HIGH- RESOLUTION MELTING (HRM) CURVE ANALYSIS: NEW APPROACH USED TO DETECT BLAD AND DUMPS IN URUGUAYAN HOLSTEIN BREED

The widespread use of artificial insemination has allowed the expansion of genetic progress. However, it also brought consequences such as the expansion of lethal hereditary diseases and the increase in inbreeding. The object of this study was to establish a fast and sensitive molecular assay to detect bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and deficiency of uridine monophosphate synthase (DUMPS) carriers in Uruguayan Holstein cattle by means of high resolution melting (HRM) curve analysis. By testing previously confirmed carrier and non-carrier animals, we set up a rapid, simple, and inexpensive diagnostic test using PCR followed by HRM curve analysis. The PCR-HRM genotyping method was effective for the discrimination of BLAD and DUMPS homozygous genotypes, and the BLAD heterozygous genotype. We conclude that the PCR-HRM assay is a robust, reliable, and economical tool for the detection of these mutations in the Holstein breed, which may be implemented in genetic selection programs

Comparative analysis of PRNP 12-bp and 23-bp indels in healthy Aberdeen Angus, Aberdeen Angus x Hereford, Holstein Friesian and Uruguayan Creole cattle

ABSTRACT: Bovine spongiform encephalopathy (BSE) is a transmissible progressive neurodegenerative disease characterized by the accumulation of a pathological isoform (PrpSC) of the cellular prion protein (PrpC) in the brain of cattle. Two insertion/deletion polymorphisms in the PRNP gene (23bp in the promoter and 12bp in intron 1) have been associated with resistance or susceptibility to the disease. The aim of this study was to analyze the distribution of these polymorphisms in 214 healthy bovines belonging to four different breed groups (Aberdeen Angus, Aberdeen Angus x Hereford, Holstein Friesian and Uruguayan Creole cattle). DNA samples were amplified by end-point PCR. A high frequency of the alleles and haplotype associated with susceptibility to BSE (del12 and del23, and del12-del23, respectively) were found in the Aberdeen Angus, Aberdeen Angus x Hereford and Holstein Friesian animals. At the same time, the Uruguayan Creole cattle presented a higher frequency of the alleles and haplotype associated with resistance to BSE (ins12 and ins23, and ins12-ins23, respectively). These data could indicate a greater genetic resistance of the Uruguayan Creole cattle to BSE compared to other analyzed breeds, reinforcing its value as a zoogenetic resource

Descondensación de la heterocromatina en bovinos criollos portadores de la translocación robertsoniana (rob1; 29). acción del inductor 5 - azacitidina - C

La translocación Robertsoniana (rob1; 29) está ampliamente distribuida en razas comerciales y en reservas genéticas de bovinos Criollos americanos. Se ha descrito un enlentecimiento en el desarrollo de embriones portadores de esta aneuploidía, frente a embriones normales. La acción de la 5–aza–C, como agente desmetilante, permitiría descondensar la heterocromatina constitutiva o facultativa. En este trabajo se realiza inducción con el análogo de base 5–aza–C(10mM, 2 hrs) en cultivos linfocitarios de una hembra y un macho portadores de la rob1; 29, frente a bovinos Criollos normales. Se controla la acción desmetilante del inductor al identificar la despiralización del cromosoma X de replicación tardía en hembras y permitir el análisis de la despiralización de la cromatina en múltiples regiones de los autosomas (grandes, medianos, pequeños); de la rob1; 29 y del BTA1. Se discute la correlación existente entre regiones desmetiladas con la descondensación de la heterocromatina facultativa (condicional), relacionándola con la inestabilidad genómica, y la reprogramación epigenética.The Robertsonian translocation (rob1; 29) is widely spread in commercial breeds and specially in genetic reserve of American Creole cattle. It is also described a delay on embryo development in front of normal ones. The action of 5–aza–C, as an hypomethylated agent, could permitted to decondensate the constitutive or facultative heterochromatin. In this work we made induction with the 5–aza–C(10mM, 2 hrs) analogs, in lymphocyte cultures of female and male carriers and normal Creole cattle. The DNA hypometilation is found in the inactive X chromosome of late replication as it is incorporated during the last hours of cell culture. The decondensing effects of 5–aza–C analogs is observed in multiple regions of the autosomes chromatin, the rob1; 29 and the BTA1. A correlation between hypometilated regions and decondensed of facultative (conditional) heterochromatin is related with genomic instability, and epigenetic reprogramming

Análisis de dos poblaciones de caninos (Canis familiaris) de la raza cimarrón uruguayo utilizando rapds como marcadores moleculares

Objetivo. Analizar la variabilidad genética en dos poblaciones de caninos de la raza autóctona “Cimarrón uruguayo” provenientes de distintas zonas del País. Materiales y métodos. Se aisló ADN de 40 animales de la raza Cimarrón. Mediante la técnica de PCR se analizaron 11 marcadores moleculares RAPD (amplificación al azar de ADN polimórfico). Resultados. Se detectó un 14.9% de loci polimórficos. Se obtuvo un índice de bandas compartidas de 0.91, una distancia genética de 0.16 e índice promedio de diversidad de Nei’s de 0.08. Conclusiones. Ambas poblaciones presentan una alta homogeneidad e identidad genética para estos marcadores y pertenecerían a un núcleo genético común

Heterochromatin decondesation in Creole cattle carrier of Robertsonian franslocation (rob 1; 29). Action of 5–azacytidine–C Descondensación de la heterocromatina en bovinos criollos portadores de la translocación Robertsoniana (rob1; 29). Acción del inductor 5–azacitidina–C

<span style="font-size: 10pt; font-family: Arial">The Robertsonian translocation (rob1; 29) is widely spread in commercial breeds and specially in genetic reserve of American Creole cattle. It is also described a delay on embryo development in front of normal ones. The action of 5–aza–C, as an hypomethylated agent, could permitted to decondensate the constitutive or facultative heterochromatin. In this work we made induction with the 5–aza–C(10mM, 2 hrs) analogs, in lymphocyte cultures of female and male carriers and normal Creole cattle. The DNA hypometilation is found in the inactive X chromosome of late replication as it is incorporated during the last hours of cell culture. The decondensing effects of 5–aza–C analogs is observed in multiple regions of the autosomes chromatin, the rob1; 29 and the BTA1. A correlation between hypometilated regions and decondensed of facultative (conditional) heterochromatin is related with genomic instability, and epigenetic reprogramming.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial"></span><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial">La translocación Robertsoniana (rob1; 29) está ampliamente distribuida en razas comerciales y en reservas genéticas de bovinos Criollos americanos. Se ha descrito un enlentecimiento en el desarrollo de embriones portadores de esta aneuploidía, frente a embriones normales. La acción de la 5–aza–C, como agente desmetilante, permitiría descondensar la heterocromatina constitutiva o facultativa. En este trabajo se realiza inducción con el análogo de base 5–aza–C(10mM, 2 hrs) en cultivos linfocitarios de una hembra y un macho portadores de la rob1; 29, frente a bovinos Criollos normales. Se controla la acción desmetilante del inductor al identificar la despiralización del cromosoma X de replicación tardía en hembras y permitir el análisis de la despiralización de la cromatina en múltiples regiones de los autosomas (grandes, medianos, pequeños); de la rob1; 29 y del BTA1. Se discute la correlación existente entre regiones desmetiladas con la descondensación de la heterocromatina facultativa (condicional), relacionándola con la inestabilidad genómica, y la reprogramación epigenética.</span><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial"></span&gt

Descondensación de la heterocromatina en bovinos criollos portadores de la translocación Robertsoniana (rob1; 29). Acción del inductor 5-azacitidina-C Heterochromatin decondesation in Creole cattle carrier of Robertsonian franslocation (rob 1; 29). Action of 5-azacytidine-C

La translocación Robertsoniana (rob1; 29) está ampliamente distribuida en razas comerciales y en reservas genéticas de bovinos Criollos americanos. Se ha descrito un enlentecimiento en el desarrollo de embriones portadores de esta aneuploidía, frente a embriones normales. La acción de la 5-aza-C, como agente desmetilante, permitiría descondensar la heterocromatina constitutiva o facultativa. En este trabajo se realiza inducción con el análogo de base 5-aza-C(10mM, 2 hrs) en cultivos linfocitarios de una hembra y un macho portadores de la rob1; 29, frente a bovinos Criollos normales. Se controla la acción desmetilante del inductor al identificar la despiralización del cromosoma X de replicación tardía en hembras y permitir el análisis de la despiralización de la cromatina en múltiples regiones de los autosomas (grandes, medianos, pequeños); de la rob1; 29 y del BTA1. Se discute la correlación existente entre regiones desmetiladas con la descondensación de la heterocromatina facultativa (condicional), relacionándola con la inestabilidad genómica, y la reprogramación epigenética.<br>The Robertsonian translocation (rob1; 29) is widely spread in commercial breeds and specially in genetic reserve of American Creole cattle. It is also described a delay on embryo development in front of normal ones. The action of 5-aza-C, as an hypomethylated agent, could permitted to decondensate the constitutive or facultative heterochromatin. In this work we made induction with the 5-aza-C(10mM, 2 hrs) analogs, in lymphocyte cultures of female and male carriers and normal Creole cattle. The DNA hypometilation is found in the inactive X chromosome of late replication as it is incorporated during the last hours of cell culture. The decondensing effects of 5-aza-C analogs is observed in multiple regions of the autosomes chromatin, the rob1; 29 and the BTA1. A correlation between hypometilated regions and decondensed of facultative (conditional) heterochromatin is related with genomic instability, and epigenetic reprogramming

Análisis de dos poblaciones de caninos (Canis familiaris) de la raza cimarrón uruguayo utilizando RAPDs como marcadores moleculares

Objective. To analyze the genetic variability in two populations of the native canine breed �Uruguayan Cimarron� from different areas of the country. Materials and methods. DNA was isolated from 40 animals of the Cimarron breed. Using PCR, 11 RAPD (random amplified polymorphism of DNA) molecular markers were analyzed. Results. 14.9% of loci were polymorphic. We found an index of shared bands of 0.91, a genetic distance of 0.16 and a Nei�s average diversity index of 0.08. Conclusions. Both populations present a high homogeneity and genetic identity for these markers suggesting that they belong to a common genetic nucleus.Objetivo. Analizar la variabilidad genética en dos poblaciones de caninos de la raza autóctona �Cimarrón uruguayo� provenientes de distintas zonas del País. Materiales y métodos. Se aisló ADN de 40 animales de la raza Cimarrón. Mediante la técnica de PCR se analizaron 11 marcadores moleculares RAPD (amplificación al azar de ADN polimórfico). Resultados. Se detectó un 14.9% de loci polimórficos. Se obtuvo un índice de bandas compartidas de 0.91, una distancia genética de 0.16 e índice promedio de diversidad de Nei�s de 0.08. Conclusiones. Ambas poblaciones presentan una alta homogeneidad e identidad genética para estos marcadores y pertenecerían a un núcleo genético común

Análise preliminar das características de crescimento, carcaça e qualidade da carne em novilhos uruguaios da raça Crioula em comparação com novilhos Hereford.

The Uruguayan Creole cattle (UCC) reserve has aproximately 600 individuals. These animals have shown high capability of adaptation to unfavorable environments. In this work we evaluated growth and meat production traits of 30 UCC steers in comparison with 10 Hereford steers. All animals received the same sanitary and nutritional management (grazing in natural grasslands, without supplementation), from 6-8 months of age. At 43 months of age a sample of 6 UCC and 6 Hereford steers was selected for carcass and meat evaluation. The evolution of body weight was similar, having Hereford steers higher weight (p &lt; 0.05) only at the beginning and at the end of the trial. Significant diferences were observed in rib-eye area and fat thickness (p &lt; 0.05) towards UCC. Most of the carcass measures did not show significant differences, except pH which was lower in UCC (p &lt; 0.05). Significant differences were observed in muscle and bone porcentaje at the 10th rib favorable to UCC steers (p &lt; 0.05), and a slightly significant difference towards Hereford in visible fat percentage (p = 0,049). No significant differences were observed between both breeds for meat quality traits, except for fatty acids profile. Hereford showed higher unsaturated fatty acids percentage (p &lt; 0.05), and UCC higher levels of conjugated linoleic acid (CLA, p &lt; 0,05). No differences were observed in the comsumer panel trial. A larger sample is needed to obtain firm conclusions, but these results are promising and show a very good potential of UCC for beef production, in comparison with a highly selected breed.La reserva de bovinos Criollos del Uruguay (BCU) cuenta con aproximadamente 600 individuos. Estos animales han demostrado una elevada rusticidad y capacidad de adaptación a medios poco favorables. En este trabajo se evaluó el crecimiento y la capacidad de producción de carne de 30 novillos Criollos en comparación con 10 novillos Hereford. Todos los animales recibieron el mismo manejo sanitario y de alimentación (pastoreo a campo natural, sin suplementación), desde los 6-8 meses de edad. A los 43 meses se seleccionó para faena una muestra de 6 novillos Criollos y 6 Hereford. La evolución del peso corporal fue similar, con una tendencia a favor de Hereford (p &lt; 0,05 sólo al inicio y al final del experimento). Se detectaron diferencias significativas en área de ojo de bife (p &lt; 0,05) y de espesor de grasa dorsal (p &lt;&lt; 0,05) a favor de los Criollos. No se observaron diferencias significativas para la mayoría de las variables medidas en la canal, con una tendencia a favor de los Criollos para pH (p &lt; 0,05). Se observaron diferencias significativas en porcentaje de músculo y hueso a nivel de la 10va costilla a favor del Criollo (p &lt; 0,05), y una diferencia apenas significativa en porcentaje de grasa visible a favor de Hereford (p = 0,049). No se observaron diferencias significativas entre las dos razas para variables de calidad de carne. Hereford mostró una tendencia hacia un mayor porcentaje de ácidos grasos insaturados que Criollo, en el cual se observó un mayor porcentaje de ácido linoleico conjugado (CLA). No hubo diferencias significativas a nivel de las apreciaciones de un panel de consumidores. Se requiere una muestra más grande para sacar conclusiones firmes, pero estos resultados indicarían un muy buen potencial del BCU para la producción de carne, en comparación con una raza altamente seleccionada