Avaliação da técnica de MALDI-TOF MS no laboratório de microbiologia

Rapid identification of microorganisms by the clinical microbiology laboratory is of crucial importance for optimal patients’ management and treatment. In general, bacterial identification by conventional methods requires 18-24 hours for colony isolation and at least 24 additional hours for species identification. New technologies in microbiology have focused on the rapid diagnosis of bloodstream infections, since they are associated with high morbidity and mortality rates.A rápida identificação de microrganismos no laboratório de microbiologia clínica é de extrema importância para direcionar o manejo e o tratamento de pacientes. Geralmente, a identificação bacteriana por métodos bioquímicos convencionais necessita de 18 a 24 horas para o crescimento e o isolamento da colônia bacteriana e, pelo menos, 24 horas adicionais para a identificação da espécie. Novas tecnologias em microbiologia têm focado no desenvolvimento de métodos relacionados com o diagnóstico rápido das infecções da corrente sanguínea, uma vez que essas infecções são associadas à alta morbimortalidade.UNIFESPUNIFESP Infectious Disease Department ALERTA laboratoryNational Council for Scientific and Technological DevelopmentBrazilian Society of Infectious Diseases Bacteriology CommitteeUNIFESP, Infectious Disease Department ALERTA laboratorySciEL

Early dissemination of OXA-72-producing Acinetobacter baumannii strain in Colombia: a case report

Nosocomial infections caused by carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates have reached epidemic levels in past decades. Currently this microorganism is responsible for outbreaks of difficult eradication and with high mortality rates worldwide. We herein report a rare case of an OXA-72-producing A. baumannii isolate colonizing a 47-year-old male patient with peritonitis due to abdominal stab wound, four years earlier than the first report of this carbapenemase in Acinetobacter pittii in Colombia. Although OXA-72 presents a low prevalence compared with OXA-23, our study demonstrated that A. baumannii isolates carrying the blaOXA-72 gene were present in the hospital environment in Colombia and could act as a reservoir for further spread to other Acinetobacter species, like A. pittii, causing carbapenem-resistance.ColcienciasUniversidad Nacional de ColombiaUniversidad Nacional de Colombia Medical School Microbiology DepartmentUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Disciplina de Infectologia Laboratório ALERTAUniversidad Nacional de Colombia Medical School Medicine DepartmentUNIFESP, Disciplina de Infectologia Laboratório ALERTAColciencias: 11010416355, Agreement 444Universidad Nacional de Colombia: 20201009713SciEL

OXA-207, a novel OXA-24 variant with reduced catalytic efficiency against carbapenems in Acinetobacter pittii from Spain

A carbapenem-resistant Acinetobacter pittii strain carrying an OXA-24-like enzyme was isolated in northern Spain in 2008. Sequence analysis confirmed the presence of the novel bla(OXA-207) gene flanked by the site-specific XerC/XerD-like recombination binding sites and showing a unique Gly222Val substitution compared to OXA-24. Cloning and kinetic analysis showed that OXA-207 presents a reduction in the catalytic efficiency against carbapenems and a noticeable increase for oxacillin

Detection of PER-2-Producing Enterobacter cloacae in a Brazilian Liver Transplantation Unit

Universidade Federal de São Paulo, Dept Med, Lab Alerta, São Paulo, BrazilUniv Fed Parana, Hosp Clin, BR-80060000 Curitiba, Parana, BrazilFac & Inst Pesquisa Pele Pequeno Principe, Curitiba, Parana, BrazilUniversidade Federal de São Paulo, Dept Med, Lab Alerta, São Paulo, BrazilWeb of Scienc

Primeira aproximação para solo cultivado com cafeeiro conilon na região atlântica da Bahia

The Integrated Diagnosis and Recommendation (DRIS), although commonly used in the interpretation of leaf analysis has also been employed in chemical analysis of soil, as there is potential for the use of the methodology also in soil and coffee. This study aimed to establish DRIS sufficiency ranges and standards for soils under conilon coffee in the Atlantic region of Bahia State. Forty eight samples of soil were collected in two years at a depth of 0-20 cm. Amounts of organic matter, Ca, Mg , K, P, S , Zn, Cu, Fe, Mn, bases and saturation capacity cation exchange at pH 7 were quantified. It managed to establish DRIS and soil sufficiency ranges from crops to productivity, equal and more than 100 ha-1 bags of coffee conilon, which are applicable in the fertilizer recommendation of this culture in the region. Most parameters set presented discrepancy in relation to the theoretical framework that currently has to conilon coffee. The results suggest the development of regional and specific rules for the application of DRIS and band of sufficiency on the ground to conilon coffee plantations.O Sistema Integrado de Diagnose e Recomendação (DRIS), apesar de ser comumente utilizado na interpretação de análises foliares, pode ser empregado em análise química de solo, existindo potencial do uso da metodologia em solos cultivados com cafeeiros. Objetivou-se estabelecer faixas de suficiência e normas DRIS para solos cultivados com cafeeiro conilon na região Atlântica do Estado da Bahia. Coletaram-se 24 amostras de solo em 2012 e 2013, na profundidade de 0-20 cm, sendo quantificados os teores de matéria orgânica, Ca, Mg, K, P, S, Zn, B, Cu, Fe, Mn, saturação de bases e capacidade de troca catiônica a pH 7. Estabeleceram-se normas DRIS e faixas de suficiência para os nutrientes do solo, a partir de lavouras com produtividade, igual e superior a 100 sacas beneficiadas ha-1 de café conilon, sendo aplicáveis na recomendação de adubação da cultura na região. A maioria dos parâmetros estabelecidos apresentou discrepância em relação ao referencial teórico que se tem atualmente para o café conilon. Os resultados sugerem o desenvolvimento de normas regionais e específicas para a aplicação do método DRIS e faixas de suficiência no solo, para lavouras de café conilon

Degradabilidade in situ dos componentes do feno de capim Andropogon Gayanus colhido em diferentes idades

In this study were evaluated Andropogon gayanus hays produced at different ages of growth (56, 84 and 112 days) to assay in situ dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), and fiber fractions degradability. The statistical design was randomized blocks with split plots. The ages of growth were parcels and degradation time (0, 3, 6, 12, 24, 48 and 96 hours) were subparcels with five repetition by treatment (blocks). The different ages showed the same degradation kinetic behavior. A. gayanus hays produced with plant between 56 days are different from the 84 and 112 days of growth and had higher degradation for DM,OM,CP, NDF and ADF. The observed results indicated that the best A. gayanus hays are obtained from plants cut in between 56 days.Objetivou-se com este trabalho determinar a degradabilidade ruminal e os parâmetros da cinética de degradação da matéria seca, matéria orgânica, proteína bruta e frações fibrosas dos fenos de Andropogon gayanus produzidos a partir de 56, 84 e 112 dias de idade. O delineamento estatístico utilizado foi o de blocos ao acaso em esquema de parcelas subdivididas, sendo cinco animais utilizados como blocos, as três idades como parcelas e sete tempos (0, 3, 6, 12, 24, 48 e 96 horas) de incubação como subparcelas. As médias foram comparadas pelo teste SNK ao nível de 5% de significância. O desaparecimento ruminal médio da matéria seca, matéria orgânica, proteína bruta e das porções fibrosas, após 96 horas de incubação ruminal, foram maiores (P<0,05) para o feno colhido aos 56 dias, quando comparado aos fenos colhidos aos 84 e 112 dias de idade. O maior potencial e taxa de degradação ruminal dos nutrientes indicam que melhores fenos de A. gayanus são obtidos aos 56 dias de idade

Evaluation of hays produced with <i>Andropogon Gayanus</i> at different ages using <i>in situ</i> degradability technique

Objetivou-se com este trabalho determinar a degradabilidade ruminal e os parâmetros da cinética de degradação da matéria seca, matéria orgânica, proteína bruta e frações fibrosas dos fenos de Andropogon gayanusproduzidos a partir de 56, 84 e 112 dias de idade. O delineamento estatístico utilizado foi o deblocos ao acaso em esquema de parcelas subdivididas, sendo cinco animais utilizados como blocos, as três idades como parcelas e sete tempos (0, 3, 6, 12, 24, 48 e 96 horas) de incubação como subparcelas. As médias foram comparadas pelo testeSNK ao nível de 5% de significância. O desaparecimento ruminal médio da matéria seca, matéria orgânica, proteína bruta e das porções fibrosas, após 96 horas de incubação ruminal, foram maiores (P<0,05) para o feno colhido aos 56 dias, quando comparado aos fenos colhidos aos 84 e 112 dias de idade. O maior potencial e taxa de degradação ruminal dos nutrientes indicam que melhores fenos de A. gayanus são obtidos aos 56 dias de idade.In this study were evaluated Andropogon gayanus hays produced at different ages of growth (56, 84 and 112 days) to assay in situ dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), and fiber fractions degradability. The statistical design was randomized blocks with split plots. The ages of growth were parcels and degradation time (0, 3, 6, 12, 24, 48 and 96 hours) were subparcels with five repetition by treatment (blocks). The different ages showed the same degradation kinetic behavior. A. gayanus hays produced with plant between 56 days are different from the 84 and 112 days of growth and had higher degradation for DM,OM,CP, NDF and ADF. Theobserved results indicated that the best A. gayanus hays are obtained from plants cut in between 56 days.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Energy partition and methane production in sheep fed with Andropogon Gayanus hays in three different ages

Foi realizado estudo para descrever a partição da energia e produção de metano por ovinos alimentados com fenos do capim Andropogon gayanus colhidos aos 56, 84 e 112 dias de crescimento. Utilizou-se a metodologia da calorimetria indireta para mensuração das perdas de energia e para a determinação da energia digestível (ED), metabolizável (EM) e líquida (EL). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, sendo constituído de três tratamentos e seis repetições. As médias foram comparadas pelo teste Studant-Newman- Keuls (SNK) ao nível de 5% de significância. O feno, cujo material foi colhido aos 56 dias, resultou em maior (P<0,05) consumo de energia digestível (CED) em relação aos materiais fenados com 84 e 112 dias de rebrote. As perdas diárias de energia através da urina, do metano e do incremento calórico não apresentaram diferença (P>0,05) entre os tratamentos. O feno contendo material colhido aos 56 dias apresentou valor de digestibilidade aparente da energia bruta (DAEB) superior (P0,05) entre si. O feno colhido as 56 dias apresentou maior valor de energia digestível e energia metabolizavél em relação aos demais fenos que não diferiram entre si (P>0,05). A produção de metano não variou (P>0,05) entre os tratamentos estudados.A study was conducted to describe the energy partition and methane production by sheep fed grass hay of Andropogon gayanus harvested at 56, 84 and 112 days of growth. We used the methodology of indirect calorimetry to measure energy losses and to determine the digestible energy (DE), metabolizable (ME) and liquid (EL). The experimental design was completely randomized, consisting of three treatments and six replications. Means were compared by Studant -Newman -Keuls (SNK) test at 5 % significance level. Hays was collected at 56 days, resulted in higher (P &lt; 0.05) digestible energy intake (DEI) in relation to hays 84 and 112 days of regrowth. The daily energy losses through urine, methane and heat increment did not differ (P&gt; 0.05) between treatments. Hay containing material collected at 56 days showed apparent digestibility of the gross energy value higher ( P &lt; 0.5) to the other treatments did not differ ( P&gt; 0.05 ) between them. Hay harvested the 56 days had higher digestible energy and metabolizable energy value compared to other hays that did not differ (P&gt; 0.05). The methane production did not change (P&gt; 0.05) between the treatments.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

CONSUMO E DIGESTIBILIDADE APARENTE DO FENO DE Andropogon gayanus COLHIDO EM TRÊS IDADES DIFERENTES

Este experimento teve como objetivo avaliar o consumo e a digestibilidade aparente da matéria seca, proteína bruta, frações fibrosas, energia e balanço do nitrogênio do feno de Andropogon gayanus colhido em três diferentes idades (56, 84 e 112 dias). O delineamento estatístico utilizado foi o inteiramente casualizado com três tratamentos e seis repetições. As digestibilidades aparentes da matéria seca, das frações fibrosas e da energia bruta foram maiores para os fenos colhidos aos 56 e 84 dias (P0,05). Os valores de consumo e digestibilidade aparente apontam as idades de 56 e 84 dias como as melhores dentre as estudadas para o corte do capim A. gayanus para fenação. Palavras-chave: forragem; ovino; valor nutritivo

Energy partition and methane production in sheep fed with Andropogon Gayanus hays in three different ages

Foi realizado estudo para descrever a partição da energia e produção de metano por ovinos alimentados com fenos do capim Andropogon gayanus colhidos aos 56, 84 e 112 dias de crescimento. Utilizou-se a metodologia da calorimetria indireta para mensuração das perdas de energia e para a determinação da energia digestível (ED), metabolizável (EM) e líquida (EL). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, sendo constituído de três tratamentos e seis repetições. As médias foram comparadas pelo teste Studant-Newman- Keuls (SNK) ao nível de 5% de significância. O feno, cujo material foi colhido aos 56 dias, resultou em maior (P<0,05) consumo de energia digestível (CED) em relação aos materiais fenados com 84 e 112 dias de rebrote. As perdas diárias de energia através da urina, do metano e do incremento calórico não apresentaram diferença (P>0,05) entre os tratamentos. O feno contendo material colhido aos 56 dias apresentou valor de digestibilidade aparente da energia bruta (DAEB) superior (P0,05) entre si. O feno colhido as 56 dias apresentou maior valor de energia digestível e energia metabolizavél em relação aos demais fenos que não diferiram entre si (P>0,05). A produção de metano não variou (P>0,05) entre os tratamentos estudados.A study was conducted to describe the energy partition and methane production by sheep fed grass hay of Andropogon gayanus harvested at 56, 84 and 112 days of growth. We used the methodology of indirect calorimetry to measure energy losses and to determine the digestible energy (DE), metabolizable (ME) and liquid (EL). The experimental design was completely randomized, consisting of three treatments and six replications. Means were compared by Studant -Newman -Keuls (SNK) test at 5 % significance level. Hays was collected at 56 days, resulted in higher (P &lt; 0.05) digestible energy intake (DEI) in relation to hays 84 and 112 days of regrowth. The daily energy losses through urine, methane and heat increment did not differ (P&gt; 0.05) between treatments. Hay containing material collected at 56 days showed apparent digestibility of the gross energy value higher ( P &lt; 0.5) to the other treatments did not differ ( P&gt; 0.05 ) between them. Hay harvested the 56 days had higher digestible energy and metabolizable energy value compared to other hays that did not differ (P&gt; 0.05). The methane production did not change (P&gt; 0.05) between the treatments.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale