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    Benthic communities in shipwrecks along the portuguese continental coast

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    Dissertação de mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2016Os naufrágios representam provavelmente o tipo de recife artificial mais conspícuo. Além do impacto nos ecossistemas e biodiversidade locais, constituem sítios de mergulho muito populares por todo o mundo. O impacto que naufrágios podem ter na indústria do mergulho é imenso. No geral, recifes artificiais são estruturas feitas pelo Homem que podem assumir várias formas, desde barcos a cubos de betão feitos propositadamente para serem afundados no mar. Em diferentes áreas, recifes artificiais têm funções diferentes, entre as quais gestão das pescas, prevenir a pesca de arrasto, compensação de perda de habitat e proteger habitats costeiros. Os recifes artificiais podem ter impactos positivos ou negativos nos ecossistemas. Consequências entre as quais mudanças no hidrodinamismo da área, alterações nas distribuições de sedimento e nas comunidades biológicas podem ser positivas ou não. Esta tese representa o primeiro registo das comunidades bentónicas dos naufrágios na costa Portuguesa. Escolheram-se quarto naufrágios, um na costa oeste (Sesimbra) e três na costa sul (em Sagres, Portimão e Tavira): River Gurara, Torvore, Oliveira e Carmo e Titan. Por cada naufrágio amostraram-se também recifes rochosos locais, de modo a comparar as comunidades em cada tipo de recife: natural e artificial. Os objectivos principais deste projecto foram registar pela primeira vez as comunidades que habitam os naufrágios e criar uma base de dados disponível online, acessível a qualquer pessoa, que possa ser consultada e actualizada em estudos futuros sobre colonização de recifes artificiais. As hipóteses a testar foram: 1) Os naufrágios têm comunidades bentónicas diferentes uns dos outros e estas diferenças deverão estar relacionadas com os diferentes estados de colonização dos naufrágios devido às diferentes idades; 2) A biodiversidade deve aumentar com a idade do naufrágio, devido aos estados de colonização mais avançados; 3) Naufrágios com mais de oito anos (idade baseada num estudo prévio) devem apresentar comunidades semelhantes às dos recifes rochosos locais; 4) As partes intactas dos naufrágios devem possuir mais biodiversidade que as partes fragmentadas; 5) Os lados dos naufrágios mais expostos às correntes devem possuir mais biodiversidade que os lados mais protegidos; 6) Superfícies verticais nos naufrágios devem possuir mais biodiversidade que as superficies horizontais, devido à taxa de sedimentação mais elevada nas superficies horizontais que acaba por sufocar organismos filtradores. O registo das comunidades bentónicas foi feito usando video-transectos em mergulho. Um estudo preliminar feito num dos naufrágios indicou que era necessário realizar no mínimo três transectos para amostrar a diversidade dos recifes , embora tenham sido feitos mais transectos em alguns locais de estudo. No total foram feitos 16 transectos nos quarto naufrágios, seis num, quarto noutro e três nos dois restantes. Cada recife natural foi amostrado com três transectos. Os dados foram divididos em duas bases de dados: uma com a densidade de organismos (número de invidíduos por metro quatrado) e a outra com percentagem de cobertura de animais incrustantes e algas. As hipóteses foram testadas através de análises de variâncias multivariadas (PERMANOVA). Os resultados significativos foram analisados recorrendo a NMDS e análises SIMPER. No geral, as análises de densidades mostraram resultados mais claros do que as análises de percentagem de cobertura. Os naufrágios da costa portuguesa aqui analisados têm na maioria dos casos comunidades bentónicas semelhantes. Os únicos significativamente diferentes foram o River Gurara e o Oliveira e Carmo. Estas diferenças estão provavelmente relacionadas com as diferentes idades dos naufrágios. Naufrágios podem ser habitats semelhantes a ilhas, em que a biodiversidade aumenta durante os primeiros anos até ao máximo possível dado o ambiente local. A partir deste ponto a colonização de novas espécies continua a acontecer, mas através de um equilíbrio dinâmico no qual algumas espécies se extinguem enquanto novas espécies aparecem. Factores como distúrbios físicos, relacionados com pesca de arrasto por exemplo, também podem contribuir para uma atenuação das diferenças entre o resto dos barcos. Em alguns dos casos, os naufrágios têm comunidades semelhantes às dos recifes naturais da área. No geral, 40% da biodiversidade dos naufrágios não está presente nos recifes naturais locais, o que permite explorar a hipótese de que naufrágios são habitats disponíveis para serem colonizados por espécies que não ocorrem nos recifes naturais locais, levando a um aumento de biodiversidade local. Naufrágios mais antigos têm comunidades mais semelhantes às naturais. Comparativamente, o naufrágio mais antigo (99 anos) tem 44% de espécies em comum com o recife rochoso amostrado, enquanto o naufrágio mais recente (4 anos) só tem 20% em comum com o recife natural. Na maioria dos casos, os testes mostraram diferenças significativas entre naufrágios e recifes rochosos. Na comparação entre as comunidades bentónicas presentes em estruturas verticais e horizontais dos naufrágios, houve algumas diferenças, principalmente nas percentagens de cobertura mas sem um padrão de segregação biológica aparente. Esta semelhança estará provavelmente relacionada com o facto de as estruturas verticais e horizontais não terem uma extensão suficientemente grande para permitir o desenvolvimento de grupos de organismos diferentes. Na comparação entre os lados expostos e protegidos das correntes, a ausência de diferenças entre lados expostos e protegidos pode dever-se a uma colonização homogénea em todo o naufrágio sem uma zonação provocada pelas correntes, ou a uma suposição errada de haver um lado do navio mais exposto que outro. As estruturas intactas dos naufrágios albergam muito mais biodiversidade que as partes fragmentadas dos barcos, o que pode ser um indicador de que naufrágios intactos e em boas condições albergam comunidades mais diversas e consequentemente mais saudáveis. Uma das conclusões mais importantes desta tese foi a criação de um “catálogo” das espécies que se podem encontrar nos naufrágios da costa portuguesa. Este catálogo estará disponível online para que possa ser consultado pelo público em geral e referenciado pela comunidade científica em futuros estudos sobre colonização em recifes artificiais. Além da informação já recolhida, deu-se início ao desenvolvimento de um projecto (Project Baseline) com base em mergulhadores recreativos voluntários que se disponibilizarão a desenvolver um registo fotográfico contínuo destes naufrágios ao longo do tempo, permitindo um estudo sobre colonização a longo prazo e também com o objectivo de chamar a atenção da comunidade não científica para a importância destes naufrágios.Shipwrecks are the most conspicuous type of artificial reefs. Besides their impact on local biodiversity, they have a major impact on the diving industry, being some of the preferred diving sites worldwide. Artificial reefs have been used for a long time with various purposes across different regions. There are multiple studies about their effect on fish and benthic communities, but there is little research focusing on shipwrecks specifically. This thesis is the first survey of shipwrecks on the Portuguese coastline, comparing their benthic communities with adjacent natural reef communities, and analysing the spatial distribution patterns within each shipwreck. Four shipwrecks and four nearby natural reefs between Sesimbra and Tavira were sampled with video-transects. The data were divided into two datasets: one dataset included densities of organisms that could be individually counted and the other included percent cover of morphological groups that could not be individually assessed (e.g., algae and incrusting fauna). The density analysis revealed similar communities between shipwrecks along the coastline despite their different ages. Surprisingly, in most cases shipwrecks had different communities from natural rocky reefs, with 40 to 70% of biodiversity not coming from the local reefs. Also unexpectedetly, there were almost no differences between vertical and horizontal surfaces or between the exposed and protected sides of the wrecks, but intact (vs fragmented) parts of the shipwrecks harbour more biodiversity. Even though shipwreck age is likely to influence the observed colonization stage, it is hypothesized that a maximum of biodiversity is quickly reached, and thereafter a dynamic equilibrium is established, with the number of species remaining approximately constant, despite species compositional changes over time. Age also reduces the differences between artificial and natural reefs, making them more similar in therms of biodiversity. Overall, if remaining structurally in a good condition, shipwrecks can increase the local macrobenthic biodiversity

    Metagenome-assembled genome sequences of three uncultured planktomarina sp. strains from the Northeast Atlantic Ocean

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    We report three metagenome-assembled genomes (MAGs) of Planktomarina strains from coastal seawater (Portugal) to help illuminate the functions of understudied Rhodobacteraceae bacteria in marine environments. The MAGs encode proteins involved in aerobic anoxygenic photosynthesis and a versatile carbohydrate metabolism, strengthening the role of Planktomarina species in oceanic carbon cycling.Portuguese Foundation for Science and Technology: EXPL/MAR-EST/1664/2013 PTDC/MAR-BIO/1547/2014, UIDB/04565/2020, PD/BD/143029/2018, CEECIND/00788/2017,PTDC/BIA-MIC/31996/2017;Institute of Bioengineering and Biosciences (iBB) by the Programa Operacional Regional de Lisboa 007317; Helmholtz Association VH-NG-1248.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    São as bunds um novo safe haven?

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    Na presente dissertação é analisada a atuação das obrigações alemãs, as bunds, como ativo de refúgio durante a crise financeira de 2008 e comparamos a mesmo com o ouro. Para tal, será testado o comportamento destes dois ativos recorrendo a duas perspetivas. Numa primeira abordagem, vamos testar as propriedades do ouro e das bunds como hedge e safe haven, no geral. Numa segunda perspetiva identificamos períodos relevantes para a economia de forma a entender se as bunds e o ouro atuaram como ativos de refúgio durante as datas em análise. Os períodos que vamos estudar são a crise económica de 2008, a crise asiática (apenas para o ouro) e o ano de 2014 (ano em que a política de taxas de juro negativas entra em vigor na União Europeia). Desta forma vamos estimar um modelo GARCH (1,1) por máxima verossimilhança para uma amostra de 9 de Setembro de 1996 a 9 de Setembro de 2016. Os índices bolsistas escolhidos representam grupos de índices acionistas como América do Norte, Europa e Mundo. Concluímos que as bunds são um ativo de refúgio bastante forte e que atuaram, durante a crise financeira de 2008, como safe haven mais poderoso do que o ouro.In the present dissertation is analyzed the performance of German bonds, the bunds, as a safe haven asset during the 2008 financial crisis and we compare the same with gold. For this, the behavior of these two assets will be tested using two perspectives. In a first approach, we will test the properties of gold and bunds as hedge and safe haven, in general. In a second perspective, we identified relevant periods for the economy to understand whether bunds and gold acted as safe haven assets during the dates under analysis. The periods under study are the 2008 economic crisis, the Asian crisis (for gold only) and 2014 (the year when the negative interest rate policy comes into force in the European Union). In this way, we will estimate a GARCH (1,1) maximum likelihood model for a sample from September 9, 1996 to September 9, 2016. The stock indexes chosen represent stock index groups such as North America, Europe and the World. We conclude that bunds are a strong safe haven asset and that they acted, during the 2008 financial crisis, as a safe haven more powerful than gold

    The power of Dionysus—Effects of red wine on consciousness in a naturalistic setting

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    There is lack of research on effects of red wine on consciousness when drank in wine bars designed to enhance the pleasurableness of the wine drinking experience. Effects of a moderate dose of red wine (� 40.98 g of ethanol) on consciousness were examined in a naturalistic study taking place in a wine bar located in one of the most touristic areas of Lisbon, Portugal. One hundred two participants drank in one of three conditions: alone, in dyad, or in groups up to six people. Red wine increased pleasure and arousal, decreased the awareness of time, slowed the subjective passage of time, increased the attentional focus on the present moment, decreased body awareness, slowed thought speed, turned imagination more vivid, and made the environment become more fascinating. Red wine increased insightfulness and originality of thoughts, increased sensations of oneness with the environment, spiritual feelings, all-encompassing love, and profound peace. All changes in consciousness occurred regardless of volunteers drinking alone, in dyad or in group. Men and women did not report different changes in consciousness. Older age correlated with greater increases in pleasure. Younger age correlated with greater increases in fascination with the environment of the wine bar. Drinking wine in a contemporaneous Western environment designed to enhance the pleasurableness of the wine drinking experience may trigger changes in consciousness commonly associated with mystical-type statesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Fetal Heart Rate Fragmentation

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    This article was supported by National Funds through FCT– Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., within CINTESIS, R&D Unit (reference UIDB/4255/2020)info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Estratégias de reconstrução Urbana. A experiência do Chiado em discurso directo

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    (Reconstrução, continuidade, transformação, método)A presente dissertação tem como objectivo principal o estudo da estratégia gizada por Álvaro Siza na operação de reconstrução do Chiado, em Lisboa, usando-a como plataforma de entendimento de opções projectuais capazes, com a finalidade de as transpor para o discurso contemporâneo sobre renovação urbana nos tecidos históricos.A reflexão a que nos propomos, tem como princípio o desejo de aprender como transformar a cidade do passado, de forma a que ela se perpetue no futuro. É no entendimento de que estes dois tempos devem ser sobrepostos em análise, através de uma posição crítica e profundamente atenda, que julgamos residir a pertinência deste estudo.De forma a enquadrar e melhor compreender a estratégia, recuamos até ao fim da 2º Grande Guerra Mundial, altura em que, imbuídos de um espírito transformador acelerado, numa tentativa de resolver rapidamente os traumas urbanos que jaziamnas cidades europeias, são produzidos os mais interessantes discursos sobre como transformar a cidade: atendendo à sua continuidade histórica ou fazendo novo? A dialéctica entre a tradição e a inovação está presente, assim como a importância do conhecimento da História e da Memória, em oposição ao discurso funcionalista do Moderno.O Chiado em discurso directoAtravés de uma serie de entrevistas, realizadas com os três arquitectos que participaram directamente na coordenação do Plano: Álvaro Siza, Carlos Castanheira e Jorge Carvalho; e com Roberto Collovà, um estudioso da obra e método de Álvaro Siza, e das questões ligadas ao património; foi traçado um percurso de investigação, apoiado no discurso destes personagens.Mais do que uma exaustiva análise sobre a obra final, pretende-se estudar as opções geradoras, e o método que as suportou. Numa tentativa de sensibilizar para a importância do estudo método, bem como para a discussão destas problemáticas demodo critico e operativo, transpondo atitude diligente de Álvaro Siza, para os demais problemas associados à intervenção na cidade consolidada.É na complexa tensão entre tradição e Modernidade que reside a genialidade da operação do Chiado, pensamos.(Reconstruction, continuity, transformation, method)The following thesis aims to study the strategy chalked by Álvaro Siza towards the reconstruction works carried at Chiado, in Lisbon, using it as a platform for understanding the capable design solutions as means to transpose the renovation ofthe historic urban fabric into contemporary culture.The proposed reflection has as a principle the desire to learn how to transform the city of the past, so that it perpetuates in the future. The relevance of this study resides through the understanding that these two periods have to be superimposed under analysis, through a critical in depth position.For a better understanding and framing of the given strategy we ought to recall the end of the Second World War, where enlightened by a fast paced transforming spirit and in an attempt to quickly solve the urban traumas felt by European cities, the most interesting speeches are made on how to transform cities: attending to it's historic continuity or in re-doing? The dialogue between tradition and innovation is ever present as well as the importance on the knowledge of History and Memory in opposition to the Modern functionalist speech.The Chiado in direct speechThrough a series of interviews with the three architects who were directly involved in the coordination of the Chiado re qualification plan: Álvaro Siza, Carlos Castanheira and Jorge Carvalho; and with Roberto Collovà, a scholar of the work and method of Álvaro Siza, as well as heritage affairs; a research path was traced, supported by the speech of these intellectual individuals.More than an in depth analysis of the concluded works, the intention of this thesis is to study the generating options, and the method that conveyed them. In an attempt to raise awareness for the importance of the study method, as well as for the discussion of these critical issues and their operation mode, reaffirming the diligent attitude of Alvaro Siza, to regards to the rising problems associated with the intervention of the consolidated city. It is in the complex tension between tradition and modernity that lies the genius of the Chiado requalification

    Proposta de uma escala para avaliação do processo de cicatrização de ferida cirúrgica no cão e no gato

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    Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaA cicatrização de feridas é um processo complexo e bem concertado, capaz de restabelecer a integridade anatómica e fisiológica dos tecidos e que termina na formação de uma cicatriz. Não existe um método padronizado para a avaliação da cicatrização. O objectivo deste estudo foi a criação de uma escala de avaliação do processo de cicatrização, aplicada a feridas cirúrgicas, com uma potencial aplicação prática. Assim surgiu a Escala para Avaliação do Processo de Cicatrização de Ferida Cirúrgica (EAPCFC). A EAPCFC foi aplicada na prática e foram estudadas 14 suturas cutâneas (n=14) de gatos (n=9) e de cães (n=5). Cada sutura foi avaliada ao longo de 21 dias em 4 tempos de avaliação: no pós-cirúrgico imediato (T0), 1 dia após a cirurgia (T1), 8 dias após a cirurgia (T2), e 21 dias após a cirurgia (T3). Os resultados foram analisados estatisticamente, tendo-se verificado: diferenças na cicatrização entre as suturas dos gatos e as suturas dos cães, estatisticamente significativas em T2; diferenças ao longo do tempo na amostra total, estatisticamente significativas entre T1 e T3; correlação entre a pontuação total obtida em T1 e em T2 e a obtida em T3, estatisticamente significativa para a amostra total e para as suturas dos cães. Uma análise estatística demostrou a consistência interna para os parâmetros da EAPCFC em T2, mas não para os outros tempos, para a amostra estudada. Finalmente, a EAPCFC foi aplicada a um conjunto de fotografias por 14 avaliadores relativamente aos parâmetros classificados por inspecção visual, tendo-se verificado níveis de concordância excelente entre os avaliadores, independentemente da sua experiência na prática clínica ou da prática com a utilização prévia da escala. Os resultados do tratamento estatístico são promissores relativamente à potencial aplicação prática da EAPCFC.ABSTRACT - PROPOSAL OF A SCALE FOR THE EVALUATION OF THE WOUND HEALING PROCESS OF THE SURGICAL WOUND IN THE DOG AND CAT - Wound healing is a complex and fine-tuned process capable of restoring anatomic and physiologic integrity to the tissues and culminates in the formation of a scar. There is no standard method for wound healing evaluation. The objective of this study was the creation of a scale for the evaluation of the wound healing process, applied to surgical wounds, which has potential practical application. Thus came the Scale for the Evaluation of Surgical Wound Healing (SESWH). SESWH was applied in practice and 14 skin sutures (n=14) from cats (n=9) and dogs (n=5) were studied. Each suture was evaluated over 21 days on 4 different times of evaluation: immediately post-surgically (T0), 1 day after surgery (T1), 8 days after surgery (T2), and 21 days after surgery (T3). The results were statistically analyzed and have been found: differences in wound healing between cat sutures and dog sutures, statistically significant on T2; differences over time in the total sample, statistically significant between T1 and T3; correlation between the total score obtained on T1 and T2 and the one obtained on T3, statistically significant for the total sample and for the dog sutures. Statistical analysis showed internal consistency for the SESWH parameters on T2, but not on the other times of evaluation, for the studied sample. Finally, the SESWH was applied to a group of photographs by 14 raters relatively to the parameters scored by visual inspection, have been found excellent inter-rater agreement, despite their clinical experience or the practice using the scale provided. Statistical results are promising concerning the potential practical application of the SESWH
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