157 research outputs found

    Modelling the head and neck region for microwave imaging of cervical lymph nodes

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    Tese de mestrado integrado, Engenharia Biomédica e Biofísica (Radiações em Diagnóstico e Terapia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020O termo “cancro da cabeça e pescoço” refere-se a um qualquer tipo de cancro com início nas células epiteliais das cavidades oral e nasal, seios perinasais, glândulas salivares, faringe e laringe. Estes tumores malignos apresentaram, em 2018, uma incidência mundial de cerca de 887.659 novos casos e taxa de mortalidade superior a 51%. Aproximadamente 80% dos novos casos diagnosticados nesse ano revelaram a proliferação de células cancerígenas dos tumores para outras regiões do corpo através dos vasos sanguíneos e linfáticos das redondezas. De forma a determinar o estado de desenvolvimento do cancro e as terapias a serem seguidas, é fundamental a avaliação dos primeiros gânglios linfáticos que recebem a drenagem do tumor primário – os gânglios sentinela – e que, por isso, apresentam maior probabilidade de se tornarem os primeiros alvos das células tumorais. Gânglios sentinela saudáveis implicam uma menor probabilidade de surgirem metástases, isto é, novos focos tumorais decorrentes da disseminação do cancro para outros órgãos. O procedimento standard que permite o diagnóstico dos gânglios linfáticos cervicais, gânglios que se encontram na região da cabeça e pescoço, e o estadiamento do cancro consiste na remoção cirúrgica destes gânglios e subsequente histopatologia. Para além de ser um procedimento invasivo, a excisão cirúrgica dos gânglios linfáticos representa perigos tanto para a saúde mental e física dos pacientes, como para a sua qualidade de vida. Dores, aparência física deformada (devido a cicatrizes), perda da fala ou da capacidade de deglutição são algumas das repercussões que poderão advir da remoção de gânglios linfáticos da região da cabeça e pescoço. Adicionalmente, o risco de infeção e linfedema – acumulação de linfa nos tecidos intersticiais – aumenta significativamente com a remoção de uma grande quantidade de gânglios linfáticos saudáveis. Também os encargos para os sistemas de saúde são elevados devido à necessidade de monitorização destes pacientes e subsequentes terapias e cuidados associados à morbilidade, como é o caso da drenagem linfática manual e da fisioterapia. O desenvolvimento de novas tecnologias de imagem da cabeça e pescoço requer o uso de modelos realistas que simulem o comportamento e propriedades dos tecidos biológicos. A imagem médica por micro-ondas é uma técnica promissora e não invasiva que utiliza radiação não ionizante, isto é, sinais com frequências na gama das micro-ondas cujo comportamento depende do contraste dielétrico entre os diferentes tecidos atravessados, pelo que é possível identificar regiões ou estruturas de interesse e, consequentemente, complementar o diagnóstico. No entanto, devido às suas características, este tipo de modalidade apenas poderá ser utilizado para a avaliação de regiões anatómicas pouco profundas. Estudos indicam que os gânglios linfáticos com células tumorais possuem propriedades dielétricas distintas dos gânglios linfáticos saudáveis. Por esta razão e juntamente pelo facto da sua localização pouco profunda, consideramos que os gânglios linfáticos da região da cabeça e pescoço constituem um excelente candidato para a utilização de imagem médica por radar na frequência das micro-ondas como ferramenta de diagnóstico. Até à data, não foram efetuados estudos de desenvolvimento de modelos da região da cabeça e pescoço focados em representar realisticamente os gânglios linfáticos cervicais. Por este motivo, este projeto consistiu no desenvolvimento de dois geradores de fantomas tridimensionais da região da cabeça e pescoço – um gerador de fantomas numéricos simples (gerador I) e um gerador de fantomas numéricos mais complexos e anatomicamente realistas, que foi derivado de imagens de ressonância magnética e que inclui as propriedades dielétricas realistas dos tecidos biológicos (gerador II). Ambos os geradores permitem obter fantomas com diferentes níveis de complexidade e assim acompanhar diferentes fases no processo de desenvolvimento de equipamentos médicos de imagiologia por micro-ondas. Todos os fantomas gerados, e principalmente os fantomas anatomicamente realistas, poderão ser mais tarde impressos a três dimensões. O processo de construção do gerador I compreendeu a modelação da região da cabeça e pescoço em concordância com a anatomia humana e distribuição dos principais tecidos, e a criação de uma interface para a personalização dos modelos (por exemplo, a inclusão ou remoção de alguns tecidos é dependente do propósito para o qual cada modelo é gerado). O estudo minucioso desta região levou à inclusão de tecidos ósseos, musculares e adiposos, pele e gânglios linfáticos nos modelos. Apesar destes fantomas serem bastante simples, são essenciais para o início do processo de desenvolvimento de dispositivos de imagem médica por micro-ondas dedicados ao diagnóstico dos gânglios linfáticos cervicais. O processo de construção do gerador II foi fracionado em 3 grandes etapas devido ao seu elevado grau de complexidade. A primeira etapa consistiu na criação de uma pipeline que permitiu o processamento das imagens de ressonância magnética. Esta pipeline incluiu: a normalização dos dados, a subtração do background com recurso a máscaras binárias manualmente construídas, o tratamento das imagens através do uso de filtros lineares (como por exemplo, filtros passa-baixo ideal, Gaussiano e Butterworth) e não-lineares (por exemplo, o filtro mediana), e o uso de algoritmos não supervisionados de machine learning para a segmentação dos vários tecidos biológicos presentes na região cervical, tais como o K-means, Agglomerative Hierarchical Clustering, DBSCAN e BIRCH. Visto que cada algoritmo não supervisionado de machine learning anteriormente referido requer diferentes hiperparâmetros, é necessário proceder a um estudo pormenorizado que permita a compreensão do modo de funcionamento de cada algoritmo individualmente e a sua interação / performance com o tipo de dados tratados neste projeto (isto é, dados de exames de ressonâncias magnéticas) com vista a escolher empiricamente o leque de valores de cada hiperparâmetro que deve ser considerado, e ainda as combinações que devem ser testadas. Após esta fase, segue-se a avaliação da combinação de hiperparâmetros que resulta na melhor segmentação das estruturas anatómicas. Para esta avaliação são consideradas duas metodologias que foram combinadas: a utilização de métricas que permitam avaliar a qualidade do clustering (como por exemplo, o Silhoeutte Coefficient, o índice de Davies-Bouldin e o índice de Calinski-Harabasz) e ainda a inspeção visual. A segunda etapa foi dedicada à introdução manual de algumas estruturas, como a pele e os gânglios linfáticos, que não foram segmentadas pelos algoritmos de machine learning devido à sua fina espessura e pequena dimensão, respetivamente. Finalmente, a última etapa consistiu na atribuição das propriedades dielétricas, para uma frequência pré-definida, aos tecidos biológicos através do Modelo de Cole-Cole de quatro pólos. Tal como no gerador I, foi criada uma interface que permitiu ao utilizador decidir que características pretende incluir no fantoma, tais como: os tecidos a incluir (tecido adiposo, tecido muscular, pele e / ou gânglios linfáticos), relativamente aos gânglios linfáticos o utilizador poderá ainda determinar o seu número, dimensões, localização em níveis e estado clínico (saudável ou metastizado) e finalmente, o valor de frequência para o qual pretende obter as propriedades dielétricas (permitividade relativa e condutividade) de cada tecido biológico. Este projeto resultou no desenvolvimento de um gerador de modelos realistas da região da cabeça e pescoço com foco nos gânglios linfáticos cervicais, que permite a inserção de tecidos biológicos, tais como o tecidos muscular e adiposo, pele e gânglios linfáticos e aos quais atribui as propriedades dielétricas para uma determinada frequência na gama de micro-ondas. Estes modelos computacionais resultantes do gerador II, e que poderão ser mais tarde impressos em 3D, podem vir a ter grande impacto no processo de desenvolvimento de dispositivos médicos de imagem por micro-ondas que visam diagnosticar gânglios linfáticos cervicais, e consequentemente, contribuir para um processo não invasivo de estadiamento do cancro da cabeça e pescoço.Head and neck cancer is a broad term referring to any epithelial malignancies arising in the paranasal sinuses, nasal and oral cavities, salivary glands, pharynx, and larynx. In 2018, approximately 80% of the newly diagnosed head and neck cancer cases resulted in tumour cells spreading to neighbouring lymph and blood vessels. In order to determine cancer staging and decide which follow-up exams and therapy to follow, physicians excise and assess the Lymph Nodes (LNs) closest to the primary site of the head and neck tumour – the sentinel nodes – which are the ones with highest probability of being targeted by cancer cells. The standard procedure to diagnose the Cervical Lymph Nodes (CLNs), i.e. lymph nodes within the head and neck region, and determine the cancer staging frequently involves their surgical removal and subsequent histopathology. Besides being invasive, the removal of the lymph nodes also has negative impact on patients’ quality of life, it can be health threatening, and it is costly to healthcare systems due to the patients’ needs for follow-up treatments/cares. Anatomically realistic phantoms are required to develop novel technologies tailored to image head and neck regions. Medical MicroWave Imaging (MWI) is a promising non-invasive approach which uses non-ionizing radiation to screen shallow body regions, therefore cervical lymph nodes are excellent candidates to this imaging modality. In this project, a three-dimensional (3D) numerical phantom generator (generator I) and a Magnetic Resonance Imaging (MRI)-derived anthropomorphic phantom generator (generator II) of the head and neck region were developed to create phantoms with different levels of complexity and realism, which can be later 3D printed to test medical MWI devices. The process of designing the numerical phantom generator included the modelling of the head and neck regions according to their anatomy and the distribution of their main tissues, and the creation of an interface which allowed the users to personalise the model (e.g. include or remove certain tissues, depending on the purpose of each generated model). To build the anthropomorphic phantom generator, the modelling process included the creation of a pipeline of data processing steps to be applied to MRIs of the head and neck, followed by the development of algorithms to introduce additional tissues to the models, such as skin and lymph nodes, and finally, the assignment of the dielectric properties to the biological tissues. Similarly, this generator allowed users to decide the features they wish to include in the phantoms. This project resulted in the creation of a generator of 3D anatomically realistic head and neck phantoms which allows the inclusion of biological tissues such as skin, muscle tissue, adipose tissue, and LNs, and assigns state-of-the-art dielectric properties to the tissues. These phantoms may have a great impact in the development process of MWI devices aimed at screening and diagnosing CLNs, and consequently, contribute to a non-invasive staging of the head and neck cancer

    Community-based aquaculture: using local ingredients for tilapia diets

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    The United Nations’ Sustainable Development Goal (SDG) 2 was developed in an endeavour to end world hunger as well as to achieve food security and improved nutrition by 2030. In developing countries, especially in Sub-Saharan Africa, food insecurity is probably still the biggest threat that comes with poverty. Aquaculture has been proposed to undermine this problem, as it has the potential to provide animal protein to low-income communities, without the need to further explore natural resources. The concept of community-based aquaculture is especially interesting as it involves local communities in the animal production process, creating not only a source of food but also a source of income, improving the livelihoods of those involved. Tilapia (Oreochromis spp.), referred by the International Development Agencies as “aquatic chicken”, is a great candidate species to be used in this context as it is an extremely robust fish, adaptable to a wide range of culture conditions. For community-based aquaculture to be sustainable, it is important that the ingredients used in diet formulation are readily accessible to farmers and have also low environmental impact. Therefore, the aim of this study was to formulate a diet mainly based on local ingredients commonly found in Mozambican household and agricultural waste. This diet was used in Nile tilapia juveniles and its effect on growth performance, feed utilization and nutrient balances was evaluated and compared to those obtained using a typical commercial formulation. The results show that inclusion of local ingredients does not significantly impair growth neither feed utilization in Nile tilapia juveniles. Moreover, higher retention values of phosphorous and nitrogen obtained from this diet, suggest that this formulation is more environmental friendly than the commercial formulations.Em 2015, a Organização das Nações Unidas definiu um conjunto de objetivos de forma a promover o desenvolvimento sustentável. De entre estes, destaca-se o objetivo 2, que pretende terminar com a fome, a insegurança alimentar e a malnutrição até 2030. Em muitas áreas do mundo, de entre as quais se salienta a África subsaariana, a insegurança alimentar é ainda uma das mais sérias ameaças que vem com a fome, e com o ano 2030 a aproximar-se a um ritmo galopante, é imperativo que se desenvolvam soluções que sejam viáveis a longo prazo e que perdurem mesmo após o término dos projetos de promoção ao desenvolvimento das comunidades menos afortunadas. Sendo a aquacultura a indústria de produção animal com um maior crescimento nos últimos anos, esta tem sido sistematicamente sugerida como uma possível fonte de proteína animal suplementar, de modo a garantir a subsistência destas populações. Contudo, a sustentabilidade, quer económica quer ambiental, deverá ser priorizada aquando da implementação da aquacultura nos países menos desenvolvidos. Para tal, a formulação das dietas é de maior importância, de forma a garantir o crescimento dos indivíduos bem como minimizar as perdas de fósforo e compostos azotados para o ambiente, minorando assim o impacto ambiental. A aquacultura praticada em comunidade tem também o potencial de desenvolver a economia das mesmas, criando postos de trabalho e gerando rendimento suplementar que pode subsequentemente ser usado para adquirir outros géneros alimentares e não só, promovendo assim uma melhoria na qualidade de vida. A aquacultura desenvolvida em contexto comunitário recorre ao uso de tanques de terra e de recursos como restos alimentares e das atividades agrícola e pecuária, que são utilizados para alimentar os peixes e consequentemente como fertilizante, para promover a produtividade primária do tanque, reduzindo assim a necessidade de inputs alimentares externos. A tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) tem alto potencial para ser utilizada neste contexto de produção, uma vez que é uma espécie muito resiliente e que se encontra num nível baixo da cadeia trófica. A sua fácil manutenção em cativeiro, valeu à espécie a designação de “galinha aquática”, vulgarmente empregue pelas agências de desenvolvimento. Apesar do seu indubitável potencial, a aquacultura em comunidade tem ficado aquém das suas promessas, principalmente em zonas como a África subsaariana. Isto deve-se, em grande parte, a iniciativas levadas a cabo por organizações, governamentais ou não, com o objetivo de promover e estabelecer a aquacultura como um setor económico próspero nas mesmas áreas. Contudo, estas iniciativas têm-se baseado maioritariamente em incentivos monetários, desacreditando a formação contínua dos aquacultores, que uma vez findas as campanhas de promoção ao desenvolvimento se sentem incapazes de fazer face às despesas e às dificuldades que encontram, acabando assim por abandonar o seu ofício em detrimento de outro mais lucrativo. Muitas das vezes os aquacultores dependem de rações comerciais que podem constituir mais de 60% do total de custos operacionais. A eliminação ou minimização dos conteúdos de farinha e óleo de peixe nas dietas são de maior importância para reduzir os custos de produção, mas também para assegurar uma maior sustentabilidade das dietas. Muitas alternativas têm sido testadas, com resultados promissores, desde fontes alternativas de proteína vegetal, resíduos de produção da pecuária e aquacultura e também ingredientes alternativos como a farinha de inseto, os subprodutos da produção de bebidas alcoólicas e da pecuária, entre outros. O objetivo deste estudo foi, desta forma, formular uma dieta à base de alimentos locais de Moçambique, como a mandioca, o milho, o amendoim, e feijões. Esta dieta experimental continha um teor mínimo de farinha de peixe, para garantir a aceitação do alimento. Esta dieta foi testada em juvenis de tilápia do Nilo, durante um período de 57 dias. Os parâmetros utilizados para avaliar o potencial da dieta foram a performance de crescimento, a utilização do alimento, bem como os balanços de fósforo e azoto. Para tal determinaram-se parâmetros como o aumento de peso, o índice de ingestão voluntária, o índice de conversão alimentar, o índice de eficiência proteica, os índices hepatossomático e viscerossomático, bem como o fator de condição. A composição corporal dos indivíduos foi determinada para obter os teores de matéria seca e cinzas, bem como os teores brutos de proteína, lípidos, energia e fósforo. A retenção de energia, proteína, lípidos e fósforo foram calculadas como a percentagem de ingestão de cada componente. Por último foram também calculados os balanços de fósforo e azoto com base na ingestão, ganho e perda dos mesmos. Os resultados foram comparados com os obtidos em indivíduos mantidos durante o mesmo período de tempo e em condições análogas, mas alimentados com uma dieta seguindo uma típica formulação comercial. As diferenças estatísticas entre os resultados foram calculadas através de um teste t, utilizando o software SPSS. Os resultados mostram um menor crescimento dos indivíduos alimentados com a dieta experimental, o que pode estar relacionado com o menor teor de proteína presente nesta dieta. Relativamente à utilização do alimento, não foram encontradas diferenças na taxa de alimentação voluntária, o que sugere que a palatabilidade da dieta é adequada. Já a taxa de conversão de alimento foi superior para os indivíduos do grupo experimental, revelando uma menor eficiência na utilização do mesmo. Contudo, os valores registados neste estudo estão dentro da faixa de valores referidos na literatura para a tilápia do Nilo. A dieta experimental promoveu uma maior deposição de gordura na carcaça, o que pode ser devido à presença de ingredientes com alto teor energético como o amendoim e o milho. Por último, a dieta experimental promoveu a retenção de fósforo e compostos azotados, minorando a perda dos mesmos. Num contexto de cultivo em tanques de terra, esta é uma característica muito importante, pois permite evitar a eutrofização dos corpos de água que para além de comportarem a produção de peixe irrigam também os solos agrícolas circundantes. O baixo impacto ambiental da dieta experimental aliado à sua relação custo-benefício, fazem desta uma alternativa ideal para promover a aquacultura de espécies de baixo nível na cadeia trófica, como a tilápia do Nilo

    Determinantes do consumo de pescado fresco: comportamentos, atitudes e motivações dos consumidores

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    Portugal surge como um dos países europeus com taxas mais elevadas de consumo de pescado fresco. No entanto, do ponto de vista comportamental, pouco se conhece acerca dos fatores que determinam o seu consumo. Assim, com esta investigação pretendemos identificar comportamentos, atitudes e motivações dos consumidores no que respeita ao consumo de pescado fresco. Pretendemos chegar a estas informações combinando métodos de investigação qualitativos e quantitativos que permitirão construir perfis de consumidores e respetivos pescados bem como mapear o processo de tomada de decisão identificando os principais atributos valorizados na compra ao mesmo tempo que avaliamos atitudes ao aplicar o Modelo de Dissonância Cognitiva

    Satisfaction and perceived usefulness of a boxing group exercise class at the Parkinson Patient Association

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    Poster apresentado no Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Doenças do Movimento (SPDMov), Curia, 15-16 de Março 2019N/

    The profile of people with Parkinson’s disease included in community boxing exercise programs

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    Communication abstract: Proceedings of the 5th International Congress of CiiEM - Reducing inequalities in Health and Society, held at Egas Moniz’ University Campus in Monte de Caparica, Almada, from June 16th to 18th, 2021.This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.Exercise is widely recommended for people with Parkinson (PD). Boxing is a popular mode of training. However, including individuals with less favorable profiles may have a negative impact on participation. We performed a systematic review to study the patient characteristics that were included in boxing exercise programs research and reflect on the possible inclusion criteria that professionals can use for boxing exercise programs. Indications for the best profiles were limited due to the small number of studies. Boxing programs should include people with the diagnosis of PD in earlier stages, independently ambulatory, and without current severe musculoskeletal or cardiovascular conditions.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Social exclusion in public policies and the micropolitics of an association founded by migrants

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    The theme of social exclusion has gained visibility in recent years through political discourse. This paper problematises the issue of social exclusion by analysing the hegemonic discourse in public policies and the alternative discourse grounded on the policies of an association, a civil society organization, facilitated by migrants and their descendants. The analysis is the result of a participatory research study based on the collection of documentation and semi-structured interviews. The hegemonic discourse on social exclusion was analysed through empirical data from the perspective of those who inhabit and/or intervene in a neighbourhood that is the object of public policies targeting the so-called \u27excluded\u27. Several paradoxes were identified between the social exclusion discourses conveyed in public policies and in the micropolitics of this association. The discourse, goals and working methods that characterise the micropolitics of the association contribute to the emergence of new forms of singularisation, through adult education initiatives. (DIPF/Orig.

    Popular education in an association. Expert by experience and work in tandem

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    The aim of this paper is to analyse the dynamics of popular education in the Associação Cultural Moinho da Juventude focusing on the expert by experience and the work in tandem. The expert by experience is someone who has personal life experience of poverty and social exclusion and who has also undergone specific training in these areas. The work in tandem is a work methodology involving two individuals and grounded on the complementarity of knowledge. The empirical data was collected using participatory action research. In conceptual terms, the paper is framed by critical theory and popular education. The research findings point to diversified and continuing popular education dynamics in the initiatives of this association, managed by residents in several interdependent areas (social, cultural, urbanistic, educational, etc) across a long time period. Its practices are geared towards emancipation and the construction of a more just world, with less inequality. Popular education has contributed both to the qualification and the promotion of the power to act of the experts by experience who take action in the neighbourhood, in tandem, in various areas of intervention. (DIPF/Orig.

    Whey protein supplementation in the elderly

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    Poster presented at the 3rd International Congress of CiiEM - Research and Innovation in Human and Health Sciences. Campus Egas Moniz, Monte da Caparica, Portugal, 20-22 June 2018N/

    Validação de um método de HPLC para análise de conteúdo em comprimidos

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    Mestrado em BioquimicaO presente trabalho descreve o desenvolvimento e validação de um método analítico para análise de conteúdo de substância activa em comprimidos revestidos de Blue025 (formulação final a ser comercializada). O método foi desenvolvido tomando como ponto de partida as condições definidas pelo fabricante da substância activa, sendo que a melhor separação de todos os componentes da amostra foi conseguida com uma coluna Zorbax SB-Phenyl, 3.5μm, 150 x 4.6mm e recorrendo a um programa de gradiente de duas fases móveis, com um fluxo constante e igual a 1.0 ml/min. A validação do método foi realizada de acordo com as diretrizes ICH. Foram realizados testes de filtração, seletividade, linearidade, rigor, precisão, robustez e estabilidade. Após os testes de filtração verificou-se que para a preparação das amostras deve ser utilizada a centrifugação a 4000rpm durante 10min. Não foi observada interferência de qualquer constituinte da amostra na análise de Blue025, pelo que ficou demonstrado tratar-se de um método seletivo. O método apresenta uma resposta linear para uma gama de concentrações de 60% a 140% (100% concentração de Blue025 de 0.2mg/ml), tanto para as soluções padrão como para as amostras de fórmula reconstituída. Os testes de rigor demonstraram que o método é rigoroso e através da avaliação da precisão do sistema verificou-se que o sistema cromatográfico usado para a análise é preciso na aplicação do método analítico. Tanto as soluções padrão como as amostras apresentaram uma estabilidade de pelo menos 48h nas condições ambiente. O método demonstrou ser robusto para volumes de injeção de 5μL e 15μL, para fluxos de 0.8ml/min. e para temperaturas da coluna de 36ºC e 44ºC. Neste sentido, o método definido para avaliação do conteúdo de substância ativa em comprimidos revestidos de Blue025 está adequado para a finalidade a que foi proposto, e portanto é válido para a referida análise.This work describes the development and validation of an analytical method defined to be used for the evaluation of assay of drug substance in Blue025 film-coated tablets (final formulation to be marketed). The method was developed using the conditions set by drug substance manufacturer as a starting point, and the best separation of all components of the sample was achieved with a Zorbax SB-Phenyl, 3.5μm, 150×4.6mm column and using a program gradient of two mobile phases with a constant flow of 1.0ml/min. The method validation was performed according to ICH guidelines. Filtration, selectivity, linearity, accuracy, precision, robustness and stability tests were performed. Filtration tests showed that centrifugation at 4000rpm for 10min. should be used for the samples preparation. There was no interference of any constituent of the sample in Blue025 analysis, demonstrating that the method is selective. The method shows a linear response for a range of concentrations from 60% to 140% (100% concentration of Blue025 of 0.2mg/ml) for standard solutions and for reconstituted formula samples. The accuracy tests demonstrated that the method is rigorous and the evaluation of the system precision showed that the chromatographic system used is accurate applying the analytical method. Standard solutions and reconstituted formula samples are stable at least 48 hours at room conditions. The method proved to be robust for injection volumes of 5μL and 15μL, flow of 0.8mL/min. and for column temperatures of 36ºC and 44ºC. In this sense, the method defined for the assay evaluation of the drug substance in Blue025 film-coated tablets complies with its purpose and therefore is valid for the referred analysis
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