Diversity of floral regulatory genes of japonica rice cultivated at northern latitudes

BACKGROUND: Rice is considered a short day plant. Originally from tropical regions rice has been progressively adapted to temperate climates and long day conditions in part by modulating its sensitivity to day length. Heading date 3a (Hd3a) and RICE FLOWERING LOCUS T 1 (RFT1) that code for florigens, are known as major regulatory genes of floral transition in rice. Both Hd3a and RFT1 are regulated by Early heading date 1 (Ehd1) and Days to heading on chromosome 2 (DTH2) while Heading date 1 (Hd1) also governs Hd3a expression. To investigate the mechanism of rice adaptation to temperate climates we have analyzed the natural variation of these five genes in a collection of japonica rice representing the genetic diversity of long day cultivated rice. RESULTS: We have investigated polymorphisms of Hd3a, RFT1, Ehd1, Hd1 and DTH2 in a collection of 57 japonica varieties. Hd3a and RFT1 were highly conserved, displaying one major allele. Expression analysis suggested that RFT1 rather than Hd3a could be the pivotal gene controlling flowering under long day conditions. While few alleles were found in the Ehd1 promoter and DTH2 coding region, a high degree of variation in Hd1, including non-functional alleles, was observed. Correlation analysis between gene expression levels and flowering periods suggested the occurrence of other factors, additionally to Ehd1, affecting RFT1 regulation in long day adapted cultivars. CONCLUSIONS: During domestication, rice expansion was accompanied by changes in the regulatory mechanism of flowering. The existence of non-functional Hd1 alleles and the lack of correlation of their presence with flowering times in plants grown under long day conditions, indicate a minor role of this branch in this process and the existence of an alternative regulatory pathway in northern latitudes. Expression analysis data and a high degree of conservation of RFT1 suggested that this gene could be the main factor regulating flowering among japonica cultivars adapted to northern areas. In the absence of inhibition exerted by Hd1 through repression of Hd3a expression, the role of Ehd1 as a regulator of RFT1 and Hd3a appears to be reinforced. Data also indicated the occurrence of additional regulatory factors controlling flowering

Bioinformatics approach for developing a minimum set of SNP markers for identification of temperate japonica rice varieties cultivated in Spain

The use of molecular markers for plant variety identification and protection is increasing. For this purpose, SNP markers have provided a reliable and stable tool for plant genotyping. The availability of small and low-cost SNP panels to accelerate the identification of the cultivated rice varieties should be beneficial for breeders, seed certification entities and rice industry. With the intention of providing of such a facility, we first developed a simple and easy-handle bioinformatics tool based on the widely used and freely available software R to generate small sets of SNPs that can discriminate varieties, by selecting markers from a larger genotyping dataset. By applying this algorithm to data from a previously genotyped collection of temperate japonica varieties from different countries, we identified a minimal set of 31 SNPs markers to distinguish 210 varieties. In addition, we used this algorithm to discriminate the 43 most cultivated in Spain rice varieties with minimal sets of 8 SNPs. We then developed and tested 22 Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) assays for the markers included in these panels, and obtained reliable genotype patterns for rice varieties identification. The complete 22 markers panel and the rice genotypes data could offer a useful and low-cost tool for rice breeders and industry to identify varieties and therefore to guarantee the quality of rice. The provided R-based algorithm can be applied to other genomic resources to develop core sets of discriminating markers

Inmigración femenina en España y relaciones de género

En la corriente migratoria no sólo se manifiestan las diferencias entre hombres y mujeres, sino las peculiaridades de género, como construcción social, que influyen en la configuración del propio fenómeno migratorio. En este trabajo se alude a tres de esos aspectos. En primer lugar, la trayectoria seguida en la última década, respecto a la evolución del flujo, desequilibrios de sexo, modelos de estructura y sus consecuencias de género. En segundo lugar, la fecundidad de las mujeres inmigradas, su percepción y proyección geográfica en la sociedad de acogida. Por último, la heterogénea situación femenina en el mercado laboral y sus diferencias ligadas también al género

Fuentes agrarias pre catastrales valencianas. Su utilidad geográfica

Valencia agrarian precatastral sources. Its geographical utility. The socalled Llibres de Values de la Peyta and Cap-patrons are the oldest agrarian census in Valencia. As a geographic source, they give information about the properties, their division into plots, and about the types of lands and crops. They also make possible an approximate cartographic representation of all this.Fuentes agrarias pecatastrales Valencianas. Su utilidad geográfica: Los Llibres de Values de la Peyta y Cap-patrons constituyen los padrones agrarios valencianos más antiguos. Como fuente geográfica informan sobre la propiedad, parcelación, tipos de tierra y cultivos. La riqueza de sus datos permite ima representación cartográfica aproximada. [fr] ources agraires precadastraies Valenciannes. Son utilité géographique. Les Llibres de Values de la Peyta et Cap-patrons sont les plus antiques registres agraires valenciens. Comme source géographique ils nous informent en plus de la propriété, du parcellement, des types de terre et des cultures. En outre, ils permettent de s'approcher á leur représentation cartographique

La diversidad genética del arroz cultivado en climas templados

El arroz se domesticó hace más de 6.500 años en una región de clima tropical situada en el sureste asiático. Desde allí, el cultivo se extendió al resto del mundo diversificándose, mediante mutaciones espontáneas o hibridaciones, con la aparición de alelos en genes clave que aportaban cualidades que favorecían la adaptación a las nuevas regiones alcanzadas y que han facilitado el desarrollo de plantas adaptadas a los nuevos ambientes. El estudio de la diversidad genética y los cambios fenotípicos asociados, permite realizar asociaciones que son útiles para entender los procesos biológicos de la planta y también permite aprovechar de manera eficiente los recursos genéticos en los programas de mejora. En el laboratorio, llevamos en marcha estudios sobre la diversidad del arroz adaptado a clima templado. Entre los objetivos está la variabilidad en los genes reguladores de la floración. El arroz se considera como una especie de día corto. Sin embargo, en Europa, el cultivo se realiza en verano, cuando los días son largos. Hemos analizado los alelos de los genes reguladores de la floración presentes en una colección de variedades adaptadas a clima templado y hemos podido determinar diferencias respecto a las variedades de clima tropical que permiten que florezcan en días largos. También estamos obteniendo el perfil genético de una colección amplia de variedades modernas y antiguas, adaptadas al clima templado. Para ello hemos obtenido y analizado la secuencia del genoma de variedades representativas. A partir de los datos de las secuencias estamos diseñando un microchip de DNA con 3000 polimorfismos que permitan distinguir, a nivel molecular, las variedades que son cultivadas en nuestro entorno, así como el desarrollo de marcadores moleculares, útiles en los programas de mejora de variedades

Poesía y fotografía. Defensa de la mirada constructora: un diálogo intermedial de Alberto García-Alix y Jenaro Talens

This article provides the reader with a comparatist analysis of the dialogic bonds between the photographic work of Alberto García-Alix and the poetry of Jenaro Talens, specifically on their collaboration in the book Lo que los ojos tienen que decir (Cátedra, 2014). Its methodology is grounded in a radical understanding of intermediality and the concepts of imagentext (WJT Mitchell 1994, 2019) and iconotext, the latter being coined by Talens himself to designate a series of his books where the poetic word mingles and interacts with the visual image. Our research identifies a series of poetic (theoretical) common categories, such as the discursive configuration of subjectivity, desire (both in a psychoanalytical and a comparatist perspective) and constructing view (mirada constructora) as creative forces in this collaboration, together with some photographic techniques that the poet imports and adapts to its language (framing, off camera, depth of field, light exposure). As a whole, this book comes out to be an extraordinary case of resistance to the aesthetical dominance of realism, choosing to adopt a shared strong materialist and space stance, open to poetic mistery and compromised with the deconstruction of any possible autobiography or self-portrait in the narrow sense of self and referential coincidence.En este artículo se lleva a cabo un ensayo de análisis comparatista entre la fotografía de Alberto García-Alix y la poesía de Jenaro Talens a propósito de la colaboración de ambos autores en el libro Lo que los ojos tienen que decir (Cátedra, 2014). El trabajo se fundamenta metodológicamente en una teoría radical de la intermedialidad y en los conceptos de imagentexto (WJT Mitchell 1994, 2019) y de iconotexto, término con el que el mismo Talens designa una serie de libros en los que su poesía ha dialogado en el tiempo con la imagen visual. A partir de una serie de categorías poéticas comunes (la articulación discursiva del sujeto, el deseo y la mirada constructora como fuerzas creadoras y la imagen poética como espacio común a fotografía y palabra poética) y de una serie de técnicas fotográficas que son simuladas y adaptadas por el poeta (encuadre, fuera de campo, profundidad de campo, exposición a la luz) este libro ofrece un caso extraordinario de resistencia a la estética realista, apostando por una concepción fuertemente material y espacial, abierta al misterio y comprometida en la deconstrucción de toda posible autobiografía o autorretrato en sentido referencial estrecho

La crónica de sucesos criminales en el relato periodístico y el cinematográfico : el viaje de Edgar Neville entre las calles Fuencarral y Bodadores

El filme El crimen de la calle Bordadores (Edgar Neville, 1946) es propuesto como caso extraordinario en el cine español de la primera posguerra por su interpretación de un suceso criminal real del pasado, el asesinato de la calle Fuencarral (2-7-1888). Considerado dentro del debate sobre la especificidad del cine español, y sobre la base de una doble perspectiva, histórico-documental y teórico-textual, se ensaya un análisis comparativo de los relatos periodísticos y su adaptación o reescritura cinematográfica a propósito del suceso criminal, ficcionalizado por Neville, en un contexto como el de los años 40, marcado por la censura franquista

Poetry & photography. A defense of the constructing view: an intermedial dialogue between Alberto García-Alix & Jenaro Talens

En este artículo se lleva a cabo un ensayo de análisis comparatista entre la fotografía de Alberto García-Alix y la poesía de Jenaro Talens a propósito de la colaboración de ambos autores en el libro Lo que los ojos tienen que decir (Cátedra, 2014). El trabajo se fundamenta metodológicamente en una teoría radical de la intermedialidad y en los conceptos de imagentexto (WJT Mitchell 1994, 2019) y de iconotexto, término con el que el mismo Talens designa una serie de libros en los que su poesía ha dialogado en el tiempo con la imagen visual. A partir de una serie de categorías poéticas comunes (la articulación discursiva del sujeto, el deseo y la mirada constructora como fuerzas creadoras y la imagen poética como espacio común a fotografía y palabra poética) y de una serie de técnicas fotográficas que son simuladas y adaptadas por el poeta (encuadre, fuera de campo, profundidad de campo, exposición a la luz) este libro ofrece un caso extraordinario de resistencia a la estética realista, apostando por una concepción fuertemente material y espacial, abierta al misterio y comprometida en la deconstrucción1 de toda posible autobiografía o autorretrato en sentido referencial estrecho.This article provides the reader with a comparatist analysis of the dialogic bonds between the photographic work of Alberto García-Alix and the poetry of Jenaro Talens, specifically on their collaboration in the book Lo que los ojos tienen que decir (Cátedra, 2014). Its methodology is grounded in a radical understanding of intermediality and the concepts of imagentext (WJT Mitchell 1994, 2019) and iconotext, the latter being coined by Talens himself to designate a series of his books where the poetic word mingles and interacts with the visual image. Our research identifies a series of poetic (theoretical) common categories, such as the discursive configuration of subjectivity, desire (both in a psychoanalytical and a comparatist perspective) and constructing view (mirada constructora) as creative forces in this collaboration, together with some photographic techniques that the poet imports and adapts to its language (framing, off camera, depth of field, light exposure). As a whole, this book comes out to be an extraordinary case of resistance to the aesthetical dominance of realism, choosing to adopt a shared strong materialist and space stance, open to poetic mistery and compromised with the deconstruction of any possible autobiography or self-portrait in the narrow sense of self and referential coincidence