23 research outputs found

    2,3-Diphosphoglycerate and the Protective Effect of Pyruvate Kinase Deficiency against Malaria Infection—Exploring the Role of the Red Blood Cell Membrane

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    Malaria remains a major world public health problem, contributing to poverty and inequality. It is urgent to find new efficacious tools with few adverse effects. Malaria has selected red blood cell (RBC) alterations linked to resistance against infection, and understanding the protective mechanisms involved may be useful for developing host-directed tools to control Plasmodium infection. Pyruvate kinase deficiency has been associated with resistance to malaria. Pyruvate kinase-deficient RBCs display an increased concentration of 2,3-diphosphoglycerate (2,3-DPG).We recently showed that 2,3-DPG impacts in vitro intraerythrocytic parasite growth, induces a shift of the metabolic profile of infected cells (iRBCs), making it closer to that of noninfected ones (niRBCs), and decreases the number of parasite progenies that invade new RBCs. As an increase of 2,3-DPG content may also have an adverse effect on RBC membrane and, consequently, on the parasite invasion, in this study, we explored modifications of the RBC morphology, biomechanical properties, and RBC membrane on Plasmodium falciparum in vitro cultures treated with 2,3-DPG, using atomic force microscopy (AFM)-based force spectroscopy and other experimental approaches. The presence of infection by P. falciparum significantly increased the rigidity of parasitized cells and influenced the morphology of RBCs, as parasitized cells showed a decrease of the area-to-volume ratio. The extracellular addition of 2,3-DPG also slightly affected the stiffness of niRBCs, making it more similar to that of infected cells. It also changed the niRBC height, making the cells appear more elongated. Moreover, 2,3-DPG treatment influenced the cell surface charge, becoming more negative in treated RBCs than in untreated ones. The results indicate that treatment with 2,3-DPG has only a mild effect on RBCs in comparison with the effect of the presence of the parasite on the host cell. 2,3-DPG is an endogenous host metabolite, which may, in the future, originate a new antimalarial tool with few adverse effects on noninfected cells.publishersversionpublishe

    IMPLICON: an ultra-deep sequencing method to uncover DNA methylation at imprinted regions

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    Babraham Institute Translational Advisory Group award (to M.E.-M. and F.v.M.); M.E.-M. is supported by a BBSRC Discovery Fellowship [BB/T009713/1]; EMBO Fellowship [ALTF938-2014]; Marie Sklodowska-Curie Individual Fellowship; Work in S.T.d.R.’s team at iMM JLA was supported by Fundac¸ao para a Ci ˜ encia e Tecnologia ˆ(FCT) Ministerio da Cincia, Tecnologia e Ensino Supe- ˆrior (MCTES), Portugal [PTDC/BEX-BCM/2612/2014, PTDC/BIA-MOL/29320/2017 IC&DT]; S.T.d.R. has a CEECUIND/01234/207 assistant research contract from FCT/MCTES; T.K.’s work was supported by Erasmus+and University Foundation of eng. Lenarciˇ c Milan at ˇthe University of Ljubljana. Funding for open access charge: accounts payable, Babraham Institute.publishersversionpublishe

    Aortitis Secondary to Cogan’s Syndrome: A Rare Cause of Fever of Unknown Origin

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    Fever of unknown origin remains a diagnostic challenge. Aortitis, defined as inflammation of the aorta, has multiple infectious and non-infectious causes. We report the case of an elderly woman with vertigo and bilateral hearing loss, presenting with fever of unknown origin. Blood tests were remarkable for leucocytosis with neutrophilia, elevation of C-reactive protein and the erythrocyte sedimentation rate, and positive antinuclear antibodies and rheumatoid factor, and an unremarkable search for multiple infectious causes of fever. During admission the patient developed a bilateral red eye. Abdominal and chest computed tomography was performed and demonstrated signs of aortitis. Due to the coexistence of aortitis, ocular inflammation, vertigo and bilateral hearing loss in a patient with persistent fever and elevation of inflammatory parameters, a presumptive diagnosis of Cogan’s syndrome was made, with improvement after initiation of steroid therapy

    Imprinting fidelity in mouse iPSCs depends on sex of donor cell and medium formulation

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    Funding Information: We would like to thank Sérgio de Almeida, Miguel Casanova and Inês Milagre for critical reading of the manuscript, and the members of the S.T.d.R.’s team for helpful discussions. We also thank Tânia Carvalho and Pedro Ruivo for their help in histological analysis; Judith Webster at Babraham Institute for LC-MS measurements; Bethan Hussey at Sanger Sequencing and Kristina Tabbada at Babraham Institute for assistance with high-throughput sequencing; and the Bioimaging unit as well as Andreia Santos, Rute Gonçalves and Mariana Fernandes of the Flow Cytometry Facility of Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes for their services and assistance. Work in S.T.d.R.’s team was supported by Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT) Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (MCTES), Portugal [IC&DT projects PTDC/BEX-BCM/2612/2014 and PTDC/BIA-MOL/29320/2017 as well as projects UIDB/04565/2020 and UIDP/04565/2020 of the Research Unit Institute from Bioengineering and Biosciences – iBB and LA/P/0140/2020 of the Associate Laboratory Institute for Health and Bioeconomy – i4HB]; S.T.d.R. and A.-V.G. are supported by assistant research contracts from FCT/MCTES (CEECIND/01234/2017 and CEECIND/02085/2018, respectively); M.A and A.C.R. are supported, respectively, by SFRH/BD/151251/2021 and SFRH/BD/137099/2018 PhD fellowships from FCT/MCTES. J.V.G.L is supported by COVID/BD/152624/2022 from FCT/MCTES. MAE-M was supported by a BBSRC Discovery Fellowship (BB/T009713/1) and is now supported by a Snow Medical Fellowship. F.K. is supported by the Babraham Institute Strategic Core Funding and A.M. by BBSRC BBS/E/B/000C0421. B.B.J. work was funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT), and FEDER, LISBOA-01-0145-FEDER-028534, project co-funded by FEDER, through POR Lisboa 2020—Programa Operacional Regional de Lisboa. T.K. is supported by Janko Jamnik Doctoral Scholarship from National Institute of Chemistry. Funding Information: We would like to thank Sérgio de Almeida, Miguel Casanova and Inês Milagre for critical reading of the manuscript, and the members of the S.T.d.R.’s team for helpful discussions. We also thank Tânia Carvalho and Pedro Ruivo for their help in histological analysis; Judith Webster at Babraham Institute for LC-MS measurements; Bethan Hussey at Sanger Sequencing and Kristina Tabbada at Babraham Institute for assistance with high-throughput sequencing; and the Bioimaging unit as well as Andreia Santos, Rute Gonçalves and Mariana Fernandes of the Flow Cytometry Facility of Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes for their services and assistance. Work in S.T.d.R.’s team was supported by Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT) Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (MCTES), Portugal [IC&DT projects PTDC/BEX-BCM/2612/2014 and PTDC/BIA-MOL/29320/2017 as well as projects UIDB/04565/2020 and UIDP/04565/2020 of the Research Unit Institute from Bioengineering and Biosciences – iBB and LA/P/0140/2020 of the Associate Laboratory Institute for Health and Bioeconomy – i4HB]; S.T.d.R. and A.-V.G. are supported by assistant research contracts from FCT/MCTES (CEECIND/01234/2017 and CEECIND/02085/2018, respectively); M.A and A.C.R. are supported, respectively, by SFRH/BD/151251/2021 and SFRH/BD/137099/2018 PhD fellowships from FCT/MCTES. J.V.G.L is supported by COVID/BD/152624/2022 from FCT/MCTES. MAE-M was supported by a BBSRC Discovery Fellowship (BB/T009713/1) and is now supported by a Snow Medical Fellowship. F.K. is supported by the Babraham Institute Strategic Core Funding and A.M. by BBSRC BBS/E/B/000C0421. B.B.J. work was funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT), and FEDER, LISBOA-01-0145-FEDER-028534, project co-funded by FEDER, through POR Lisboa 2020—Programa Operacional Regional de Lisboa. T.K. is supported by Janko Jamnik Doctoral Scholarship from National Institute of Chemistry. Publisher Copyright: © 2022, The Author(s).Reprogramming of somatic cells into induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) is a major leap towards personalised approaches to disease modelling and cell-replacement therapies. However, we still lack the ability to fully control the epigenetic status of iPSCs, which is a major hurdle for their downstream applications. Epigenetic fidelity can be tracked by genomic imprinting, a phenomenon dependent on DNA methylation, which is frequently perturbed in iPSCs by yet unknown reasons. To try to understand the causes underlying these defects, we conducted a thorough imprinting analysis using IMPLICON, a high-throughput method measuring DNA methylation levels, in multiple female and male murine iPSC lines generated under different experimental conditions. Our results show that imprinting defects are remarkably common in iPSCs, but their nature depends on the sex of donor cells and their response to culture conditions. Imprints in female iPSCs resist the initial genome-wide DNA demethylation wave during reprogramming, but ultimately cells accumulate hypomethylation defects irrespective of culture medium formulations. In contrast, imprinting defects on male iPSCs depends on the experimental conditions and arise during reprogramming, being mitigated by the addition of vitamin C (VitC). Our findings are fundamental to further optimise reprogramming strategies and generate iPSCs with a stable epigenome.publishersversionpublishe

    TempuSpacium Didática das Ciências Sociais - Estudos I

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    A educação para os media é, em geral, entendida enquanto etapa e meio para a educação para a cidadania. Nas suas diversas formas, os media, estão presentes, desde bem cedo, na vida das pessoas e, por isso, são determinantes na formação de cidadãos. No entanto, o efeito dos media é qualitativamente muito diferente em função dos grupos sociais e das desiguais capacidades dos recetores e utilizadores para aceder e fazer escolhas face ao enorme acervo de informação e de ofertas disponíveis através dos referidos media. Estas evidências acentuam a necessidade de a escola reforçar, criativa e permanentemente, o seu papel de facilitador na utilização das imensas possibilidades oferecidas pelos media, promovendo uma educação para escolhas valorativamente ponderadas face aos seus conteúdos. Não parece que tal esteja a acontecer de modo significativo

    TempuSpacium Didática das Ciências Sociais - Estudos I

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    A educação para os media é, em geral, entendida enquanto etapa e meio para a educação para a cidadania. Nas suas diversas formas, os media, estão presentes, desde bem cedo, na vida das pessoas e, por isso, são determinantes na formação de cidadãos. No entanto, o efeito dos media é qualitativamente muito diferente em função dos grupos sociais e das desiguais capacidades dos recetores e utilizadores para aceder e fazer escolhas face ao enorme acervo de informação e de ofertas disponíveis através dos referidos media. Estas evidências acentuam a necessidade de a escola reforçar, criativa e permanentemente, o seu papel de facilitador na utilização das imensas possibilidades oferecidas pelos media, promovendo uma educação para escolhas valorativamente ponderadas face aos seus conteúdos. Não parece que tal esteja a acontecer de modo significativo

    Valsa D’água. Do espaço público ao doméstico: desenhar para o conforto climático e a coesão social

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    Assistindo ao reiterado processo de encanamento dos cursos hídricos e ao desaparecimento da água do espaço público — bem como à consequente ausência de conforto climático, sensorial e psicológico nesses lugares —, a população residente nas cidades tem vindo a resguardar-se cada vez mais no interior dos edifícios, artificialmente climatizado. Entendendo a água como um elemento natural, e ao mesmo tempo simbólico, propõe-se a hipótese de retomar a sua presença no espaço público e coletivo, partindo do pressuposto de que esta poderá assumir um papel regenerador nas relações sociais e humanas. Esta conjetura estende-se ao projeto de novos edifícios coletivos, tendo em vista a construção da infraestrutura necessária à qualificação do espaço público. Neste contexto, são tidos em consideração dois casos de estudo distintos, mas não exclusivos — um tendo Viena como ponto de partida, outro, Lisboa. Em ambos os casos, a água é o elemento catalisador da cidade relacional, ocupando um lugar chave nas possibilidades levantadas — da escala territorial à doméstica —, gerando atmosferas propícias ao desenvolvimento de uma sociedade constituída por indivíduos menos isolados e mais participantes da vida pública, por serem usufrutuários de um chão comum qualificado

    Integr(Arte): Imigração, Artes, Educação e Experiências Locais de Integração

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    A dimensão social dos processos participativos no domínio das práticas artísticas assumiu nas últimas décadas uma visibilidade e importância acrescidas na medida em que artistas e outros agentes culturais desenvolveram um interesse particular pelo trabalho coletivo, colaborativo, baseado num contacto direto com as comunidades. Este interesse por parte dos artistas, enquadrado sob designações como community– based art, socially–engaged art, collaborative ou participatory art, entre outras, observou, por vezes, uma diluição de fronteiras entre artista e público, profissional e amador ou entre produção e receção pois o que estava em jogo era a recompensa criativa da experiência social. Atualmente este interesse pela dimensão social da arte repercute-se quer no campo da formação académica especializada em arte e educação, quer no campo da investigação, abrindo espaço para um cruzamento entre os domínios da prática artística, da educação e das ciências sociais. Apesar do crescente interesse sobre as práticas educativas em contextos não formais, designadamente no que diz respeito à arte, o facto é que escasseiam os estudos sobre os processos e o impacto de tais práticas no contexto português tendo em consideração as ligações entre educação artística não formal, comunidade, imigração e integração de imigrantes. A investigação realizada parte precisamente da necessidade de aprofundar o conhecimento sobre as potencialidades educativas das artes (nos domínios das artes visuais, música e teatro), em contextos não formais, para a integração de populações de origem imigrante, assumindo desde logo que a integração se constitui como um processo dinâmico, marcado pela reciprocidade e que se joga em grande parte à escala local. Neste sentido propõe-se, através do estudo “Integr(arte) - Imigração, Artes, Educação e Estratégias Locais de Integração”, a realização, em primeiro lugar, de um mapeamento de plataformas, redes e entidades que na sua ação prefigurem estratégias educativas que concorrem para práticas de integração de imigrantes sustentadas nos domínios das Artes Visuais, Música e Teatro. Em segundo lugar propõe-se a identificação de estratégias educativas desenvolvidas pelas plataformas, redes e entidades que contribuem para a integração de imigrantes, mobilizando as Artes Visuais, Música e Teatro, com o intuito de, finalmente, em terceiro lugar, compreender os significados atribuídos aos processos de participação dos imigrantes nestas instâncias capazes de configurar percursos de integração, envolvendo práticas artísticas nos referidos domínios artísticos. A criação de plataformas e redes informais de aprendizagem e partilha tem-se constituído como uma dinâmica de mobilização de conhecimentos e experiências que, nas fronteiras das instituições, procuram dar espaço e voz a formas renovadas e/ou inovadoras que potenciem a reconfiguração de discursos e práticas em áreas artísticas e culturais de interesse comum. Através da proximidade, entendimento, experimentação e conhecimento de processos e práticas artísticas – integradas nos domínios das Artes Visuais, Música e Teatro – é possível um desenvolvimento de competências sociais, comunicacionais e expressivas, que, para além de potenciarem a criatividade e a inovação, possibilitem uma participação ativa na vida cívica e cultural, prevenindo ou revertendo situações de exclusão social, em particular, discriminação social e/ou expressões de racismo. Considerando que esta problemática implica uma visão multidimensional, o estudo integra uma equipa de investigação composta por dez elementos que reúne um conjunto de docentes da Escola Superior de Educação de Lisboa (ESELx) e investigadores contratados cuja formação pós-graduada, investigação científica e experiência profissional se encontra estruturada em torno de três grandes eixos: a Educação (formal, não formal e informal), a Intervenção Comunitária e as Artes (Artes Visuais, Música e Teatro). A diversidade da formação e experiência da equipa possibilitou o cruzamento de múltiplas perspetivas de análise acerca das ligações entre educação artística não formal, intervenção social e integração de imigrantes. Neste sentido foram desenvolvidas metodologias de trabalho que contemplaram, simultaneamente, uma abordagem extensiva da qual resultou uma base de dados e uma abordagem intensiva da qual emergiram estudos de caso no âmbito de cada área artística. No primeiro caso foi realizado um mapeamento prévio de plataformas, redes e entidades localizadas em territórios dos concelhos de Lisboa e Loures que pertencem aos diferentes setores de atividade - setor público, privado e terceiro setor – e que desenvolvem uma ação educativa no domínio artístico que contribui para a integração de imigrantes. Este mapeamento possibilitou, por um lado, traçar um quadro geral acerca da educação artística não formal nos referidos territórios considerando o carácter das entidades envolvidas (i.e. social, artística e/ou cultural), a sua localização, os seus objetivos, equipas de trabalho envolvidas bem como a continuidade e natureza das atividades desenvolvidas nos domínios das Artes Visuais, Música e Teatro. Por outro lado, possibilitou a construção de uma base de dados, disponível online para consulta quer em contexto de investigação, quer como ferramenta capaz de potenciar o estabelecimento de novas redes e parcerias. Com base na informação recolhida, sistematizada e analisada foram desenvolvidos estudos de caso em ambos os concelhos que compreenderam um contacto aprofundado com entidades escolhidas pela diversidade e continuidade da atividade desenvolvida no âmbito da educação artística não formal nos domínios da Artes Visuais, Música e Teatro. Deste modo foi possível aprofundar o conhecimento de estratégias e metodologias de trabalho desenvolvidas pelas diferentes entidades que configurem práticas implicadas em processos integradores – considerando diversas faixas etárias, desafios sociais e culturais – bem como compreender e avaliar os discursos a partir dos processos criativos, produtos artísticos e vozes de participantes/organizadores das atividades que, à escala local, contribuem para a integração de imigrantes. Todos os processos de pesquisa obedeceram a metodologias específicas que incluem a criação de instrumentos de recolha, análise e sistematização de informação, trabalho de campo que incluiu a entrevista, observação de processos criativos bem como a análise de objetos de arte produzidos. A descrição mais detalhada das metodologias utilizadas será realizada no âmbito do capítulo 2 do estudo. Este estudo organiza-se em cinco capítulos. No Capítulo 1 realiza-se um enquadramento teórico (com vista à discussão conceptual em torno das questões da integração de imigrantes, da educação não formal e das práticas artísticas que cruzam as dimensões anteriores) e um estado da arte da investigação produzida em torno da educação artística não-formal nas Artes Visuais, Música e Teatro e populações imigrantes entre os anos de 2014 a 2017. O Capítulo 2 integra uma definição de estratégias metodológicas seguidas no âmbito do estudo, considerando igualmente a caracterização das unidades territoriais selecionadas – Lisboa e Loures. No Capítulo 3 é desenvolvida a análise em torno do mapeamento das entidades envolvidas, de acordo com as diferentes dimensões que nortearam a sua elaboração, designadamente as áreas artísticas abrangidas, localização, missão e objetivos, tipologias de intervenção, programação, públicos envolvidos e participação em redes. Nos Capítulos 4 e 5 são apresentados os estudos de caso que envolvem entidades de Loures e Lisboa que desenvolvem, com regularidade, atividades de natureza artística inseridas no domínio da educação não formal e que se constituem como exemplos variados de práticas que participam em processos de integração de populações imigrantes. A análise dos discursos de responsáveis pelas entidades mapeadas, dos processos de trabalho, de testemunhos dos participantes e a análise dos resultados finais (sob a forma de objeto de arte) permitiu aceder a informação relativa às áreas de intervenção, estratégias de atuação, graus de participação dos envolvidos, bem como das modalidades de comunicação, explícitas ou implícitas, nas diferentes linguagens artísticas e opções estéticas que incorporam os objetos analisados. Finalmente apresentam-se as conclusões e um conjunto de recomendações baseadas nas principais conclusões do estudo, tendo em linha de conta os domínios das práticas, das políticas culturais, da formação de profissionais ligados à intervenção social, educação e artes bem como da comunicação e da disseminação da ação desenvolvida.info:eu-repo/semantics/publishedVersio
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