The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation

The S:A222V point mutation, within the G clade, was characteristic of the 20E (EU1) SARS-CoV-2 variant identified in Spain in early summer 2020. This mutation has since reappeared in the Delta subvariant AY.4.2, raising questions about its specific effect on viral infection. We report combined serological, functional, structural and computational studies characterizing the impact of this mutation. Our results reveal that S:A222V promotes an increased RBD opening and slightly increases ACE2 binding as compared to the parent S:D614G clade. Finally, S:A222V does not reduce sera neutralization capacity, suggesting it does not affect vaccine effectiveness

Alterações cognitivas na infecção pelo HIV: uma revisão sistemática: Cognitive changes in HIV infection: a systematic review

Provocada pelo vírus da imunodeficiência humana, com a síndrome da imunodeficiência adquirida, numa pessoa tem o seu sistema imunológico prejudicado, tornando-se suscetível a outras doenças e infecção. Tem-se a estimativa de que 50% dos infectados com o referido vírus podem sofrer alterações cognitivas. Diante disso, este estudo tem como objetivo refletir sobre mudanças estruturais cerebrais e comprometimento cognitivo em pacientes com HIV. Portanto, trata-se de uma revisão sistemática de literatura, desenvolvida a partir da seleção de estudos nas bases de dados Scielo, Pubmed e BVS/Medline a partir do uso de descritores DeCS/MeSH e aplicação de critérios de inclusão e exclusão. Após a análise e interpretação dos dados, concluiu-se que há uma significativa prevalência de HAND em adultos infectados por HIV, no que se refere a alterações cognitivas, especialmente entre pacientes do sexo feminino, de baixa escolaridade e renda, com diagnóstico tardio e baixa quantidade de linfócitos CD4 no início do tratamento. Entre essas pessoas, revelam-se comprometimentos quanto à memória, atenção, controle de impulsos, velocidade de processamento e motora, dentre outros

Ciencias Sociales: Economía y Humanidades HANDBOOK T-I

Se presenta un breve examen de la producción y comercialización de rosa en México; un estudio en México sobre el ingreso mínimo de las familias que identifica la línea de pobreza alimentaria en el área rural del sur de México, 2012; un pequeño estudio donde hablará sobre el análisis comparado del Sector Gubernamental y la Economía Mexicana desde la perspectiva de los eslabonamientos productivos Hirshman-Rasmuss; un estudio sobre los canales de comercialización de limón persa en el municipio de Martínez de la Torre, Veracruz; una análisis del comercio estratégico en el TLCAN: El Estado en la política agrícola de biocombustibles; también se expresan acerca de la importancia de la comercialización del café en México; un diagnóstico, retos del comercio electrónico en el Sector Agroindustrial Mexicano; trabajo nos muestra y habla sobre la inversión extranjera directa y su impacto en crecimiento de México, un análisis en prospectiva: 1999-2010; un estudio acerca sobre la importancia de la Banca en México; un trabajo acerca de la competitividad de la producción agrícola en México, un análisis regional; se analizan todo acerca de el SIAL productor de quesos en Poxtla, competividad y territorio; se habla acerca de la intermediación financiera al servicio de la comunidad indígena: el fondo regional indígena Tarhiata Keri; ademas un estudio acerca de la demanda de Importaciones de durazno (Prunus pérsica L. Batsch) en México procedentes de Estados Unidos de América (1982-2011); Loera y Sepúlveda analizan los parámetros de la productividad forestal en la producción de madera en rollo; un análisis de factores sociales, ambientales y económicos del territorio rural cercano a la ciudad de México; un estudio acerca de la crisis económica mundial y su efecto sobre los flujos migratorios de América Latina; Magadán, Hernández y Escalona presentan la tipología de los sujetos sociales que intervienen en el mercado campesino de Ocotlán Oaxaca; la normalización del proceso de compostaje: una opción para desarrollar el mercado de la composta; acerca de la reestructuración del capitalismo y crisis política en México; la rentabilidad de la producción de miel en el municipio de León, Guanjuato; la economía del maíz en la región metropolitana, Chiapas, 2014; análisis de los centros de educación y cultura ambiental, necesidad de profesionalización Pedagógica de facilitadores ambientales; los Costos y competitividad de la producción del limón persa en el municipio de Martínez de la Torre, Veracruz

Top face of the β-propeller contains “hot spot” residues.

<p>(a) Top face of the propeller showing the position (in red) of the residues most likely to participate in macromolecular interactions as predicted by WDSP server (<a href="http://wu.scbb.pkusz.edu.cn/wdsp/" target="_blank">http://wu.scbb.pkusz.edu.cn/wdsp/</a>). (b) Superposition of Lis1 (pink, PDB: 1VYH) with Erb1 β-propeller. The side chains of the conserved amino acids are shown and labeled.</p

Insertion within WD repeat 2.

<p>(a) The insertion (red) forms an important protrusion on the bottom of the domain. (b) Position of the insertion (red) in the context of the second blade only. Residues corresponding to WD repeat 2 are represented in light blue and the strand D of WD repeat 3 is shown in dark blue. (c) Comparison of blades 1 and 2 of WDR5 from <i>H</i>. <i>sapiens</i> (PDB:4CY2; pink) and Erb1 (blue). Side chains of conserved tryptophan corresponding to the strand C (in canonical WD repeats) are shown for both proteins. Black arrows indicate the position of 2D-2A loops. The letters in (b) and (c) indicate the position of each strand.</p

Analysis of crystal packing.

<p>(a) Overview of crystal contacts of Erb1 monomer (blue) with symmetry related molecules (grey) shows that the top and bottom areas of the propeller are not involved in crystallographic interactions. (b) Helix H2 interacts with symmetrically related molecule (shown in pink). (c) 6C-7D loop penetrates deeply into a conserved cavity of another monomer (in pink). The residues directly involved in crystal packing are labelled in (b) and (c).</p

A canonical Asp/His/Ser triad necessary for correct blade organization.

<p>Conserved residues participating in the crucial hydrogen bond formation are shown and labelled. The distances between the atoms directly involved in H-H bonding are also represented.</p

Data collection and refinement statistics.

<p>^a Statistics for the highest-resolution shell are shown in parentheses.</p><p>^b Mean [<i>I</i>/<i>σ</i>(<i>I</i>)] is the average of the relation between the intensity of the diffraction and the background.</p><p>^c R_meas = {Σ_<i>hkl</i> [N/(N-1)]^1/2 Σ_i |<i>I</i>_<i>i</i>(<i>hkl</i>)—<<i>I</i>(<i>hkl</i>)>|} / Σ_<i>hkl</i> Σ_i<i>I</i>_<i>i</i>(<i>hkl</i>), where <i>I</i>_<i>i</i>(<i>hkl</i>) are the observed intensities, <<i>I</i>(<i>hkl</i>)> are the average intensities and N is the multiplicity of reflection <i>hkl</i>.</p><p>^d R-work = Σ_<i>hkl</i> {[<i>F</i>_<i>obs</i>(<i>hkl</i>)]—[<i>F</i>_<i>calc</i>(<i>hkl</i>)]} / Σ_<i>hkl</i> [<i>F</i>_<i>obs</i>(<i>hkl</i>)], where <i>F</i>_<i>obs</i>(<i>hkl</i>) and <i>F</i>_<i>calc</i>(<i>hkl</i>) are the structure factors observed and calculated, respectively.</p><p>^e R-free corresponds to R_factor calculated using 2% of the total reflections selected randomly and excluded during refinement.</p><p>^f Ligands: glycerol, ethylene glycol, ethanol.</p><p>^g RMSD is the root mean square deviation.</p><p>Data collection and refinement statistics.</p