Chemical post-processing of magneto-hydrodynamical simulations of star-forming regions: robustness and pitfalls

A common approach to model complex chemistry in numerical simulations is via post-processing of existing magneto-hydrodynamic simulations, relying on computing the evolution of chemistry over the dynamic history of a subset of particles from within the raw simulation. Here, we validate such a technique, assessing its ability to recover the abundances of chemical species, using the chemistry package KROME. We also assess, for the first time, the importance of the main free input parameters, by means of a direct comparison with a self-consistent state-of-the-art simulation in which chemistry was directly coupled to hydrodynamics. We have found that the post-processing is highly reliable, with an accuracy at the percent level, even when the most relaxed input parameters are employed. In particular, our results show that the number of particles used does not affect significantly the average properties, although it suppresses the appearance of possibly important spatial features. On the other hand, the choice of the integration time-step plays a crucial role. Longer integration time-steps can produce large errors, as the post-processing solution will be forced towards chemical equilibrium, a condition that does not always necessarily apply. When the interpolation-based reconstruction of chemical properties is performed, the errors further increase up to a factor of $\sim2$. Concluding, our results suggest that this technique is extremely useful when exploring the relative quantitative effect of different chemical parameters and/or networks, without the need of re-running simulations multiple times, but some care should be taken in the choice of particles sub-sample and integration time-step.Comment: 11 pages, 6 figures, 3 table

The GRETOBAPE gas-phase reaction network: the importance of being exothermic

The gas-phase reaction networks are the backbone of astrochemical models. However, due to their complexity and non-linear impact on the astrochemical modeling, they can be the first source of error in the simulations if incorrect reactions are present. Over time, following the increasing number of species detected, astrochemists have added new reactions, based on laboratory experiments and quantum mechanics (QM) computations as well as reactions inferred by chemical intuition and similarity principle. However, sometimes no verification of their feasibility in the interstellar conditions, namely their exothermicity, was performed. In this work, we present a new gas-phase reaction network, GRETOBAPE, based on the KIDA2014 network and updated with several reactions, cleaned from endothermic reactions not explicitly recognized as such. To this end, we characterized all the species in the GRETOBAPE network with accurate QM calculations. We found that 5% of the reactions in the original network are endothermic although most of them are reported as barrierless. The reaction network of Si-bearing species is the most impacted by the endothermicity cleaning process. We also produced a cleaned reduced network, GRETOBAPE-red, to be used to simulate astrochemical situations where only C-, O-, N- and S- bearing species with less than 6 atoms are needed. Finally, the new GRETOBAPE network, its reduced version, as well as the database with all the molecular properties are made publicly available. The species properties database can be used in the future to test the feasibility of possibly new reactions.Comment: ApJS submitte

Morphologic and bioerosive features from an old marine highstand: the Cabililla archaeological shelter, Benzú, Ceuta

The micro-morphologic and bioerosive features, analyzed in the Benzú shelter (Ceuta), allow us to deduce an erosion marine surface elaborated onto dolomite triassic substrate. The Entobia-Gastrochaenolites Ichnoassociation and Entobia ichnofacies denote high energy coastal or shallow marine environment with low sedimentation rates. Two phases are differentiated in the evolution of these bioerosive structures: the first one defined by great borings of Gastrochaenolites, and the second recorded by bioerosive activity of Entobia and truncation of both, the previous borings and the cliff surface

The Benzú rockshelter: a Middle Palaeolithic site on the North African coast

The rockshelter of Benzu ´ has a Middle–Upper Pleistocene stratigraphic sequence with ten levels, seven with evidence of human occupation. Speleothems have been dated by U/Th and the sedimentary levels by OSL and TL, showing that the sequence extends from 250 ka to 70 ka. In this paper, we summarise the results of geomorphology, chronostratigraphy and excavation, and provide preliminary results on the pollen, faunal and lithic remains. The location of the site on the North African coast of the Strait of Gibraltar offers the potential to throw light on contacts and relationships between prehistoric communities in North Africa and the South Iberian Peninsula, for whom the Strait may have served as a bridge rather than a barrier

Polinización por abejas en cultivos promisorios de Colombia

"El presente libro hace parte de los resultados del proyecto de investigación “Valoración de los servicios de polinización por abejas en algunos frutales promisorios de Colombia, financiado por COLCIENCIAS y la Universidad Nacional de Colombia. Seleccionamos tres frutales promisorios, es decir aquellos cultivados y aprovechados en forma local, y que a pesar de su importancia son poco conocidos: Agraz (Vaccinium meridionale), fuente de antioxidantes; guayaba chamba (Campomanesia lineatifolia) fruto aromático y delicado aprovechado profusamente en Miraflores (Boyacá) y Cholupa (Passiflora maliformis), prima de la granadilla y el maracuyá, pero también poco conocida fuera de Rivera (Huila). Gracias a esta investigación aprendimos que las abejas son los polinizadores importantes de estos tres frutales. Según la estrategia reproductiva del agraz se estima que el 65% de la producción de frutos depende de la polinización por abejas. Por su parte, la chamba es una especie xenógama obligada y los polinizares son esenciales para la formación de frutos y semillas. En cuanto a la cholupa los ensayos de polinización demuestran que la dependencia de las abejas polinizadoras es alta, ya que sin la acción de estos vectores de polen la producción se reduce un 77.7%. Especies de Melipona, Bombus, Xylocopa y Apis mellifera son algunos de los polinizadores importantes de estas especies vegetales. Con este trabajo se contribuye al desarrollo de los objetivos de la Iniciativa Colombiana de Polinizadores (ICPA) sobre conocimiento, uso sostenible y valoración tanto de los polinizadores como del servicio de polinización prestado por abejas en Colombia.""Agradecimientos Presentación Polinización Agraz Chamba Cholupa Recomendaciones Fuentes de información

Avance al estudio de la Cueva de Benzú (Ceuta). Nuevas perspectivas de investigación de sociedades tribales en el área norteafricana del Estrecho de Gibraltar

Las excavaciones en la Cueva de Benzú aportan interesantes datos para el estudio de las sociedades tribales. Está situada en la región Atlántica-Mediterránea, en el Norte de África. Tiene una datación en el VI milenio BC.The excavations in Benzu’s Cave provides interesting facts to the study of the tribal societies. It is placed between the Atlantic and the Mediterranean region, in the North of Africa. It is dated in the VI millennium BC.10 página

El abrigo de Benzú (Ceuta). Aportaciones al conocimiento de las sociedades con tecnología de Modo III en la región histórica del Estrecho de Gibraltar

El abrigo de Benzú se encuentra situado próximo a la ciudad de Ceuta, en el (norte) de África. Trabajamos en estos momentos en una fase final de la memoria científica de las actividades realizadas los últimos años. Por ello damos un balance, que todavía no es definitivo, de los datos geológicos, estratigráficos, cronológicos, ecológicos y de los recursos utilizados por las sociedades prehistóricas. Incidimos en datos tecnológicos de los productos arqueológicos y en los modos de vida. Las bases geológicas y paleoecológicas de la región histórica del Estrecho de Gibraltar ofrecen grandes semejanzas entre la orilla norteafricana y la europea. abrigo de Benzú cuenta con una secuencia de 7 estratos con tecnología muy definida en el concepto de Modo III. Las similitudes con los conjuntos del sur de la Península Ibérica son manifiestas. Destacamos también la explotación de recursos marinos por sociedades cazadoras-recolectoras desde el inicio de la secuencia en el Pleistoceno Medio. Con estas bases arqueológicas y el contexto de estudios recientes en la región norteafricana valoramos las posibles relaciones y contactos entre las sociedades de las dos orillas de la región histórica del Estrecho de Gibraltar

El Abrigo de Benzú (Ceuta). Un asentamiento de cazadores-recolectores del Pleistoceno medio y superior. Estratigrafía, estudio polínico y recursos hídricos

Aportación sobre Benzú al Simposio del Agua en Andalucía (2005

El Abrigo de Benzú (Ceuta). Frecuentaciones humanas de un yacimiento con tecnología de modo 3 en el norte de África

[ES] El Abrigo de Benzú se encuentra situado en el norte de África. Hemos desarrollado hasta el presente tres campañas de excavación por un equipo interdisciplinar. Exponemos un balance de su situación geográfica, geomorfología, estratigrafía, dataciones absolutas, sistema de excavación, valoración de los estudios polínicos, faunísticos y de tecnología lítica. El asentamiento muestra una secuencia de ocupación de grupos cazadores-recolectores del Pleistoceno Medio y Superior. Ofrece un registro y datos de interés para reflexionar sobre posibles contactos y relaciones entre comunidades prehistóricas más en el sentido de puente que de frontera.[EN] The Rock Shelter of Benzú is situated in the area of North Africa. An interdisciplinary group of collaborators have worked there during three campaigns of excavations. It is exposed a balance of its geographic situation, geomorphology, stratigraphic sequence, absolute data, excavation system, as well as the pollen, faunal and lithic remains. The settlement includes an occupation sequence of hunter-gathered communities that belong to Middle and Upper Pleistocene. It offers us interesting data to think about possible contacts and relationships among Prehistoric communities. These communities could have used the Strait as a bridge and not as a frontier