Comportamiento termomecánico de pilotes prefabricados

This thesis follows the development of the PITERM project (Thermo-mechanical characterization and new design techniques of geothermal piles) within the Spanish INNPACTO 2011 program, a public-private cooperation funded by our Ministry of Science and Innovation. This project was the first to aim at a fully integrated analysis of the combined effect of mechanical and thermal actions upon a newly designed precast pile, thermally activated and fully instrumented. The project started in September 2011 and lasted until December 2013. The overall goal of this project was to analyse the behaviour of thermo-active foundations in order to further develop-relevant design methodologies for these elements, to be validated by experimental data By means of this combined analytic-experimental effort, we aim to validate the idea that foundations, designed appropriately, are able to cope with the thermal and mechanical stresses to which they ought to be subjected throughout its lifespan. More specifically, the project has studied the thermomechanical behaviour of a prefabricated pile driven in Valencia, prepared to work as thermo-active element and properly instrumented. With the registration and interpretation of data from the instrumented it was possible to evaluate its behaviour under mechanical and thermal stresses similar to those that would exist in a real working scenario. The results of this Thesis allow to understand and characterize the mechanical behaviour of geo-active piles and their response under different types of thermal cycling stresses under realistic conditions, contributing to the extension and dissemination of the use of this type of geo-structural elements, and, in the long run, aiming to increase our ability to harvest renewable heat out of the subsurface of our cities.La presente tesis doctoral es consecuencia del desarrollo del proyecto PITERM (Caracterización termo-mecánica y nuevas técnicas de diseño de pilotes termo-activos), dentro del subprograma INNPACTO 2011, del programa nacional de cooperación público-privada del Ministerio de Ciencia e Innovación. Este proyecto ha sido el primero que ha integrado en el análisis el efecto combinado de las acciones mecánicas, geotécnicas y térmicas en el comportamiento de un pilote prefabricado hincado, activado térmicamente y completamente instrumentado. El proyecto se inició en septiembre de 2011 y se prolongó hasta diciembre de 2013. El proyecto se orienta hacia el análisis del comportamiento de las cimentaciones termo-activas, el desarrollo de metodologías de diseño de estos elementos, en particular de los pilotes termoactivos, y su validación mediante datos experimentales. El objetivo de este trabajo es validar, mediante una aproximación analítico-experimental, que los elementos objeto de estudio son capaces de hacer frente a las solicitaciones térmicas y mecánicas a las que se verá sometida a lo largo de su vida útil. Más concretamente, en el proyecto se ha estudiado el comportamiento termo-mecánico de un pilote prefabricado y posteriormente hincado en Valencia, preparado para funcionar como elemento termoactivo, debidamente instrumentado. Con el registro e interpretación de los datos de las variables instrumentadas se ha evaluado el comportamiento del pilote sometido a solicitaciones mecánicas y térmicas semejantes a las que lo estaría en una obra real de edificación con aprovechamiento geotérmico. Los resultados de esta tesis permiten entender y caracterizar el comportamiento mecánico de los pilotes y su respuesta ante diferentes solicitaciones térmicas en condiciones similares a las que tendrían en un edificio real. En este sentido, pretende ser una contribución a la extensión y popularización del uso de estos elementos en aras a aumentar nuestra capacidad de captar energía renovable del subsuelo de nuestras ciudades.El present TESIS doctoral es conseqüència del desenrola del projecte PITERM (Caracterització termo-mecànic i noves tècniques de disseny de pilotes termo-actius), dins del SUBPROGRAMA INNPACTO 2011, del programa nacional de cooperació publica-privada del Ministeri de Ciència i Innovació. Este projecte ha segut el primer que ha integrat en la anàlisis l'efecte combinat de les accions mecàniques, geotécnicas i tèrmiques en el comportament d'un pilote prefabricat estacionat, activat tèrmicament i completament instrumentat. El projecte s'inicià en setembre de 2011 i se prolongà fins desembre de 2013. El projecte s'orienta cap al anàlisis del comportament de les fonamentacions termo-actives, el desenrola de metodologies de disseny d'estos elements, en particular dels pilotes termoactivos, i la seua validació mediant senyes experimentals. L'objectiu d'este treball es validar, mediant una aproximació analítica-experimental, que els elements objecte d'estudi son capaços de fer front a les sol¿licitacions tèrmiques i mecàniques a les que se vorà somes a lo llars de la seua vida útil. Mes concretament, en el projecte s'ha estudiat el comportament termo-mecànic d'un pilote prefabricat i posteriorment estacionat en Valencia, preparat per a funcionar com element termoactivo, degudament instrumentat. En el registre i interpretació de les senyes de les variables instrumentades s'ha valorat el comportament del pilote somes a sol¿licitacions mecàniques i tèrmiques semblants a les que ho estaria en una obra real d'edificació en aprofitament geotèrmic. Els resultats d'esta tesis permeten entendre i caracteritzar el comportament mecànic dels pilotes i la seua resposta davant diferents sol¿licitacions tèrmiques en condicions similars a les que tindrien en un edifici real. En este sentit, pretén ser una contribució a l'extensió i popularització de l'ús d'estos elements en ares a augmentar nostra capacitat de captar energia renovellable del subsòl de nostres ciutats.Groot Viana, MD. (2017). Comportamiento termomecánico de pilotes prefabricados [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/89097TESI

Arqueología de San Agustín: Alto de Lavapatas

Arqueologia de San Agustin: Alto de Lavapatas El libro "Arqueología de San Agustín: Alto de Lavapatas" de Luis Duque G. y Julio César Cubillos publicado por la Fundación de Investigaciones Arqueológicas Nacionales del Banco de la República es de singular importancia para el conocimiento de la cultura arqueológica agustiniana. Una vez más los autores de esta obra enriquecen con el rigor científico de sus investigaciones la visión sobre el pasado prehispánicos en el Alto Magdalena, en particular de la región de San Agustín e Isnos

Buritaca-200: Una fecha de radiocarbono asociada con objetos de orfebrería tairona

El material que a continuación se presenta, forma parte del Proyecto de Investigación Arqueológica y de Protección del sitio Buritaca-200 iniciado en el año de 1976 por el Instituto Colombiano de Antropología, subdivisión de Colcultura. Corresponde a una fase de trabajo de campo desarrollada entre octubre de 1976 y diciembre de 1977. En él se hace referencia a la composición cultural del sitio de vivienda en el cual se registraron los objetos de orfebrería.

Intento de delimitación del territorio de los grupos étnicos Pastos y Quillacingas en el altiplaño Nariñense

Hasta hace pocos años el conocimiento que se tenía sobre el poblamiento precolombino de la región andina del departamento de Nariño era limitado y disímil. Se contaba con estudios dispersos sobre temas históricos, geográficos y aun arqueológicos pero que no presentaban una visión regional articulada, en la cual se pudiera enmarcar cronológica y espacialmente la cultura  material de los grupos étnicos que habitaron esta región antes y en el momento de la conquista española.Existían descripciones de hallazgos arqueológicos ocasionales, como aquellos ilustrados por investigadores como Sergio Elías Ortiz (1934, 1938, 1958, 1960), Wenceslao  Cabrera (1962) y José Pérez de Barradas (1941), los cuales daban señas del valioso patrimonio  arqueológico de este territorio. Patrimonio cultural, que con el transcurso de los años estaba  siendo destruido por buscadores de tesoros, quienes en los comienzos de la década de los  setenta intensificaron sus actividades y surtieron de objetos precolombinos el mercado  clandesto de los mismos. Se efectuaron hallazgos sorprendentes y valiosos que atrajeron el  interés de estudiosos en la materia.  El Instituto Colombiano de Antropología designó varias comisiones de arqueólogos, quienes  efectuaron trabajos de emergencia en el municipio de Pupiales

Excavaciones arqueológicas en el municipio de Nemocón

La investigación arqueológica que había proyectado realizar en la salina de Nemocón según la propuesta que presenté a la Fundación, debió ser modificada en los comienzos del proceso de trabajo, por motivos que en este informe se presentan.El hallazgo de una estación a cielo abierto relacionado con la presencia de cazadores y recolectores, llamó mi atención, por las posibilidades que ofrecía para complementar la historia del poblamiento prehispánico de la región de Nemocón.Una vez evaluado el potencial de este sitio arqueológico, y frente a un inminente riesgo de que fuera alterado, tomé la decisión de realizar allí una excavación sistemática en área.El trabajo de campo se realizó en dos temporadas; una de dos semanas en la salina y alrededores de Nemocón, y otra, de tres meses en el sitio Checua 1, con la participación de estudiantes de Antropología de la Universidad Nacional.El avance de investigación que aquí se presenta corresponde a esta fase de trabajo, cuya descripción general a continuación se desarrolla.

Chromosome-level assemblies from diverse clades reveal limited structural and gene content variation in the genome of Candida glabrata

Background Candida glabrata is an opportunistic yeast pathogen thought to have a large genetic and phenotypic diversity and a highly plastic genome. However, the lack of chromosome-level genome assemblies representing this diversity limits our ability to accurately establish how chromosomal structure and gene content vary across strains. Results Here, we expanded publicly available assemblies by using long-read sequencing technologies in twelve diverse strains, obtaining a final set of twenty-one chromosome-level genomes spanning the known C. glabrata diversity. Using comparative approaches, we inferred variation in chromosome structure and determined the pan-genome, including an analysis of the adhesin gene repertoire. Our analysis uncovered four new adhesin orthogroups and inferred a rich ancestral adhesion repertoire, which was subsequently shaped through a still ongoing process of gene loss, gene duplication, and gene conversion. Conclusions C. glabrata has a largely stable pan-genome except for a highly variable subset of genes encoding cell wall-associated functions. Adhesin repertoire was established for each strain and showed variability among clades.TG group acknowledges support from the Spanish Ministry of Science and Innovation (MCIN) for grant PGC2018-099921-B-I00, cofounded by European Regional Development Fund (ERDF); from the Catalan Research Agency (AGAUR) SGR423; from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme (ERC-2016-724173); from the Gordon and Betty Moore Foundation (Grant GBMF9742); from the “La Caixa” foundation (Grant LCF/PR/HR21/00737), and from the Instituto de Salud Carlos III (IMPACT Grant IMP/00019 and CIBERINFEC CB21/13/00061- ISCIII-SGEFI/ERDF). PWJG acknowledges support by grants SBPLY/19/180501/000114 and SBPLY/19/180501/000356 funded by the Regional government of Castilla-La Mancha and grants SAF2013-47570-P and PID2020-117983RB-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and by ERDF a way of making Europe.Peer ReviewedPostprint (author's final draft

Virulence of Candida Auris from Different Clinical Origins in Caenorhabditis Elegans and Galleria Mellonella Host Models

Candida auris is an emerging multidrug-resistant fungal pathogen responsible for nosocomial outbreaks of invasive candidiasis. Although several studies on the pathogenicity of this species have been reported, the knowledge on C. auris virulence is still limited. This study aims to analyze the pathogenicity of C. auris, using one aggregating isolate and eleven non-aggregating isolates from different clinical origins (blood, urine and oropharyngeal specimens) in two alternative host models of candidiasis: Caenorhabditis elegans and Galleria mellonella. Furthermore, possible associations between virulence, aggregation, biofilm-forming capacity, and clinical origin were assessed. The aggregating phenotype isolate was less virulent in both in vivo invertebrate infection models than non-aggregating isolates but showed higher capacity to form biofilms. Blood isolates were significantly more virulent than those isolated from urine and respiratory specimens in the G. mellonella model of candidiasis. We conclude that both models of candidiasis present pros and cons but prove useful to evaluate the virulence of C. auris in vivo. Both models also evidence the heterogeneity in virulence that this species can develop, which may be influenced by the aggregative phenotype and clinical origin.This work was supported by the Euskal Herriko Unibertsitatea [PIF 16/39]; Euskal Herriko Unibertsitatea [PIF17/167]; Eusko Jaurlaritza [GIC15/78 IT-990-16]; Ministerio de Economia y Competitividad [SAF2017-86188-P]

High Biofilm Formation of Non-Smooth Candida parapsilosis Correlates with Increased Incorporation of GPI-Modified Wall Adhesins

Candida parapsilosis is among the most frequent causes of candidiasis. Clinical isolates of this species show large variations in colony morphotype, ranging from round and smooth to a variety of non-smooth irregular colony shapes. A non-smooth appearance is related to increased formation of pseudohyphae, higher capacity to form biofilms on abiotic surfaces, and invading agar. Here, we present a comprehensive study of the cell wall proteome of C. parapsilosis reference strain CDC317 and seven clinical isolates under planktonic and sessile conditions. This analysis resulted in the identification of 40 wall proteins, most of them homologs of known Candida albicans cell wall proteins, such as Gas, Crh, Bgl2, Cht2, Ecm33, Sap, Sod, Plb, Pir, Pga30, Pga59, and adhesin family members. Comparative analysis of exponentially growing and stationary phase planktonic cultures of CDC317 at 30 °C and 37 °C revealed only minor variations. However, comparison of smooth isolates to non-smooth isolates with high biofilm formation capacity showed an increase in abundance and diversity of putative wall adhesins from Als, Iff/Hyr, and Hwp families in the latter. This difference depended more strongly on strain phenotype than on the growth conditions, as it was observed in planktonic as well as biofilm cells. Thus, in the set of isolates analyzed, the high biofilm formation capacity of non-smooth C. parapsilosis isolates with elongated cellular phenotypes correlates with the increased surface expression of putative wall adhesins in accordance with their proposed cellular function.This work was funded by grants from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (MINECO) (SAF2013-47570-P and SAF2017-86188-P) and the regional government of Castilla-La Mancha (JCCM) (SBPLY/19/180501/000114), all co-financed by the EU (FEDER), to P.W.J.d.G. and E.E., the Consejería de Educación, Universidades e Investigación (GIC15/78 IT-990-16) of Gobierno Vasco-Eusko Jaurlaritza to E.E., and the FP7-PEOPLE-2013-ITN—Marie-Curie Action: “Initial Training Networks”: Molecular Mechanisms of Human Fungal Pathogen Host Interaction, ImResFun, MC-ITN-606786, to O.B

Candida duobushaemulonii: An Old But Unreported Pathogen

Candidiasis caused by species of the Candida haemulonii complex (Candida haemulonii and Candida duobushaemulonii) and closely related species, Candida auris and Candida pseudohaemulonii are increasing. These species often show reduced susceptibility to antifungal drugs, such as azoles and amphotericin B or, less frequently, echinocandins. However, conventional phenotypic identification methods are unable to accurately differentiate these species and, therefore, their prevalence may have been underestimated. In this study, 150 isolates that were probably misidentified were reanalyzed using two novel PCR approaches. We found that one isolate previously identified in 1996 as Candida intermedia was C. duobushaemulonii, being one of the oldest isolates of this species described to date. We also found that this isolate had reduced susceptibility to fluconazole, itraconazole, and amphotericin B.This research was funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (MINECO) [SAF2017-86188-P] and from the Consejería de Educación, Universidades e Investigación of Gobierno Vasco-Eusko Jaurlaritza [GIC15/78 IT-990-16]. C.M.-A. is recipient of a research grant from the program Reina Letizia para la inclusión of the Real Patronato de Discapacidad

Susceptibilidad genética y riesgo de cáncer gástrico en una población del Cauca.

Gastric cancer (GC) is the main cause of mortality by cancer in Colombia. Glutathione S-transferase (GST) enzymes are involved in the detoxification of many environmental carcinogens. The homozygous deletions of glutathione S-transferase M1 (GSTM1-0) and glutathione S-transferase T1 (GSTT1-0) have been associated with several types of cancer. The risk to develop GC has been associated with environmental factors and Helicobacter pylori infection. The tumor necrosis factor (TNF-alpha) and its levels are increased in patients infected with H. pylori. A G/ A transition in the position -308 of the promoter of the TNF-alpha has been related in several studies to an increased expression of the gene and is associated with susceptibility to GC. The association of these polymorphisms with GC and the interaction with other risk factors (life style) were investigated. Blood samples were obtained from 46 GC patients and 96 controls. The logistic regression model was used to obtain the odds ratio (OR) and their 95% confidence intervals. These statistics established the association between the enzymatic polymorphisms and GC and between other independent factors and GC. The frequency of the TNF-alpha polymorphism in people infected with H. pylori was 18% in the GC population and 7% in the control group. This transition was not significantly associated with H. pylori infection and GC. The frequencies of the deletion polymorphisms for patients and controls were as follows: GSTM1 65.2% and 37.5%; GSTT1 17.4% and 14.6%. These results suggested that the GSTM1 deletion polymorphism was associated with an increased risk of gastric cancer (OR of 5.5; 95%CI, 1.7-17.2). Furthermore, other risk factors such as H. pylori infection (OR 5.58, CI 1.8-17.2), smoking (OR 6.70, CI 2.2-20.3) and alcohol intake (OR 3.27, CI 1.1-9.4) were associated with GC.El cáncer gástrico es la principal causa de mortalidad por cáncer en Colombia. El riesgo de desarrollar cáncer gástrico se ha asociado con factores ambientales y con la infección por Helicobacter pylori. Las enzimas glutatión-S-transferasas están involucradas en la desintoxicación de varios carcinógenos ambientales. Las deleciones homocigóticas de glutatión-S-transferasa M1 (GSTM1-0) y glutatión-S-transferasa T1 (GSTT1-0) se han asociado con algunos tipos de cáncer. Los niveles del factor de necrosis tumoral (FNT ?) están aumentados en pacientes infectados por H. pylori. Una transición G/A en la posición -308 del promotor del FNT-? se ha visto relacionada en algunos estudios con un incremento en la expresión del gen, y está asociada con la susceptibilidad a cáncer gástrico. Se investigó la asociación de estos polimorfismos con cáncer gástrico y la interacción con otros factores de riesgo (estilo de vida). Se obtuvieron muestras de sangre de 46 pacientes con cáncer gástrico y 96 controles. Se empleó el modelo de regresión logística para obtener la razón de posibilidades (OR) y sus intervalos de confianza del 95% y, así, establecer la asociación entre los polimorfismos enzimáticos y el cáncer gástrico, y entre otros factores independientes y esta enfermedad. Las frecuencias de los polimorfismos de deleción en pacientes y controles fueron: para la GSTM1, 65,2% y 37,5%, y para la GSTT1, 17,4% y 14,6%, respectivamente. La frecuencia del polimorfismo G/A del FNT ? en las personas infectadas con H. pylori fue de 18% en la población con cáncer gástrico y de 7% en el grupo control. Nuestros resultados sugieren que el polimorfismo de deleción de GSTM1 puede estar asociado con un riesgo aumentado de cáncer gástrico (OR 5,5; IC95%, 1,7-17,2). Igualmente, nuestros datos muestran que otros factores de riesgo como la infección por H. pylori y el consumo de cigarrillo y alcohol están asociados con este tipo de cáncer (OR 5,58; IC95% 1,81-17,19; OR 6,70; IC95%, 2,20-20,30 y OR 3,27; IC95% 1,14-9,4, respectivamente)