Succès des plantations de sapins baumiers sous de fortes pressions de broutement exercées par le cerf de Virginie sur l'île d'Anticosti

La plantation d'arbres est un outil d'aménagement permettant de restaurer les écosystèmes forestiers dont la résilience est compromise par l'intensité et la répétition d'une perturbation, mais peut être insuffisante si le régime de perturbation est maintenu. Les plantations de sapins baumiers sont utilisées sur l'île d'Anticosti pour restaurer l'habitat du cerf de Virginie. Pour favoriser la régénération naturelle ainsi que la croissance des sapins plantés, des enclos ont été érigés et les densités de cerf y ont été réduites afin de diminuer la pression de broutement. Notre objectif était d'identifier les facteurs qui influencent l'herbivorie à l'échelle du paysage et à l'échelle locale et d'identifier les facteurs influençant la croissance du sapin, notamment l'herbivorie, les caractéristiques du sol et la végétation avoisinante. Nous avons mesuré la croissance de 114 sapins baumiers situés dans deux enclos de gestion après 8 ans. Après le démantèlement des enclos, nous avons évalué l'intensité du broutement et l'occurrence d'écorçage des sapins. À l'échelle du paysage, l'intensité du broutement augmente en se rapprochant des peuplements de conifères matures, mais pas l'écorçage. L'intensité du broutement sur le sapin augmente également avec la densité d'épinettes blanches environnantes. L'abondance en sapin baumier et bouleau blanc augmente le risque des sapins d'être écorcés. Enfin, l'addition des effets négatifs du broutement et de la densité de végétation sur la croissance des sapins ont permis de mieux prédire la croissance des sapins une meilleure prédiction que les effets individuels de ces deux facteurs. En revanche nous n'avons pas observé d'effet de la composition chimique du sol sur la croissance. Nos résultats montrent que le succès de la restauration des écosystèmes forestiers par la plantation dépend de la végétation avoisinante qui influence indirectement la croissance via le broutement ainsi que directement par la compétition pour les ressources.Tree planting is a management tool to restore forest ecosystems whose resilience is compromised by the intensity and repetition of a disturbance, but may be insufficient if the disturbance regime is maintained. Balsam fir plantations are used on Anticosti Island to restore white-tailed deer habitat. To promote natural regeneration and growth of planted fir trees, enclosures were erected and deer densities were reduced to decrease browsing pressure. Our objective was to identify factors influencing herbivory at the landscape and local scales and to identify factors influencing fir growth, such as herbivory, soil characteristics, and surrounding vegetation. We measured growth of 114 balsam fir trees located in two management enclosures after 8 years. After dismantling the enclosures, we assessed browsing intensity and the occurrence of fir bark. At the landscape scale, browsing intensity increased as we approached mature conifer stands, but bark stripping did not. Browsing intensity on fir increases with surrounding white spruce density. Abundance of balsam fir and white birch increases the risk of fir being bark stripped. Finally, the addition of the negative effects of browsing and vegetation density on fir growth resulted in a better prediction of fir growth than the individual effects of these two factors. In contrast we did not observe an effect of soil chemistry on growth. Our results show that the success of forest ecosystem restoration through planting depends on the surrounding vegetation, which influences growth indirectly via browsing as well as directly by the competition for resources

Plant and Aphid Partners of Poleroviruses: Role in Virus Transmission by Aphids?

Comité de lecture : trueConférence invitée : falseDate de début de l'événement : 2011-07-11Date de fin de l'évenement : 2011-07-14Date de validation : Tue Aug 13 15:11:30 CEST 2013Diffusion de la pièce jointe : Publique, PubliqueIdentifiant : 200587Langue du titre : engNombre de consultation de la notice : 77Nombre de téléchargements de la pièce jointe : 8Pays de l'événement : BRAPublic visé : ScientifiqueType de communication avec actes : Présentation oraleType d'événement : SymposiumPoleroviruses are phloem limited viruses strictly transmitted by aphids in a circulative and non propagative manner. Virions are acquired by aphids when ingesting sap from infected plants. Virus particles cross the gut epithelium and the accessory salivary gland cells before being released, together with saliva, into the plant during a subsequent feed. This highly specific transcytosis mechanism relies on the presence of virus receptors on the surface of the aphid cells. We developed several approaches to identify virus partners in the plant and in the aphid to analyse their role in virus transmission by the vector. By screening different aphid cDNA libraries using a yeast two hybrid system, only few candidates were able to bind virus structural proteins. Among them, we found two nuclear proteins (GAR1 and ALY) which may not be the true virusreceptors but could be considered as virus-sensors. An Ephrin receptor-like protein was also found to interact with the viral proteins. Involvement of these candidates in virus transport through the aphid needs to be analyzed by developing in the insect RNAi-based techniques. These experiments are in progress. We also looked for plant virus-partners and identified several phloem proteins able to bind purified virions in vitro. We showed that these proteins could stimulate virus transmission by aphids when added together with purified virus to the aphid diet (Bencharki et al. 2010, M.P.M.I., 23: 799). By developing a yeast two hybrid system using a phloem specific cDNA library, we identified five additional proteins able to bind viral proteins. Among them, we found ALY proteins already identified as aphid virus-partners suggesting that orthologous plant and aphid proteins could be implicated in the virus cycle. So far, a direct implication of these proteins in aphid transmission has not been observed and experiments are on going to analyze their functions

Genome analysis of the necrotrophic fungal pathogens Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea

Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea are closely related necrotrophic plant pathogenic fungi notable for their wide host ranges and environmental persistence. These attributes have made these species models for understanding the complexity of necrotrophic, broad host-range pathogenicity. Despite their similarities, the two species differ in mating behaviour and the ability to produce asexual spores. We have sequenced the genomes of one strain of S. sclerotiorum and two strains of B. cinerea. The comparative analysis of these genomes relative to one another and to other sequenced fungal genomes is provided here. Their 38–39 Mb genomes include 11,860–14,270 predicted genes, which share 83% amino acid identity on average between the two species. We have mapped the S. sclerotiorum assembly to 16 chromosomes and found large-scale co-linearity with the B. cinerea genomes. Seven percent of the S. sclerotiorum genome comprises transposable elements compared t

Genomic Analysis of the Necrotrophic Fungal Pathogens Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea

Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea are closely related necrotrophic plant pathogenic fungi notable for their wide host ranges and environmental persistence. These attributes have made these species models for understanding the complexity of necrotrophic, broad host-range pathogenicity. Despite their similarities, the two species differ in mating behaviour and the ability to produce asexual spores. We have sequenced the genomes of one strain of S. sclerotiorum and two strains of B. cinerea. The comparative analysis of these genomes relative to one another and to other sequenced fungal genomes is provided here. Their 38–39 Mb genomes include 11,860–14,270 predicted genes, which share 83% amino acid identity on average between the two species. We have mapped the S. sclerotiorum assembly to 16 chromosomes and found large-scale co-linearity with the B. cinerea genomes. Seven percent of the S. sclerotiorum genome comprises transposable elements compared to <1% of B. cinerea. The arsenal of genes associated with necrotrophic processes is similar between the species, including genes involved in plant cell wall degradation and oxalic acid production. Analysis of secondary metabolism gene clusters revealed an expansion in number and diversity of B. cinerea–specific secondary metabolites relative to S. sclerotiorum. The potential diversity in secondary metabolism might be involved in adaptation to specific ecological niches. Comparative genome analysis revealed the basis of differing sexual mating compatibility systems between S. sclerotiorum and B. cinerea. The organization of the mating-type loci differs, and their structures provide evidence for the evolution of heterothallism from homothallism. These data shed light on the evolutionary and mechanistic bases of the genetically complex traits of necrotrophic pathogenicity and sexual mating. This resource should facilitate the functional studies designed to better understand what makes these fungi such successful and persistent pathogens of agronomic crops

Annotation of Acyrthosiphon pisum genes potentially involved in Luteoviridae transcytosis: yeast two-hybrid system to confirm interaction between aphid and virus proteins

National audienc

Etude de l'interaction entre la protéine de membrane des flavivirus et la chaîne légère de dynéineTcex-1

PARIS7-Bibliothèque centrale (751132105) / SudocSudocFranceF

Emploi du double hybride de levure pour confirmer les interactions entre 2 protéines de Myzus persicae et les protéines structurales du BWYV

National audienceLe Beet western yellows virus (BWYV) est un polerovirus (Luteoviridae) qui est transmis par Myzus persicae de manière circulante non-multipliante. Une fois ingérées, les particules virales doivent obligatoirement franchir l’épithélium de l’intestin moyen puis celui des glandes salivaires accessoires afin d’être transmises à une nouvelle plante hôte. Ces deux étapes de transcytose (endocytose/exocytose) des virions au travers du puceron-vecteur requièrent des interactions spécifiques entre les particules virales et des récepteurs localisés au niveau des deux épithéliums (intestin et glandes salivaires accessoires). Des expériences de far-Western blot ont été réalisées à partir de protéines (totales, membranaires et/ou solubles) extraites de Myzus persicae [1] et ont permis, après séquençage par spectrométrie de masse, l’identification de plusieurs candidats homologues à certaines protéines de Drosophila melanogaster dont Rack1 (Receptor for Activated C Kinase 1) et Gapdh3 (GlycerAldehyde-3-Phosphate DesHydrogenase). Bien qu’aucune de ces deux protéines ne soit probablement le récepteur membranaire (extracellulaire) du BWYV, elles interviendraient plus ou moins indirectement dans les mécanismes de transcytose et pourraient ainsi participer activement au passage du BWYV dans le corps du puceron-vecteur. Les tests d’interaction réalisés avec différents mutants du BWYV suggère que Rack1 interagit avec un motif spécifique de la protéine mineure de capside (la RT : ReadThrough) qui est impliquée dans l’efficacité d’endocytose des virions au niveau intestinal. Gapdh3, à l’inverse, interagit avec tous les virus mutés Ŕ même ceux délétés du domaine de readthrough (DRT) Ŕ vraisemblablement par le biais de la protéine majeure de capside (la CP). Afin de confirmer ces interactions observées par far-Western blot, nous avons utilisé un système split-ubiquitin de double hybride de levure, le « mbSUS ». Les protéines appâts (CP ou DRT) ont été fusionnées à la partie C-ter de l’ubiquitine (Cub), elle-même en fusion avec un facteur de transcription synthétique (PLV). Celui-ci est uniquement libéré par clivage lorsqu’il y a interaction de l’appât avec une proie fusionné à la partie N-ter de l’ubiquitine (Nub) ce qui permet l’action de protéases spécifiques reconnaissant l’ubiquitine (entière). La libération du facteur de transcription induit l’activation des gènes rapporteurs du système permettant, entre autre, la croissance des levures sur un milieu spécifique. Le génome d’Acyrthosiphon pisum étant maintenant disponible et les EST pour Myzus persicae assez nombreux, nous avons pu identifier chez M. persicae les gènes codant pour les protéines Rack1 et Gapdh3. Les séquences de ces deux gènes ont été fusionnées à la partie N-ter de l’ubiquitine (Nub) et serviront de proie dans les expériences de double hybride. Les expériences sont en cours, résultats sur le poster