An economic model for offshore cultivation of macroalgae

Algae biomass is considered as a potential non-fossil source of raw materials to produce fuel, feed, chemicals and materials. For this purpose microalgae as well as macroalgae can be used, and in this report we focus on the latter. More than 99% of the world production of aquatic plants is produced in Asia (FAO 2012, Table 1). From the remaining 1% about 4% is cultivated in Europe. Important European countries with commercial seaweed cultivation are Denmark, Ireland and France. Depending on their pigmentation seaweed species are commonly grouped in brown, red and green seaweeds

VIH : comment la recherche en épidémiologie s’est orientée de l’évaluation thérapeutique au dépistage et à la prévention

In years following the onset of HIV infection, priority was given to therapeutic research. Since the introduction of highly active antiretroviral therapy in 1996, mortality and morbidity related to HIV have decreased dramatically. However, the epidemic remains active, especially among men who have sex with men (MSM), highlighting the need for changes in testing and prevention policies. This thesis presents the evolution of a part of research in epidemiology of HIV in Northern countries, focusing first on HIV treatments effectiveness then moving toward to limitations of current HIV testing strategies, new strategies of HIV testing, and finally addressing prevention. This Ph.D thesis contains five epidemiological studies conducted in France.The first study, conducted in 175 HIV-1 infected antiretroviral-naive patients, showed that lopinavir/ritonavir was efficient regardless to polymorphisms carried by the viral protease.The second study, based on an economic model accounting changes in medical practices and the impact of new drugs, showed that lifetime cost associated with HIV care is €535,000/patient (€320,700 discounted) for a life expectancy of 26.5 years under current conditions. Moreover, it highlighted that annual cost of care increases with late access to care (€21,600/year if AIDS or CD4 count 500 cells/mm3, undiscounted costs).The third study conducted in 1,008 HIV-infected patients newly diagnosed, showed that 93% of patients had seen a general practitioner within 3-year period prior to HIV diagnosis. Of patients enrolled, 82 who sought care for HIV-related symptoms within this period had a missed opportunity for HIV testing proposition. Similarly, 55% of MSM who notified to a healthcare setting that they belonged to this risk group had a missed opportunity for HIV testing proposition. The fourth study assessed a community-based HIV testing strategy targeting MSM (532 MSM tested into the program studied). This HIV testing reached people at high risk of HIV, on third of these was little or not tested in other testing facilities. Among the 15 patients who tested positive (2.8%), 12 (80%) received confirmation and linked to care (median CD4 count =550 cells/mm3). The fifth study, a case-control study conducted in MSM in northern France (53 cases of early syphilis and 90 controls) showed receptive oral sex without a condom and anal sex toy use as the main risk factors for syphilis acquisition. Our results highlight limitations of current HIV testing strategies. They show the importance of promoting routine HIV testing in primary care settings, and extension of testing facilities that target populations with specific risk. In addition, they enhanced prevention for risk reduction measures for HIV and STIs. In the era of effective and well tolerated but expensive antiretroviral therapy, testing and prevention are significant issues in the control of the HIV epidemic.Dans les années qui ont suivi l’apparition de l’infection par le VIH, la priorité était donnée à la recherche thérapeutique. Depuis l’introduction des trithérapies antirétrovirales en 1996, la mortalité et la morbidité liées du VIH ont fortement chuté. Cependant, l’épidémie reste très active, notamment chez les hommes ayant des relations sexuelles avec d’autres hommes (HSH), signifiant la nécessité d’un changement de paradigmes en termes de dépistage et de prévention. Cette thèse suit l’évolution d’une partie de la recherche en épidémiologie du VIH dans les pays du Nord, en s’intéressant d’abord à l’efficacité des traitements pour ensuite s’orienter vers les limites et les nouvelles stratégies de dépistage du VIH et enfin aborder le thème de la prévention. Elle regroupe cinq études épidémiologiques conduites en France.La première étude, conduite chez 175 patients infectés par le VIH-1 et naïfs de traitement antirétroviral, a montré que le lopinavir/ritonavir était efficace quelques soient les polymorphismes portés par la protéase virale. La seconde étude, basée sur un modèle économique prenant en compte l’évolution des pratiques médicales et l’impact des nouveaux traitements a montré que le coût des soins relatifs au VIH est 535000€ par patient (coût actualisé : 320700€) pour une espérance de vie de 26,5 ans dans les conditions actuelles de prise en charge. Elle met en évidence que le coût annuel d’un patient est d’autant plus élevé qu’il débute la prise en charge à un stade avancé de la maladie (21600€/an s’il accède aux soins en stade sida ou avec un taux de CD4500/mm3, coûts non actualisés). La troisième étude portant sur 1008 patients VIH nouvellement diagnostiqués, a montré que 93% des patients avaient consulté un médecin généraliste dans les trois années qui précèdent le diagnostic de VIH et que 82% des patients inclus qui consultaient pour des symptômes associés au VIH durant cette période avaient une opportunité manquée de proposition de dépistage du VIH. De même, 55% des HSH qui mentionnaient à une structure de soins leur appartenance à ce groupe à risque, avaient une opportunité manquée de dépistage. La quatrième étude a évalué un dépistage communautaire du VIH auprès des HSH (532 HSH ont été testés dans le cadre de l’étude). Ce dépistage a atteint des personnes à risque d’acquisition du VIH dont un tiers se dépistait peu dans les autres structures de dépistage. Parmi les 15 hommes testés positif (2,8%), 12 (80%) ont reçu la confirmation de leur séropositivité pour le VIH et ont été liés aux soins (médiane des CD4 =550/mm3). La cinquième étude, basée sur un design cas-témoins et menée chez les HSH dans le Nord (53 cas de syphilis précoce et 90 témoins) a mis en évidence la fellation réceptive sans préservatif et l’utilisation de jouets sexuels anaux comme principaux facteurs de risque de la syphilis. Nos résultats montrent les limites des stratégies actuelles de dépistage et sont en faveur d’un dépistage systématique du VIH en routine dans les structures de soins primaires, d’une extension de l’offre de dépistage pour les populations à risque spécifique et d’une prévention renforcée axée sur les mesures de réduction des risques du VIH mais aussi des IST. A l’ère des traitements antirétroviraux efficaces, bien tolérés, mais coûteux, le dépistage et la prévention sont des enjeux de poids dans la maitrise de l’épidémie

HIV : how research in epidemiology have moved forward from therapeutic evaluation to testing and prevention

Dans les années qui ont suivi l’apparition de l’infection par le VIH, la priorité était donnée à la recherche thérapeutique. Depuis l’introduction des trithérapies antirétrovirales en 1996, la mortalité et la morbidité liées du VIH ont fortement chuté. Cependant, l’épidémie reste très active, notamment chez les hommes ayant des relations sexuelles avec d’autres hommes (HSH), signifiant la nécessité d’un changement de paradigmes en termes de dépistage et de prévention. Cette thèse suit l’évolution d’une partie de la recherche en épidémiologie du VIH dans les pays du Nord, en s’intéressant d’abord à l’efficacité des traitements pour ensuite s’orienter vers les limites et les nouvelles stratégies de dépistage du VIH et enfin aborder le thème de la prévention. Elle regroupe cinq études épidémiologiques conduites en France.La première étude, conduite chez 175 patients infectés par le VIH-1 et naïfs de traitement antirétroviral, a montré que le lopinavir/ritonavir était efficace quelques soient les polymorphismes portés par la protéase virale. La seconde étude, basée sur un modèle économique prenant en compte l’évolution des pratiques médicales et l’impact des nouveaux traitements a montré que le coût des soins relatifs au VIH est 535000€ par patient (coût actualisé : 320700€) pour une espérance de vie de 26,5 ans dans les conditions actuelles de prise en charge. Elle met en évidence que le coût annuel d’un patient est d’autant plus élevé qu’il débute la prise en charge à un stade avancé de la maladie (21600€/an s’il accède aux soins en stade sida ou avec un taux de CD4500/mm3, coûts non actualisés). La troisième étude portant sur 1008 patients VIH nouvellement diagnostiqués, a montré que 93% des patients avaient consulté un médecin généraliste dans les trois années qui précèdent le diagnostic de VIH et que 82% des patients inclus qui consultaient pour des symptômes associés au VIH durant cette période avaient une opportunité manquée de proposition de dépistage du VIH. De même, 55% des HSH qui mentionnaient à une structure de soins leur appartenance à ce groupe à risque, avaient une opportunité manquée de dépistage. La quatrième étude a évalué un dépistage communautaire du VIH auprès des HSH (532 HSH ont été testés dans le cadre de l’étude). Ce dépistage a atteint des personnes à risque d’acquisition du VIH dont un tiers se dépistait peu dans les autres structures de dépistage. Parmi les 15 hommes testés positif (2,8%), 12 (80%) ont reçu la confirmation de leur séropositivité pour le VIH et ont été liés aux soins (médiane des CD4 =550/mm3). La cinquième étude, basée sur un design cas-témoins et menée chez les HSH dans le Nord (53 cas de syphilis précoce et 90 témoins) a mis en évidence la fellation réceptive sans préservatif et l’utilisation de jouets sexuels anaux comme principaux facteurs de risque de la syphilis. Nos résultats montrent les limites des stratégies actuelles de dépistage et sont en faveur d’un dépistage systématique du VIH en routine dans les structures de soins primaires, d’une extension de l’offre de dépistage pour les populations à risque spécifique et d’une prévention renforcée axée sur les mesures de réduction des risques du VIH mais aussi des IST. A l’ère des traitements antirétroviraux efficaces, bien tolérés, mais coûteux, le dépistage et la prévention sont des enjeux de poids dans la maitrise de l’épidémie.In years following the onset of HIV infection, priority was given to therapeutic research. Since the introduction of highly active antiretroviral therapy in 1996, mortality and morbidity related to HIV have decreased dramatically. However, the epidemic remains active, especially among men who have sex with men (MSM), highlighting the need for changes in testing and prevention policies. This thesis presents the evolution of a part of research in epidemiology of HIV in Northern countries, focusing first on HIV treatments effectiveness then moving toward to limitations of current HIV testing strategies, new strategies of HIV testing, and finally addressing prevention. This Ph.D thesis contains five epidemiological studies conducted in France.The first study, conducted in 175 HIV-1 infected antiretroviral-naive patients, showed that lopinavir/ritonavir was efficient regardless to polymorphisms carried by the viral protease.The second study, based on an economic model accounting changes in medical practices and the impact of new drugs, showed that lifetime cost associated with HIV care is €535,000/patient (€320,700 discounted) for a life expectancy of 26.5 years under current conditions. Moreover, it highlighted that annual cost of care increases with late access to care (€21,600/year if AIDS or CD4 count 500 cells/mm3, undiscounted costs).The third study conducted in 1,008 HIV-infected patients newly diagnosed, showed that 93% of patients had seen a general practitioner within 3-year period prior to HIV diagnosis. Of patients enrolled, 82 who sought care for HIV-related symptoms within this period had a missed opportunity for HIV testing proposition. Similarly, 55% of MSM who notified to a healthcare setting that they belonged to this risk group had a missed opportunity for HIV testing proposition. The fourth study assessed a community-based HIV testing strategy targeting MSM (532 MSM tested into the program studied). This HIV testing reached people at high risk of HIV, on third of these was little or not tested in other testing facilities. Among the 15 patients who tested positive (2.8%), 12 (80%) received confirmation and linked to care (median CD4 count =550 cells/mm3). The fifth study, a case-control study conducted in MSM in northern France (53 cases of early syphilis and 90 controls) showed receptive oral sex without a condom and anal sex toy use as the main risk factors for syphilis acquisition. Our results highlight limitations of current HIV testing strategies. They show the importance of promoting routine HIV testing in primary care settings, and extension of testing facilities that target populations with specific risk. In addition, they enhanced prevention for risk reduction measures for HIV and STIs. In the era of effective and well tolerated but expensive antiretroviral therapy, testing and prevention are significant issues in the control of the HIV epidemic

Le syndrome lipodystrophique associé au virus d'immunodéficience humaine (à propos d'une observation pédiatrique)

LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF

Assessing complex interventions: a systematic review of outcomes used in randomised controlled trials on STI partner notification in high-income countries

Abstract Background Partner notification interventions are complex and assessing their effectiveness is challenging. By reviewing the literature on the effectiveness of partner notification interventions, our aim was to evaluate the choice, collection, and interpretation of outcomes and their impact on study findings. Methods We conducted a systematic review of individual-level randomised controlled trials evaluating the effectiveness of partner notification interventions for bacterial STIs, HIV or sexually transmitted HCV in high-income countries since 2000. Partner notification interventions included assisted patient referral interventions and expedited treatment. The content analysis was carried out through a narrative review. Results In the 9 studies that met the inclusion criteria, 16 different outcomes were found. In most studies, one or two outcomes assessing partner notification practices were associated with an outcome reflecting STI circulation through index case reinfections. These outcomes assessed the main expected effects of partner notification interventions. However, partner notification is composed of a succession of actions between the intervention on the index case and the testing and/or treatment of the notified partners. Intermediate outcomes were missing so as to better understand levers and barriers throughout the process. Potential changes in participants’ sexual behaviour after partner notification, e.g. condom use, were outcomes reported in only two studies assessing interventions including counselling. Most outcomes were collected through interviews, some weeks after the intervention, which might lead to desirability and attrition biases, respectively. Assessment of the effectiveness of partner notification interventions on partner testing/treatment was limited by the collection of data from index cases. Few data describing index cases and their partners were provided in the studies. Additional data on the number and type of exposed partners and the proportion of partners already aware of their infection before being notified would help to interpret the results. Conclusions These insights would help to understand why and under what conditions the intervention is considered effective and therefore can be replicated or adapted to other populations and contexts

Impact of <it>Herpes simplex virus</it> load and red blood cells in cerebrospinal fluid upon herpes simplex meningo-encephalitis outcome

Abstract Background Herpes simplex encephalitis (HSE) often leads to severe disability or death. Factors usually associated with outcome include Simplified Acute Physiology Score, age and delay of initiation of acyclovir treatment. Our aim was to determine the impact of Herpes simplex virus (HSV) load in cerebrospinal fluid (CSF) upon HSE outcome. Methods We retrospectively determined HSV load in the CSF of 43 patients with confirmed HSE, hospitalized in northern France from 1998 to 2005, using CSF samples collected the day of hospital admission and stored at −20°C. We analyzed the association between HSV load and mortality/morbidity by the Glasgow Outcome Scale. Fisher’s exact test and Wilcoxon’s test were used for statistical analysis. Results The M/F sex ratio was 1.7 and median patient age was 61 years. Median HSV load in CSF was 2.0 log copies/μL (IQR 25-75=1.2-2.6). The mortality rate was 32.6% six months after HSE diagnosis. Higher age was associated with mortality (p=0.03). Longer delay in acyclovir initiation tended to be associated with higher mortality but did not reach statistical significance (p=0.08). Severe disability and death due to HSV were associated with a higher Knaus score (p=0.004), later acyclovir initiation (p=0.006), older age (p=0.04) and presence of red blood cells in CSF (p=0.05). HSV load in CSF was neither associated with mortality (p=1.00) nor with morbidity (p=0.90). Conclusion In this study, HSV load in CSF was not found to be associated with poor outcome in patients with HSE. These data do not support measurement of HSV load at admission in patients with HSE.</p

Impact of Herpes simplex virus load and red blood cells in cerebrospinal fluid upon herpes simplex meningo-encephalitis outcome.

International audienceABSTRACT: BACKGROUND: Herpes simplex encephalitis (HSE) often leads to severe disability or death. Factors usually associated with outcome include Simplified Acute Physiology Score, age and delay of initiation of acyclovir treatment.Our aim was to determine the impact of Herpes simplex virus (HSV) load in cerebrospinal fluid (CSF) upon HSE outcome. METHODS: We retrospectively determined HSV load in the CSF of 43 patients with confirmed HSE, hospitalized in northern France from 1998 to 2005, using CSF samples collected the day of hospital admission and stored at -20[degree sign]C. We analyzed the association between HSV load and mortality/morbidity by the Glasgow Outcome Scale. Fisher's exact test and Wilcoxon's test were used for statistical analysis. RESULTS: The M/F sex ratio was 1.7 and median patient age was 61 years. Median HSV load in CSF was 2.0 log copies/muL (IQR 25-75=1.2-2.6). The mortality rate was 32.6% six months after HSE diagnosis. Higher age was associated with mortality (p=0.03). Longer delay in acyclovir initiation tended to be associated with higher mortality but did not reach statistical significance (p=0.08). Severe disability and death due to HSV were associated with a higher Knaus score (p=0.004), later acyclovir initiation (p=0.006), older age (p=0.04) and presence of red blood cells in CSF (p=0.005). HSV load in CSF was neither associated with mortality (p=1.00) nor with morbidity (p=0.90). CONCLUSION: In this study, HSV load in CSF was not found to be associated with poor outcome in patients with HSE. These data do not support measurement of HSV load at admission in patients with HSE