proteases. However, the whole process is not fully understood yet and additional viral/host factors might be required for viral fusion and subsequent viral replication. Here, we report a novel interaction between the SARS-CoV-2 nucleoprotein (N) and the cholesterol transporter NPC1. Furthermore, we have found that some compounds reported to interact with NPC1, carbazole SC816 and sulfides SC198 and SC073, were able to reduce SARS-CoV-2 viral infection with a good selectivity index in human cell infection models. These findings suggest the importance of NPC1 for SARS-CoV-2 viral infection and a new possible potential therapeutic target to fight against COVID-19
Linfangioma lingual: caso clínico
Los linfangiomas son masas de mayor o menor extensión, de origen controvertido. Son malformaciones congénitas del sistema linfático, poco frecuentes, que distintos autores consideran de carácter neoplásico, hamartomatoso o de displasia congénita. Afectan piel o mucosas, así como tejidos subcutáneos o submucosos, en cualquier localización. Se clasifican en superficiales (circunscritos) y profundos (cavernosos, higromas, quísticos), en base a su asiento y al tamaño de las formaciones vasculares linfáticas
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