Preliminary study of the individual telomere length and chromosome anomalies in glioblastomas

Le glioblastome (GBM) est une tumeur cérébrale maligne de grade IV dont le pronostic est de 14,6 mois avec le traitement standard. Le pronostic des patients est difficile à préciser et de meilleures connaissances de révolution de ce cancer nous permettraient d’identifier de nouveaux marqueurs permettant d’estimer plus précisement le stade du cancer et ainsi, la survie des patients. L’équipe du Dr Ju Yan a étudié les profils de longueurs individuelles des télomères des cellules de patients normaux et de patients atteints de leucemie myéloïde chronique (LMC) avec les techniques d’analyse des fragments terminaux de restriction des télomères (TRF) et d’hybridation in situ observée en fluorescence de façon quantitative (Q-FISH). En utilisant les mêmes protocoles sur les GBM, nous avons évalué les longueurs individuelles des télomères et leurs profils. L’analyse complète de onze spécimens de GBM humains et de la lignée cellulaire de glioblastome U-87 MG nous a permis d’observer que les télomères 12p, 16p, 22q, 17p, 17q, 19p et 22q sont maintenus plus longs dans les profils de longueurs individuelles relatives. En comparant avec les données du Dr Yan, nous avons pu déterminer que les télomères 21p et 2q sont fréquemment observés parmi les télomères les plus courts dans les GBM et dans la LMC. Les comparaisons des télomères significativement plus courts à ceux plus longs nous ont permis d’identifier l’allongement des télomères 12p, 16p et 20q de même que le raccourcissement des télomères 3q, 9p et 22q comme étant des événements potentiellement spécifiques à révolution des GBM. Les télomères 12q et 22q ont été observés parmi les télomères les plus courts et parmi les plus longs dans différents cas de GBM et de LMC, suggérant que le maintien de la longueur et le raccourcissement de ces extrémités peuvent jouer un rôle dans l'évolution du cancer. L’utilisation du FISH multicolore (M-FISH) nous a permis d’identifier les chromosomes impliques de façon récurrente parmi les anomalies de nombre et de structure. Nous avons noté les délétions des chromosomes 1, 2, et 20 ainsi que des segments des chromosomes 6, 11q , 13q, 14q et 18. Au niveau des duplications, on retrouve majoritairement le bras court du chromosome 4 et un segment du chromosome 7. Nous avons aussi observé dans nos analyses que les chromosomes 1, 6, 12, 13, 22 et 14 sont particulièrement impliqués dans les réarrangements et leurs télomères sont fréquemment retrouvés dans les plus courts (1p, 1q, 13p, 22p et 6p). Globalement, nous avons observés que les tumeurs décrites comme étant agressives sont associées avec une survie courte après diagnostic et elles présentent des télomères courts et/ou plusieurs anomalies chromosomiques. Les tumeurs décrites comme étant indolentes sont associées avec une survie longue après diagnostic et elles présentent des télomères souvent de longueur normale et un nombre inférieur d’anomalies chromosomiques comparativement aux tumeurs agressives

Remote sensing of coastal vegetation phenology in a cold temperate intertidal system: Implications for classification of coastal habitats

Intertidal vegetation provides important ecological functions, such as food and shelter for wildlife and ecological services with increased coastline protection from erosion. In cold temperate and subarctic environments, the short growing season has a significant impact on the phenological response of the different vegetation types, which must be considered for their mapping using satellite remote sensing technologies. This study focuses on the effect of the phenology of vegetation in the intertidal ecosystems on remote sensing outputs. The studied sites were dominated by eelgrass (Zostera marina L.), saltmarsh cordgrass (Spartina alterniflora), creeping saltbush (Atriplex prostrata), macroalgae (Ascophyllum nodosum, and Fucus vesiculosus) attached to scattered boulders. In situ data were collected on ten occasions from May through October 2019 and included biophysical properties (e.g., leaf area index) and hyperspectral reflectance spectra (Rrs(λ)). The results indicate that even when substantial vegetation growth is observed, the variation in Rrs(λ) is not significant at the beginning of the growing season, limiting the spectral separability using multispectral imagery. The spectral separability between vegetation types was maximum at the beginning of the season (early June) when the vegetation had not reached its maximum growth. Seasonal time series of the normalized difference vegetation index (NDVI) values were derived from multispectral sensors (Sentinel-2 multispectral instrument (MSI) and PlanetScope) and were validated using in situ-derived NDVI. The results indicate that the phenology of intertidal vegetation can be monitored by satellite if the number of observations obtained at a low tide is sufficient, which helps to discriminate plant species and, therefore, the mapping of vegetation. The optimal period for vegetation mapping was September for the study area

Preliminary study of the individual telomere length and chromosome anomalies in glioblastomas

Le glioblastome (GBM) est une tumeur cérébrale maligne de grade IV dont le pronostic est de 14,6 mois avec le traitement standard. Le pronostic des patients est difficile à préciser et de meilleures connaissances de révolution de ce cancer nous permettraient d’identifier de nouveaux marqueurs permettant d’estimer plus précisement le stade du cancer et ainsi, la survie des patients. L’équipe du Dr Ju Yan a étudié les profils de longueurs individuelles des télomères des cellules de patients normaux et de patients atteints de leucemie myéloïde chronique (LMC) avec les techniques d’analyse des fragments terminaux de restriction des télomères (TRF) et d’hybridation in situ observée en fluorescence de façon quantitative (Q-FISH). En utilisant les mêmes protocoles sur les GBM, nous avons évalué les longueurs individuelles des télomères et leurs profils. L’analyse complète de onze spécimens de GBM humains et de la lignée cellulaire de glioblastome U-87 MG nous a permis d’observer que les télomères 12p, 16p, 22q, 17p, 17q, 19p et 22q sont maintenus plus longs dans les profils de longueurs individuelles relatives. En comparant avec les données du Dr Yan, nous avons pu déterminer que les télomères 21p et 2q sont fréquemment observés parmi les télomères les plus courts dans les GBM et dans la LMC. Les comparaisons des télomères significativement plus courts à ceux plus longs nous ont permis d’identifier l’allongement des télomères 12p, 16p et 20q de même que le raccourcissement des télomères 3q, 9p et 22q comme étant des événements potentiellement spécifiques à révolution des GBM. Les télomères 12q et 22q ont été observés parmi les télomères les plus courts et parmi les plus longs dans différents cas de GBM et de LMC, suggérant que le maintien de la longueur et le raccourcissement de ces extrémités peuvent jouer un rôle dans l'évolution du cancer. L’utilisation du FISH multicolore (M-FISH) nous a permis d’identifier les chromosomes impliques de façon récurrente parmi les anomalies de nombre et de structure. Nous avons noté les délétions des chromosomes 1, 2, et 20 ainsi que des segments des chromosomes 6, 11q , 13q, 14q et 18. Au niveau des duplications, on retrouve majoritairement le bras court du chromosome 4 et un segment du chromosome 7. Nous avons aussi observé dans nos analyses que les chromosomes 1, 6, 12, 13, 22 et 14 sont particulièrement impliqués dans les réarrangements et leurs télomères sont fréquemment retrouvés dans les plus courts (1p, 1q, 13p, 22p et 6p). Globalement, nous avons observés que les tumeurs décrites comme étant agressives sont associées avec une survie courte après diagnostic et elles présentent des télomères courts et/ou plusieurs anomalies chromosomiques. Les tumeurs décrites comme étant indolentes sont associées avec une survie longue après diagnostic et elles présentent des télomères souvent de longueur normale et un nombre inférieur d’anomalies chromosomiques comparativement aux tumeurs agressives

Revue d'histoire du Bas-Saint-Laurent, vol. 16 (1)

Éditorial -- La colonisation dans la vallée de la Matapédia de 1850 à 1900 : le rôle du clergé et des compagnies forestières -- Les mentions relatives au Bas-Saint-Laurent et à la Gaspésie dans les archives de la Compagnie de la Baie d'Hudson (1834-1910) -- Exploration sur "les hauteurs" à l'arrière de la seigneurie Lepage-Thivierge -- Saint-Germain de Rimouski, ou la guerre des saints! -- Chroniques rimouskoises -- Les archives: Le fonds Léo-Pierre Bernier - Une mine d'informations linguistiques -- Patrimoine : des presbytères à vendre -- Propriétés et familles: les Brand-Larrivée à Grand-Métis 1822-1992 -- Où s'en va notre patrimoine industriel? -- En bref -- Des livres à lire

Revue d'histoire du Bas-Saint-Laurent, vol. 14 (1)

Éditorial -- La Société et la Revue d'histoire du Bas-Saint-Laurent prennent un nouvel envol -- Les Clarke et la Compagnie de transport du Bas St-Laurent -- Des arbres, des cailloux et des hommes -- Criminalité féminine dans le Bas-Saint-Laurent -- Souvenirs, mémoire et histoire orale -- La légende Toussaint Cartier -- Chroniques rimouskoises -- La place de l'histoire au Cégep -- Chronique des archives -- Chronique du patrimoine -- Nouvelles des sociétés d'histoire et de généalogie -- Un record Guinness -- Des livres à lire

Three-Dimensional Nuclear Telomere Profiling as a Biomarker for Recurrence in Oligodendrogliomas: A Pilot Study

Mechanisms of recurrence in oligodendrogliomas are poorly understood. Recurrence might be driven by telomere dysfunction-mediated genomic instability. In a pilot study, we investigated ten patients with oligodendrogliomas at the time of diagnosis (first surgery) and after recurrence (second surgery) using three-dimensional nuclear telomere analysis performed with quantitative software TeloView® (Telo Genomics Corp, Toronto, Ontario, Canada). 1p/19q deletion status of each patient was determined by fluorescent in situ hybridization on touch preparation slides. We found that a very specific 3D telomeric profile was associated with two pathways of recurrence in oligodendrogliomas independent of their 1p/19q status: a first group of 8 patients displayed significantly different 3D telomere profiles between both surgeries (p < 0.0001). Their recurrence happened at a mean of 231.375 ± 117.42 days and a median time to progression (TTP) of 239 days, a period defined as short-term recurrence; and a second group of three patients displayed identical 3D telomere profiles between both surgery samples (p > 0.05). Their recurrence happened at a mean of 960.666 ± 86.19 days and a median TTP of 930 days, a period defined as long-term recurrence. Our results suggest a potential link between nuclear telomere architecture and telomere dysfunction with time to recurrence in oligodendrogliomas, independently of the 1p/19q status

Tolerance and Physiological Correlates of Neuromuscular Electrical Stimulation in COPD: A Pilot Study

<div><p>Rationale</p><p>Neuromuscular electrical stimulation (NMES) of the lower limbs is an emerging training strategy in patients with COPD. The efficacy of this technique is related to the intensity of the stimulation that is applied during the training sessions. However, little is known about tolerance to stimulation current intensity and physiological factors that could determine it. Our goal was to find potential physiological predictors of the tolerance to increasing NMES stimulation intensity in patients with mild to severe COPD.</p><p>Methods</p><p>20 patients with COPD (FEV₁ = 54±14% pred.) completed 2 supervised NMES sessions followed by 5 self-directed sessions at home and one final supervised session. NMES was applied simultaneously to both quadriceps for 45 minutes, at a stimulation frequency of 50 Hz. Spirometry, body composition, muscle function and aerobic capacity were assessed at baseline. Cardiorespiratory responses, leg discomfort, muscle fatigue and markers of systemic inflammation were assessed during or after the last NMES session. Tolerance to NMES was quantified as the increase in current intensity from the initial to the final NMES session (ΔInt).</p><p>Results</p><p>Mean ΔInt was 12±10 mA. FEV₁, fat-free-mass, quadriceps strength, aerobic capacity and leg discomfort during the last NMES session positively correlated with ΔInt (r = 0.42 to 0.64, all p≤0.06) while post/pre NMES IL-6 ratio negatively correlated with ΔInt (r = −0.57, p = 0.001). FEV₁, leg discomfort during last NMES session and post/pre IL-6 ratio to NMES were independent factors of variance in ΔInt (r² = 0.72, p = 0.001).</p><p>Conclusion</p><p>Lower tolerance to NMES was associated with increasing airflow obstruction, low tolerance to leg discomfort during NMES and the magnitude of the IL-6 response after NMES.</p><p>Trial Registration</p><p>ClinicalTrials.gov <a href="http://clinicaltrial.gov/ct2/show/NCT00809120?term=NCT00809120&rank=1" target="_blank">NCT00809120</a></p></div

Relationships between tolerance to NMES (ΔInt) and its physiological correlates: (A) forced expiratory volume in 1 second (FEV₁), (B) fat-free mass, (C) quadriceps strength, (D) VO_2peak at end of the incremental shuttle walk (ISWT) (E) the perception of leg discomfort during NMES and (F) the post/pre NMES plasma IL-6 ratio during the final NMES session.

<p>Spearman correlation coefficients are provided.</p

Predictors of the increase in current intensity from the second to the final NMES session (ΔInt) in multiple regression analysis.

<p>Definitions of abbreviations: FEV₁: forced expiratory volume in 1 s; FFM; Fat-free-mass; MVC, maximal voluntary contraction; VO₂, oxygen consumption.</p