The influence of genetic stability on Aspergillus fumigatus virulence and azole resistance

Genetic stability is extremely important for the survival of every living organism, and a very complex set of genes has evolved to cope with DNA repair upon DNA damage. Here, we investigated the Aspergillus fumigatus AtmA (Ataxia-telangiectasia mutated, ATM) and AtrA kinases, and how they impact virulence and the evolution of azole resistance. We demonstrated that A. fumigatus atmA and atrA null mutants are haploid and have a discrete chromosomal polymorphism. The ?atmA and ?atrA strains are sensitive to several DNA-damaging agents, but surprisingly both strains were more resistant than the wild-type strain to paraquat, menadione, and hydrogen peroxide. The atmA and atrA genes showed synthetic lethality emphasizing the cooperation between both enzymes and their consequent redundancy. The lack of atmA and atrA does not cause any significant virulence reduction in A. fumigatus in a neutropenic murine model of invasive pulmonary aspergillosis and in the invertebrate alternative model Galleria mellonela. Wild-type, ?atmA, and ?atrA populations that were previously transferred 10 times in minimal medium (MM) in the absence of voriconazole have not shown any significant changes in drug resistance acquisition. In contrast, ?atmA and ?atrA populations that similarly evolved in the presence of a subinhibitory concentration of voriconazole showed an ~5-10-fold increase when compared to the original minimal inhibitory concentration (MIC) values. There are discrete alterations in the voriconazole target Cyp51A/Erg11A or cyp51/erg11 and/or Cdr1B efflux transporter overexpression that do not seem to be the main mechanisms to explain voriconazole resistance in these evolved populations. Taken together, these results suggest that genetic instability caused by ?atmA and ?atrA mutations can confer an adaptive advantage, mainly in the intensity of voriconazole resistance acquisition.We thank the Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de São Paulo and the Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientí fi co e Tecnológico, Brazil, for fi nancial support. F.R. and B.H.F. were supported by the Northern Portugal Regional Operational Program (NORTE 2020), under the Portugal 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (NORTE-01-0145-FEDER-000013)info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Atualizações sobre os distúrbios e as complicações do período pós-parto: Updates on disorders and complications of the postpartum period

Os cuidados pós-parto devem se concentrar na identificação de mulheres em risco de morbidade e mortalidade significativas a curto prazo, o período pós-parto, também conhecido como puerpério, refere-se ao período após o parto em que as alterações fisiológicas maternas relacionadas à gravidez retornam ao estado não grávido, os numerosos distúrbios e complicações podem ocorrer no pós-parto imediato ou após a alta da maternidade. Uma variedade de eventos adversos pode ocorrer após o parto, incluindo retenção urinária, hemorroidas, incontinência, neuropatia, morbidade relacionada à anestesia e vários tipos de infecções. Os distúrbios que podem se apresentar após a alta ou a visita inicial pós-parto incluem disfunção sexual, problemas de saúde mental, tireoidite, preocupações com a amamentação e disfunções relacionadas com controle do peso

ATLANTIC EPIPHYTES: a data set of vascular and non-vascular epiphyte plants and lichens from the Atlantic Forest

Epiphytes are hyper-diverse and one of the frequently undervalued life forms in plant surveys and biodiversity inventories. Epiphytes of the Atlantic Forest, one of the most endangered ecosystems in the world, have high endemism and radiated recently in the Pliocene. We aimed to (1) compile an extensive Atlantic Forest data set on vascular, non-vascular plants (including hemiepiphytes), and lichen epiphyte species occurrence and abundance; (2) describe the epiphyte distribution in the Atlantic Forest, in order to indicate future sampling efforts. Our work presents the first epiphyte data set with information on abundance and occurrence of epiphyte phorophyte species. All data compiled here come from three main sources provided by the authors: published sources (comprising peer-reviewed articles, books, and theses), unpublished data, and herbarium data. We compiled a data set composed of 2,095 species, from 89,270 holo/hemiepiphyte records, in the Atlantic Forest of Brazil, Argentina, Paraguay, and Uruguay, recorded from 1824 to early 2018. Most of the records were from qualitative data (occurrence only, 88%), well distributed throughout the Atlantic Forest. For quantitative records, the most common sampling method was individual trees (71%), followed by plot sampling (19%), and transect sampling (10%). Angiosperms (81%) were the most frequently registered group, and Bromeliaceae and Orchidaceae were the families with the greatest number of records (27,272 and 21,945, respectively). Ferns and Lycophytes presented fewer records than Angiosperms, and Polypodiaceae were the most recorded family, and more concentrated in the Southern and Southeastern regions. Data on non-vascular plants and lichens were scarce, with a few disjunct records concentrated in the Northeastern region of the Atlantic Forest. For all non-vascular plant records, Lejeuneaceae, a family of liverworts, was the most recorded family. We hope that our effort to organize scattered epiphyte data help advance the knowledge of epiphyte ecology, as well as our understanding of macroecological and biogeographical patterns in the Atlantic Forest. No copyright restrictions are associated with the data set. Please cite this Ecology Data Paper if the data are used in publication and teaching events. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ

Análise genômica comparativa entre trypanosoma cruzi, trypanosoma rangeli e trypanosoma conorhini

Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016

Comparative genomic analysis of Trypanosoma cruzi and trypanosomes of the Trypanosoma rangeli - Trypanosoma conorhini clade by molecular karyotyping and comparative genomic hybridization (aCGH)

As espécies do clado Trypanosoma cruzi (Trypanosoma rangeli, Trypanosoma conorhini e T. cruzi) compartilham vetores e regiões geográficas. T. cruzi é o agente etiologico da doença de Chagas enquanto T. rangeli é avirulento em humanos. T. conorhini não infecta humanos e é filogeneticamente mais próximo de T. rangeli do que em relação a T. cruzi. A comparação genômica entre estas espécies é importante para compreendermos a evolução da virulência e patogenicidade de tripanossomas em humanos. Análise filogenética com marcadores moleculares identificaram padrões de ancestralidade comuns entre as espécies do clado T. cruzi. Nesta tese, nós comparamos o cariótipo molecular e os genomas de T. rangeli, T. cruzi e T. conorhini por hibridização das bandas cromossômicas separadas por eletroforese de campo pulsado com marcadores cromossomo-específicos, análise sintenica por bioinformática usando sequencias genômicas e hibridização genômica comparativa (aCGH). Estabelecemos o cariótipo de isolados de T. rangeli e T. conorhini provenientes de diferentes hospedeiros (triatomíneos e mamíferos) e regiões geográficas (Américas Central e do Sul). O cariótipo padrão de T. rangeli é composto por 15-21 bandas cromossômicas distribuídas em 2-5 megabandas (2,07-3,36 Mb) e 14-15 bandas de menor tamanho (0,40- 1,70 Mb). A única exceção foi o isolado humano H14 de T. rangeli da América Central que apresentou perfil cariotípico bastante complexo. O cariótipo de T. conorhini é semelhante ao de T. rangeli. A integração dos dados de sequenciamento genômico com os de hibridização das bandas cromossômicas com marcadores cromossomo-específicos mostrou que os blocos sintênicos (TcChr39) e (TcChr37+TcChr4) de T. cruzi também estão conservados com razoável manutenção da ordem gênica em T. rangeli e T. conorhini. Nestas espécies, os grupos sintênicos foram fragmentados, cada um deles, em 2 grupos de ligação menores, intercalados por regiões assintenicas. T. rangeli e T. conorhini diferem de T. cruzi com relação ao número, tamanho e conteúdo gênico de seus cromossomos resultante de diferentes combinações entre blocos sintênicos comuns entre estas espécies. Alterações do número cromossômico podem ter sido geradas por fissão cromossômica, como por exemplo, a separação do bloco sintênico (TcChr4+TcChr37) resultando em T. rangeli em uma banda menor (0,72 Mb) contendo o grupo de ligação TChr4. Também sugerimos que a combinação dos blocos sintênicos de TcChr39 e TChr37 poderia ter gerado um único cromossomo mapeado na banda cromossômica de 2,33 Mb de T. rangeli. A comparação por Hibridização Genômica Comparativa (aCGH) entre T. cruzi CLB e T. rangeli SC58 confirmou a variabilidade genética entre isolados de T. rangeli, notadamente, nos isolados de humanos da América Central. Na comparação dos genomas T. rangeli com T. cruzi foram identificadas alterações de ganho e de perda de material genético. Algumas alterações de ganho ocupam quase toda extensão do cromossomo, sugerindo a ocorrência de aneuploidia cromossômica. Existem eventos de ganho comuns aos isolados de T. rangeli e T. conorhini. As famílias multigênicas estão presentes na maioria alterações de ganho presentes nos genomas de T. rangeli e T. conorhini. Também foram identificadas alterações relacionadas com genes de proteínas hipotéticas e outros genes. Em resumo, T. cruzi e a as espécies do clado T. rangeli-T. conorhini compartilham blocos sintênicos que estão reunidos em diferentes combinações nestas espécies.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)147453/2016-

OCCURRENCE OF Blastocystis spp. IN UBERABA, MINAS GERAIS, BRAZIL

Parasitos intestinais são um problema de saúde pública no mundo e a infecção por Blastocystis, protozoário de patogenicidade controversa, é uma das mais frequentes. Nesse estudo foi investigada a ocorrência de parasitos intestinais em pacientes atendidos na Universidade Federal do Triângulo Mineiro, em Uberaba (MG), com ênfase em Blastocystis, pelos métodos parasitológicos direto e de Ritchie. Foram examinadas fezes de 1.323 pacientes de abril/2011 a maio/2012. Em 28,7% deles foi identificado um parasito intestinal, sendo Blastocystis spp. (17,8%) e Giardia intestinalis (7,4%) os mais frequentes. A ocorrência de parasitismo foi maior em crianças de 6-10 anos e a infecção por Blastocystis spp. foi maior acima de seis anos (p < 0,001). Presença exclusiva de G. intestinalis e de Blastocystis spp. foi observada em 5,4% e 12,2% dos pacientes, respectivamente, sendo que dos pacientes com fezes diarreicas, 8% apresentavam parasitismo exclusivo por Blastocystis spp. Outros parasitos intestinais observados em crianças foram Ascaris lumbricoides (0,3%) e Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii (1,4%). O método de Ritchie foi mais sensível (92,8%) que o direto (89,8%), com alta concordância entre eles (97,7%, kappa = 0,92). Em conclusão, a ocorrência de Blastocystis spp. em Uberaba é elevada e foi observada a presença de fezes diarreicas com parasitismo exclusivo por Blastocystis spp.Intestinal parasites are a problem for public health all over the world. The infection with Blastocystis, a protozoan of controversial pathogenicity, is one of the most common among them all. In this study, the occurrence of intestinal parasites, with emphasis on Blastocystis, in patients at the Universidade Federal do Triângulo Mineiro was investigated in Uberaba (MG) through microscopy of direct smears and fecal concentrates using Ritchie’s method. Feces of 1,323 patients were examined from April 2011 to May 2012. In 28.7% of them at least one intestinal parasite was identified, and the most frequent organisms were Blastocystis spp. (17.8%) and Giardia intestinalis (7.4%). The occurrence of parasitism was higher in children aged 6 -10 years old, and the infection with Blastocystis spp. was higher above the age of six (p < 0.001). The exclusive presence of G. intestinalis and of Blastocystis spp. was observed in 5.4% and 12.2% of the patients, respectively. Regarding patients with diarrheic feces, 8% revealed unique parasitism of Blastocystis spp. Other intestinal parasites observed in children were Ascaris lumbricoides (0.3%) and Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii (1.4%). The Ritchie’s method was more sensitive (92.8%) when compared to direct microscopy (89.8%), with high agreement between them (97.7%, kappa = 0.92). In conclusion, the occurrence of Blastocystis spp. in Uberaba is high and the presence of diarrheic feces with exclusive presence of the parasite of Blastocystis spp. was observed