29 research outputs found

    Genetic variability of Sugarcane mosaic virus causing maize mosaic in Brazil

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    O objetivo deste trabalho foi caracterizar biológica e molecularmente três isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analisá‑los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de São Paulo e no Município de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos à análise sorológica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresentaram sintomas de mosaico após a inoculação dos três isolados, e o DAS‑ELISA confirmou a infecção pelo SCMV. O RNA total foi extraído e usado para amplificação por transcriptase reversa seguida de reação em cadeia de polimerase (RT‑PCR). Fragmentos específicos foram amplificados, submetidos à análise por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e sequenciados. Foi possível discriminar os genótipos de SCMV isolados de milho de outros isolados brasileiros do vírus. Alinhamentos múltiplos e análises dos perfis filogenéticos corroboram esses dados e mostram diversidade nas sequências de nucleotídeos que codificam para a proteína capsidial, o que explica o agrupamento separado desses isolados e sugere sua classificação como estirpes distintas, em lugar de simples isolados geográficos.The objective of this work was to characterize biologically and molecularly three Sugarcane mosaic virus (SCMV) isolates from maize crops in Brazil, to analyze them phylogenetically and to discriminate genome polymorphisms. Plants with mosaic and stunting symptons were collected from maize crops in the state of São Paulo and in Rio Verde county, GO, Brazil; their foliar extracts were inoculated in indicator plants and subjected to serological analysis with antisera to SCMV, Maize dwarf mosaic virus (MDMV) and Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Sorghum 'Rio' and 'TX 2786' seedlings showed mosaic symptons after inoculation of the three isolates, and DAS‑ELISA confirmed infection by SCMV in these plants. Total RNA was extracted from the infected leaves and was used as template for reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT‑PCR). Specific fragments were amplified, subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and sequenced. It was possible to discriminate the SCMV maize isolates from other Brazilian isolates of the virus. Multiple alignments and phylogenetic profile analyses corroborate these data and show diversity in the sequence of nucleotides that code for capsidal protein, what explains the distinct clustering of these isolates, suggesting that they should be ranked as distinct SCMV strains rather than geographical isolates

    Genetic variability of Sugarcane mosaic virus causing maize mosaic in Brazil

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    O objetivo deste trabalho foi caracterizar biológica e molecularmente três isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analisá‑los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de São Paulo e no Município de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos à análise sorológica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresentaram sintomas de mosaico após a inoculação dos três isolados, e o DAS‑ELISA confirmou a infecção pelo SCMV. O RNA total foi extraído e usado para amplificação por transcriptase reversa seguida de reação em cadeia de polimerase (RT‑PCR). Fragmentos específicos foram amplificados, submetidos à análise por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e sequenciados. Foi possível discriminar os genótipos de SCMV isolados de milho de outros isolados brasileiros do vírus. Alinhamentos múltiplos e análises dos perfis filogenéticos corroboram esses dados e mostram diversidade nas sequências de nucleotídeos que codificam para a proteína capsidial, o que explica o agrupamento separado desses isolados e sugere sua classificação como estirpes distintas, em lugar de simples isolados geográficos.The objective of this work was to characterize biologically and molecularly three Sugarcane mosaic virus (SCMV) isolates from maize crops in Brazil, to analyze them phylogenetically and to discriminate genome polymorphisms. Plants with mosaic and stunting symptons were collected from maize crops in the state of São Paulo and in Rio Verde county, GO, Brazil; their foliar extracts were inoculated in indicator plants and subjected to serological analysis with antisera to SCMV, Maize dwarf mosaic virus (MDMV) and Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Sorghum 'Rio' and 'TX 2786' seedlings showed mosaic symptons after inoculation of the three isolates, and DAS‑ELISA confirmed infection by SCMV in these plants. Total RNA was extracted from the infected leaves and was used as template for reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT‑PCR). Specific fragments were amplified, subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and sequenced. It was possible to discriminate the SCMV maize isolates from other Brazilian isolates of the virus. Multiple alignments and phylogenetic profile analyses corroborate these data and show diversity in the sequence of nucleotides that code for capsidal protein, what explains the distinct clustering of these isolates, suggesting that they should be ranked as distinct SCMV strains rather than geographical isolates

    Value of adenosine infusion for infarct size determination using real-time myocardial contrast echocardiography

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    BACKGROUND: Myocardial contrast echocardiography has been used for determination of infarct size (IS) in experimental models. However, with intermittent harmonic imaging, IS seems to be underestimated immediately after reperfusion due to areas with preserved, yet dysfunctional, microvasculature. The use of exogenous vasodilators showed to be useful to unmask these infarcted areas with depressed coronary flow reserve. This study was undertaken to assess the value of adenosine for IS determination in an open-chest canine model of coronary occlusion and reperfusion, using real-time myocardial contrast echocardiography (RTMCE). METHODS: Nine dogs underwent 180 minutes of coronary occlusion followed by reperfusion. PESDA (Perfluorocarbon-Exposed Sonicated Dextrose Albumin) was used as contrast agent. IS was determined by RTMCE before and during adenosine infusion at a rate of 140 mcg·Kg(-1)·min(-1). Post-mortem necrotic area was determined by triphenyl-tetrazolium chloride (TTC) staining. RESULTS: IS determined by RTMCE was 1.98 ± 1.30 cm(2 )and increased to 2.58 ± 1.53 cm(2 )during adenosine infusion (p = 0.004), with good correlation between measurements (r = 0.91; p < 0.01). The necrotic area determined by TTC was 2.29 ± 1.36 cm(2 )and showed no significant difference with IS determined by RTMCE before or during hyperemia. A slight better correlation between RTMCE and TTC measurements was observed during adenosine (r = 0.99; p < 0.001) then before it (r = 0.92; p = 0.0013). CONCLUSION: RTMCE can accurately determine IS in immediate period after acute myocardial infarction. Adenosine infusion results in a slight better detection of actual size of myocardial damage

    O parto prematuro induzido pela covid-19: uma revisão da literatura / Premature birth induced by covid-19: a literature review

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    INTRODUÇÃO: A Coronavírus Disease-2019 é uma infecção respiratória aguda potencialmente grave e de distribuição global. Devido à sua propagação global e ao estado de calamidade provocado foi declarado pela OMS, a pandemia por COVID-19. O seu acometimento em gestantes está associado a diversas repercussões, como o parto prematuro. METODOLOGIA: Trata-se de uma revisão narrativa de literatura, através de pesquisa na base de dados Pubmed utilizando os descritores: ''preterm birth''; ''coronavirus infection'', ''premature birth labor'' e ''pregnancy''.  RESULTADOS: Foram encontrados 121 artigos, entre os quais 17 foram selecionados, sendo todos publicados em 2020 e consistem em estudos de coorte prospectivos e retrospectivos, revisões sistemáticas e metanálises. DISCUSSÃO: Pesquisas que avaliaram mulheres grávidas infectadas apontam um índice superior de prematuridade entre os recém-nascidos de mães com COVID-19, em comparação com a população geral. A invasão viral poderia desencadear trabalho de parto prematuro via receptor toll-like TLR-3 ativando a via comum. Os partos prematuros ocorrem com frequência em mulheres com doença grave, sendo predominantemente cesáreas. CONCLUSÃO: A infecção pelo SARS-CoV-2 em gestantes foi associada a maiores índices de parto prematuro e de partos cesáreos quando comparados à população não infectada.

    ATLANTIC-PRIMATES: a dataset of communities and occurrences of primates in the Atlantic Forests of South America

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    Primates play an important role in ecosystem functioning and offer critical insights into human evolution, biology, behavior, and emerging infectious diseases. There are 26 primate species in the Atlantic Forests of South America, 19 of them endemic. We compiled a dataset of 5,472 georeferenced locations of 26 native and 1 introduced primate species, as hybrids in the genera Callithrix and Alouatta. The dataset includes 700 primate communities, 8,121 single species occurrences and 714 estimates of primate population sizes, covering most natural forest types of the tropical and subtropical Atlantic Forest of Brazil, Paraguay and Argentina and some other biomes. On average, primate communities of the Atlantic Forest harbor 2 ± 1 species (range = 1–6). However, about 40% of primate communities contain only one species. Alouatta guariba (N = 2,188 records) and Sapajus nigritus (N = 1,127) were the species with the most records. Callicebus barbarabrownae (N = 35), Leontopithecus caissara (N = 38), and Sapajus libidinosus (N = 41) were the species with the least records. Recorded primate densities varied from 0.004 individuals/km 2 (Alouatta guariba at Fragmento do Bugre, Paraná, Brazil) to 400 individuals/km 2 (Alouatta caraya in Santiago, Rio Grande do Sul, Brazil). Our dataset reflects disparity between the numerous primate census conducted in the Atlantic Forest, in contrast to the scarcity of estimates of population sizes and densities. With these data, researchers can develop different macroecological and regional level studies, focusing on communities, populations, species co-occurrence and distribution patterns. Moreover, the data can also be used to assess the consequences of fragmentation, defaunation, and disease outbreaks on different ecological processes, such as trophic cascades, species invasion or extinction, and community dynamics. There are no copyright restrictions. Please cite this Data Paper when the data are used in publications. We also request that researchers and teachers inform us of how they are using the data. © 2018 by the The Authors. Ecology © 2018 The Ecological Society of Americ

    Para a análise teórico-metodológica das plataformas digitais como estruturas de mediação a partir da Economia Política da Comunicação

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    O objetivo deste artigo é apresentar um quadro de análise para o estudo das plataformas digitais, de acordo com o marco teórico desenvolvido no Brasil desde a segunda metade dos anos oitenta do século passado, no âmbito da chamada economia política da comunicação e da cultura (EPC). Trata-se de uma apresentação esquemática, que recorre a uma série de diagramas elaborados ao longo dos anos para o estudo das indústrias culturais e da comunicação, para a Indústria Cultural no seu conjunto, para as telecomunicações, a economia política da internet e outros objetos que constituem o sistema global de cultura e sua evolução no interior do capitalismo monopolista. A partir dela, buscamos apontar agentes principais e suas interações, percebendo o que permanece e o que é alterado na configuração da nova estrutura de mediação social.Identificador permanente (ARK): http://id.caicyt.gov.ar/ark:/s18535925/wdrcmrjx
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